Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:N-acylphytosphingosine
go back to main search page
Accession:CHEBI:31998 term browser browse the term
Definition:A ceramide that is phytosphingosine having a fatty acyl group attached to the nitrogen.
Synonyms:exact_synonym: N-[(2S,3S,4R)-1,3,4-trihydroxyoctadecan-2-yl]alkanamide
 related_synonym: Ceramide II;   Formula=C19H38NO4R;   N-acyl-4-hydroxysphinganine;   N-acylphytosphingosines;   Phytoceramide;   SMILES=CCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)NC([*])=O;   an N-acyl-(4R)-4-hydroxysphinganine;   phytoceramides
 alt_id: CHEBI:50933
 xref: KEGG:C12145;   LIPID_MAPS_instance:LMSP01030000


show annotations for term's descendants           Sort by:
 
1-O-(alpha-D-galactosyl)-N-hexacosanoylphytosphingosine term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Cxcl10 C-X-C motif chemokine ligand 10 increases expression ISO KRN 7000 results in increased expression of CXCL10 protein CTD PMID:15867097 NCBI chr14:15,704,772...15,706,969
Ensembl chr14:15,704,758...15,706,975
JBrowse link
G Il12b interleukin 12B increases expression ISO KRN 7000 results in increased expression of IL12B protein CTD PMID:15867097 NCBI chr10:28,888,832...28,903,796
Ensembl chr10:28,893,008...28,902,903
JBrowse link

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19821
    chemical entity 19821
      atom 19819
        nonmetal atom 19707
          carbon atom 19630
            organic molecular entity 19630
              beta-galactosylceramide 10
                N-acyl-beta-D-galactosylphytosphingosine 10
                  N-acylphytosphingosine 2
                    (2S,3S,4R,9E)-1,3,4-trihydroxyl-2-[(2'R)-2'-hydroxytetracosanoylamino]-9-octadecene 0
                    (4R)-N-(2,3-dihydroxytetracosanoyl)-4-hydroxysphinganine + 0
                    2-Hydroxy-N-(1,3,4-trihydroxy-2-octadecanyl)docosanamide 0
                    Man-alpha-1->6-Ins-1-P-Cer(t18:0)(1-) 0
                    N-(1,2-saturated acyl)phytosphingosine 0
                    N-(13Z-docosenoyl)-phytosphingosine 0
                    N-(2,3-dihydroxyhexacosanoyl)-(4R)-hydroxysphinganine + 0
                    N-(2-hydroxydocosanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                    N-(2-hydroxyeicosanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                    N-(2-hydroxyhexacosanoyl)phytosphingosine + 0
                    N-(2-hydroxyhexadecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                    N-(2-hydroxyoctacosanoyl)phytosphingosine 0
                    N-(2-hydroxyoctadecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                    N-(2-hydroxytetracosanoyl)phytosphingosine + 0
                    N-(2-hydroxytetradecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                    N-(2-hydroxytricontanoyl)phytosphingosine 0
                    N-(2R-Hydroxyhexacosanoyl)-2S-amino-1,3S,4R-octadecanetriol 0
                    N-[(R)-2-hydroxyacyl]phytosphingosine 0
                    N-acylphytosphingosine-1-phosphoethanolamine + 0
                    N-acylphytosphingosine-1-phosphoethanolamine zwitterion + 0
                    N-arachidonoylphytosphingosine 0
                    N-docosanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                    N-dodecanoylphytosphingosine 0
                    N-eicosanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                    N-hexacosanoylphytosphingosine + 0
                    N-hexadecanoylphytosphingosine + 0
                    N-icosenoylphytosphingosine + 0
                    N-octacosanoylphytosphingosine 0
                    N-octadecanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                    N-octanoylphytosphingosine 0
                    N-oleoylphytosphingosine 0
                    N-tetracosanoylphytosphingosine + 0
                    N-tetradecanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                    N-triacontanoyphytosphingosine 0
                    benjaminamide 0
                    glycophytoceramide + 2
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19821
    subatomic particle 19819
      composite particle 19819
        hadron 19819
          baryon 19819
            nucleon 19819
              atomic nucleus 19819
                atom 19819
                  main group element atom 19716
                    p-block element atom 19716
                      carbon group element atom 19640
                        carbon atom 19630
                          organic molecular entity 19630
                            organic group 18737
                              organic divalent group 18728
                                organodiyl group 18728
                                  carbonyl group 18675
                                    carbonyl compound 18675
                                      carboxylic acid 18373
                                        carboacyl group 17485
                                          univalent carboacyl group 17485
                                            carbamoyl group 17299
                                              carboxamide 17299
                                                ceramide 111
                                                  cerebroside 20
                                                    galactosylceramide 20
                                                      beta-galactosylceramide 10
                                                        N-acyl-beta-D-galactosylphytosphingosine 10
                                                          phytosphingosine 10
                                                            N-acylphytosphingosine 2
                                                              (2S,3S,4R,9E)-1,3,4-trihydroxyl-2-[(2'R)-2'-hydroxytetracosanoylamino]-9-octadecene 0
                                                              (4R)-N-(2,3-dihydroxytetracosanoyl)-4-hydroxysphinganine + 0
                                                              2-Hydroxy-N-(1,3,4-trihydroxy-2-octadecanyl)docosanamide 0
                                                              Man-alpha-1->6-Ins-1-P-Cer(t18:0)(1-) 0
                                                              N-(1,2-saturated acyl)phytosphingosine 0
                                                              N-(13Z-docosenoyl)-phytosphingosine 0
                                                              N-(2,3-dihydroxyhexacosanoyl)-(4R)-hydroxysphinganine + 0
                                                              N-(2-hydroxydocosanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                                                              N-(2-hydroxyeicosanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                                                              N-(2-hydroxyhexacosanoyl)phytosphingosine + 0
                                                              N-(2-hydroxyhexadecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                                                              N-(2-hydroxyoctacosanoyl)phytosphingosine 0
                                                              N-(2-hydroxyoctadecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                                                              N-(2-hydroxytetracosanoyl)phytosphingosine + 0
                                                              N-(2-hydroxytetradecanoyl)-4-hydroxysphinganine 0
                                                              N-(2-hydroxytricontanoyl)phytosphingosine 0
                                                              N-(2R-Hydroxyhexacosanoyl)-2S-amino-1,3S,4R-octadecanetriol 0
                                                              N-[(R)-2-hydroxyacyl]phytosphingosine 0
                                                              N-acylphytosphingosine-1-phosphoethanolamine + 0
                                                              N-acylphytosphingosine-1-phosphoethanolamine zwitterion + 0
                                                              N-arachidonoylphytosphingosine 0
                                                              N-docosanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                                                              N-dodecanoylphytosphingosine 0
                                                              N-eicosanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                                                              N-hexacosanoylphytosphingosine + 0
                                                              N-hexadecanoylphytosphingosine + 0
                                                              N-icosenoylphytosphingosine + 0
                                                              N-octacosanoylphytosphingosine 0
                                                              N-octadecanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                                                              N-octanoylphytosphingosine 0
                                                              N-oleoylphytosphingosine 0
                                                              N-tetracosanoylphytosphingosine + 0
                                                              N-tetradecanoyl-4-hydroxysphinganine 0
                                                              N-triacontanoyphytosphingosine 0
                                                              benjaminamide 0
                                                              glycophytoceramide + 2
paths to the root