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CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:uracil
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Accession:CHEBI:17568 term browser browse the term
Definition:A common and naturally occurring pyrimidine nucleobase in which the pyrimidine ring is substituted with two oxo groups at positions 2 and 4. Found in RNA, it base pairs with adenine and replaces thymine during DNA transcription.
Synonyms:exact_synonym: pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
 related_synonym: 2,4(1H,3H)-pyrimidinedione;   2,4-Pyrimidinedione;   2,4-dioxopyrimidine;   Formula=C4H4N2O2;   InChI=1S/C4H4N2O2/c7-3-1-2-5-4(8)6-3/h1-2H,(H2,5,6,7,8);   InChIKey=ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N;   SMILES=O=c1cc[nH]c(=O)[nH]1;   U;   Ura;   Urazil
 alt_id: CHEBI:15288;   CHEBI:27210;   CHEBI:46375;   CHEBI:9882
 xref: Beilstein:606623;   CAS:66-22-8;   DrugBank:DB03419;   Gmelin:2896;   HMDB:HMDB0000300;   KEGG:C00106;   KEGG:D00027;   KNApSAcK:C00001513
 xref_mesh: MESH:D014498
 xref: MetaCyc:URACIL;   PDBeChem:URA;   PMID:11279060;   PMID:12855717;   PMID:15274295;   PMID:16834123;   PMID:17439666;   PMID:18533995;   PMID:18815805;   PMID:19175333;   PMID:22020693;   PMID:22074393;   PMID:22120518;   PMID:22171528;   PMID:22237209;   PMID:22299724;   PMID:22356544;   PMID:22447672;   PMID:22483865;   PMID:22567906;   PMID:22685418;   PMID:3654008;   Reaxys:606623;   Wikipedia:Uracil
 cyclic_relationship: is_tautomer_of CHEBI:43254



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      CHEBI ontology 19795
        role 19746
          application 19492
            pro-agent 10113
              prodrug 9917
                uracil 5719
                  (5R)-6-hydroxy-5-[4-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]-5-phenyluracil 0
                  (Z)-2-methylureidoacrylic acid 0
                  (\{[(1R,2R)-2-(uracil-1-yl)cyclopentyl]oxy\}methyl)phosphonic acid 0
                  1,3-dimethyluracil 0
                  1,5-dimethyluracil 0
                  1-(3-O-phosphono-beta-D-arabinofuranosyl)uracil 0
                  1-(ethoxymethyl)-5-isopropyl-6-(phenylsulfanyl)uracil 0
                  1-[3-(4-carboxypiperidin-1-yl)-3-deoxy-beta-D-arabinofuranosyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
                  1-methyluracil 0
                  2'-deoxyuridine + 0
                  3,5-dimethyluracil 0
                  3-(5-bromouracil-1-yl)-L-alanine 0
                  3-(5-fluorouracil-1-yl)-L-alanine 1
                  3-(5-iodouracil-1-yl)-L-alanine 0
                  3-(uracil-1-yl)-L-alanine 0
                  3-methyluracil 0
                  4-[(1E,7E)-8-(2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl)-3,6-dioxa-2,7-diazaocta-1,7-dien-1-yl]benzoic acid 0
                  5,6-dihydrouracil 0
                  5,6-dihydroxyuracil 0
                  5-(4,5-dihydroxypentyl)uracil 0
                  5-[3-(benzyloxy)benzyl]-6-hydroxy-1-[(2-hydroxyethoxy)methyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
                  5-acetamido-6-formamido-3-methyluracil 1
                  5-benzyl-1-(2-hydroxyethoxymethyl)uracil 2
                  5-benzyloxybenzylacyclouridine 0
                  5-bromouracil 0
                  5-carboxy-2'-deoxyuridine 0
                  5-chloro-6-\{[(2Z)-2-iminopyrrolidin-1-yl]methyl\}uracil 0
                  5-chlorouracil 2
                  5-diazouracil 0
                  5-fluorouracil 1446
                  5-hydroxymethyluracil + 0
                  5-hydroxyuracil 0
                  5-iodouracil 0
                  5-nitrouracil 0
                  6-(3,5-dimethylbenzyl)-1-(ethoxymethyl)-5-isopropyluracil 0
                  6-[(1,2-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                  6-[(1,3-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                  6-[(1,4-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                  6-[(1,5-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                  6-[(1-deoxy-D-ribityl)methyl]-5-[(1E)-3-oxobut-1-en-1-yl]uracil 0
                  6-[(2-hydroxyethyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                  6-[(3-hydroxypropyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                  6-[(4-hydroxybutyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                  6-[(5-hydroxypentyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                  6-benzyl-1-(benzyloxymethyl)-5-isopropyluracil 0
                  6-cyclohexylsulfanyl-1-ethoxymethyl-5-isopropyluracil 0
                  6-methyl-5-[(1E)-3-oxobut-1-en-1-yl]uracil 0
                  6-methyluracil 0
                  6-propyl-2-thiouracil 4790
                  aminouracil + 0
                  butafenacil 1
                  dasabuvir 0
                  emivirine 0
                  orotate + 0
                  orotic acid + 17
                  saflufenacil 0
                  thiouracil 1
                  tipiracil 0
                  uracil-1-yl group 0
                  uracil-5-carboxylic acid 0
                  uracil-6-ylacetic acid 0
                  uridine + 16
                  uridines + 49
    Path 2
    Term Annotations click to browse term
      CHEBI ontology 19795
        subatomic particle 19794
          composite particle 19794
            hadron 19794
              baryon 19794
                nucleon 19794
                  atomic nucleus 19794
                    atom 19794
                      main group element atom 19693
                        p-block element atom 19693
                          carbon group element atom 19614
                            carbon atom 19604
                              organic molecular entity 19604
