Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:adenosine
go back to main search page
Accession:CHEBI:16335 term browser browse the term
Definition:A ribonucleoside composed of a molecule of adenine attached to a ribofuranose moiety via a beta-N(9)-glycosidic bond.
Synonyms:related_synonym: (2R,3R,4S,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-(hydroxymethyl)oxolane-3,4-diol;   6-Amino-9-beta-D-ribofuranosyl-9H-purine;   9-beta-D-Ribofuranosidoadenine;   9-beta-D-ribofuranosyl-9H-purin-6-amine;   Ade-Rib;   Adenine Deoxyribonucleoside;   Adenocard;   Adenocor;   Adenoscan;   Adenosin;   Adenyldeoxyriboside;   Ado;   Deoxyadenosine;   Desoxyadenosine;   Formula=C10H13N5O4;   InChI=1S/C10H13N5O4/c11-8-5-9(13-2-12-8)15(3-14-5)10-7(18)6(17)4(1-16)19-10/h2-4,6-7,10,16-18H,1H2,(H2,11,12,13)/t4-,6-,7-,10-/m1/s1;   InChIKey=OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N;   SMILES=Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O;   beta-D-Adenosine
 alt_id: CHEBI:13734;   CHEBI:22237;   CHEBI:2472;   CHEBI:40558;   CHEBI:40825;   CHEBI:40906
 xref: Beilstein:93029 "Beilstein";   CAS:58-61-7 "ChemIDplus";   CAS:58-61-7 "KEGG COMPOUND";   CAS:58-61-7 "NIST Chemistry WebBook";   DrugBank:DB00640;   Drug_Central:90 "DrugCentral";   ECMDB:ECMDB00050;   Gmelin:53385 "Gmelin";   HMDB:HMDB0000050;   KEGG:C00212;   KEGG:D00045;   KNApSAcK:C00007444;   LINCS:LSM-28568
 xref_mesh: MESH:D000241
 xref: MetaCyc:ADENOSINE;   PDBeChem:ADN;   PMID:11213237 "Europe PMC";   PMID:11820865 "Europe PMC";   PMID:11978011 "Europe PMC";   PMID:16183671 "Europe PMC";   PMID:16917093 "Europe PMC";   PMID:17190852 "Europe PMC";   PMID:18000974 "Europe PMC";   PMID:323854 "Europe PMC";   Reaxys:93029 "Reaxys";   Wikipedia:Adenosine;   YMDB:YMDB00058


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
adenosine term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G MYL9 myosin light chain 9 JBrowse link 17 39,788,165 39,795,240 RGD:6480464
ATP term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G BCL2 BCL2 apoptosis regulator JBrowse link 1 158,337,403 158,518,214 RGD:6480464
G CASP8 caspase 8 JBrowse link 15 104,923,659 104,948,470 RGD:6480464
G CYCS cytochrome c, somatic JBrowse link 18 47,169,921 47,172,212 RGD:6480464
G MYL9 myosin light chain 9 JBrowse link 17 39,788,165 39,795,240 RGD:6480464
G TNF tumor necrosis factor JBrowse link 7 23,699,635 23,702,393 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 835
    role 812
      biological role 812
        pharmacological role 354
          analgesic 26
            adenosine 5
              1-methyladenosine 0
              1-tuberculosinyladenosine(1+) 0
              2-methylthio-N(6)-(Delta(2)-isopentenyl)adenosine + 0
              2-methylthio-N(6)-(cis-4-hydroxy-Delta(2)-isopentenyl)adenosine + 0
              2-thio-N(6)-(Delta(2)-isopentenyl)adenosine + 0
              3'-O-salicyl-AMP 0
              3'-phosphoadenylyl selenate 0
              3-iodo-4-aminobenzyl-5'-N-methylcarboxamidoadenosine 0
              3-iodobenzyl-5'-N-methylcarboxamidoadenosine 0
              5'-O-sulfamoyladenosine 0
              5'-S-methyl-5'-thioadenosine 0
              5'-chloro-5'-deoxyadenosine 0
              5'-deoxyadenosine 0
              5'-ethylthioadenosine 0
              9-ribosyl-trans-zeatin 0
              CGS-21680 0
              L-adenosylselenohomocysteine 0
              N(6),N(6)-dimethyladenosine 0
              N(6)-(Delta(2)-isopentenyl)adenosine + 0
              N-[(9-beta-D-ribofuranosyl-2-methylthiopurin-6-yl)carbamoyl]threonine 0
              N-[(9-beta-D-ribofuranosylpurin-6-yl)carbamoyl]threonine 0
              N-ethyl-5'-carboxamidoadenosine 0
              adenosine phosphate + 5
              adenosine residue 0
              adenylyl selenate 0
              alpha-N-(9-beta-D-ribofuranosylpurin-6-yl)glycinamide 0
              aspartyl adenylate beta-ketophosphonate isostere 0
              cordysinin B 0
              diadenosyl diphosphate + 0
              diadenosyl hexaphosphate + 0
              diadenosyl pentaphosphate + 0
              diadenosyl tetraphosphate + 0
              diadenosyl triphosphate + 0
              propionyl adenylate 0
              sangivamycin 0
              succinyladenosine 0
              thioadenosine + 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 835
    subatomic particle 819
      composite particle 819
        hadron 819
