Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:uracil
go back to main search page
Accession:CHEBI:17568 term browser browse the term
Definition:A common and naturally occurring pyrimidine nucleobase in which the pyrimidine ring is substituted with two oxo groups at positions 2 and 4. Found in RNA, it base pairs with adenine and replaces thymine during DNA transcription.
Synonyms:exact_synonym: pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
 related_synonym: 2,4(1H,3H)-pyrimidinedione;   2,4-Pyrimidinedione;   2,4-dioxopyrimidine;   Formula=C4H4N2O2;   InChI=1S/C4H4N2O2/c7-3-1-2-5-4(8)6-3/h1-2H,(H2,5,6,7,8);   InChIKey=ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N;   SMILES=O=c1cc[nH]c(=O)[nH]1;   U;   Ura;   Urazil
 alt_id: CHEBI:15288;   CHEBI:27210;   CHEBI:46375;   CHEBI:9882
 xref: Beilstein:606623;   CAS:66-22-8;   DrugBank:DB03419;   Gmelin:2896;   HMDB:HMDB0000300;   KEGG:C00106;   KEGG:D00027;   KNApSAcK:C00001513
 xref_mesh: MESH:D014498
 xref: MetaCyc:URACIL;   PDBeChem:URA;   PMID:11279060;   PMID:12855717;   PMID:15274295;   PMID:16834123;   PMID:17439666;   PMID:18533995;   PMID:18815805;   PMID:19175333;   PMID:22020693;   PMID:22074393;   PMID:22120518;   PMID:22171528;   PMID:22237209;   PMID:22299724;   PMID:22356544;   PMID:22447672;   PMID:22483865;   PMID:22567906;   PMID:22685418;   PMID:3654008;   Reaxys:606623;   Wikipedia:Uracil
 cyclic_relationship: is_tautomer_of CHEBI:43254


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 





Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19758
    role 19705
      application 19359
        pro-agent 8832
          prodrug 8621
            uracil 5645
              (5R)-6-hydroxy-5-[4-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]-5-phenyluracil 0
              (Z)-2-methylureidoacrylic acid 0
              (\{[(1R,2R)-2-(uracil-1-yl)cyclopentyl]oxy\}methyl)phosphonic acid 0
              1,3-dimethyluracil 0
              1,5-dimethyluracil 0
              1-(3-O-phosphono-beta-D-arabinofuranosyl)uracil 0
              1-(ethoxymethyl)-5-isopropyl-6-(phenylsulfanyl)uracil 0
              1-[3-(4-carboxypiperidin-1-yl)-3-deoxy-beta-D-arabinofuranosyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
              1-methyluracil 0
              2'-deoxyuridine + 0
              3,5-dimethyluracil 0
              3-(5-bromouracil-1-yl)-L-alanine 0
              3-(5-fluorouracil-1-yl)-L-alanine 1
              3-(5-iodouracil-1-yl)-L-alanine 0
              3-(uracil-1-yl)-L-alanine 0
              3-methyluracil 0
              4-[(1E,7E)-8-(2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl)-3,6-dioxa-2,7-diazaocta-1,7-dien-1-yl]benzoic acid 0
              5,6-dihydrouracil 0
              5,6-dihydroxyuracil 0
              5-(4,5-dihydroxypentyl)uracil 0
              5-[3-(benzyloxy)benzyl]-6-hydroxy-1-[(2-hydroxyethoxy)methyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
              5-acetamido-6-formamido-3-methyluracil 1
              5-benzyl-1-(2-hydroxyethoxymethyl)uracil 2
              5-benzyloxybenzylacyclouridine 0
              5-bromouracil 0
              5-carboxy-2'-deoxyuridine 0
              5-chloro-6-\{[(2Z)-2-iminopyrrolidin-1-yl]methyl\}uracil 0
              5-chlorouracil 2
              5-diazouracil 0
              5-fluorouracil 1351
              5-hydroxymethyluracil + 0
              5-hydroxyuracil 0
              5-iodouracil 0
              5-nitrouracil 0
              6-(3,5-dimethylbenzyl)-1-(ethoxymethyl)-5-isopropyluracil 0
              6-benzyl-1-(benzyloxymethyl)-5-isopropyluracil 0
              6-cyclohexylsulfanyl-1-ethoxymethyl-5-isopropyluracil 0
              6-methyluracil 0
              6-propyl-2-thiouracil 4789
              aminouracil + 0
              butafenacil 1
              dasabuvir 0
              emivirine 0
              orotate + 0
              orotic acid + 17
              saflufenacil 0
              thiouracil 1
              tipiracil 0
              uracil-1-yl group 0
              uracil-5-carboxylic acid 0
              uracil-6-ylacetic acid 0
              uridine + 15
              uridines + 43
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19758
    subatomic particle 19756
      composite particle 19756
        hadron 19756
          baryon 19756
            nucleon 19756
              atomic nucleus 19756
                atom 19756
                  main group element atom 19641
                    p-block element atom 19641
                      carbon group element atom 19532
                        carbon atom 19521
                          organic molecular entity 19521
