Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:octahydronaphthalenes
go back to main search page
Accession:CHEBI:138397 term browser browse the term
Definition:Any carbobycyclic compound that is an octahydronaphthalene or a compound obtained from an octahydronaphthalene by formal substitution of one or more hydrogens.


show annotations for term's descendants           Sort by:
 
(+)-artemisinic acid term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Cebpa CCAAT/enhancer binding protein alpha decreases expression
multiple interactions
ISO [artemisic acid results in decreased expression of CEBPA mRNA] which results in decreased expression of HMGCR mRNA; artemisic acid results in decreased expression of CEBPA mRNA
[[artemisic acid results in decreased expression of CEBPA mRNA] which results in decreased expression of HMGCR mRNA] which results in decreased chemical synthesis of Cholesterol
CTD PMID:23063590 NCBI chr 1:91,363,492...91,366,164
Ensembl chr 1:91,363,492...91,366,164
JBrowse link
G Dct dopachrome tautomerase decreases expression ISO artemisic acid results in decreased expression of DCT mRNA CTD PMID:23063590 NCBI chr15:103,208,174...103,245,033
Ensembl chr15:103,208,258...103,244,494
JBrowse link
G Hmgcr 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase multiple interactions
decreases expression
ISO [[artemisic acid results in decreased expression of CEBPA mRNA] which results in decreased expression of HMGCR mRNA] which results in decreased chemical synthesis of Cholesterol; [artemisic acid results in decreased expression of HMGCR protein] which results in decreased chemical synthesis of Cholesterol
[artemisic acid results in decreased expression of CEBPA mRNA] which results in decreased expression of HMGCR mRNA; artemisic acid results in decreased expression of HMGCR mRNA; artemisic acid results in decreased expression of HMGCR protein
CTD PMID:23063590 NCBI chr 2:27,480,224...27,500,654
Ensembl chr 2:27,480,226...27,500,654
JBrowse link
G Kit KIT proto-oncogene receptor tyrosine kinase decreases expression ISO artemisic acid results in decreased expression of KIT mRNA CTD PMID:23063590 NCBI chr14:35,072,131...35,149,638
Ensembl chr14:35,072,108...35,149,610
JBrowse link
G Kitlg KIT ligand decreases expression ISO artemisic acid results in decreased expression of KITLG mRNA CTD PMID:23063590 NCBI chr 7:42,269,784...42,351,054
Ensembl chr 7:42,269,784...42,351,054
JBrowse link
G Mif macrophage migration inhibitory factor decreases expression ISO artemisic acid results in decreased expression of MIF mRNA CTD PMID:23063590 NCBI chr20:13,715,219...13,732,980
Ensembl chr20:13,732,198...13,732,859
JBrowse link
G Mitf melanocyte inducing transcription factor decreases expression ISO artemisic acid results in decreased expression of MITF mRNA CTD PMID:23063590 NCBI chr 4:130,172,484...130,425,496
Ensembl chr 4:130,172,727...130,425,532
JBrowse link
G Tyr tyrosinase decreases expression ISO artemisic acid results in decreased expression of TYR mRNA CTD PMID:23063590 NCBI chr 1:151,012,598...151,106,802
Ensembl chr 1:151,012,598...151,106,802
JBrowse link
G Tyrp1 tyrosinase-related protein 1 decreases expression ISO artemisic acid results in decreased expression of TYRP1 mRNA CTD PMID:23063590 NCBI chr 5:98,387,291...98,406,083
Ensembl chr 5:98,387,291...98,406,083
JBrowse link
drimenol term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Bax BCL2 associated X, apoptosis regulator increases expression ISO drimenol results in increased expression of BAX protein CTD PMID:30935903 NCBI chr 1:101,451,801...101,457,207
Ensembl chr 1:101,451,802...101,457,207
JBrowse link
G Bcl2 BCL2, apoptosis regulator decreases expression ISO drimenol results in decreased expression of BCL2 protein CTD PMID:30935903 NCBI chr13:26,605,426...26,769,374
Ensembl chr13:26,605,426...26,769,374
JBrowse link
G Casp3 caspase 3 increases activity ISO drimenol results in increased activity of CASP3 protein CTD PMID:30935903 NCBI chr16:48,845,011...48,863,249
Ensembl chr16:48,845,012...48,863,204
JBrowse link
G Casp9 caspase 9 increases cleavage ISO drimenol results in increased cleavage of CASP9 protein CTD PMID:30935903 NCBI chr 5:160,356,211...160,373,774
Ensembl chr 5:160,355,833...160,373,778
JBrowse link
Goitrin term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Gsta2 glutathione S-transferase alpha 2 increases expression
multiple interactions
EXP goitrin results in increased expression of GSTA2 protein
Triiodothyronine inhibits the reaction [goitrin results in increased expression of GSTA2 protein]
CTD PMID:7532609 NCBI chr 8:85,640,081...85,645,621 JBrowse link
G Gstp1 glutathione S-transferase pi 1 decreases expression
increases expression
multiple interactions
EXP goitrin results in decreased expression of GSTP1 protein
goitrin results in increased expression of GSTP1 protein