          baryon 819
            nucleon 819
              atomic nucleus 819
                atom 819
                  main group element atom 807
                    p-block element atom 804
                      carbon group element atom 775
                        carbon atom 771
                          organic molecular entity 771
                            heteroorganic entity 527
                              organochalcogen compound 496
                                organooxygen compound 431
                                  carbohydrates and carbohydrate derivatives 109
                                    carbohydrate 109
                                      carbohydrate derivative 98
                                        glycosyl compound 40
                                          N-glycosyl compound 27
                                            nucleoside 27
                                              ribonucleoside 6
                                                purine ribonucleoside 6
                                                  purines D-ribonucleoside 5
                                                    adenosine 5
                                                      1-methyladenosine 0
                                                      1-tuberculosinyladenosine(1+) 0
                                                      2-methylthio-N(6)-(Delta(2)-isopentenyl)adenosine + 0
                                                      2-methylthio-N(6)-(cis-4-hydroxy-Delta(2)-isopentenyl)adenosine + 0
                                                      2-thio-N(6)-(Delta(2)-isopentenyl)adenosine + 0
                                                      3'-O-salicyl-AMP 0
                                                      3'-phosphoadenylyl selenate 0
                                                      3-iodo-4-aminobenzyl-5'-N-methylcarboxamidoadenosine 0
                                                      3-iodobenzyl-5'-N-methylcarboxamidoadenosine 0
                                                      5'-O-sulfamoyladenosine 0
                                                      5'-S-methyl-5'-thioadenosine 0
                                                      5'-chloro-5'-deoxyadenosine 0
                                                      5'-deoxyadenosine 0
                                                      5'-ethylthioadenosine 0
                                                      9-ribosyl-trans-zeatin 0
                                                      CGS-21680 0
                                                      L-adenosylselenohomocysteine 0
                                                      N(6),N(6)-dimethyladenosine 0
                                                      N(6)-(Delta(2)-isopentenyl)adenosine + 0
                                                      N-[(9-beta-D-ribofuranosyl-2-methylthiopurin-6-yl)carbamoyl]threonine 0
                                                      N-[(9-beta-D-ribofuranosylpurin-6-yl)carbamoyl]threonine 0
                                                      N-ethyl-5'-carboxamidoadenosine 0
                                                      adenosine phosphate + 5
                                                      adenosine residue 0
                                                      adenylyl selenate 0
                                                      alpha-N-(9-beta-D-ribofuranosylpurin-6-yl)glycinamide 0
                                                      aspartyl adenylate beta-ketophosphonate isostere 0
                                                      cordysinin B 0
                                                      diadenosyl diphosphate + 0
                                                      diadenosyl hexaphosphate + 0
                                                      diadenosyl pentaphosphate + 0
                                                      diadenosyl tetraphosphate + 0
                                                      diadenosyl triphosphate + 0
                                                      propionyl adenylate 0
                                                      sangivamycin 0
                                                      succinyladenosine 0
                                                      thioadenosine + 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.