Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:N-acylphytosphingosine
go back to main search page
Accession:CHEBI:31998 term browser browse the term
Definition:A ceramide that is phytosphingosine having a fatty acyl group attached to the nitrogen.
Synonyms:exact_synonym: N-[(2S,3S,4R)-1,3,4-trihydroxyoctadecan-2-yl]alkanamide
 related_synonym: Ceramide II;   Formula=C19H38NO4R;   N-acyl-4-hydroxysphinganine;   N-acylphytosphingosines;   Phytoceramide;   SMILES=CCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)NC([*])=O;   an N-acyl-(4R)-4-hydroxysphinganine;   phytoceramides
 alt_id: CHEBI:50933
 xref: KEGG:C12145;   LIPID_MAPS_instance:LMSP01030000


show annotations for term's descendants           Sort by:
 
1-O-(alpha-D-galactosyl)-N-hexacosanoylphytosphingosine term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Cxcl10 C-X-C motif chemokine ligand 10 increases expression ISO KRN 7000 results in increased expression of CXCL10 protein CTD PMID:15867097 NCBI chr14:17,210,733...17,212,930
Ensembl chr14:17,210,733...17,212,930
JBrowse link
G Il12b interleukin 12B increases expression ISO KRN 7000 results in increased expression of IL12B protein CTD PMID:15867097 NCBI chr10:30,034,447...30,048,774
Ensembl chr10:30,038,709...30,048,085
JBrowse link

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19816
    role 19764
      application 19426
        refrigerant 17439
          ammonia 16959
            organic amino compound 16958
              amino alcohol 883
                phytosphingosine 10
                  N-acylphytosphingosine 2
                    (2S,3S,4R,9E)-1,3,4-trihydroxyl-2-[(2'R)-2'-hydroxytetracosanoylamino]-9-octadecene 0
                    (4R)-N-(2,3-dihydroxytetracosanoyl)-4-hydroxysphinganine + 0
                    N-(1,2-saturated acyl)phytosphingosine 0
                    N-(13Z-docosenoyl)-phytosphingosine 0
                    N-(2,3-dihydroxyhexacosanoyl)-(4R)-hydroxysphinganine + 0
                    N-(2-hydroxydocosanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                    N-(2-hydroxyeicosanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                    N-(2-hydroxyhexacosanoyl)phytosphingosine + 0
                    N-(2-hydroxyhexadecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                    N-(2-hydroxyoctacosanoyl)phytosphingosine 0
                    N-(2-hydroxyoctadecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                    N-(2-hydroxytetracosanoyl)phytosphingosine + 0
                    N-(2-hydroxytetradecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                    N-(2-hydroxytricontanoyl)phytosphingosine 0
                    N-[(R)-2-hydroxyacyl]phytosphingosine 0
                    N-acylphytosphingosine-1-phosphoethanolamine + 0
                    N-acylphytosphingosine-1-phosphoethanolamine zwitterion + 0
                    N-arachidonoylphytosphingosine 0
                    N-docosanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                    N-dodecanoylphytosphingosine 0
                    N-eicosanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                    N-hexacosanoylphytosphingosine + 0
                    N-hexadecanoylphytosphingosine + 0
                    N-icosenoylphytosphingosine + 0
                    N-octacosanoylphytosphingosine 0
                    N-octadecanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                    N-octanoylphytosphingosine 0
                    N-oleoylphytosphingosine 0
                    N-tetracosanoylphytosphingosine + 0
                    N-tetradecanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                    N-triacontanoyphytosphingosine 0
                    benjaminamide 0
                    glycophytoceramide + 2
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19816
    subatomic particle 19814
      composite particle 19814
        hadron 19814
          baryon 19814
            nucleon 19814
              atomic nucleus 19814
                atom 19814
                  main group element atom 19702
                    p-block element atom 19702
                      carbon group element atom 19608
                        carbon atom 19597
                          organic molecular entity 19597
                            organic group 18537
                              organic divalent group 18530
                                organodiyl group 18530
                                  carbonyl group 18436
                                    carbonyl compound 18436
                                      carboxylic acid 18114
                                        carboacyl group 17372
                                          univalent carboacyl group 17372
                                            carbamoyl group 17158
                                              carboxamide 17158
                                                ceramide 107
                                                  N-acylsphingoid 84
                                                    phytoceramide 2
                                                      N-acylphytosphingosine 2
                                                        (2S,3S,4R,9E)-1,3,4-trihydroxyl-2-[(2'R)-2'-hydroxytetracosanoylamino]-9-octadecene 0
                                                        (4R)-N-(2,3-dihydroxytetracosanoyl)-4-hydroxysphinganine + 0
                                                        N-(1,2-saturated acyl)phytosphingosine 0
                                                        N-(13Z-docosenoyl)-phytosphingosine 0
                                                        N-(2,3-dihydroxyhexacosanoyl)-(4R)-hydroxysphinganine + 0
                                                        N-(2-hydroxydocosanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                                                        N-(2-hydroxyeicosanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                                                        N-(2-hydroxyhexacosanoyl)phytosphingosine + 0
                                                        N-(2-hydroxyhexadecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                                                        N-(2-hydroxyoctacosanoyl)phytosphingosine 0
                                                        N-(2-hydroxyoctadecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                                                        N-(2-hydroxytetracosanoyl)phytosphingosine + 0
                                                        N-(2-hydroxytetradecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                                                        N-(2-hydroxytricontanoyl)phytosphingosine 0
                                                        N-[(R)-2-hydroxyacyl]phytosphingosine 0
                                                        N-acylphytosphingosine-1-phosphoethanolamine + 0
                                                        N-acylphytosphingosine-1-phosphoethanolamine zwitterion + 0
                                                        N-arachidonoylphytosphingosine 0
                                                        N-docosanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                                                        N-dodecanoylphytosphingosine 0
                                                        N-eicosanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                                                        N-hexacosanoylphytosphingosine + 0
                                                        N-hexadecanoylphytosphingosine + 0
                                                        N-icosenoylphytosphingosine + 0
                                                        N-octacosanoylphytosphingosine 0
                                                        N-octadecanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                                                        N-octanoylphytosphingosine 0
                                                        N-oleoylphytosphingosine 0
                                                        N-tetracosanoylphytosphingosine + 0
                                                        N-tetradecanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                                                        N-triacontanoyphytosphingosine 0
                                                        benjaminamide 0
                                                        glycophytoceramide + 2
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.