Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:L-serine
go back to main search page
Accession:CHEBI:17115 term browser browse the term
Definition:The L-enantiomer of serine.
Synonyms:related_synonym: (2S)-2-amino-3-hydroxypropanoic acid;   (S)-2-amino-3-hydroxypropanoic acid;   (S)-alpha-Amino-beta-hydroxypropionic acid;   (S)-serine;   Formula=C3H7NO3;   InChI=1S/C3H7NO3/c4-2(1-5)3(6)7/h2,5H,1,4H2,(H,6,7)/t2-/m0/s1;   InChIKey=MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N;   L-2-Amino-3-hydroxypropionic acid;   L-3-Hydroxy-2-aminopropionic acid;   L-3-Hydroxy-alanine;   L-Ser;   L-Serin;   S;   SERINE;   SMILES=N[C@@H](CO)C(O)=O;   Ser;   beta-Hydroxy-L-alanine;   beta-Hydroxyalanine
 alt_id: CHEBI:13167;   CHEBI:21387;   CHEBI:45440;   CHEBI:45451;   CHEBI:45590;   CHEBI:45597;   CHEBI:45677;   CHEBI:6301
 xref: Beilstein:1721404 "Beilstein";   CAS:56-45-1 "ChemIDplus";   CAS:56-45-1 "KEGG COMPOUND";   CAS:56-45-1 "NIST Chemistry WebBook";   DrugBank:DB00133;   Drug_Central:4127 "DrugCentral";   ECMDB:ECMDB00187;   Gmelin:2570 "Gmelin";   HMDB:HMDB0000187;   KEGG:C00065;   KEGG:D00016;   KNApSAcK:C00001393;   MetaCyc:SER;   PDBeChem:SER;   PMID:1650428 "Europe PMC";   PMID:17439666 "Europe PMC";   PMID:19062365 "Europe PMC";   PMID:21956576 "Europe PMC";   PMID:22265470 "Europe PMC";   PMID:22393170 "Europe PMC";   PMID:22547037 "Europe PMC";   PMID:22566084 "Europe PMC";   PMID:22566694 "Europe PMC";   Reaxys:1721404 "Reaxys";   Wikipedia:L-serine;   YMDB:YMDB00112
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:32836;   is_conjugate_base_of CHEBI:32837;   is_enantiomer_of CHEBI:16523;   is_tautomer_of CHEBI:33384


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
Phe-Ser term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Slc15a1 solute carrier family 15 member 1 JBrowse link 15 106,800,081 106,844,668 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19716
    role 19663
      application 19308
        fuel 10307
          methanol 2951
            hydroxymethyl group 8
              serine 8
                L-serine 1
                  Ala-Ala-Ser 0
                  Ala-Asn-Gln-Ser 0
                  Ala-Asp-Ser 0
                  Ala-Gly-Ser 0
                  Ala-Leu-Leu-Ser 0
                  Ala-Leu-Val-Ser 0
                  Ala-Met-Ser-Arg 0
                  Ala-Phe-Thr-Ser 0
                  Ala-Ser 0
                  Ala-Val-Asp-Ser 0
                  Arg-Asn-Gly-Ser 0
                  Arg-Asp-Gln-Ser 0
                  Arg-Trp-Ser-Tyr 0
                  Asn-Asn-Pro-Ser 0
                  Asn-Leu-Leu-Ser 0
                  Asn-Ser 0
                  Asn-Trp-Asp-Ser 0
                  Asp-Gln-Ser 0
                  Asp-Leu-Leu-Ser 0
                  Asp-Leu-Thr-Ser 0
                  Asp-Pro-Ser-Ser 0
                  Asp-Ser 0
                  Cys-Ser 0
                  Glu-Ile-Ser 0
                  Glu-Ser 0
                  Gly-Ser 0
                  L-3-oxoalanine + 0
                  L-serine derivative + 0
                  L-serine residue + 0
                  L-serino group 0
                  L-seryl group 0
                  Leu-Ala-Ser 0
                  Leu-Asp-Ser 0
                  Leu-Gly-Ser 0
                  Leu-Leu-Ser 0
                  Leu-Ser 0
                  Leu-Ser-Ser-Tyr 0
                  Leu-Thr-Ser 0
                  Leu-Val-Ser 0
                  Lys-Ser-Trp 0
                  Met-Ser 0
                  N-arachidonoyl-L-serine 0
                  O-ureido-L-serine 0
                  Phe-Ser 1
                  Pro-Ser 0
                  Ser-His 0
                  Ser-Leu-Ser 0
                  Ser-Lys 0
                  Ser-Phe 0
                  Ser-Ser 0
                  Ser-Thr 0
                  Ser-Trp 0
                  Ser-Trp-Lys 0
                  Ser-Tyr 0
                  Thr-Ala-Ser 0
                  Thr-Ser 0
                  Trp-Asp-Ser 0
                  Trp-Ser 0
                  Tyr-Ser 0
                  lejimalide A 0
                  lejimalide B 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19716
    subatomic particle 19712
      composite particle 19712
        hadron 19712
          baryon 19712
            nucleon 19712
              atomic nucleus 19712
                atom 19712
                  main group element atom 19598
                    p-block element atom 19598
                      carbon group element atom 19486
                        carbon atom 19480
                          organic molecular entity 19480
                            organic group 18407
