Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:5beta-cholestane
go back to main search page
Accession:CHEBI:35517 term browser browse the term
Definition:A cholestane that has formula C27H48.
Synonyms:related_synonym: Formula=C27H48;   InChI=1S/C27H48/c1-19(2)9-8-10-20(3)23-14-15-24-22-13-12-21-11-6-7-17-26(21,4)25(22)16-18-27(23,24)5/h19-25H,6-18H2,1-5H3/t20-,21+,22+,23-,24+,25+,26+,27-/m1/s1;   InChIKey=XIIAYQZJNBULGD-CJPSHIORSA-N;   SMILES=[H][C@@]12CCCC[C@]1(C)[C@@]1([H])CC[C@]3(C)[C@]([H])(CC[C@@]3([H])[C@]1([H])CC2)[C@H](C)CCCC(C)C;   beta-cholestane;   coprostane;   pseudocholestane
 xref: Beilstein:2051807 "Beilstein";   CAS:481-20-9 "NIST Chemistry WebBook";   LIPID_MAPS_instance:LMST01010085 "LIPID MAPS"


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
20-hydroxyecdysone term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Akt1 AKT serine/threonine kinase 1 JBrowse link 6 137,218,398 137,239,970 RGD:6480464
G Casp3 caspase 3 JBrowse link 16 48,845,011 48,863,249 RGD:6480464
G Gsk3b glycogen synthase kinase 3 beta JBrowse link 11 65,060,884 65,208,842 RGD:6480464
G Hmox1 heme oxygenase 1 JBrowse link 19 14,508,634 14,515,455 RGD:6480464
G Hspa5 heat shock protein family A (Hsp70) member 5 JBrowse link 3 13,838,304 13,842,763 RGD:6480464
G Nfe2l2 nuclear factor, erythroid 2-like 2 JBrowse link 3 62,497,568 62,525,146 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19669
    chemical entity 19667
      atom 19665
        nonmetal atom 19531
          carbon atom 19420
            organic molecular entity 19420
              lipid 16950
                steroid 12767
                  steroid fundamental parent 12390
                    cholestane 328
                      5beta-cholestane 6
                        2,22,25-trideoxyecdysone 0
                        2-deoxyecdysone 0
                        25-deoxyecdysone 0
                        3alpha,7alpha,12alpha,24-tetrahydroxy-5beta-cholestan-26-oic acid + 0
                        3alpha,7alpha,12alpha-trihydroxy-5beta-cholestan-26-al + 0
                        3alpha,7alpha,12alpha-trihydroxy-5beta-cholestan-26-oic acid + 0
                        3alpha,7alpha,24-trihydroxy-5beta-cholestan-26-al + 0
                        3alpha,7alpha,24-trihydroxy-5beta-cholestan-26-oic acid + 0
                        3alpha,7alpha-dihydroxy-5beta-cholestan-26-al 0
                        3alpha,7alpha-dihydroxy-5beta-cholestan-26-oic acid + 0
                        3alpha,7beta-dihydroxy-5beta-cholest-24-en-26-oic acid 0
                        5,6beta-epoxy-5beta-cholestan-3beta-ol 0
                        5,6beta-epoxy-5beta-cholestane 0
                        5beta-cholest-7-ene 0
                        5beta-cholestan-3-one 0
                        5beta-cholestane-3alpha,7alpha,12alpha,24,26-pentol + 0
                        5beta-cholestane-3alpha,7alpha,12alpha,24-tetrol + 0
                        5beta-cholestane-3alpha,7alpha,12alpha,26-tetrol + 0
                        5beta-cholestane-3alpha,7alpha,12alpha-triol 0
                        5beta-cholestane-3alpha,7alpha,24,26-tetrol + 0
                        5beta-cholestane-3alpha,7alpha,24-triol + 0
                        5beta-cholestane-3alpha,7alpha,26-triol 0
                        5beta-cholestane-3alpha,7alpha-diol 0
                        5beta-cyprinol + 0
                        5beta-scymnol + 0
                        7alpha,12alpha,24-trihydroxy-5beta-cholestan-3-one + 0
                        7alpha,12alpha,26-trihydroxy-5beta-cholestan-3-one 0
                        7alpha,12alpha-dihydroxy-5beta-cholestan-3-one 0
                        7alpha,24-dihydroxy-5beta-cholestan-3-one + 0
                        7alpha,26-dihydroxy-5beta-cholestan-3-one 0
                        7alpha-hydroxy-5beta-cholestan-3-one 0
                        coprostanol + 0
                        ecdysone + 6
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19669
    subatomic particle 19665
      composite particle 19665
        hadron 19665
          baryon 19665
            nucleon 19665
              atomic nucleus 19665
                atom 19665
                  main group element atom 19545
                    p-block element atom 19545
                      carbon group element atom 19428
                        carbon atom 19420
                          organic molecular entity 19420
                            organic molecule 19343
                              organic cyclic compound 19093
                                organic polycyclic compound 16028
                                  steroid 12767
                                    steroid fundamental parent 12390
                                      cholestane 328
                                        5beta-cholestane 6
                                          2,22,25-trideoxyecdysone 0
                                          2-deoxyecdysone 0
                                          25-deoxyecdysone 0
                                          3alpha,7alpha,12alpha,24-tetrahydroxy-5beta-cholestan-26-oic acid + 0
                                          3alpha,7alpha,12alpha-trihydroxy-5beta-cholestan-26-al + 0
                                          3alpha,7alpha,12alpha-trihydroxy-5beta-cholestan-26-oic acid + 0
                                          3alpha,7alpha,24-trihydroxy-5beta-cholestan-26-al + 0
                                          3alpha,7alpha,24-trihydroxy-5beta-cholestan-26-oic acid + 0
                                          3alpha,7alpha-dihydroxy-5beta-cholestan-26-al 0
                                          3alpha,7alpha-dihydroxy-5beta-cholestan-26-oic acid + 0
                                          3alpha,7beta-dihydroxy-5beta-cholest-24-en-26-oic acid 0
                                          5,6beta-epoxy-5beta-cholestan-3beta-ol 0
                                          5,6beta-epoxy-5beta-cholestane 0
                                          5beta-cholest-7-ene 0
                                          5beta-cholestan-3-one 0
                                          5beta-cholestane-3alpha,7alpha,12alpha,24,26-pentol + 0
                                          5beta-cholestane-3alpha,7alpha,12alpha,24-tetrol + 0
                                          5beta-cholestane-3alpha,7alpha,12alpha,26-tetrol + 0
                                          5beta-cholestane-3alpha,7alpha,12alpha-triol 0
                                          5beta-cholestane-3alpha,7alpha,24,26-tetrol + 0
                                          5beta-cholestane-3alpha,7alpha,24-triol + 0
                                          5beta-cholestane-3alpha,7alpha,26-triol 0
                                          5beta-cholestane-3alpha,7alpha-diol 0
                                          5beta-cyprinol + 0
                                          5beta-scymnol + 0
                                          7alpha,12alpha,24-trihydroxy-5beta-cholestan-3-one + 0
                                          7alpha,12alpha,26-trihydroxy-5beta-cholestan-3-one 0
                                          7alpha,12alpha-dihydroxy-5beta-cholestan-3-one 0
                                          7alpha,24-dihydroxy-5beta-cholestan-3-one + 0
                                          7alpha,26-dihydroxy-5beta-cholestan-3-one 0
                                          7alpha-hydroxy-5beta-cholestan-3-one 0
                                          coprostanol + 0
                                          ecdysone + 6
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.