Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:prostaglandin F1alpha
go back to main search page
Accession:CHEBI:28852 term browser browse the term
Definition:A prostaglandins Falpha that has formula C20H36O5.
Synonyms:exact_synonym: (13E,15S)-9alpha,11alpha,15-trihydroxyprost-13-en-1-oic acid
 related_synonym: (13E,15S)-9alpha,11alpha-9,11,15-Trihydroxyprost-13-en-1-oic acid;   Formula=C20H36O5;   InChI=1S/C20H36O5/c1-2-3-6-9-15(21)12-13-17-16(18(22)14-19(17)23)10-7-4-5-8-11-20(24)25/h12-13,15-19,21-23H,2-11,14H2,1H3,(H,24,25)/b13-12+/t15-,16+,17+,18-,19+/m0/s1;   InChIKey=DZUXGQBLFALXCR-CDIPTNKSSA-N;   PGF 1-alpha;   Prostaglandin F1;   Prostaglandin f1-alpha;   SMILES=CCCCC[C@H](O)\\C=C\\[C@H]1[C@H](O)C[C@H](O)[C@@H]1CCCCCCC(O)=O
 alt_id: CHEBI:26325;   CHEBI:8515
 xref: CAS:745-62-0 "ChemIDplus";   CAS:745-62-0 "KEGG COMPOUND";   KEGG:C06475;   LIPID_MAPS_instance:LMFA03010137 "LIPID MAPS"
 xref_mesh: MESH:C100006


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
prostaglandin F1alpha term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Ptgr1 prostaglandin reductase 1 JBrowse link 5 76,110,746 76,129,361 RGD:6480464
G Ptgs2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 JBrowse link 13 67,351,230 67,356,920 RGD:6480464
6-oxoprostaglandin F1alpha term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Agt angiotensinogen JBrowse link 19 57,321,594 57,333,460 RGD:6480464
G Alox15 arachidonate 15-lipoxygenase JBrowse link 10 56,953,692 56,962,145 RGD:6480464
G Apoe apolipoprotein E JBrowse link 1 80,612,894 80,616,820 RGD:6480464
G Avp arginine vasopressin JBrowse link 3 123,117,482 123,119,460 RGD:6480464
G Bdkrb2 bradykinin receptor B2 JBrowse link 6 129,399,468 129,429,676 RGD:6480464
G Calca calcitonin-related polypeptide alpha JBrowse link 1 184,184,018 184,188,922 RGD:6480464
G Klkb1 kallikrein B1 JBrowse link 16 50,151,127 50,175,407 RGD:6480464
G Kng2 kininogen 2 JBrowse link 11 81,509,185 81,516,759 RGD:6480464
G Nos2 nitric oxide synthase 2 JBrowse link 10 66,188,290 66,221,621 RGD:6480464
G Ptgis prostaglandin I2 synthase JBrowse link 3 163,950,746 163,986,129 RGD:6480464
G Ptgs2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 JBrowse link 13 67,351,230 67,356,920 RGD:6480464
G Tnf tumor necrosis factor JBrowse link 20 5,189,382 5,192,000 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19654
    role 19598
      biological role 19596
        biochemical role 19125
          metabolite 19093
            eukaryotic metabolite 18735
              animal metabolite 18475
                mammalian metabolite 18457
                  human metabolite 18120
                    prostaglandin F1alpha 13
                      13,14-dihydro-15-keto-PGF1alpha 0
                      15-ketoprostaglandin F1alpha 0
                      2,3-dinor-6-oxoprostaglandin F1alpha + 0
                      2,3-dinor-8-epi-prostaglandin F1alpha 0
                      6,15-diketo,13,14-dihydroprostaglandin F1alpha 0
                      6-oxoprostaglandin F1alpha 12
                      prostaglandin F1alpha alcohol 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19654
    subatomic particle 19650
      composite particle 19650
        hadron 19650
          baryon 19650
            nucleon 19650
              atomic nucleus 19650
                atom 19650
                  main group element atom 19531
                    p-block element atom 19531
                      carbon group element atom 19413
                        carbon atom 19405
                          organic molecular entity 19405
                            organic group 18331
                              organic divalent group 18321
                                organodiyl group 18321
                                  carbonyl group 18209
                                    carbonyl compound 18209
                                      carboxylic acid 17908
                                        monocarboxylic acid 17245
                                          fatty acid 15807
                                            fatty acid derivative 1008
                                              icosanoid 450
                                                prostanoid 393
                                                  prostaglandin 388
                                                    prostaglandins F 97
                                                      prostaglandins Falpha 96
                                                        prostaglandin F1alpha 13
                                                          13,14-dihydro-15-keto-PGF1alpha 0
                                                          15-ketoprostaglandin F1alpha 0
                                                          2,3-dinor-6-oxoprostaglandin F1alpha + 0
                                                          2,3-dinor-8-epi-prostaglandin F1alpha 0
                                                          6,15-diketo,13,14-dihydroprostaglandin F1alpha 0
                                                          6-oxoprostaglandin F1alpha 12
                                                          prostaglandin F1alpha alcohol 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.