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ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:dTMP
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Accession:CHEBI:17013 term browser browse the term
Definition:The neutral species of thymidine 5'-monophosphate (2'-deoxythymidine 5'-monophosphate).
Synonyms:exact_synonym: 2'-deoxy-5-methyluridine 5'-(dihydrogen phosphate)
 related_synonym: (dT)1;   5'-TMP;   5'-Thymidylic acid;   5-methyl-dUMP;   Formula=C10H15N2O8P;   InChI=1S/C10H15N2O8P/c1-5-3-12(10(15)11-9(5)14)8-2-6(13)7(20-8)4-19-21(16,17)18/h3,6-8,13H,2,4H2,1H3,(H,11,14,15)(H2,16,17,18)/t6-,7+,8+/m0/s1;   InChIKey=GYOZYWVXFNDGLU-XLPZGREQSA-N;   SMILES=Cc1cn([C@H]2C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(O)=O)O2)c(=O)[nH]c1=O;   THYMIDINE-5'-PHOSPHATE;   TMP;   Thymidine monophosphate;   Thymidylate;   Thymidylic acid;   deoxyribosylthymine monophosphate;   ribothymidine 5'-monophosphate;   thymidine 5'-(dihydrogen phosphate);   thymidine 5'-phosphoric acid;   thymidine-5'-monophosphoric acid
 alt_id: CHEBI:10529;   CHEBI:14092;   CHEBI:15246;   CHEBI:45759;   CHEBI:45772;   CHEBI:45926;   CHEBI:46013;   CHEBI:46036;   CHEBI:47711;   CHEBI:63549
 xref: Beilstein:47541;   CAS:365-07-1;   DrugBank:DB01643;   HMDB:HMDB0001227;   KEGG:C00364;   KNApSAcK:C00019637
 xref_mesh: MESH:D013938
 xref: PDBeChem:TMPdF10;   PDBeChem:TdF10;   PMID:22512654;   PMID:22761426;   PMID:23149755;   PMID:23288848;   PMID:23362972;   PMID:23501933;   PMID:23518161;   PMID:2559771;   PMID:7110140;   PMID:8647821;   Reaxys:47541;   Wikipedia:Thymidine_monophosphate
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:46960;   is_enantiomer_of CHEBI:42112


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dTMP term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Idh2 isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 2 JBrowse link 1 141,874,354 141,893,674 RGD:6480464
G Tyms thymidylate synthetase JBrowse link 9 121,918,875 121,931,564 RGD:6480464

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Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19764
    role 19710
      biological role 19709
        biochemical role 19210
          metabolite 19184
            fundamental metabolite 9672
              dTMP 2
                5,6-dihydrothymidine 5'-monophosphate 0
                dTMP 3'-end residue + 0
                dTMP 5'-end residue + 0
                p-nitrophenyl thymidine 5'-monophosphate 0
                thymidine 5'-monophosphate residue + 0
Path 2
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  CHEBI ontology 19764
    subatomic particle 19762
      composite particle 19762
        hadron 19762
          baryon 19762
            nucleon 19762
              atomic nucleus 19762
                atom 19762
                  main group element atom 19645
                    p-block element atom 19645
                      chalcogen 19350
                        oxygen atom 19312
                          oxygen molecular entity 19312
                            hydroxides 19065
                              oxoacid 18129
                                pnictogen oxoacid 10114
                                  phosphorus oxoacid 9014
                                    phosphoric acids 7768
                                      phosphoric acid 7768
                                        phosphoric acid derivative 7447
                                          phosphate 7447
                                            organic phosphate 7446
                                              carbohydrate phosphate 1527
                                                phospho sugar 1454
                                                  aldose phosphate 1452
                                                    aldopentose phosphate 1446
                                                      deoxyaldopentose phosphate 9
                                                        2-deoxyribose phosphate 9
                                                          2'-deoxyribonucleotide 8
                                                            2'-deoxyribonucleoside 5'-phosphate 8
                                                              2'-deoxyribonucleoside 5'-monophosphate 3
                                                                pyrimidine 2'-deoxyribonucleoside 5'-monophosphate 3
                                                                  thymidine 5'-monophosphate 2
                                                                    dTMP 2
                                                                      5,6-dihydrothymidine 5'-monophosphate 0
                                                                      dTMP 3'-end residue + 0
                                                                      dTMP 5'-end residue + 0
                                                                      p-nitrophenyl thymidine 5'-monophosphate 0
                                                                      thymidine 5'-monophosphate residue + 0
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