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CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:uracil
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Accession:CHEBI:17568 term browser browse the term
Definition:A common and naturally occurring pyrimidine nucleobase in which the pyrimidine ring is substituted with two oxo groups at positions 2 and 4. Found in RNA, it base pairs with adenine and replaces thymine during DNA transcription.
Synonyms:exact_synonym: pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
 related_synonym: 2,4(1H,3H)-pyrimidinedione;   2,4-Pyrimidinedione;   2,4-dioxopyrimidine;   Formula=C4H4N2O2;   InChI=1S/C4H4N2O2/c7-3-1-2-5-4(8)6-3/h1-2H,(H2,5,6,7,8);   InChIKey=ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N;   SMILES=O=c1cc[nH]c(=O)[nH]1;   U;   Ura;   Urazil
 alt_id: CHEBI:15288;   CHEBI:27210;   CHEBI:46375;   CHEBI:9882
 xref: Beilstein:606623;   CAS:66-22-8;   DrugBank:DB03419;   Gmelin:2896;   HMDB:HMDB0000300;   KEGG:C00106;   KEGG:D00027;   KNApSAcK:C00001513
 xref_mesh: MESH:D014498
 xref: MetaCyc:URACIL;   PDBeChem:URA;   PMID:11279060;   PMID:12855717;   PMID:15274295;   PMID:16834123;   PMID:17439666;   PMID:18533995;   PMID:18815805;   PMID:19175333;   PMID:22020693;   PMID:22074393;   PMID:22120518;   PMID:22171528;   PMID:22237209;   PMID:22299724;   PMID:22356544;   PMID:22447672;   PMID:22483865;   PMID:22567906;   PMID:22685418;   PMID:3654008;   Reaxys:606623;   Wikipedia:Uracil
 cyclic_relationship: is_tautomer_of CHEBI:43254


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      CHEBI ontology 19770
        role 19720
          application 19411
            pro-agent 8879
              prodrug 8632
                uracil 5664
                  (5R)-6-hydroxy-5-[4-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]-5-phenyluracil 0
                  (Z)-2-methylureidoacrylic acid 0
                  (\{[(1R,2R)-2-(uracil-1-yl)cyclopentyl]oxy\}methyl)phosphonic acid 0
                  1,3-dimethyluracil 0
                  1,5-dimethyluracil 0
                  1-(3-O-phosphono-beta-D-arabinofuranosyl)uracil 0
                  1-(ethoxymethyl)-5-isopropyl-6-(phenylsulfanyl)uracil 0
                  1-[3-(4-carboxypiperidin-1-yl)-3-deoxy-beta-D-arabinofuranosyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
                  1-methyluracil 0
                  2'-deoxyuridine + 0
                  3,5-dimethyluracil 0
                  3-(5-bromouracil-1-yl)-L-alanine 0
                  3-(5-fluorouracil-1-yl)-L-alanine 1
                  3-(5-iodouracil-1-yl)-L-alanine 0
                  3-(uracil-1-yl)-L-alanine 0
                  3-methyluracil 0
                  4-[(1E,7E)-8-(2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl)-3,6-dioxa-2,7-diazaocta-1,7-dien-1-yl]benzoic acid 0
                  5,6-dihydrouracil 0
                  5,6-dihydroxyuracil 0
                  5-(4,5-dihydroxypentyl)uracil 0
                  5-[3-(benzyloxy)benzyl]-6-hydroxy-1-[(2-hydroxyethoxy)methyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
                  5-acetamido-6-formamido-3-methyluracil 1
                  5-benzyl-1-(2-hydroxyethoxymethyl)uracil 2
                  5-benzyloxybenzylacyclouridine 0
                  5-bromouracil 0
                  5-carboxy-2'-deoxyuridine 0
                  5-chloro-6-\{[(2Z)-2-iminopyrrolidin-1-yl]methyl\}uracil 0
                  5-chlorouracil 2
                  5-diazouracil 0
                  5-fluorouracil 1373
                  5-hydroxymethyluracil + 0
                  5-hydroxyuracil 0
                  5-iodouracil 0
                  5-nitrouracil 0
                  6-(3,5-dimethylbenzyl)-1-(ethoxymethyl)-5-isopropyluracil 0
                  6-[(1,2-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                  6-[(1,3-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                  6-[(1,4-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                  6-[(1,5-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                  6-[(1-deoxy-D-ribityl)methyl]-5-[(1E)-3-oxobut-1-en-1-yl]uracil 0
                  6-[(2-hydroxyethyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                  6-[(3-hydroxypropyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                  6-[(4-hydroxybutyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                  6-[(5-hydroxypentyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                  6-benzyl-1-(benzyloxymethyl)-5-isopropyluracil 0
                  6-cyclohexylsulfanyl-1-ethoxymethyl-5-isopropyluracil 0
                  6-methyl-5-[(1E)-3-oxobut-1-en-1-yl]uracil 0
                  6-methyluracil 0
                  6-propyl-2-thiouracil 4787
                  aminouracil + 0
                  butafenacil 1
                  dasabuvir 0
                  emivirine 0
                  orotate + 0
                  orotic acid + 17
                  saflufenacil 0
                  thiouracil 1
                  tipiracil 0
                  uracil-1-yl group 0
                  uracil-5-carboxylic acid 0
                  uracil-6-ylacetic acid 0
                  uridine + 16
                  uridines + 48
    Path 2
    Term Annotations click to browse term
      CHEBI ontology 19770
        subatomic particle 19768
          composite particle 19768
            hadron 19768
              baryon 19768
                nucleon 19768
                  atomic nucleus 19768
                    atom 19768
                      main group element atom 19662
                        p-block element atom 19662
                          carbon group element atom 19580
                            carbon atom 19571
                              organic molecular entity 19571
