Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References FTP Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) RatMine GViewer (Genome Viewer) Overgo Probe Designer ACP Haplotyper Genome Scanner
Aging & Age-Related Disease Cancer Cardiovascular Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Genetic Models PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes GERRC (Gene Editing Rat Resource Center) Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Poster Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS
Term:omega-hydroxy fatty acid
go back to main search page
Accession:CHEBI:10615 term browser browse the term
Definition:Any member of the class of naturally-occurring straight-chain fatty acids n carbon atoms long with a carboxyl group at position 1 and a hydroxyl at position n (omega).
Synonyms:related_synonym: Formula=CH2O3(CH2)n;   omega-hydroxy fatty acids
 xref: KEGG:C03547;   PMID:13771448 "Europe PMC";   PMID:16660004 "Europe PMC"
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:76307

show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
12-hydroxylauric acid term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Adh5 alcohol dehydrogenase 5 (class III), chi polypeptide JBrowse link 2 243,728,500 243,740,907 RGD:6480464
G Cyp4v3 cytochrome P450, family 4, subfamily v, polypeptide 3 JBrowse link 16 50,111,803 50,136,741 RGD:6480464
8-hydroxyoctanoic acid term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Adh5 alcohol dehydrogenase 5 (class III), chi polypeptide JBrowse link 2 243,728,500 243,740,907 RGD:6480464
beta-propiolactone term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Nfe2l2 nuclear factor, erythroid 2-like 2 JBrowse link 3 62,497,568 62,525,146 RGD:6480464
royal jelly term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Bcl2 BCL2, apoptosis regulator JBrowse link 13 26,605,426 26,769,374 RGD:6480464
G Casp3 caspase 3 JBrowse link 16 48,845,011 48,863,249 RGD:6480464
G Cat catalase JBrowse link 3 93,379,872 93,412,058 RGD:6480464
G Esr1 estrogen receptor 1 JBrowse link 1 41,192,029 41,594,799 RGD:6480464
G Esr2 estrogen receptor 2 JBrowse link 6 99,163,953 99,214,711 RGD:6480464
G Pcna proliferating cell nuclear antigen JBrowse link 3 124,880,698 124,884,570 RGD:6480464
G Tff1 trefoil factor 1 JBrowse link 20 9,892,124 9,895,984 RGD:6480464
G Tp53 tumor protein p53 JBrowse link 10 56,186,299 56,198,449 RGD:6480464
G Vegfa vascular endothelial growth factor A JBrowse link 9 17,340,341 17,355,681 RGD:6480464
Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19754
    chemical entity 19753
      molecular entity 19751
        polyatomic entity 19662
          heteroatomic molecular entity 19575
            hydroxides 19053
              organic hydroxy compound 18629
                alcohol 14958
                  primary alcohol 13841
                    omega-hydroxy fatty acid 12
                      (2E)-11-hydroxy-2-dodecenoic acid 0
                      (2E)-11-hydroxyundec-2-enoic acid + 0
                      (2E)-12-hydroxydodec-2-enoic acid + 0
                      (2E)-13-hydroxytridec-2-enoic acid + 0
                      (2E)-14-hydroxytetradec-2-enoic acid + 0
                      (2E)-15-hydroxypentadec-2-enoic acid + 0
                      (2E)-16-hydroxyhexadec-2-enoic acid + 0
                      (2E)-17-hydroxyheptadec-2-enoic acid + 0
                      (2E)-18-hydroxyoctadec-2-enoic acid + 0
                      (2E)-19-hydroxynonadec-2-enoic acid + 0
                      (2E)-20-hydroxyicos-2-enoic acid + 0
                      (2E)-21-hydroxyhenicos-2-enoic acid + 0
                      (2E)-7-hydroxyhept-2-enoic acid + 0
                      (2E)-9-hydroxynon-2-enoic acid + 0
                      (3R)-3,10-dihydroxydecanoic acid + 0
                      (3R)-3,11-dihydroxyundecanoic acid + 0
                      (3R)-3,12-dihydroxylauric acid + 0
                      (3R)-3,13-dihydroxytridecanoic acid + 0
                      (3R)-3,14-dihydroxymyristic acid + 0
                      (3R)-3,15-dihydroxypentadecanoic acid + 0
                      (3R)-3,17-dihydroxymargaric acid + 0
                      (3R)-3,18-dihydroxyoctadecanoic acid + 0
                      (3R)-3,19-dihydroxynonadecanoic acid + 0
                      (3R)-3,20-dihydroxyicosanoic acid + 0
                      (3R)-3,21-dihydroxyhenicosanoic acid + 0
                      (3R)-3,22-dihydroxybehenic acid + 0
                      (3R)-3,22-dihydroxytricosanoic acid + 0
                      (3R)-3,9-dihydroxynonanoic acid + 0
                      (4Z,7Z,10Z,12E,14R,16Z,19Z)-14,22-dihydroxydocosahexaenoic acid 0
                      (4Z,7Z,10Z,12E,14S,16Z,19Z)-14,22-dihydroxydocosahexaenoic acid 0
                      (9Z,12R)-12,18-dihydroxyoctadecenoic acid 0
                      (E)-10-hydroxydec-2-enoic acid + 9
                      10-hydroxycapric acid + 0
                      11,12-epoxy-20-hydroxy-(5Z,8Z,14Z)-icosatrienoic acid 0
                      11-hydroxyundecanoic acid + 0
