Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:L-histidine
go back to main search page
Accession:CHEBI:15971 term browser browse the term
Definition:The L-enantiomer of the amino acid histidine.
Synonyms:exact_synonym: (2S)-2-amino-3-(1H-imidazol-4-yl)propanoic acid
 related_synonym: (S)-4-(2-Amino-2-carboxyethyl)imidazole;   (S)-alpha-Amino-1H-imidazole-4-propionic acid;   (S)-alpha-amino-1H-Imidazole-4-propanoic acid;   Formula=C6H9N3O2;   H;   HISTIDINE;   His;   InChI=1S/C6H9N3O2/c7-5(6(10)11)1-4-2-8-3-9-4/h2-3,5H,1,7H2,(H,8,9)(H,10,11)/t5-/m0/s1;   InChIKey=HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N;   L-Histidin;   SMILES=N[C@@H](Cc1c[nH]cn1)C(O)=O
 alt_id: CHEBI:13117;   CHEBI:21324;   CHEBI:43048;   CHEBI:43114;   CHEBI:43190;   CHEBI:43239;   CHEBI:6240
 xref: Beilstein:84088 "Beilstein";   CAS:71-00-1 "ChemIDplus";   CAS:71-00-1 "KEGG COMPOUND";   CAS:71-00-1 "NIST Chemistry WebBook";   DrugBank:DB00117;   ECMDB:ECMDB00177;   Gmelin:83042 "Gmelin";   HMDB:HMDB0000177;   KEGG:C00135;   KEGG:D00032;   KNApSAcK:C00001363;   MetaCyc:HIS;   PDBeChem:HIS;   PMID:15206581 "Europe PMC";   PMID:21608102 "Europe PMC";   PMID:21719207 "Europe PMC";   PMID:22324399 "Europe PMC";   PMID:22415677 "Europe PMC";   PMID:22517640 "Europe PMC";   Reaxys:84088 "Reaxys";   Wikipedia:L-histidine;   YMDB:YMDB00369
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:32510;   is_conjugate_base_of CHEBI:32513;   is_enantiomer_of CHEBI:27947;   is_tautomer_of CHEBI:57595


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
ergothioneine term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Ache acetylcholinesterase JBrowse link 12 22,472,358 22,477,052 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19617
    role 19560
      biological role 19553
        biochemical role 19059
          metabolite 19039
            histidine 1
              L-histidine 1
                Ala-Gly-His 0
                Ala-Leu-Leu-His 0
                Ala-Val-Asp-His 0
                Asn-His 0
                Asn-Trp-Cys-His 0
                Asp-His 0
                Cys-Cys-His-His 0
                Cys-Met-Phe-His 0
                Gly-His 0
                His-His 0
                His-Ile 0
                His-Phe 0
                Ile-His 0
                L-histidine derivative + 1
                L-histidine residue + 0
                L-histidyl group 0
                Leu-Asn-His 0
                N(2)-L-histidino group 0
                N(alpha)-(L-gamma-glutamyl)-hercynyl-L-cysteine sulfoxide 0
                N(alpha)-(L-gamma-glutamyl)-hercynyl-L-selenocysteine 0
                N(pros)-L-histidino group 0
                N(tele)-L-histidino group 0
                Phe-His 0
                Ser-His 0
                Thr-Ala-His 0
                Thr-His 0
                Tyr-His 0
                Val-His 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19617
    subatomic particle 19613
      composite particle 19613
        hadron 19613
          baryon 19613
            nucleon 19613
              atomic nucleus 19613
                atom 19613
                  main group element atom 19491
                    p-block element atom 19491
                      carbon group element atom 19363
                        carbon atom 19355
                          organic molecular entity 19355
                            organic group 18311
                              organic divalent group 18301
                                organodiyl group 18301
                                  carbonyl group 18186
                                    carbonyl compound 18186
                                      carboxylic acid 17852
                                        amino acid 12310
                                          alpha-amino acid 7413
                                            L-alpha-amino acid 7071
                                              L-histidine 1
                                                Ala-Gly-His 0
                                                Ala-Leu-Leu-His 0
                                                Ala-Val-Asp-His 0
                                                Asn-His 0
                                                Asn-Trp-Cys-His 0
                                                Asp-His 0
                                                Cys-Cys-His-His 0
                                                Cys-Met-Phe-His 0
                                                Gly-His 0
                                                His-His 0
                                                His-Ile 0
                                                His-Phe 0
                                                Ile-His 0
                                                L-histidine derivative + 1
                                                L-histidine residue + 0
                                                L-histidyl group 0
                                                Leu-Asn-His 0
                                                N(2)-L-histidino group 0
                                                N(alpha)-(L-gamma-glutamyl)-hercynyl-L-cysteine sulfoxide 0
                                                N(alpha)-(L-gamma-glutamyl)-hercynyl-L-selenocysteine 0
                                                N(pros)-L-histidino group 0
                                                N(tele)-L-histidino group 0
                                                Phe-His 0
                                                Ser-His 0
                                                Thr-Ala-His 0
                                                Thr-His 0
                                                Tyr-His 0
                                                Val-His 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.