Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 205,517 (bp)   Positions: 383
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.976
.001
.153
.847
1.0
.071
.037
.999
.609
.6
.06
.566
.033
.008
.001
.035
.006
.0
.004
.001
.0
.002
.137
.008
.75
.145
.0
.0
.08
.001
.015
.027
.015
.002
.003
.009
.887
.283
.0
.079
.0
.01
.0
.043
.002
.01
.0
.011
.002
.0
.0
.005
.005
.004
.062
.001
.008
.07
.003
.014
.124
.004
.001
.003
.001
.002
.009
.001
.002
.001
.002
.035
.0
.845
.008
.001
.106
.057
.002
.0
.031
.003
.0
.001
.001
.0
--
--
.535
.003
.272
.043
.091
.0
.0
.004
.001
.075
.037
.0
.001
.003
.001
.0
.013
.013
.002
.393
.001
.003
.002
.006
.003
.0
.001
.012
.004
.008
.029
.01
.008
.0
.003
.002
.426
.004
.017
.0
.006
.0
--
--
--
--
.062
.049
.28
.026
.003
.004
.0
.001
.033
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.115
.001
.0
.0
.003
.378
.016
.043
.019
.0
.033
.03
.017
.021
.06
.014
.001
--
--
.0
.001
.024
.0
.001
.0
.706
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.006
.031
.071
.001
.016
.046
.033
.528
.004
.001
.536
.546
.546
.548
--
--
--
.0
.009
.0
.02
.017
.005
.07
.013
.002
.015
.219
.148
.007
.003
.003
.0
--
--
.151
--
.006
.001
.0
.0
.007
.013
.132
.001
.006
.013
.001
.0
.008
.011
.008
.007
.002
.001
.998
.997
.884
.603
.998
.981
.0
.001
.001
.357
.009
.01
.001
.0
.002
.061
.077
.022
.004
.001
.01
.0
.005
.001
.0
.0
.002
.0
.001
.0
.008
.007
.012
.044
.0
.0
.001
.003
.006
.002
.008
.0
.003
.005
.002
.006
.009
.008
.001
.007
.001
.141
.046
.053
.037
.0
.001
.005
.03
.018
.02
.031
.211
.284
.008
.009
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.011
.015
.001
.008
.945
.052
.001
.0
.001
.155
.035
.002
.001
.002
.001
.0
.157
.03
.005
.033
.06
.104
.01
.025
.048
.017
.004
.002
.008
.0
.0
.005
.999
.0
.001
.0
.0
.004
.0
.563
.079
.08
.019
.0
.998
.001
.0
.0
.003
.0
.789
.009
.0
.002
.001
.002
.024
.0
.0
.0
.0
.005
.0
.003
.075
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
Zmiz1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
G
G
A
T
G
A
3
9
G
C
A
2
A
C
G
A
C
G
A
A
G
G
T
T
21
C
T
G
T
A
C
A
G
G
C
T
T
G
T
C
T
C
G
G
G
C
G
G
G
G
G
T
T
G
C
A
G
A
G
A
T
T
G
G
A
C
G
C
C
G
C
A
T
C
G
T
C
A
T
6
C
G
A
T
5
C
A
A
G
T
2
A
A
A
C
T
3
C
C
C
2
C
A
C
G
10
T
A
A
2
G
C
A
C
A
T
A
A
12
T
G
C
G
C
G
T
T
G
A
A
T
G
C
C
A
A
T
C
G
4
C
C
T
G
A
T
T
G
A
T
T
T
G
A
G
A
A
T
T
A
A
C
T
C
3
C
C
G
G
T
C
A
T
C
C
6
C
G
G
2
C
C
G
G
G
G
C
T
C
C
C
2
C
T
C
G
C
G
2
4
T
12
C
T
C
A
T
T
T
C
2
5
G
G
A
A
C
T
4
C
G
T
2
T
A
A
C
A
G
G
G
A
C
T
T
C
A
A
T
T
T
A
T
C
G
2
T
8
C
C
G
G
A
2
G
A
T
G
C
C
5
C
G
C
A
C
A
T
A
G
C
T
A
A
T
G
G
A
T
A
A
G
G
G
T
A
C
G
A
T
G
T
G
C
C
C
G
G
G
G
T
C
T
G
A
T
C
T
T
G
G
T
2
C
2
G
2
C
C
A
4
C
G
G
T
C
2
G
A
A
G
C
G
T
T
T
G
T
G
A
A
A
T
C
C
G
G
C
C
C
T
A
C
G
C
T
C
C
G
T
C
C
A
G
A
G
C
G
A
5
C
A
A
A