                      12,13-epoxy-18-hydroxy-(9Z)-octadecenoic acid 0
                      12,18-dihydroxyoctadecanoic acid 0
                      12,20-DiHETE 0
                      12-hydroxylauric acid + 2
                      14,15-epoxy-20-hydroxy-(5Z,8Z,11Z)-icosatrienoic acid 0
                      18-hydroxylinoleic acid 0
                      18-hydroxyoleic acid + 0
                      2,4-dihydroxybutanoic acid 0
                      20-HETrE 0
                      20-hydroxy-6-trans-leukotriene B4 0
                      20-hydroxylipoxin A4 0
                      20-hydroxylipoxin B4 0
                      22-hydroxyprotectin D1 0
                      26-hydroxyhexacosanoic acid 0
                      3,12-dihydroxylauric acid 0
                      3,18-dihydroxyoctadecanoic acid 0
                      3,4-dihydroxybutyric acid 0
                      3-hydroxypropionic acid + 1
                      5,20-DiHETE 0
                      5,20-diHEPE 0
                      5,6-epoxy-20-hydroxy-(8Z,11Z,14Z)-icosatrienoic acid 0
                      5-hydroxypentanoic acid + 0
                      6-hydroxyhexanoic acid + 0
                      7-hydroxyheptanoic acid + 0
                      8,20-DiHETE 0
                      8,9-epoxy-20-hydroxy-(5Z,11Z,14Z)-icosatrienoic acid 0
                      8-hydroxyoctanoic acid + 1
                      9,10,18-trihydroxyoctadecanoic acid 0
                      9,10-epoxy-18-hydroxy-(12Z)-octadecenoic acid 0
                      9,10-epoxy-18-hydroxyoctadecanoic acid + 0
                      9-hydroxynonanoic acid + 0
                      omega-hydroxy fatty acid ascaroside + 0
                      omega-hydroxy fatty acyl-CoA + 0
                      omega-hydroxy fatty ester + 0
                      omega-hydroxy-long-chain fatty acid + 0
                      omega-hydroxydotriacontanoic acid 0
                      omega-hydroxyhentriacontanoic acid 0
                      omega-hydroxyheptacosanoic acid 0
                      omega-hydroxynonacosanoic acid 0
                      omega-hydroxyoctacosanoic acid 0
                      omega-hydroxytetracosanoic acid 0
                      omega-hydroxytriacontanoic acid + 0
                      omega-hydroxytritriacontanoic acid 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19754
    subatomic particle 19752
      composite particle 19752
        hadron 19752
          baryon 19752
            nucleon 19752
              atomic nucleus 19752
                atom 19752
                  main group element atom 19637
                    p-block element atom 19637
                      carbon group element atom 19528
                        carbon atom 19517
                          organic molecular entity 19517
                            organic group 18422
                              organic divalent group 18414
                                organodiyl group 18414
                                  carbonyl group 18303
                                    carbonyl compound 18303
                                      carboxylic acid 17971
                                        monocarboxylic acid 17286
                                          fatty acid 15829
                                            hydroxy fatty acid 176
                                              omega-hydroxy fatty acid 12
                                                (2E)-11-hydroxy-2-dodecenoic acid 0
                                                (2E)-11-hydroxyundec-2-enoic acid + 0
                                                (2E)-12-hydroxydodec-2-enoic acid + 0
                                                (2E)-13-hydroxytridec-2-enoic acid + 0
                                                (2E)-14-hydroxytetradec-2-enoic acid + 0
                                                (2E)-15-hydroxypentadec-2-enoic acid + 0
                                                (2E)-16-hydroxyhexadec-2-enoic acid + 0
                                                (2E)-17-hydroxyheptadec-2-enoic acid + 0
                                                (2E)-18-hydroxyoctadec-2-enoic acid + 0
                                                (2E)-19-hydroxynonadec-2-enoic acid + 0
                                                (2E)-20-hydroxyicos-2-enoic acid + 0
                                                (2E)-21-hydroxyhenicos-2-enoic acid + 0
                                                (2E)-7-hydroxyhept-2-enoic acid + 0
                                                (2E)-9-hydroxynon-2-enoic acid + 0
                                                (3R)-3,10-dihydroxydecanoic acid + 0
                                                (3R)-3,11-dihydroxyundecanoic acid + 0
                                                (3R)-3,12-dihydroxylauric acid + 0
                                                (3R)-3,13-dihydroxytridecanoic acid + 0
                                                (3R)-3,14-dihydroxymyristic acid + 0
