Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:partially-defined glycan
go back to main search page
Accession:CHEBI:146306 term browser browse the term
Definition:A member of the class of carbohydrates and carbohydrate derivatives that is any oligosaccharide or polysaccharide in which the identity of one or more of the individual monosaccharide units, their connectivity (position of attachment) or the stereochemistry (alpha- or beta-) of one or more of the glycosidic linkages is not known.
Synonyms:related_synonym: partially-defined glycans



show annotations for term's descendants           Sort by:
 

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 20072
    chemical entity 20071
      atom 20071
        nonmetal atom 19959
          oxygen atom 19681
            oxygen molecular entity 19681
              organooxygen compound 19239
                carbohydrates and carbohydrate derivatives 13962
                  partially-defined glycan 0
                    2-acetamido-2-deoxy-3-O-D-galactopyranosyl-D-galactitol 0
                    ?-D-Glcp-(1->2)-[?-D-Glcp-(1->6)]-?-D-Glcp 0
                    ?-D-Glcp-(1->2)-[?-D-Glcp-(1->6)]-beta-D-Glcp 0
                    ?-D-GlcpNAc-(1->3)-?-D-Galp-(1->3)-D-GalNAc-OH 0
                    ?-D-Manp-(1->5)-?-D-Araf-(1->2)-D-Araf 0
                    ?-L-Fucp-(1->?)-?-D-Galp-(1->?)-D-GlcNAc 0
                    D-Galp-(1->3)-D-GalpNAc + 0
                    D-Galp-(1->3)-beta-D-Galp-(1->4)-D-Glcp 0
                    D-Galp-(1->4)-D-GlcpNAc + 0
                    D-Galp-(1->4)-D-GlcpNAc-(1->3)-D-GalNAc-OH 0
                    D-Galp-(1->4)-D-GlcpNAc-(1->3)-D-GalpNAc 0
                    D-Galp-(1->4)-alpha-D-Galp-(1->4)-beta-D-Galp 0
                    D-Galp-(1->6)-beta-D-Galp-(1->4)-D-Glcp 0
                    D-Galp3S-(1->4)-D-Glcp 0
                    D-GalpNAc-(1->3)-D-GalpNAc + 0
                    D-Glcp-(1->2)-D-Galp 0
                    D-Glcp-(1->2)-alpha-D-Galp 0
                    D-Glcp-(1->4)-alpha-D-Glcp-(1->4)-beta-D-Glcp + 0
                    D-GlcpNAc-(1->3)-D-GalpNAc 0
                    D-GlcpNAc-(1->4)-D-GlcpNAc 0
                    D-GlcpNAc-(?1->6)-D-GalpNAc 0
                    D-Manp-(1->3)-D-Manp 0
                    D-Manp-(1->5)-D-Araf 0
                    GlyTouCan G02815KT 0
                    GlyTouCan G06110VR 0
                    GlyTouCan G06356OH 0
                    GlyTouCan G14548ZL 0
                    GlyTouCan G14669DU 0
                    GlyTouCan G22140GZ + 0
                    GlyTouCan G23294PN 0
                    GlyTouCan G23863VK 0
                    GlyTouCan G29068FM 0
                    GlyTouCan G31852PQ 0
                    GlyTouCan G39397SW 0
                    GlyTouCan G41247ZX 0
                    GlyTouCan G42358LZ 0
                    GlyTouCan G43417UB 0
                    GlyTouCan G48975GN 0
                    GlyTouCan G57818FI + 0
                    GlyTouCan G62765YT 0
                    GlyTouCan G70101JE 0
                    GlyTouCan G72291OX 0
                    GlyTouCan G74724QE 0
                    GlyTouCan G80920RR 0
                    GlyTouCan G84452RH 0
                    GlyTouCan G93860XO 0
                    GlyTouCan G97763ON 0
                    GlyTouCan G97938ZK 0
                    GlyTouCan G98058RD 0
                    GlyTouCan G99758GD 0
                    Neu5Ac-?-(2->3)-D-Galp 0
                    alpha-D-Glcp-(1->3)-?-D-Glcp-(1->2)-beta-D-Glcp 0
                    base composition glycan + 0
                    beta-D-galactopyranosyl D-galactopyranoside 0
                    composition glycan 0
                    di-(D-mannosylated) alpha-D-Manp-(1->3)-[alpha-D-Manp-(1->6)]-beta-D-Manp-(1->4)-beta-D-GlcpNAc-(1->4)-D-GlcpNAc + 0
                    topology glycan 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 20072
    subatomic particle 20071
      composite particle 20071
        hadron 20071
          baryon 20071
            nucleon 20071
              atomic nucleus 20071
                atom 20071
                  main group element atom 19971
                    p-block element atom 19971
                      carbon group element atom 19894
                        carbon atom 19887