T
T
A
A
A
2
T
  1,726,892
  1,727,287
  1,727,403
  1,727,842
  1,728,294
  1,728,889
  1,729,003
  1,729,187
  1,729,285
  1,729,289
  1,729,530
  1,730,024
  1,730,050
  1,732,862
  1,733,125
  1,734,520
  1,734,652
  1,737,709
  1,738,752
  1,739,519
  1,740,409
  1,740,664
  1,746,777
  1,747,040
  1,749,176
  1,749,850
  1,751,439
  1,751,457
  1,752,144
  1,752,161
  1,752,775
  1,753,792
  1,754,199
  1,754,424
  1,754,883
  1,756,172
  1,757,526
  1,758,079
  1,758,205
  1,759,202
  1,761,704
  1,761,712
  1,762,191
  1,762,214
  1,763,673
  1,763,692
  1,764,068
  1,764,524
  1,765,713
  1,765,799
  1,765,800
  1,765,969
  1,766,532
  1,767,402
  1,768,925
  1,768,961
  1,768,967
  1,768,986
  1,769,362
  1,769,364
  1,770,903
  1,770,992
  1,771,011
  1,771,016
  1,771,334
  1,771,354
  1,771,987
  1,772,171
  1,772,786
  1,772,894
  1,773,816
  1,775,976
  1,776,429
  1,776,946
  1,777,009
  1,777,603
  1,778,062
  1,778,104
  1,778,944
  1,779,960
  1,781,320
  1,781,325
  1,781,806
  1,782,522
  1,782,523
  1,784,506
  1,784,939
  1,785,110
  1,785,183
  1,785,321
  1,785,603
  1,785,993
  1,785,998
  1,786,961
  1,787,028
  1,787,221
  1,787,231
  1,787,538
  1,788,000
  1,788,745
  1,788,773
  1,788,787
  1,788,810
  1,789,208
  1,789,346
  1,789,347
  1,789,414
  1,789,666
  1,789,725
  1,789,754
  1,789,756
  1,789,787
  1,791,253
  1,791,392
  1,791,492
  1,792,439
  1,792,453
  1,792,478
  1,792,753
  1,793,560
  1,794,033
  1,794,337
  1,794,338
  1,794,685
  1,794,749
  1,794,949
  1,794,965
  1,795,532
  1,795,907
  1,795,915
  1,797,378
  1,797,393
  1,797,395
  1,797,396
  1,797,495
  1,797,526
  1,797,574
  1,797,902
  1,798,696
  1,799,269
  1,799,463
  1,799,660
  1,800,078
  1,800,570
  1,802,238
  1,802,641
  1,802,649
  1,802,706
  1,803,164
  1,804,545
  1,804,566
  1,805,011
  1,806,989
  1,807,160
  1,807,198
  1,807,366
  1,807,543
  1,807,547
  1,808,143
  1,809,087
  1,809,262
  1,809,666
  1,809,781
  1,810,166
  1,810,205
  1,810,780
  1,810,936
  1,810,938
  1,812,552
  1,812,737
  1,813,790
  1,814,571
  1,815,509
  1,817,686
  1,817,741
  1,818,461
  1,818,472
  1,818,506
  1,818,517
  1,818,551
  1,818,557
  1,818,590
  1,818,597
  1,818,605
  1,818,637
  1,818,643
  1,818,651
  1,818,655
  1,821,292
  1,821,329
  1,822,115
  1,822,120
  1,822,139
  1,822,231
  1,822,249
  1,822,357
  1,822,360
  1,822,362
  1,822,366
  1,822,478
  1,822,583
  1,822,941
  1,825,378
  1,825,559
  1,826,512
  1,826,888
  1,827,169
  1,827,423
  1,829,773
  1,832,194
  1,832,288
  1,834,240
  1,834,898
  1,835,079
  1,835,917
  1,836,287
  1,841,116
  1,843,534
  1,844,878
  1,844,882
  1,847,419
  1,847,729
  1,849,111
  1,851,615
  1,853,984
  1,855,198
  1,855,568
  1,855,849
  1,865,326
