Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:L-serine
go back to main search page
Accession:CHEBI:17115 term browser browse the term
Definition:The L-enantiomer of serine.
Synonyms:related_synonym: (2S)-2-amino-3-hydroxypropanoic acid;   (S)-2-amino-3-hydroxypropanoic acid;   (S)-alpha-Amino-beta-hydroxypropionic acid;   (S)-serine;   Formula=C3H7NO3;   InChI=1S/C3H7NO3/c4-2(1-5)3(6)7/h2,5H,1,4H2,(H,6,7)/t2-/m0/s1;   InChIKey=MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N;   L-2-Amino-3-hydroxypropionic acid;   L-3-Hydroxy-2-aminopropionic acid;   L-3-Hydroxy-alanine;   L-Ser;   L-Serin;   S;   SERINE;   SMILES=N[C@@H](CO)C(O)=O;   Ser;   beta-Hydroxy-L-alanine;   beta-Hydroxyalanine
 alt_id: CHEBI:13167;   CHEBI:21387;   CHEBI:45440;   CHEBI:45451;   CHEBI:45590;   CHEBI:45597;   CHEBI:45677;   CHEBI:6301
 xref: Beilstein:1721404;   CAS:56-45-1;   DrugBank:DB00133;   Drug_Central:4127;   ECMDB:ECMDB00187;   Gmelin:2570;   HMDB:HMDB0000187;   KEGG:C00065;   KEGG:D00016;   KNApSAcK:C00001393;   MetaCyc:SER;   PDBeChem:SER;   PMID:1650428;   PMID:17439666;   PMID:19062365;   PMID:21956576;   PMID:22265470;   PMID:22393170;   PMID:22547037;   PMID:22566084;   PMID:22566694;   Reaxys:1721404;   Wikipedia:L-serine;   YMDB:YMDB00112
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:32836;   is_conjugate_base_of CHEBI:32837;   is_enantiomer_of CHEBI:16523;   is_tautomer_of CHEBI:33384


show annotations for term's descendants           Sort by:
 
Phe-Ser term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Slc15a1 solute carrier family 15 member 1 affects binding ISO phenylalanylserine analog binds to SLC15A1 protein CTD PMID:21147219 NCBI chr15:106,800,081...106,844,668
Ensembl chr15:106,800,081...106,844,426
JBrowse link

