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CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:arachidonate
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Accession:CHEBI:32395 term browser browse the term
Definition:A long-chain fatty acid anion resulting from the removal of a proton from the carboxy group of arachidonic acid.
Synonyms:exact_synonym: (5Z,8Z,11Z,14Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate
 related_synonym: (20:4n6);   (5Z,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoate;   Formula=C20H31O2;   InChI=1S/C20H32O2/c1-2-3-4-5-6-7-8-9-10-11-12-13-14-15-16-17-18-19-20(21)22/h6-7,9-10,12-13,15-16H,2-5,8,11,14,17-19H2,1H3,(H,21,22)/p-1/b7-6-,10-9-,13-12-,16-15-;   InChIKey=YZXBAPSDXZZRGB-DOFZRALJSA-M;   SMILES=CCCCC\\C=C/C\\C=C/C\\C=C/C\\C=C/CCCC([O-])=O
 alt_id: CHEBI:13852;   CHEBI:22607
 xref: Beilstein:5439048;   Gmelin:419207;   MetaCyc:ARACHIDONIC_ACID;   PMID:18772128
 cyclic_relationship: is_conjugate_base_of CHEBI:15843


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triarachidonin term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Scd stearoyl-CoA desaturase decreases expression
multiple interactions
ISO Triarachidonin results in decreased expression of SCD1 mRNA
Clofibrate inhibits the reaction [Triarachidonin results in decreased expression of SCD1 mRNA]
CTD PMID:8729090 PMID:8790349 NCBI chr 1:264,159,966...264,173,061
Ensembl chr 1:264,160,129...264,172,729
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Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19770
    chemical entity 19770
      molecular entity 19768
        ion 15934
          anion 14953
            organic anion 3032
              carboxylic acid anion 2392
                icosanoid anion 1
                  arachidonate 1
                    10-HETE(1-) 0
                    11,12-EET(1-) + 0
                    13-HETE(1-) + 0
                    19-HETE(1-) 0
                    2-arachidonoyl-sn-glycero-3-phosphate(2-) 0
                    20-HETE(1-) 0
                    20-oxoarachidonate 0
                    7-HETE(1-) 0
                    8(S),15(S)-DiHPETE(1-) 0
                    8-HPETE(1-) + 0
                    N-arachidonoyl-L-alaninate 0
                    N-arachidonoyl-L-serine(1-) 0
                    S-arachidonoyl-4'-phosphopantetheine(2-) 0
                    S-arachidonoyl-L-cysteine group 0
                    triarachidonin 1
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19770
    subatomic particle 19768
      composite particle 19768
        hadron 19768
          baryon 19768
            nucleon 19768
              atomic nucleus 19768
                atom 19768
                  main group element atom 19662
                    p-block element atom 19662
                      carbon group element atom 19580
                        carbon atom 19571
                          organic molecular entity 19571
                            organic ion 8447
                              organic anion 3032
                                carboxylic acid anion 2392
                                  monocarboxylic acid anion 1496
                                    fatty acid anion 103
                                      unsaturated fatty acid anion 1
                                        polyunsaturated fatty acid anion 1
                                          HPETE anion 1
                                            11-HPETE(1-) 1
                                              arachidonate 1
                                                10-HETE(1-) 0
                                                11,12-EET(1-) + 0
                                                13-HETE(1-) + 0
                                                19-HETE(1-) 0
                                                2-arachidonoyl-sn-glycero-3-phosphate(2-) 0
                                                20-HETE(1-) 0
                                                20-oxoarachidonate 0
                                                7-HETE(1-) 0
                                                8(S),15(S)-DiHPETE(1-) 0
                                                8-HPETE(1-) + 0
                                                N-arachidonoyl-L-alaninate 0
                                                N-arachidonoyl-L-serine(1-) 0
                                                S-arachidonoyl-4'-phosphopantetheine(2-) 0
                                                S-arachidonoyl-L-cysteine group 0
                                                triarachidonin 1
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