Triiodothyronine inhibits the reaction [goitrin results in increased expression of GSTP1 protein]
CTD PMID:7532609 NCBI chr 1:219,291,679...219,294,147
Ensembl chr 1:219,291,679...219,294,147
JBrowse link

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19853
    chemical entity 19853
      molecular entity 19851
        polyatomic entity 19765
          molecule 19600
            cyclic compound 19417
              bicyclic compound 16926
                carbobicyclic compound 5807
                  octahydronaphthalenes 15
                    (+)-5-epi-aristolochene + 0
                    (+)-O-methylkolavelool 0
                    (+)-Tau-muurolol 0
                    (+)-artemisinic acid 9
                    (+)-artemisinic alcohol + 9
                    (+)-epicubenol 0
                    (+)-eremophilene 0
                    (+)-gamma-cadinene + 0
                    (+)-kolavelool + 0
                    (+)-kolavenyl diphosphate 0
                    (+)-subersic acid 0
                    (-)-4-epi-eremophilene + 0
                    (-)-5-epi-eremophilene 0
                    (-)-7-epi-alpha-selinene 0
                    (-)-Tau-muurolol 0
                    (-)-cubenol 0
                    (-)-epicubenol 0
                    (-)-eremophilene 0
                    (-)-gamma-cadinene + 0
                    (-)-kolavenyl diphosphate 0
                    (11R)-dihydroartemisinic aldehyde 0
                    (13E)-labda-7,13-dien-15-ol 0
                    (1S,4aS)-1,4a-dimethyl-1,2,3,4,4a,5,6,8a-octahydronaphthalene 0
                    14-hydroxy-6,12-muuroloadien-15-oic acid 0
                    2beta-hydroxy-5-epi-aristolochene 0
                    5-epi-alpha-selinene 0
                    6-isopropenyl-4,4a-dimethyl-2,3,4,4a,5,6,7,8-octahydronaphthalen-2-ol + 0
                    7-epi-alpha-eudesmol 0
                    8-epi-ilicicolin H 0
                    UCS1025 A 0
                    achilleol B 0
                    alpha,gamma-onoceradienediol 0
                    alpha-cadinol 0
                    alpha-eudesmol 0
                    alpha-seco-amyrin 0
                    alpha-selinene 0
                    amorpha-4,11-diene 0
                    aristolochene + 0
                    artemisinic aldehyde + 0
                    ballodiolic acid 0
                    ballotenic acid 0
                    beta-seco-amyrin 0
                    callicarpenal 0
                    delta-cadinol 0
                    dihydroartemisinic acid 0
                    dihydromonacolin L + 0
                    dihydromonacolin L acid + 0
                    dihydrostemphyloxin I 0
                    drimendiol 0
                    drimenol + 4
                    drimenol diphosphate(3-) 0
                    drimenol phosphate(2-) 0
                    dysidine 0
                    elisabethatriene 0
                    equisetin 0
                    gamma-muurolene 0
                    hedychilactone D 0
                    ilicicolin H + 0
                    lamesticumin C 0
                    lamesticumin D 0
                    lobophytumin D 0
                    melemeleone B 0
                    mitchellene D 0
                    mitchellene E 0
                    oplodiol 0
                    sch 210971 0
                    sch 210972 + 0
                    sch 213766 0
                    scutebarbatine C 0
                    sibirene + 0
                    solanapyrone A + 2
                    solanapyrone B 0
                    solanapyrone C 0
                    solanapyrone D 0
                    solanapyrone E 0
                    stemphyloxin I + 0
                    tau-cadinol 0
                    terpentecin 0
                    terpentedienyl diphosphate 0
                    terpentetriene + 0
                    trichosetin + 0
                    valerianol 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19853
    subatomic particle 19851
      composite particle 19851
        hadron 19851
          baryon 19851
            nucleon 19851
              atomic nucleus 19851
                atom 19851
                  main group element atom 19744
                    p-block element atom 19744
                      carbon group element atom 19650
                        carbon group molecular entity 19650
                          organic molecular entity 19639
                            organic molecule 19568
                              organic cyclic compound 19378
                                carbocyclic compound 18284
                                  carbopolycyclic compound 17043
                                    carbobicyclic compound 5807
                                      octahydronaphthalenes 15
                                        (+)-5-epi-aristolochene + 0
                                        (+)-O-methylkolavelool 0