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19841
    role 19792
      application 19465
        fuel 10817
          methanol 3073
            hydroxymethyl group 8
              serine 8
                L-serine 1
                  Ala-Ala-Ser 0
                  Ala-Asn-Gln-Ser 0
                  Ala-Asp-Ser 0
                  Ala-Gly-Ser 0
                  Ala-Leu-Leu-Ser 0
                  Ala-Leu-Val-Ser 0
                  Ala-Met-Ser-Arg 0
                  Ala-Phe-Thr-Ser 0
                  Ala-Ser 0
                  Ala-Val-Asp-Ser 0
                  Arg-Asn-Gly-Ser 0
                  Arg-Asp-Gln-Ser 0
                  Arg-Trp-Ser-Tyr 0
                  Asn-Asn-Pro-Ser 0
                  Asn-Leu-Leu-Ser 0
                  Asn-Ser 0
                  Asn-Trp-Asp-Ser 0
                  Asp-Gln-Ser 0
                  Asp-Leu-Leu-Ser 0
                  Asp-Leu-Thr-Ser 0
                  Asp-Pro-Ser-Ser 0
                  Asp-Ser 0
                  Cys-Ser 0
                  Glu-Ile-Ser 0
                  Glu-Ser 0
                  Gly-Ser 0
                  L-3-oxoalanine + 0
                  L-serine derivative + 0
                  L-serine residue + 0
                  L-serino group 0
                  L-seryl group 0
                  Leu-Ala-Ser 0
                  Leu-Asp-Ser 0
                  Leu-Gly-Ser 0
                  Leu-Leu-Ser 0
                  Leu-Ser 0
                  Leu-Ser-Ser-Tyr 0
                  Leu-Thr-Ser 0
                  Leu-Val-Ser 0
                  Lys-Leu-Ser 0
                  Lys-Ser-Trp 0
                  Met-Ser 0
                  N(2)-[3-(3-oxo-3,4-dihydroquinoxalin-2-yl)propanoyl]-L-serinamide 0
                  N-arachidonoyl-L-serine 0
                  O-ureido-L-serine 0
                  Phe-Ser 1
                  Pro-Ser 0
                  Ser-His 0
                  Ser-Leu-Ser 0
                  Ser-Lys 0
                  Ser-Phe 0
                  Ser-Ser 0
                  Ser-Thr 0
                  Ser-Trp 0
                  Ser-Trp-Lys 0
                  Ser-Tyr 0
                  Thr-Ala-Ser 0
                  Thr-Ser 0
                  Trp-Asp-Ser 0
                  Trp-Ser 0
                  Tyr-Ser 0
                  cryptomaldamide 0
                  lejimalide A 0
                  lejimalide B 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19841
    subatomic particle 19839
      composite particle 19839
        hadron 19839
          baryon 19839
            nucleon 19839
              atomic nucleus 19839
                atom 19839
                  main group element atom 19732
                    p-block element atom 19732
                      carbon group element atom 19636
                        carbon atom 19625
                          organic molecular entity 19625
                            organic group 18537
                              organic divalent group 18528
                                organodiyl group 18528
                                  carbonyl group 18436
                                    carbonyl compound 18436
                                      carboxylic acid 18113
                                        amino acid 14108
                                          alpha-amino acid 11593
                                            L-alpha-amino acid 11430
                                              serine family amino acid 2057
                                                L-serine 1
                                                  Ala-Ala-Ser 0
                                                  Ala-Asn-Gln-Ser 0
                                                  Ala-Asp-Ser 0
                                                  Ala-Gly-Ser 0
                                                  Ala-Leu-Leu-Ser 0
                                                  Ala-Leu-Val-Ser 0
                                                  Ala-Met-Ser-Arg 0
                                                  Ala-Phe-Thr-Ser 0
                                                  Ala-Ser 0
                                                  Ala-Val-Asp-Ser 0
                                                  Arg-Asn-Gly-Ser 0
                                                  Arg-Asp-Gln-Ser 0
                                                  Arg-Trp-Ser-Tyr 0
                                                  Asn-Asn-Pro-Ser 0
                                                  Asn-Leu-Leu-Ser 0
                                                  Asn-Ser 0
                                                  Asn-Trp-Asp-Ser 0
                                                  Asp-Gln-Ser 0
                                                  Asp-Leu-Leu-Ser 0
                                                  Asp-Leu-Thr-Ser 0
                                                  Asp-Pro-Ser-Ser 0
                                                  Asp-Ser 0
                                                  Cys-Ser 0
                                                  Glu-Ile-Ser 0
                                                  Glu-Ser 0
                                                  Gly-Ser 0
                                                  L-3-oxoalanine + 0
                                                  L-serine derivative + 0
                                                  L-serine residue + 0
                                                  L-serino group 0
                                                  L-seryl group 0
                                                  Leu-Ala-Ser 0
                                                  Leu-Asp-Ser 0
                                                  Leu-Gly-Ser 0
                                                  Leu-Leu-Ser 0
                                                  Leu-Ser 0
                                                  Leu-Ser-Ser-Tyr 0
                                                  Leu-Thr-Ser 0
                                                  Leu-Val-Ser 0
                                                  Lys-Leu-Ser 0
                                                  Lys-Ser-Trp 0
                                                  Met-Ser 0
                                                  N(2)-[3-(3-oxo-3,4-dihydroquinoxalin-2-yl)propanoyl]-L-serinamide 0
                                                  N-arachidonoyl-L-serine 0
                                                  O-ureido-L-serine 0
                                                  Phe-Ser 1
                                                  Pro-Ser 0
                                                  Ser-His 0
                                                  Ser-Leu-Ser 0
                                                  Ser-Lys 0
                                                  Ser-Phe 0
                                                  Ser-Ser 0
                                                  Ser-Thr 0
                                                  Ser-Trp 0
                                                  Ser-Trp-Lys 0
                                                  Ser-Tyr 0
                                                  Thr-Ala-Ser 0
                                                  Thr-Ser 0
                                                  Trp-Asp-Ser 0
                                                  Trp-Ser 0
                                                  Tyr-Ser 0
                                                  cryptomaldamide 0
                                                  lejimalide A 0
                                                  lejimalide B 0
paths to the root