Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   


Term:cyclic ADP-ribose
go back to main search page
Accession:CHEBI:31445 term browser browse the term
Definition:A cyclic purine nucleotide that is synthesised from NAD+ by ADP-ribosyl cyclase; acts as an agonist at ryanodine receptors.
Synonyms:related_synonym: E-NAD;   Enzyme-activated NAD;   Formula=C15H21N5O13P2;   InChI=1S/C15H21N5O13P2/c16-12-7-13-18-4-19(12)14-10(23)8(21)5(31-14)1-29-34(25,26)33-35(27,28)30-2-6-9(22)11(24)15(32-6)20(13)3-17-7/h3-6,8-11,14-16,21-24H,1-2H2,(H,25,26)(H,27,28)/t5-,6-,8-,9-,10-,11-,14-,15-/m1/s1;   InChIKey=BQOHYSXSASDCEA-KEOHHSTQSA-N;   SMILES=O[C@@H]1[C@H]2COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]3O[C@H]([C@H](O)[C@@H]3O)n3cnc4n(cnc4c3=N)[C@H](O2)[C@@H]1O;   cADPR;   cyclic ADP-D-ribose;   cyclic adenosine diphosphate ribose
 xref: CAS:119340-53-3 "ChemIDplus";   CAS:119340-53-3 "KEGG COMPOUND";   KEGG:C13050
 xref_mesh: MESH:D036563
 xref: MetaCyc:CPD-14880;   PMID:21176119 "Europe PMC";   PMID:22274607 "Europe PMC";   PMID:22422046 "Europe PMC";   PMID:22547068 "Europe PMC";   PMID:22677461 "Europe PMC";   PMID:22822066 "Europe PMC";   PMID:22995315 "Europe PMC";   PMID:23183877 "Europe PMC";   PMID:23218671 "Europe PMC";   PMID:23343681 "Europe PMC";   Patent:US2005065109;   Patent:US2005276762;   Patent:WO2006120681;   Reaxys:7064766 "Reaxys";   Wikipedia:CADPR
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:73672

show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
cyclic ADP-ribose term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Cd38 CD38 molecule JBrowse link 14 71,714,768 71,754,990 RGD:6480464
G Homer1 homer scaffold protein 1 JBrowse link 2 22,909,550 23,012,303 RGD:6480464
G Ryr2 ryanodine receptor 2 JBrowse link 17 65,533,998 65,955,606 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19669
    role 19613
      biological role 19611
        biochemical role 19138
          metabolite 19106
            cyclic ADP-ribose 3
              2'-phospho-cyclic ADP-ribose 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19669
    subatomic particle 19665
      composite particle 19665
        hadron 19665
          baryon 19665
            nucleon 19665
              atomic nucleus 19665
                atom 19665
                  main group element atom 19545
                    p-block element atom 19545
                      chalcogen 19233
                        oxygen atom 19188
                          oxygen molecular entity 19188
                            hydroxides 18965
                              oxoacid 18076
                                pnictogen oxoacid 8534
                                  phosphorus oxoacid 8429
                                    phosphoric acids 7314
                                      phosphoric acid 7314
                                        phosphoric acid derivative 6965
                                          phosphate 6965
                                            organic phosphate 6964
                                              carbohydrate phosphate 1496
                                                phospho sugar 1431
                                                  aldose phosphate 1429
                                                    aldopentose phosphate 1423
                                                      ribose phosphate 1417
                                                        ribonucleotide 1376
                                                          purine ribonucleotide 1349
                                                            adenyl ribonucleotide 1229
                                                              adenosine phosphate 245
                                                                adenosine 5'-phosphate 244
                                                                  ADP 80
                                                                    ADP-sugar 6
                                                                      ADP-D-ribose 6
                                                                        cyclic ADP-ribose 3
                                                                          2'-phospho-cyclic ADP-ribose 0
paths to the root


RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.