Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:UDP-alpha-D-glucosamine
go back to main search page
Accession:CHEBI:13497 term browser browse the term
Definition:A UDP-amino sugar having alpha-D-glucosamine as the amino-sugar component.
Synonyms:exact_synonym: uridine 5'-[3-(2-amino-2-deoxyglucopyranosyl) dihydrogen diphosphate]
 related_synonym: Formula=C15H25N3O16P2;   InChI=1S/C15H25N3O16P2/c16-8-11(23)9(21)5(3-19)32-14(8)33-36(28,29)34-35(26,27)30-4-6-10(22)12(24)13(31-6)18-2-1-7(20)17-15(18)25/h1-2,5-6,8-14,19,21-24H,3-4,16H2,(H,26,27)(H,28,29)(H,17,20,25)/t5-,6-,8-,9-,10-,11-,12-,13-,14-/m1/s1;   InChIKey=CYKLRRKFBPBYEI-NQQHDEILSA-N;   SMILES=N[C@H]1[C@@H](OP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O)[C@@H]2O)n2ccc(=O)[nH]c2=O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O;   UDPglucosamine
 xref: KEGG:C02200
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:78718


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G IDH2 isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 2 JBrowse link 15 90,083,045 90,102,468 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 23909
    role 23797
      biological role 23760
        biochemical role 23098
          metabolite 22994
            prokaryotic metabolite 20554
              bacterial metabolite 20554
                Escherichia coli metabolite 20494
                  UDP 15
                    UDP-sugar 8
                      UDP-amino sugar 2
                        UDP-alpha-D-glucosamine 1
                          UDP-3-O-(3-hydroxytetradecanoyl)-N-acetyl-beta-glucosamine 0
                          UDP-3-O-[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]-N-acetyl-alpha-glucosamine 0
                          UDP-D-glucosamine + 1
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 23909
    subatomic particle 23860
      composite particle 23860
        hadron 23860
          baryon 23860
            nucleon 23860
              atomic nucleus 23860
                atom 23860
                  main group element atom 23681
                    p-block element atom 23681
                      chalcogen 22937
                        oxygen atom 22895
                          oxygen molecular entity 22895
                            hydroxides 22145
                              oxoacid 21312
                                pnictogen oxoacid 10613
                                  phosphorus oxoacid 9372
                                    phosphoric acids 8131
                                      phosphoric acid 8131
                                        phosphoric acid derivative 7799
                                          phosphate 7799
                                            organic phosphate 7798
                                              carbohydrate phosphate 1569
                                                phospho sugar 1495
                                                  aldose phosphate 1493
                                                    aldopentose phosphate 1487
                                                      ribose phosphate 1481
                                                        ribonucleotide 1440
                                                          ribonucleoside 5'-phosphate 406
                                                            ribonucleoside 5'-diphosphate 109
                                                              pyrimidine ribonucleoside 5'-diphosphate 20
                                                                UDP 15
                                                                  UDP-sugar 8
                                                                    UDP-amino sugar 2
                                                                      UDP-alpha-D-glucosamine 1
                                                                        UDP-3-O-(3-hydroxytetradecanoyl)-N-acetyl-beta-glucosamine 0
                                                                        UDP-3-O-[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]-N-acetyl-alpha-glucosamine 0
                                                                        UDP-D-glucosamine + 1
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.