Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:arachidonoyl-CoA
go back to main search page
Accession:CHEBI:15514 term browser browse the term
Definition:An unsaturated fatty acyl-CoA that results from the formal condensation of the thiol group of coenzyme A with the carboxy group of arachidononic acid.
Synonyms:exact_synonym: 3'-phosphoadenosine 5'-{3-[(3R)-3-hydroxy-4-({3-[(2-{[(5Z,8Z,11Z,14Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoyl]sulfanyl}ethyl)amino]-3-oxopropyl}amino)-2,2-dimethyl-4-oxobutyl] dihydrogen diphosphate}
 related_synonym: (5Z,8Z,11Z,14Z)-5,8,11,14-eicosatetraenoyl-CoA;   (5Z,8Z,11Z,14Z)-5,8,11,14-eicosatetraenoyl-coenzyme A;   (5Z,8Z,11Z,14Z)-5,8,11,14-icosatetraenoyl-coenzyme A;   (5Z,8Z,11Z,14Z)-Icosatetraenoyl-CoA;   Arachidonyl-CoA;   C20:4-CoA;   Formula=C41H66N7O17P3S;   InChI=1S/C41H66N7O17P3S/c1-4-5-6-7-8-9-10-11-12-13-14-15-16-17-18-19-20-21-32(50)69-25-24-43-31(49)22-23-44-39(53)36(52)41(2,3)27-62-68(59,60)65-67(57,58)61-26-30-35(64-66(54,55)56)34(51)40(63-30)48-29-47-33-37(42)45-28-46-38(33)48/h8-9,11-12,14-15,17-18,28-30,34-36,40,51-52H,4-7,10,13,16,19-27H2,1-3H3,(H,43,49)(H,44,53)(H,57,58)(H,59,60)(H2,42,45,46)(H2,54,55,56)/b9-8-,12-11-,15-14-,18-17-/t30-,34-,35-,36+,40-/m1/s1;   InChIKey=JDEPVTUUCBFJIW-YQVDHACTSA-N;   SMILES=CCCCC\\C=C/C\\C=C/C\\C=C/C\\C=C/CCCC(=O)SCCNC(=O)CCNC(=O)[C@H](O)C(C)(C)COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1OP(O)(O)=O)n1cnc2c(N)ncnc12;   all-cis-5,8,11,14-eicosatetraenoyl-CoA;   all-cis-5,8,11,14-eicosatetraenoyl-coenzyme A;   arachidonoyl-coenzyme A;   arachidonyl-coenzyme A;   cis-Delta(5,8,11,14)-eicosatetraenoyl-CoA;   cis-Delta(5,8,11,14)-eicosatetraenoyl-coenzyme A
 alt_id: CHEBI:13853;   CHEBI:13854;   CHEBI:22611;   CHEBI:22613;   CHEBI:2800
 xref: CAS:17046-56-9 "ChemIDplus";   CAS:17046-56-9 "KEGG COMPOUND";   HMDB:HMDB0006523;   KEGG:C02249
 xref_mesh: MESH:C026563
 xref: PMID:1323964 "Europe PMC";   PMID:16181777 "Europe PMC";   PMID:16344985 "Europe PMC";   PMID:2105213 "Europe PMC";   PMID:2505330 "Europe PMC";   PMID:2528345 "Europe PMC";   PMID:3989882 "Europe PMC";   PMID:4030780 "Europe PMC";   PMID:6303134 "Europe PMC";   PMID:6466693 "Europe PMC";   PMID:8605368 "Europe PMC";   Reaxys:9316147 "Reaxys"
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:57368


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
arachidonoyl-CoA term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G PPARA peroxisome proliferator activated receptor alpha JBrowse link 22 46,150,526 46,243,756 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 23677
    chemical entity 23638
      atom 23624
        nonmetal atom 23262
          carbon atom 23118
            organic molecular entity 23118
              bioconjugate 13
                arachidonoyl-CoA 1
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 23677
    subatomic particle 23624
      composite particle 23624
        hadron 23624
          baryon 23624
            nucleon 23624
              atomic nucleus 23624
                atom 23624
                  main group element atom 23441
                    p-block element atom 23441
                      chalcogen 22642
                        oxygen atom 22603
                          oxygen molecular entity 22603
                            hydroxides 21863
                              oxoacid 21066
                                pnictogen oxoacid 8906
                                  phosphorus oxoacid 8799
                                    phosphoric acids 7672
                                      phosphoric acid 7672
                                        phosphoric acid derivative 7308
                                          phosphate 7308
                                            organic phosphate 7307
                                              carbohydrate phosphate 1536
                                                phospho sugar 1471
                                                  aldose phosphate 1469
                                                    aldopentose phosphate 1463
                                                      ribose phosphate 1457
                                                        ribonucleotide 1416
                                                          purine ribonucleotide 1389
                                                            adenyl ribonucleotide 1271
                                                              adenosine phosphate 251
                                                                adenosine 5'-phosphate 250
                                                                  ADP 81
                                                                    coenzyme A 29
                                                                      acyl-CoA 29
                                                                        fatty acyl-CoA 16
                                                                          unsaturated fatty acyl-CoA 5
                                                                            arachidonoyl-CoA 1
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.