Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:cephalosporin C
go back to main search page
Accession:CHEBI:15776 term browser browse the term
Definition:A cephalosporin antibiotic carrying a 3-acetoxymethyl substituent and a 6-oxo-N(6)-L-lysino group at position 7.
Synonyms:exact_synonym: (6R,7R)-3-[(acetyloxy)methyl]-7-{[(5R)-5-amino-5-carboxypentanoyl]amino}-8-oxo-5-thia-1-azabicyclo[4.2.0]oct-2-ene-2-carboxylic acid
 related_synonym: 7-(5-Amino-5-carboxyvaleramido)cephalosporanic acid;   Formula=C16H21N3O8S;   InChI=1S/C16H21N3O8S/c1-7(20)27-5-8-6-28-14-11(13(22)19(14)12(8)16(25)26)18-10(21)4-2-3-9(17)15(23)24/h9,11,14H,2-6,17H2,1H3,(H,18,21)(H,23,24)(H,25,26)/t9-,11-,14-/m1/s1;   InChIKey=HOKIDJSKDBPKTQ-GLXFQSAKSA-N;   SMILES=[H][C@]12SCC(COC(C)=O)=C(N1C(=O)[C@H]2NC(=O)CCC[C@@H](N)C(O)=O)C(O)=O
 alt_id: CHEBI:13953;   CHEBI:23065;   CHEBI:3539
 xref: Beilstein:65348 "Beilstein";   CAS:61-24-5 "ChemIDplus";   CAS:61-24-5 "KEGG COMPOUND";   DrugBank:DB03313;   HMDB:HMDB0060450;   KEGG:C00916
 xref_mesh: MESH:C025163
 xref: MetaCyc:CSC;   PDBeChem:CSC;   PMID:13315229 "Europe PMC";   PMID:14370161 "Europe PMC";   PMID:18279889 "Europe PMC";   PMID:19787461 "Europe PMC";   PMID:20171092 "Europe PMC";   PMID:20391764 "Europe PMC";   PMID:2083978 "Europe PMC";   PMID:21219942 "Europe PMC";   PMID:21866341 "Europe PMC";   PMID:22068491 "Europe PMC";   PMID:23053347 "Europe PMC";   PMID:23334835 "Europe PMC";   PMID:23828600 "Europe PMC";   PMID:9131470 "Europe PMC";   Reaxys:65348 "Reaxys";   Wikipedia:Cephalosporin_C
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:57511


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
cephalosporin C term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Abcc4 ATP binding cassette subfamily C member 4 JBrowse link 15 103,695,415 103,927,980 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19654
    role 19598
      application 19220
        pharmaceutical 19081
          drug 19081
            drug allergen 9747
              cephalosporin 534
                cephalosporin C 1
                  deacetoxycephalosporin C 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19654
    subatomic particle 19650
      composite particle 19650
        hadron 19650
          baryon 19650
            nucleon 19650
              atomic nucleus 19650
                atom 19650
                  main group element atom 19531
                    p-block element atom 19531
                      carbon group element atom 19413
                        carbon atom 19405
                          organic molecular entity 19405
                            organic group 18331
                              organic divalent group 18321
                                organodiyl group 18321
                                  carbonyl group 18209
                                    carbonyl compound 18209
                                      carboxylic acid 17908
                                        carboacyl group 16930
                                          univalent carboacyl group 16930
                                            carbamoyl group 16610
                                              carboxamide 16610
                                                lactam 2919
                                                  beta-lactam 707
                                                    beta-lactam antibiotic 695
                                                      cephem 535
                                                        cephalosporin 534
                                                          cephalosporanic acid 14
                                                            cephalosporin C 1
                                                              deacetoxycephalosporin C 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.