  1,866,149
  1,866,231
  1,866,462
  1,868,180
  1,868,659
  1,872,502
  1,872,504
  1,872,509
  1,872,517
  1,872,521
  1,872,525
  1,873,141
  1,873,144
  1,873,152
  1,873,156
  1,873,183
  1,873,340
  1,876,429
  1,876,546
  1,877,945
  1,878,666
  1,881,071
  1,881,087
  1,883,092
  1,883,104
  1,883,106
  1,883,129
  1,883,130
  1,883,144
  1,883,159
  1,885,077
  1,885,394
  1,885,605
  1,885,794
  1,887,956
  1,888,007
  1,889,169
  1,889,754
  1,890,477
  1,890,705
  1,890,840
  1,892,121
  1,892,222
  1,893,145
  1,893,216
  1,893,613
  1,893,889
  1,893,948
  1,894,222
  1,894,256
  1,894,325
  1,894,591
  1,894,635
  1,895,131
  1,895,216
  1,895,235
  1,895,267
  1,895,578
  1,895,617
  1,895,821
  1,896,070
  1,896,118
  1,897,001
  1,897,495
  1,897,824
  1,898,057
  1,899,181
  1,899,186
  1,899,216
  1,899,510
  1,899,654
  1,899,655
  1,899,656
  1,899,663
  1,899,670
  1,899,818
  1,899,823
  1,899,844
  1,899,857
  1,899,860
  1,899,861
  1,899,864
  1,899,870
  1,899,874
  1,899,876
  1,899,899
  1,899,959
  1,900,043
  1,900,064
  1,900,113
  1,900,213
  1,900,229
  1,900,271
  1,900,933
  1,901,021
  1,901,640
  1,901,771
  1,901,965
  1,902,139
  1,902,323
  1,903,112
  1,903,518
  1,903,884
  1,904,151
  1,904,182
  1,904,907
  1,905,047
  1,905,755
  1,906,147
  1,906,435
  1,906,590
  1,906,942
  1,906,949
  1,907,306
  1,907,875
  1,908,021
  1,908,512
  1,908,722
  1,908,732
  1,909,927
  1,909,973
  1,911,486
  1,912,028
  1,912,034
  1,912,043
  1,912,243
  1,912,250
  1,912,473
  1,912,829
  1,914,285
  1,914,323
  1,914,343
  1,915,541
  1,916,112
  1,916,875
  1,916,876
  1,917,162
  1,917,284
  1,918,087
  1,919,433
  1,920,200
  1,920,814
  1,920,844
  1,920,928
  1,921,316
  1,922,448
  1,922,964
  1,922,971
  1,922,973
  1,922,979
  1,922,987
  1,923,008
  1,924,924
  1,928,980
G
G
A
A
C
C
C
2
3/-
-
4
C/3
-
-
G
3
3
G
-
C
G
2
T
T
7/5
A
-
-
C
A
3
5
G
G
A
A
T
2
C
A
G
T
C
T
A
A
A
T
A
G/2
4/T
A
A
G
C
9/C
C/G
A/T
9
10/-
G/2
-
-
-
T
T
2
T
A
G
T
A
A
G
T/3
4
C
C
A
G
-
-
T
T
C
C
-
T
C
T
A
2
-
T
G
2
2
C
-
C/G
C/G
C/G
-
T
6
6
A
-
3
5
A/5
-
5
T
G
T
T
C
G
G
-
C
A
T
-
T
A
C
C
T
A/C
9/C
T/C
G/A
C/A
C/4
A/15
G
C
T
A
-
T
T
6
A
T
T/G
C
A
G
C
G
C
A
G
G/A
A/G
G
G
C
T
G
3
13
T
3/-
8
T
A
A
2
A
T
C
2
2
6/-
C/G
G/C
G/C
2/-
C/G
C/3
G/C
G/C
G/C
G/C
-
C
C/T
C/T
C/T
-
C/T
T/C
C/G
G/C
C/T
G/3
2/-
4/-
C
-
C/T
C
T
G
C
C
C
T
-
-
A
G/T
-
G
C/T
T/C
-
3
A
C
-
5
G
G
T
G
T
A
A
G
G
C
G
G
C
G
G
-
C
C
C
G
A
-
C
-
C/G
C/G
A
G/5
A/G
2/-
G/3
A/G
C
A
T
T
-
A
C
T
-
T
C
G
G
A
T
C
G
C
C
C
A
A/C
C
G
T
A
A
T
C
T
T
C
G
C
A
G
A
2
2
2
A
C
T
T
-
-
G
-
C
A
C/4
T/-
A
A
A
A
-
A
-
G/-
-
T
3
G
-
T
2
A
C
T
-
C
12
G
A
T
A
-
G
C
A
C
A
G
G
T
C
9
-
C
A
T
T
T
C
G
T
A
T
T/G
C/T
2
A
C
T
T
G
T
G
A
T
A
G
-
T
G
T
G
C
G
C
-
-
2/-
3/5