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ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:pentanoyl-CoA
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Accession:CHEBI:15536 term browser browse the term
Definition:A short-chain fatty acyl-CoA that results from the formal condensation of the thiol group of coenzyme A with the carboxy group of pentanoic acid.
Synonyms:exact_synonym: 3'-phosphoadenosine 5'-(3-{(3R)-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4-oxo-4-[(3-oxo-3-{[2-(pentanoylsulfanyl)ethyl]amino}propyl)amino]butyl} dihydrogen diphosphate)
 related_synonym: 5:0-CoA;   C5:0-CoA;   Formula=C26H44N7O17P3S;   InChI=1S/C26H44N7O17P3S/c1-4-5-6-17(35)54-10-9-28-16(34)7-8-29-24(38)21(37)26(2,3)12-47-53(44,45)50-52(42,43)46-11-15-20(49-51(39,40)41)19(36)25(48-15)33-14-32-18-22(27)30-13-31-23(18)33/h13-15,19-21,25,36-37H,4-12H2,1-3H3,(H,28,34)(H,29,38)(H,42,43)(H,44,45)(H2,27,30,31)(H2,39,40,41)/t15-,19-,20-,21+,25-/m1/s1;   InChIKey=RXUATCUKICAIOA-ZMHDXICWSA-N;   S-Valeryl-coenzym-A;   S-valeryl-CoA;   S-valeryl-coenzyme-A;   SMILES=CCCCC(=O)SCCNC(=O)CCNC(=O)[C@H](O)C(C)(C)COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1OP(O)(O)=O)n1cnc2c(N)ncnc12;   coenzyme A S-pentanoate;   pentanoyl-coenzyme A;   valeryl-CoA;   valeryl-coenzyme A
 alt_id: CHEBI:14752;   CHEBI:25893;   CHEBI:7981
 xref: CAS:4752-33-4 "ChemIDplus";   CAS:4752-33-4 "KEGG COMPOUND";   HMDB:HMDB0013037;   KEGG:C00888;   PMID:11879205 "Europe PMC";   PMID:16133321 "Europe PMC";   PMID:19860832 "Europe PMC";   PMID:3597403 "Europe PMC";   Reaxys:78329 "Reaxys"
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:57389


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  CHEBI ontology 19748
    role 19695
      biological role 19693
        biochemical role 19191
          cofactor 15402
            coenzyme 840
              coenzyme A 28
                pentanoyl-CoA 0
                  5-hydroxypentanoyl-CoA 0
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  CHEBI ontology 19748
    subatomic particle 19744
      composite particle 19744
        hadron 19744
          baryon 19744
            nucleon 19744
              atomic nucleus 19744
                atom 19744
                  main group element atom 19628
                    p-block element atom 19628
                      chalcogen 19337
                        oxygen atom 19298
                          oxygen molecular entity 19298
                            hydroxides 19053
                              oxoacid 18117
                                pnictogen oxoacid 9850
                                  phosphorus oxoacid 8673
                                    phosphoric acids 7343
                                      phosphoric acid 7343
                                        phosphoric acid derivative 6994
                                          phosphate 6994
                                            organic phosphate 6993
                                              carbohydrate phosphate 1515
                                                phospho sugar 1445
                                                  aldose phosphate 1443
                                                    aldopentose phosphate 1437
                                                      ribose phosphate 1431
                                                        ribonucleotide 1390
                                                          purine ribonucleotide 1363
                                                            adenyl ribonucleotide 1242
                                                              adenosine phosphate 249
                                                                adenosine 5'-phosphate 248
                                                                  ADP 83
                                                                    coenzyme A 28
                                                                      acyl-CoA 28
                                                                        fatty acyl-CoA 16
                                                                          short-chain fatty acyl-CoA 2
                                                                            pentanoyl-CoA 0
                                                                              5-hydroxypentanoyl-CoA 0
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