                                organic molecule 19545
                                  organic cyclic compound 19339
                                    organic heterocyclic compound 18579
                                      organic heteromonocyclic compound 17121
                                        diazines 12332
                                          pyrimidines 12162
                                            pyrimidine nucleobase 6252
                                              uracil 5719
                                                (5R)-6-hydroxy-5-[4-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]-5-phenyluracil 0
                                                (Z)-2-methylureidoacrylic acid 0
                                                (\{[(1R,2R)-2-(uracil-1-yl)cyclopentyl]oxy\}methyl)phosphonic acid 0
                                                1,3-dimethyluracil 0
                                                1,5-dimethyluracil 0
                                                1-(3-O-phosphono-beta-D-arabinofuranosyl)uracil 0
                                                1-(ethoxymethyl)-5-isopropyl-6-(phenylsulfanyl)uracil 0
                                                1-[3-(4-carboxypiperidin-1-yl)-3-deoxy-beta-D-arabinofuranosyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
                                                1-methyluracil 0
                                                2'-deoxyuridine + 0
                                                3,5-dimethyluracil 0
                                                3-(5-bromouracil-1-yl)-L-alanine 0
                                                3-(5-fluorouracil-1-yl)-L-alanine 1
                                                3-(5-iodouracil-1-yl)-L-alanine 0
                                                3-(uracil-1-yl)-L-alanine 0
                                                3-methyluracil 0
                                                4-[(1E,7E)-8-(2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl)-3,6-dioxa-2,7-diazaocta-1,7-dien-1-yl]benzoic acid 0
                                                5,6-dihydrouracil 0
                                                5,6-dihydroxyuracil 0
                                                5-(4,5-dihydroxypentyl)uracil 0
                                                5-[3-(benzyloxy)benzyl]-6-hydroxy-1-[(2-hydroxyethoxy)methyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
                                                5-acetamido-6-formamido-3-methyluracil 1
                                                5-benzyl-1-(2-hydroxyethoxymethyl)uracil 2
                                                5-benzyloxybenzylacyclouridine 0
                                                5-bromouracil 0
                                                5-carboxy-2'-deoxyuridine 0
                                                5-chloro-6-\{[(2Z)-2-iminopyrrolidin-1-yl]methyl\}uracil 0
                                                5-chlorouracil 2
                                                5-diazouracil 0
                                                5-fluorouracil 1446
                                                5-hydroxymethyluracil + 0
                                                5-hydroxyuracil 0
                                                5-iodouracil 0
                                                5-nitrouracil 0
                                                6-(3,5-dimethylbenzyl)-1-(ethoxymethyl)-5-isopropyluracil 0
                                                6-[(1,2-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                                6-[(1,3-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                                6-[(1,4-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                                6-[(1,5-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                                6-[(1-deoxy-D-ribityl)methyl]-5-[(1E)-3-oxobut-1-en-1-yl]uracil 0
                                                6-[(2-hydroxyethyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                                6-[(3-hydroxypropyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                                6-[(4-hydroxybutyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                                6-[(5-hydroxypentyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                                6-benzyl-1-(benzyloxymethyl)-5-isopropyluracil 0
                                                6-cyclohexylsulfanyl-1-ethoxymethyl-5-isopropyluracil 0
                                                6-methyl-5-[(1E)-3-oxobut-1-en-1-yl]uracil 0
                                                6-methyluracil 0
                                                6-propyl-2-thiouracil 4790
                                                aminouracil + 0
                                                butafenacil 1
                                                dasabuvir 0
                                                emivirine 0
                                                orotate + 0
                                                orotic acid + 17
                                                saflufenacil 0
                                                thiouracil 1
                                                tipiracil 0
                                                uracil-1-yl group 0
                                                uracil-5-carboxylic acid 0
                                                uracil-6-ylacetic acid 0
                                                uridine + 16
                                                uridines + 49
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