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ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:ADP-D-ribose
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Accession:CHEBI:16960 term browser browse the term
Definition:A nucleotide-sugar having ADP as the nucleotide fragment and D-ribofuranos-5-yl as the sugar component.
Synonyms:exact_synonym: adenosine 5'-[3-(D-ribofuranos-5-O-yl) dihydrogen diphosphate]
 related_synonym: (Rib5)ppA;   5-(adenosine 5'-pyrophosphoryl)-D-ribose;   A5'pp5Rib;   ADP ribose;   ADP-Rib;   ADP-riboses;   ADPribose;   AdoPPRib;   D-ribofuranose, 5-5'-ester with adenosine 5'-(trihydrogen pyrophosphate);   Formula=C15H23N5O14P2;   InChI=1S/C15H23N5O14P2/c16-12-7-13(18-3-17-12)20(4-19-7)14-10(23)8(21)5(32-14)1-30-35(26,27)34-36(28,29)31-2-6-9(22)11(24)15(25)33-6/h3-6,8-11,14-15,21-25H,1-2H2,(H,26,27)(H,28,29)(H2,16,17,18)/t5-,6-,8-,9-,10-,11-,14-,15?/m1/s1;   InChIKey=SRNWOUGRCWSEMX-TYASJMOZSA-N;   SMILES=Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]2OC(O)[C@H](O)[C@@H]2O)[C@@H](O)[C@H]1O;   adenosine 5'-(trihydrogen diphosphate), P'-5-ester with D-ribose;   adenosine 5'-diphosphoribose;   adenosine 5'-pyrophosphate, 5'-5-ester with D-ribofuranose;   adenosine diphosphate ribose;   ribose adenosinediphosphate
 alt_id: CHEBI:13231;   CHEBI:20850;   CHEBI:2351;   CHEBI:32889;   CHEBI:40752
 xref: Beilstein:1236193 "Beilstein";   Beilstein:6081768 "Beilstein";   CAS:20762-30-5 "ChemIDplus";   KEGG:C00301
 xref_mesh: MESH:D000246
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:57967


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ADP-D-ribose term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Adprh ADP-ribosylarginine hydrolase JBrowse link 11 64,861,772 64,868,112 RGD:6480464
G Adprhl2 ADP-ribosylhydrolase like 2 JBrowse link 5 144,336,312 144,341,586 RGD:6480464
G Trpm2 transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 2 JBrowse link 20 11,434,062 11,482,880 RGD:6480464
cyclic ADP-ribose term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Cd38 CD38 molecule JBrowse link 14 71,714,768 71,754,990 RGD:6480464
G Homer1 homer scaffold protein 1 JBrowse link 2 22,909,550 23,012,303 RGD:6480464
G Ryr2 ryanodine receptor 2 JBrowse link 17 65,533,998 65,955,606 RGD:6480464

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Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19654
    role 19598
      biological role 19596
        biochemical role 19125
          metabolite 19093
            fundamental metabolite 9187
              ADP 80
                ADP-D-ribose 6
                  2''-O-glutaryl-ADP-D-ribose 0
                  2''-O-malonyl-ADP-D-ribose 0
                  2''-O-succinyl-ADP-D-ribose 0
                  ADP-D-ribose 1'',2''-cyclic phosphate 0
                  ADP-D-ribose 1''-phosphate 0
                  L-glutamyl-5-poly(ADP-ribose) 0
                  N(4)-(ADP-ribosyl)-L-asparagine 0
                  N(omega)-(ADP-D-ribosyl)-L-arginine 0
                  O-(ADP-ribosyl)-L-serine 0
                  S-(ADP-ribosyl)-L-cysteine + 0
                  cyclic ADP-ribose + 3
                  poly-ADP-D-ribose 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19654
    subatomic particle 19650
      composite particle 19650
        hadron 19650
          baryon 19650
            nucleon 19650
              atomic nucleus 19650
                atom 19650
                  main group element atom 19531
                    p-block element atom 19531
                      chalcogen 19217
                        oxygen atom 19171
                          oxygen molecular entity 19171
                            hydroxides 18951
                              oxoacid 18064
                                pnictogen oxoacid 8533
                                  phosphorus oxoacid 8426
                                    phosphoric acids 7312
                                      phosphoric acid 7312
                                        phosphoric acid derivative 6963
                                          phosphate 6963
                                            organic phosphate 6962
                                              carbohydrate phosphate 1498
                                                phospho sugar 1433
                                                  aldose phosphate 1431
                                                    aldopentose phosphate 1425
                                                      ribose phosphate 1419
                                                        ribonucleotide 1378
                                                          purine ribonucleotide 1351
                                                            adenyl ribonucleotide 1231
                                                              adenosine phosphate 246
                                                                adenosine 5'-phosphate 245
                                                                  ADP 80
                                                                    ADP-sugar 6
                                                                      ADP-D-ribose 6
                                                                        2''-O-glutaryl-ADP-D-ribose 0
                                                                        2''-O-malonyl-ADP-D-ribose 0
                                                                        2''-O-succinyl-ADP-D-ribose 0
                                                                        ADP-D-ribose 1'',2''-cyclic phosphate 0
                                                                        ADP-D-ribose 1''-phosphate 0
                                                                        L-glutamyl-5-poly(ADP-ribose) 0
                                                                        N(4)-(ADP-ribosyl)-L-asparagine 0
                                                                        N(omega)-(ADP-D-ribosyl)-L-arginine 0
                                                                        O-(ADP-ribosyl)-L-serine 0
                                                                        S-(ADP-ribosyl)-L-cysteine + 0
                                                                        cyclic ADP-ribose + 3
                                                                        poly-ADP-D-ribose 0
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