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ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:dUMP
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Accession:CHEBI:17622 term browser browse the term
Definition:A pyrimidine 2'-deoxyribonucleoside 5'-monophosphate having uracil as the nucleobase.
Synonyms:exact_synonym: 2'-deoxy-5'-uridylic acid
 related_synonym: 2'-Deoxyuridine 5'-phosphate;   2'-deoxyuridine 5'-monophosphate;   Deoxyuridine 5'-phosphate;   Deoxyuridine monophosphate;   Deoxyuridylic acid;   Formula=C9H13N2O8P;   InChI=1S/C9H13N2O8P/c12-5-3-8(11-2-1-7(13)10-9(11)14)19-6(5)4-18-20(15,16)17/h1-2,5-6,8,12H,3-4H2,(H,10,13,14)(H2,15,16,17)/t5-,6+,8+/m0/s1;   InChIKey=JSRLJPSBLDHEIO-SHYZEUOFSA-N;   SMILES=O[C@H]1C[C@@H](O[C@@H]1COP(O)(O)=O)n1ccc(=O)[nH]c1=O;   deoxyuridylate
 alt_id: CHEBI:10532;   CHEBI:14094;   CHEBI:19263;   CHEBI:42245;   CHEBI:46286;   CHEBI:46288;   CHEBI:47722
 xref: CAS:964-26-1;   DrugBank:DB03800;   HMDB:HMDB0001409;   KEGG:C00365;   KNApSAcK:C00019282
 xref_mesh: MESH:C007267
 xref: MetaCyc:DUMP;   PDBeChem:DU;   PDBeChem:UMP;   PMID:22770225;   PMID:24147825;   Reaxys:42143;   Wikipedia:Deoxyuridine_monophosphate
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:246422


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dUMP term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Abcc5 ATP binding cassette subfamily C member 5 JBrowse link 11 84,395,982 84,490,215 RGD:6480464
G Tyms thymidylate synthetase JBrowse link 9 121,918,875 121,931,564 RGD:6480464

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Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19764
    role 19710
      biological role 19709
        biochemical role 19210
          metabolite 19184
            dUMP 2
              2'-deoxy-5-(4,5-dihydroxypentyl)uridine 5'-monophosphate 0
              5,6-dihydroxy-2'-deoxyuridine 5'-monophosphate 0
              5-carboxy-2'-deoxyuridine 5'-monophosphate 0
              dUMP 3'-end residue 0
              dUMP 5'-end residue 0
              dUMP residue + 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19764
    subatomic particle 19762
      composite particle 19762
        hadron 19762
          baryon 19762
            nucleon 19762
              atomic nucleus 19762
                atom 19762
                  main group element atom 19645
                    p-block element atom 19645
                      chalcogen 19350
                        oxygen atom 19312
                          oxygen molecular entity 19312
                            hydroxides 19065
                              oxoacid 18129
                                pnictogen oxoacid 10114
                                  phosphorus oxoacid 9014
                                    phosphoric acids 7768
                                      phosphoric acid 7768
                                        phosphoric acid derivative 7447
                                          phosphate 7447
                                            organic phosphate 7446
                                              carbohydrate phosphate 1527
                                                phospho sugar 1454
                                                  aldose phosphate 1452
                                                    aldopentose phosphate 1446
                                                      deoxyaldopentose phosphate 9
                                                        2-deoxyribose phosphate 9
                                                          2'-deoxyribonucleotide 8
                                                            2'-deoxyribonucleoside 5'-phosphate 8
                                                              2'-deoxyribonucleoside 5'-monophosphate 3
                                                                pyrimidine 2'-deoxyribonucleoside 5'-monophosphate 3
                                                                  dUMP 2
                                                                    2'-deoxy-5-(4,5-dihydroxypentyl)uridine 5'-monophosphate 0
                                                                    5,6-dihydroxy-2'-deoxyuridine 5'-monophosphate 0
                                                                    5-carboxy-2'-deoxyuridine 5'-monophosphate 0
                                                                    dUMP 3'-end residue 0
                                                                    dUMP 5'-end residue 0
                                                                    dUMP residue + 0
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