Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References FTP Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) RatMine GViewer (Genome Viewer) Overgo Probe Designer ACP Haplotyper Genome Scanner
Aging & Age-Related Disease Cancer Cardiovascular Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Genetic Models PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes GERRC (Gene Editing Rat Resource Center) Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Poster Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS
Term:L-arginine
go back to main search page
Accession:CHEBI:16467 term browser browse the term
Definition:An L-alpha-amino acid that is the L-isomer of arginine.
Synonyms:related_synonym: (2S)-2-amino-5-(carbamimidamido)pentanoic acid;   (2S)-2-amino-5-guanidinopentanoic acid;   (S)-2-Amino-5-guanidinovaleric acid;   (S)-2-amino-5-guanidinopentanoic acid;   Arg;   Formula=C6H14N4O2;   InChI=1S/C6H14N4O2/c7-4(5(11)12)2-1-3-10-6(8)9/h4H,1-3,7H2,(H,11,12)(H4,8,9,10)/t4-/m0/s1;   InChIKey=ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-N;   L-Arg;   L-Arginin;   R;   SMILES=N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O;   arginine
 alt_id: CHEBI:13077;   CHEBI:21235;   CHEBI:42927;   CHEBI:6185
 xref: Beilstein:1725413 "ChemIDplus";   CAS:74-79-3 "ChemIDplus";   CAS:74-79-3 "KEGG COMPOUND";   CAS:74-79-3 "NIST Chemistry WebBook";   DrugBank:DB00125;   Drug_Central:1549 "DrugCentral";   ECMDB:ECMDB00517;   Gmelin:83283 "Gmelin";   HMDB:HMDB0000517;   KEGG:C00062;   KEGG:D02982;   KNApSAcK:C00001340;   MetaCyc:ARG;   PDBeChem:ARG;   PDBeChem:GND;   PMID:10848923 "Europe PMC";   PMID:11139824 "Europe PMC";   PMID:11300497 "Europe PMC";   PMID:11898853 "Europe PMC";   PMID:12812828 "Europe PMC";   PMID:15016745 "Europe PMC";   PMID:15465805 "Europe PMC";   PMID:16056256 "Europe PMC";   PMID:16416365 "Europe PMC";   PMID:17168727 "Europe PMC";   PMID:17439666 "Europe PMC";   PMID:19030957 "Europe PMC";   PMID:21600268 "Europe PMC";   PMID:21814794 "Europe PMC";   PMID:22179117 "Europe PMC";   PMID:22243793 "Europe PMC";   PMID:22251130 "Europe PMC";   PMID:22361732 "Europe PMC";   PMID:22425811 "Europe PMC";   PMID:22428068 "Europe PMC";   PMID:22439203 "Europe PMC";   PMID:22553931 "Europe PMC";   PMID:22619480 "Europe PMC";   PMID:22626826 "Europe PMC";   PMID:22652429 "Europe PMC";   PMID:22667467 "Europe PMC";   PMID:22709481 "Europe PMC";   PMID:8070089 "Europe PMC";   Reaxys:1725413 "Reaxys";   Wikipedia:L-arginine;   YMDB:YMDB00592
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:32681;   is_conjugate_base_of CHEBI:32682;   is_enantiomer_of CHEBI:15816

show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
(N(omega)-L-arginino)succinic acid term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Idh2 isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 2 JBrowse link 1 141,874,354 141,893,674 RGD:6480464
G Lepr leptin receptor JBrowse link 5 120,503,475 120,682,281 RGD:6480464
S-methyl-L-thiocitrulline term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Edn1 endothelin 1 JBrowse link 17 22,136,814 22,143,745 RGD:6480464
G Nos1 nitric oxide synthase 1 JBrowse link 12 44,214,949 44,405,530 RGD:6480464
G Slc18a2 solute carrier family 18 member A2 JBrowse link 1 280,397,831 280,457,968 RGD:6480464
Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19654
    role 19598
      application 19220
        indicator 8518
          biomarker 6270
            L-arginine 15
              5-methyl-L-arginine + 0
              Ala-Arg 0
              Ala-Met-Ser-Arg 0
              Arg-Asn-Gln-Arg 0
              Arg-Asn-Gly-Ser 0
              Arg-Asp-Gln-Ser 0
              Arg-Lys-Cys-Gly 0
              Arg-Phe-Phe-Cys 0
              Arg-Pro 0
              Arg-Thr-Cys-Cys 0
              Arg-Thr-Thr-Asp 0
              Arg-Trp-Ser-Tyr 0
              Asp-Arg 0
              Asp-Gln-Arg 0
              Glu-Glu-Arg 0
              Glu-Trp-Asp-Arg 0
              Gly-Arg-Pro 0
              L-arginine derivative + 15
              L-arginine residue 0
              L-arginyl group 0
              L-arginyl-L-amino acid 0
              Leu-Arg 0
              N(2)-L-arginino group 0
              N(omega)-L-arginino group 0
              N-acyl-L-arginine + 0
              Phe-Arg 0
              Phe-Arg-Thr 0
              Pro-Arg-Pro 0
              poly(glycyl-L-arginine) 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19654
    subatomic particle 19650
      composite particle 19650
        hadron 19650
          baryon 19650
            nucleon 19650
              atomic nucleus 19650
                atom 19650
                  main group element atom 19531
                    p-block element atom 19531
                      carbon group element atom 19413
                        carbon atom 19405
                          organic molecular entity 19405
                            organic group 18331
                              organic divalent group 18321
                                organodiyl group 18321
                                  carbonyl group 18209
                                    carbonyl compound 18209
                                      carboxylic acid 17908
                                        amino acid 12306
                                          alpha-amino acid 7423
                                            L-alpha-amino acid 7080
                                              glutamine family amino acid 5340
                                                L-arginine 15
                                                  5-methyl-L-arginine + 0
                                                  Ala-Arg 0
                                                  Ala-Met-Ser-Arg 0
                                                  Arg-Asn-Gln-Arg 0
                                                  Arg-Asn-Gly-Ser 0
                                                  Arg-Asp-Gln-Ser 0
                                                  Arg-Lys-Cys-Gly 0
                                                  Arg-Phe-Phe-Cys 0
                                                  Arg-Pro 0
                                                  Arg-Thr-Cys-Cys 0
                                                  Arg-Thr-Thr-Asp 0
                                                  Arg-Trp-Ser-Tyr 0
                                                  Asp-Arg 0
                                                  Asp-Gln-Arg 0
                                                  Glu-Glu-Arg 0
                                                  Glu-Trp-Asp-Arg 0
                                                  Gly-Arg-Pro 0
                                                  L-arginine derivative + 15
                                                  L-arginine residue 0
                                                  L-arginyl group 0
                                                  L-arginyl-L-amino acid 0
                                                  Leu-Arg 0
                                                  N(2)-L-arginino group 0
                                                  N(omega)-L-arginino group 0
                                                  N-acyl-L-arginine + 0
                                                  Phe-Arg 0
                                                  Phe-Arg-Thr 0
                                                  Pro-Arg-Pro 0
                                                  poly(glycyl-L-arginine) 0
paths to the root

Contact Us |  About Us |  License CC BY 4.0 |  Legal Disclaimer |  © Medical College of Wisconsin
NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.