Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:5beta-cardanolide
go back to main search page
Accession:CHEBI:35542 term browser browse the term
Definition:A cardanolide that has formula C23H36O2.
Synonyms:related_synonym: Formula=C23H36O2;   InChI=1S/C23H36O2/c1-22-11-4-3-5-16(22)6-7-17-19-9-8-18(15-13-21(24)25-14-15)23(19,2)12-10-20(17)22/h15-20H,3-14H2,1-2H3/t15-,16-,17-,18+,19+,20-,22-,23+/m0/s1;   InChIKey=AQARKTASOBROAE-KPSWSRIPSA-N;   SMILES=[H][C@]1(COC(=O)C1)[C@@]1([H])CC[C@]2([H])[C@]3([H])CC[C@]4([H])CCCC[C@]4(C)[C@@]3([H])CC[C@]12C


show annotations for term's descendants           Sort by:
 
digitoxin term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G ATP1A1 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 decreases activity EXP Digitoxin results in decreased activity of ATP1A1 protein CTD PMID:28438630 NCBI chr 4:104,353,506...104,384,321
Ensembl chr 4:104,353,506...104,384,606
JBrowse link
G CASP3 caspase 3 decreases cleavage EXP Digitoxin results in decreased cleavage of CASP3 protein CTD PMID:28438630 NCBI chr15:45,744,320...45,753,252
Ensembl chr15:45,742,749...45,763,773
JBrowse link
oleandrin term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G ATP1A1 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 decreases activity EXP oleandrin results in decreased activity of ATP1A1 protein CTD PMID:28438630 NCBI chr 4:104,353,506...104,384,321
Ensembl chr 4:104,353,506...104,384,606
JBrowse link
G CASP3 caspase 3 decreases cleavage EXP oleandrin results in decreased cleavage of CASP3 protein CTD PMID:28438630 NCBI chr15:45,744,320...45,753,252
Ensembl chr15:45,742,749...45,763,773
JBrowse link

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 874
    chemical entity 874
      atom 859
        nonmetal atom 839
          carbon atom 821
            organic molecular entity 821
              lipid 233
                steroid 95
                  steroid lactone 2
                    cardanolide 2
                      5beta-cardanolide 2
                        3-epi-digoxigenin 0
                        adonitoxigenin + 0
                        antiogenin + 0
                        bipindogenin + 0
                        cannogenin + 0
                        cardanolide glycoside + 0
                        diginatigenin + 0
                        digitoxigenin + 2
                        digoxigenin + 0
                        gitoxigenin + 2
                        ouabagenin + 0
                        sarmentogenin + 0
                        sarmentologenin + 0
                        strophanthidin + 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 874
    subatomic particle 859
      composite particle 859
        hadron 859
          baryon 859
            nucleon 859
              atomic nucleus 859
                atom 859
                  main group element atom 849
                    p-block element atom 846
                      carbon group element atom 822
                        carbon atom 821
                          organic molecular entity 821
                            organic group 391
                              organic divalent group 389
                                organodiyl group 389
                                  carbonyl group 388
                                    carbonyl compound 388
                                      carboxylic ester 234
                                        lactone 157
                                          steroid lactone 2
                                            cardanolide 2
                                              5beta-cardanolide 2
                                                3-epi-digoxigenin 0
                                                adonitoxigenin + 0
                                                antiogenin + 0
                                                bipindogenin + 0
                                                cannogenin + 0
                                                cardanolide glycoside + 0
                                                diginatigenin + 0
                                                digitoxigenin + 2
                                                digoxigenin + 0
                                                gitoxigenin + 2
                                                ouabagenin + 0
                                                sarmentogenin + 0
                                                sarmentologenin + 0
                                                strophanthidin + 0
paths to the root