                                        (+)-Tau-muurolol 0
                                        (+)-artemisinic acid 9
                                        (+)-artemisinic alcohol + 9
                                        (+)-epicubenol 0
                                        (+)-eremophilene 0
                                        (+)-gamma-cadinene + 0
                                        (+)-kolavelool + 0
                                        (+)-kolavenyl diphosphate 0
                                        (+)-subersic acid 0
                                        (-)-4-epi-eremophilene + 0
                                        (-)-5-epi-eremophilene 0
                                        (-)-7-epi-alpha-selinene 0
                                        (-)-Tau-muurolol 0
                                        (-)-cubenol 0
                                        (-)-epicubenol 0
                                        (-)-eremophilene 0
                                        (-)-gamma-cadinene + 0
                                        (-)-kolavenyl diphosphate 0
                                        (11R)-dihydroartemisinic aldehyde 0
                                        (13E)-labda-7,13-dien-15-ol 0
                                        (1S,4aS)-1,4a-dimethyl-1,2,3,4,4a,5,6,8a-octahydronaphthalene 0
                                        14-hydroxy-6,12-muuroloadien-15-oic acid 0
                                        2beta-hydroxy-5-epi-aristolochene 0
                                        5-epi-alpha-selinene 0
                                        6-isopropenyl-4,4a-dimethyl-2,3,4,4a,5,6,7,8-octahydronaphthalen-2-ol + 0
                                        7-epi-alpha-eudesmol 0
                                        8-epi-ilicicolin H 0
                                        UCS1025 A 0
                                        achilleol B 0
                                        alpha,gamma-onoceradienediol 0
                                        alpha-cadinol 0
                                        alpha-eudesmol 0
                                        alpha-seco-amyrin 0
                                        alpha-selinene 0
                                        amorpha-4,11-diene 0
                                        aristolochene + 0
                                        artemisinic aldehyde + 0
                                        ballodiolic acid 0
                                        ballotenic acid 0
                                        beta-seco-amyrin 0
                                        callicarpenal 0
                                        delta-cadinol 0
                                        dihydroartemisinic acid 0
                                        dihydromonacolin L + 0
                                        dihydromonacolin L acid + 0
                                        dihydrostemphyloxin I 0
                                        drimendiol 0
                                        drimenol + 4
                                        drimenol diphosphate(3-) 0
                                        drimenol phosphate(2-) 0
                                        dysidine 0
                                        elisabethatriene 0
                                        equisetin 0
                                        gamma-muurolene 0
                                        hedychilactone D 0
                                        ilicicolin H + 0
                                        lamesticumin C 0
                                        lamesticumin D 0
                                        lobophytumin D 0
                                        melemeleone B 0
                                        mitchellene D 0
                                        mitchellene E 0
                                        oplodiol 0
                                        sch 210971 0
                                        sch 210972 + 0
                                        sch 213766 0
                                        scutebarbatine C 0
                                        sibirene + 0
                                        solanapyrone A + 2
                                        solanapyrone B 0
                                        solanapyrone C 0
                                        solanapyrone D 0
                                        solanapyrone E 0
                                        stemphyloxin I + 0
                                        tau-cadinol 0
                                        terpentecin 0
                                        terpentedienyl diphosphate 0
                                        terpentetriene + 0
                                        trichosetin + 0
                                        valerianol 0
paths to the root