                                                (3R)-3,15-dihydroxypentadecanoic acid + 0
                                                (3R)-3,17-dihydroxymargaric acid + 0
                                                (3R)-3,18-dihydroxyoctadecanoic acid + 0
                                                (3R)-3,19-dihydroxynonadecanoic acid + 0
                                                (3R)-3,20-dihydroxyicosanoic acid + 0
                                                (3R)-3,21-dihydroxyhenicosanoic acid + 0
                                                (3R)-3,22-dihydroxybehenic acid + 0
                                                (3R)-3,22-dihydroxytricosanoic acid + 0
                                                (3R)-3,9-dihydroxynonanoic acid + 0
                                                (4Z,7Z,10Z,12E,14R,16Z,19Z)-14,22-dihydroxydocosahexaenoic acid 0
                                                (4Z,7Z,10Z,12E,14S,16Z,19Z)-14,22-dihydroxydocosahexaenoic acid 0
                                                (9Z,12R)-12,18-dihydroxyoctadecenoic acid 0
                                                (E)-10-hydroxydec-2-enoic acid + 9
                                                10-hydroxycapric acid + 0
                                                11,12-epoxy-20-hydroxy-(5Z,8Z,14Z)-icosatrienoic acid 0
                                                11-hydroxyundecanoic acid + 0
                                                12,13-epoxy-18-hydroxy-(9Z)-octadecenoic acid 0
                                                12,18-dihydroxyoctadecanoic acid 0
                                                12,20-DiHETE 0
                                                12-hydroxylauric acid + 2
                                                14,15-epoxy-20-hydroxy-(5Z,8Z,11Z)-icosatrienoic acid 0
                                                18-hydroxylinoleic acid 0
                                                18-hydroxyoleic acid + 0
                                                2,4-dihydroxybutanoic acid 0
                                                20-HETrE 0
                                                20-hydroxy-6-trans-leukotriene B4 0
                                                20-hydroxylipoxin A4 0
                                                20-hydroxylipoxin B4 0
                                                22-hydroxyprotectin D1 0
                                                26-hydroxyhexacosanoic acid 0
                                                3,12-dihydroxylauric acid 0
                                                3,18-dihydroxyoctadecanoic acid 0
                                                3,4-dihydroxybutyric acid 0
                                                3-hydroxypropionic acid + 1
                                                5,20-DiHETE 0
                                                5,20-diHEPE 0
                                                5,6-epoxy-20-hydroxy-(8Z,11Z,14Z)-icosatrienoic acid 0
                                                5-hydroxypentanoic acid + 0
                                                6-hydroxyhexanoic acid + 0
                                                7-hydroxyheptanoic acid + 0
                                                8,20-DiHETE 0
                                                8,9-epoxy-20-hydroxy-(5Z,11Z,14Z)-icosatrienoic acid 0
                                                8-hydroxyoctanoic acid + 1
                                                9,10,18-trihydroxyoctadecanoic acid 0
                                                9,10-epoxy-18-hydroxy-(12Z)-octadecenoic acid 0
                                                9,10-epoxy-18-hydroxyoctadecanoic acid + 0
                                                9-hydroxynonanoic acid + 0
                                                omega-hydroxy fatty acid ascaroside + 0
                                                omega-hydroxy fatty acyl-CoA + 0
                                                omega-hydroxy fatty ester + 0
                                                omega-hydroxy-long-chain fatty acid + 0
                                                omega-hydroxydotriacontanoic acid 0
                                                omega-hydroxyhentriacontanoic acid 0
                                                omega-hydroxyheptacosanoic acid 0
                                                omega-hydroxynonacosanoic acid 0
                                                omega-hydroxyoctacosanoic acid 0
                                                omega-hydroxytetracosanoic acid 0
                                                omega-hydroxytriacontanoic acid + 0
                                                omega-hydroxytritriacontanoic acid 0
paths to the root

Contact Us |  About Us |  License CC BY 4.0 |  Legal Disclaimer |  © Medical College of Wisconsin
NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.