                                organic molecule 19504
                                  organic cyclic compound 19331
                                    organic heterocyclic compound 18519
                                      organic heteromonocyclic compound 16987
                                        diazines 12208
                                          pyrimidines 12030
                                            pyrimidine nucleobase 6201
                                              uracil 5664
                                                (5R)-6-hydroxy-5-[4-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]-5-phenyluracil 0
                                                (Z)-2-methylureidoacrylic acid 0
                                                (\{[(1R,2R)-2-(uracil-1-yl)cyclopentyl]oxy\}methyl)phosphonic acid 0
                                                1,3-dimethyluracil 0
                                                1,5-dimethyluracil 0
                                                1-(3-O-phosphono-beta-D-arabinofuranosyl)uracil 0
                                                1-(ethoxymethyl)-5-isopropyl-6-(phenylsulfanyl)uracil 0
                                                1-[3-(4-carboxypiperidin-1-yl)-3-deoxy-beta-D-arabinofuranosyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
                                                1-methyluracil 0
                                                2'-deoxyuridine + 0
                                                3,5-dimethyluracil 0
                                                3-(5-bromouracil-1-yl)-L-alanine 0
                                                3-(5-fluorouracil-1-yl)-L-alanine 1
                                                3-(5-iodouracil-1-yl)-L-alanine 0
                                                3-(uracil-1-yl)-L-alanine 0
                                                3-methyluracil 0
                                                4-[(1E,7E)-8-(2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl)-3,6-dioxa-2,7-diazaocta-1,7-dien-1-yl]benzoic acid 0
                                                5,6-dihydrouracil 0
                                                5,6-dihydroxyuracil 0
                                                5-(4,5-dihydroxypentyl)uracil 0
                                                5-[3-(benzyloxy)benzyl]-6-hydroxy-1-[(2-hydroxyethoxy)methyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
                                                5-acetamido-6-formamido-3-methyluracil 1
                                                5-benzyl-1-(2-hydroxyethoxymethyl)uracil 2
                                                5-benzyloxybenzylacyclouridine 0
                                                5-bromouracil 0
                                                5-carboxy-2'-deoxyuridine 0
                                                5-chloro-6-\{[(2Z)-2-iminopyrrolidin-1-yl]methyl\}uracil 0
                                                5-chlorouracil 2
                                                5-diazouracil 0
                                                5-fluorouracil 1373
                                                5-hydroxymethyluracil + 0
                                                5-hydroxyuracil 0
                                                5-iodouracil 0
                                                5-nitrouracil 0
                                                6-(3,5-dimethylbenzyl)-1-(ethoxymethyl)-5-isopropyluracil 0
                                                6-[(1,2-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                                6-[(1,3-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                                6-[(1,4-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                                6-[(1,5-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                                6-[(1-deoxy-D-ribityl)methyl]-5-[(1E)-3-oxobut-1-en-1-yl]uracil 0
                                                6-[(2-hydroxyethyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                                6-[(3-hydroxypropyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                                6-[(4-hydroxybutyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                                6-[(5-hydroxypentyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                                6-benzyl-1-(benzyloxymethyl)-5-isopropyluracil 0
                                                6-cyclohexylsulfanyl-1-ethoxymethyl-5-isopropyluracil 0
                                                6-methyl-5-[(1E)-3-oxobut-1-en-1-yl]uracil 0
                                                6-methyluracil 0
                                                6-propyl-2-thiouracil 4787
                                                aminouracil + 0
                                                butafenacil 1
                                                dasabuvir 0
                                                emivirine 0
                                                orotate + 0
                                                orotic acid + 17
                                                saflufenacil 0
                                                thiouracil 1
                                                tipiracil 0
                                                uracil-1-yl group 0
                                                uracil-5-carboxylic acid 0
                                                uracil-6-ylacetic acid 0
                                                uridine + 16
                                                uridines + 48
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