Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:secondary ammonium ion
go back to main search page
Accession:CHEBI:137419 term browser browse the term
Definition:An organic cation obtained by protonation of any secondary amino compound; major species at pH 7.3.
Synonyms:related_synonym: Formula=H2NR2;   SMILES=*[NH+](*)[H];   a secondary amine;   secondary amine(1+)
 xref: MetaCyc:Secondary-Amines
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:32863


show annotations for term's descendants           Sort by:
 
pentolinium tartrate term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Ins2 insulin 2 multiple interactions ISO Pentolinium Tartrate inhibits the reaction [Epinephrine results in decreased secretion of INS protein] CTD PMID:1218171 NCBI chr 1:215,856,967...215,858,034
Ensembl chr 1:215,856,971...215,858,034
JBrowse link

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19773
    chemical entity 19773
      molecular entity 19771
        ion 15935
          organic ion 8447
            organic cation 7303
              secondary ammonium ion 1
                (1S,7R,8R,14S)-6,9-dioxo-15,17-diazatetracyclo[12.2.2.1(3,7).1(8,12)]icosa-3(20),12(19)-dien-15-ium 0
                (S)-norreticuline(1+) 0
                aculene A(1+) 0
                aculene B(1+) 0
                ent-tamsulosin(1+) + 0
                mefuparib(1+) + 0
                methamphetamine(1+) + 0
                morpholinium 0
                piperidinium 0
                pyrrolidinium ion + 1
                secondary aliphatic ammonium ion + 0
                solasodine(1+) 0
                spectinomycin(1+) 0
                tamsulosin(1+) + 0
                tomatidine(1+) 0
                validoxylamine B(1+) 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19773
    subatomic particle 19771
      composite particle 19771
        hadron 19771
          baryon 19771
            nucleon 19771
              atomic nucleus 19771
                atom 19771
                  main group element atom 19665
                    main group molecular entity 19665
                      s-block molecular entity 19430
                        hydrogen molecular entity 19424
                          hydrides 18758
                            inorganic hydride 17457
                              pnictogen hydride 17432
                                nitrogen hydride 17277
                                  ammonium 8210
                                    ammonium ion derivative 8206
                                      secondary ammonium ion 1
                                        (1S,7R,8R,14S)-6,9-dioxo-15,17-diazatetracyclo[12.2.2.1(3,7).1(8,12)]icosa-3(20),12(19)-dien-15-ium 0
                                        (S)-norreticuline(1+) 0
                                        aculene A(1+) 0
                                        aculene B(1+) 0
                                        ent-tamsulosin(1+) + 0
                                        mefuparib(1+) + 0
                                        methamphetamine(1+) + 0
                                        morpholinium 0
                                        piperidinium 0
                                        pyrrolidinium ion + 1
                                        secondary aliphatic ammonium ion + 0
                                        solasodine(1+) 0
                                        spectinomycin(1+) 0
                                        tamsulosin(1+) + 0
                                        tomatidine(1+) 0
                                        validoxylamine B(1+) 0
paths to the root