Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:decanoyl-CoA
go back to main search page
Accession:CHEBI:28493 term browser browse the term
Definition:A medium-chain fatty acyl-CoA that results from the formal condensation of the thiol group of coenzyme A with the carboxy group of decanoic acid.
Synonyms:exact_synonym: 3'-phosphoadenosine 5'-(3-{(3R)-4-[(3-{[2-(decanoylsulfanyl)ethyl]amino}-3-oxopropyl)amino]-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4-oxobutyl} dihydrogen diphosphate)
 related_synonym: 10:0-CoA;   C10:0-CoA;   Coenzyme A, S-decanoate;   Decanoyl-coenzyme A;   Formula=C31H54N7O17P3S;   InChI=1S/C31H54N7O17P3S/c1-4-5-6-7-8-9-10-11-22(40)59-15-14-33-21(39)12-13-34-29(43)26(42)31(2,3)17-52-58(49,50)55-57(47,48)51-16-20-25(54-56(44,45)46)24(41)30(53-20)38-19-37-23-27(32)35-18-36-28(23)38/h18-20,24-26,30,41-42H,4-17H2,1-3H3,(H,33,39)(H,34,43)(H,47,48)(H,49,50)(H2,32,35,36)(H2,44,45,46)/t20-,24-,25-,26+,30-/m1/s1;   InChIKey=CNKJPHSEFDPYDB-HSJNEKGZSA-N;   SMILES=CCCCCCCCCC(=O)SCCNC(=O)CCNC(=O)[C@H](O)C(C)(C)COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1OP(O)(O)=O)n1cnc2c(N)ncnc12;   capryl-CoA;   capryl-coenzyme A
 alt_id: CHEBI:23575;   CHEBI:4348
 xref: CAS:1264-57-9 "ChemIDplus";   HMDB:HMDB0006404;   KEGG:C05274;   LIPID_MAPS_instance:LMFA07050022 "LIPID MAPS"
 xref_mesh: MESH:C045561
 xref: PMID:1422210 "Europe PMC";   PMID:21175 "Europe PMC";   PMID:2178686 "Europe PMC";   PMID:3729425 "Europe PMC";   PMID:4147365 "Europe PMC";   Reaxys:8033370 "Reaxys"
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:61430


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
decanoyl-CoA term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Hsdl2 hydroxysteroid dehydrogenase like 2 JBrowse link 5 76,812,881 76,848,853 RGD:6480464
G Pecr peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase JBrowse link 9 79,601,937 79,630,547 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19716
    role 19663
      application 19308
        anti-inflammatory agent 14938
          decanoic acid 78
            decanoyl-CoA 2
              3-oxodecanoyl-CoA 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19716
    subatomic particle 19712
      composite particle 19712
        hadron 19712
          baryon 19712
            nucleon 19712
              atomic nucleus 19712
                atom 19712
                  main group element atom 19598
                    p-block element atom 19598
                      chalcogen 19301
                        oxygen atom 19261
                          oxygen molecular entity 19261
                            hydroxides 19013
                              oxoacid 18094
                                pnictogen oxoacid 9848
                                  phosphorus oxoacid 8669
                                    phosphoric acids 7336
                                      phosphoric acid 7336
                                        phosphoric acid derivative 6985
                                          phosphate 6985
                                            organic phosphate 6984
                                              carbohydrate phosphate 1506
                                                phospho sugar 1441
                                                  aldose phosphate 1439
                                                    aldopentose phosphate 1433
                                                      ribose phosphate 1427
                                                        ribonucleotide 1386
                                                          purine ribonucleotide 1359
                                                            adenyl ribonucleotide 1237
                                                              adenosine phosphate 247
                                                                adenosine 5'-phosphate 246
                                                                  ADP 81
                                                                    coenzyme A 28
                                                                      acyl-CoA 28
                                                                        fatty acyl-CoA 16
                                                                          medium-chain fatty acyl-CoA 3
                                                                            decanoyl-CoA 2
                                                                              3-oxodecanoyl-CoA 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.