                              organic divalent group 18397
                                organodiyl group 18397
                                  carbonyl group 18285
                                    carbonyl compound 18285
                                      carboxylic acid 17940
                                        amino acid 12442
                                          alpha-amino acid 7648
                                            L-alpha-amino acid 7312
                                              serine family amino acid 1768
                                                L-serine 1
                                                  Ala-Ala-Ser 0
                                                  Ala-Asn-Gln-Ser 0
                                                  Ala-Asp-Ser 0
                                                  Ala-Gly-Ser 0
                                                  Ala-Leu-Leu-Ser 0
                                                  Ala-Leu-Val-Ser 0
                                                  Ala-Met-Ser-Arg 0
                                                  Ala-Phe-Thr-Ser 0
                                                  Ala-Ser 0
                                                  Ala-Val-Asp-Ser 0
                                                  Arg-Asn-Gly-Ser 0
                                                  Arg-Asp-Gln-Ser 0
                                                  Arg-Trp-Ser-Tyr 0
                                                  Asn-Asn-Pro-Ser 0
                                                  Asn-Leu-Leu-Ser 0
                                                  Asn-Ser 0
                                                  Asn-Trp-Asp-Ser 0
                                                  Asp-Gln-Ser 0
                                                  Asp-Leu-Leu-Ser 0
                                                  Asp-Leu-Thr-Ser 0
                                                  Asp-Pro-Ser-Ser 0
                                                  Asp-Ser 0
                                                  Cys-Ser 0
                                                  Glu-Ile-Ser 0
                                                  Glu-Ser 0
                                                  Gly-Ser 0
                                                  L-3-oxoalanine + 0
                                                  L-serine derivative + 0
                                                  L-serine residue + 0
                                                  L-serino group 0
                                                  L-seryl group 0
                                                  Leu-Ala-Ser 0
                                                  Leu-Asp-Ser 0
                                                  Leu-Gly-Ser 0
                                                  Leu-Leu-Ser 0
                                                  Leu-Ser 0
                                                  Leu-Ser-Ser-Tyr 0
                                                  Leu-Thr-Ser 0
                                                  Leu-Val-Ser 0
                                                  Lys-Ser-Trp 0
                                                  Met-Ser 0
                                                  N-arachidonoyl-L-serine 0
                                                  O-ureido-L-serine 0
                                                  Phe-Ser 1
                                                  Pro-Ser 0
                                                  Ser-His 0
                                                  Ser-Leu-Ser 0
                                                  Ser-Lys 0
                                                  Ser-Phe 0
                                                  Ser-Ser 0
                                                  Ser-Thr 0
                                                  Ser-Trp 0
                                                  Ser-Trp-Lys 0
                                                  Ser-Tyr 0
                                                  Thr-Ala-Ser 0
                                                  Thr-Ser 0
                                                  Trp-Asp-Ser 0
                                                  Trp-Ser 0
                                                  Tyr-Ser 0
                                                  lejimalide A 0
                                                  lejimalide B 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.