                          organic molecular entity 19887
                            heteroorganic entity 19577
                              organochalcogen compound 19339
                                organooxygen compound 19239
                                  carbohydrates and carbohydrate derivatives 13962
                                    partially-defined glycan 0
                                      2-acetamido-2-deoxy-3-O-D-galactopyranosyl-D-galactitol 0
                                      ?-D-Glcp-(1->2)-[?-D-Glcp-(1->6)]-?-D-Glcp 0
                                      ?-D-Glcp-(1->2)-[?-D-Glcp-(1->6)]-beta-D-Glcp 0
                                      ?-D-GlcpNAc-(1->3)-?-D-Galp-(1->3)-D-GalNAc-OH 0
                                      ?-D-Manp-(1->5)-?-D-Araf-(1->2)-D-Araf 0
                                      ?-L-Fucp-(1->?)-?-D-Galp-(1->?)-D-GlcNAc 0
                                      D-Galp-(1->3)-D-GalpNAc + 0
                                      D-Galp-(1->3)-beta-D-Galp-(1->4)-D-Glcp 0
                                      D-Galp-(1->4)-D-GlcpNAc + 0
                                      D-Galp-(1->4)-D-GlcpNAc-(1->3)-D-GalNAc-OH 0
                                      D-Galp-(1->4)-D-GlcpNAc-(1->3)-D-GalpNAc 0
                                      D-Galp-(1->4)-alpha-D-Galp-(1->4)-beta-D-Galp 0
                                      D-Galp-(1->6)-beta-D-Galp-(1->4)-D-Glcp 0
                                      D-Galp3S-(1->4)-D-Glcp 0
                                      D-GalpNAc-(1->3)-D-GalpNAc + 0
                                      D-Glcp-(1->2)-D-Galp 0
                                      D-Glcp-(1->2)-alpha-D-Galp 0
                                      D-Glcp-(1->4)-alpha-D-Glcp-(1->4)-beta-D-Glcp + 0
                                      D-GlcpNAc-(1->3)-D-GalpNAc 0
                                      D-GlcpNAc-(1->4)-D-GlcpNAc 0
                                      D-GlcpNAc-(?1->6)-D-GalpNAc 0
                                      D-Manp-(1->3)-D-Manp 0
                                      D-Manp-(1->5)-D-Araf 0
                                      GlyTouCan G02815KT 0
                                      GlyTouCan G06110VR 0
                                      GlyTouCan G06356OH 0
                                      GlyTouCan G14548ZL 0
                                      GlyTouCan G14669DU 0
                                      GlyTouCan G22140GZ + 0
                                      GlyTouCan G23294PN 0
                                      GlyTouCan G23863VK 0
                                      GlyTouCan G29068FM 0
                                      GlyTouCan G31852PQ 0
                                      GlyTouCan G39397SW 0
                                      GlyTouCan G41247ZX 0
                                      GlyTouCan G42358LZ 0
                                      GlyTouCan G43417UB 0
                                      GlyTouCan G48975GN 0
                                      GlyTouCan G57818FI + 0
                                      GlyTouCan G62765YT 0
                                      GlyTouCan G70101JE 0
                                      GlyTouCan G72291OX 0
                                      GlyTouCan G74724QE 0
                                      GlyTouCan G80920RR 0
                                      GlyTouCan G84452RH 0
                                      GlyTouCan G93860XO 0
                                      GlyTouCan G97763ON 0
                                      GlyTouCan G97938ZK 0
                                      GlyTouCan G98058RD 0
                                      GlyTouCan G99758GD 0
                                      Neu5Ac-?-(2->3)-D-Galp 0
                                      alpha-D-Glcp-(1->3)-?-D-Glcp-(1->2)-beta-D-Glcp 0
                                      base composition glycan + 0
                                      beta-D-galactopyranosyl D-galactopyranoside 0
                                      composition glycan 0
                                      di-(D-mannosylated) alpha-D-Manp-(1->3)-[alpha-D-Manp-(1->6)]-beta-D-Manp-(1->4)-beta-D-GlcpNAc-(1->4)-D-GlcpNAc + 0
                                      topology glycan 0
paths to the root