                            organic molecule 19441
                              organic cyclic compound 19203
                                organic heterocyclic compound 18278
                                  organic heteromonocyclic compound 16404
                                    diazines 12146
                                      pyrimidines 11964
                                        pyrimidine nucleobase 6088
                                          uracil 5645
                                            (5R)-6-hydroxy-5-[4-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]-5-phenyluracil 0
                                            (Z)-2-methylureidoacrylic acid 0
                                            (\{[(1R,2R)-2-(uracil-1-yl)cyclopentyl]oxy\}methyl)phosphonic acid 0
                                            1,3-dimethyluracil 0
                                            1,5-dimethyluracil 0
                                            1-(3-O-phosphono-beta-D-arabinofuranosyl)uracil 0
                                            1-(ethoxymethyl)-5-isopropyl-6-(phenylsulfanyl)uracil 0
                                            1-[3-(4-carboxypiperidin-1-yl)-3-deoxy-beta-D-arabinofuranosyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
                                            1-methyluracil 0
                                            2'-deoxyuridine + 0
                                            3,5-dimethyluracil 0
                                            3-(5-bromouracil-1-yl)-L-alanine 0
                                            3-(5-fluorouracil-1-yl)-L-alanine 1
                                            3-(5-iodouracil-1-yl)-L-alanine 0
                                            3-(uracil-1-yl)-L-alanine 0
                                            3-methyluracil 0
                                            4-[(1E,7E)-8-(2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl)-3,6-dioxa-2,7-diazaocta-1,7-dien-1-yl]benzoic acid 0
                                            5,6-dihydrouracil 0
                                            5,6-dihydroxyuracil 0
                                            5-(4,5-dihydroxypentyl)uracil 0
                                            5-[3-(benzyloxy)benzyl]-6-hydroxy-1-[(2-hydroxyethoxy)methyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
                                            5-acetamido-6-formamido-3-methyluracil 1
                                            5-benzyl-1-(2-hydroxyethoxymethyl)uracil 2
                                            5-benzyloxybenzylacyclouridine 0
                                            5-bromouracil 0
                                            5-carboxy-2'-deoxyuridine 0
                                            5-chloro-6-\{[(2Z)-2-iminopyrrolidin-1-yl]methyl\}uracil 0
                                            5-chlorouracil 2
                                            5-diazouracil 0
                                            5-fluorouracil 1351
                                            5-hydroxymethyluracil + 0
                                            5-hydroxyuracil 0
                                            5-iodouracil 0
                                            5-nitrouracil 0
                                            6-(3,5-dimethylbenzyl)-1-(ethoxymethyl)-5-isopropyluracil 0
                                            6-benzyl-1-(benzyloxymethyl)-5-isopropyluracil 0
                                            6-cyclohexylsulfanyl-1-ethoxymethyl-5-isopropyluracil 0
                                            6-methyluracil 0
                                            6-propyl-2-thiouracil 4789
                                            aminouracil + 0
                                            butafenacil 1
                                            dasabuvir 0
                                            emivirine 0
                                            orotate + 0
                                            orotic acid + 17
                                            saflufenacil 0
                                            thiouracil 1
                                            tipiracil 0
                                            uracil-1-yl group 0
                                            uracil-5-carboxylic acid 0
                                            uracil-6-ylacetic acid 0
                                            uridine + 15
                                            uridines + 43
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.