Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 187,372 (bp)   Positions: 349
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.956
.918
.001
.008
.0
.03
.009
.003
.726
.562
.012
.116
--
--
--
--
.013
.954
.001
1.0
.111
.176
.001
.935
.876
.036
.003
.245
.998
.391
.005
.119
.251
.578
.492
.003
.994
1.0
.997
.0
.005
.099
.006
.134
.111
--
--
.006
.014
.014
.051
.0
.002
.001
.249
.014
.004
.029
--
.011
.0
.059
.118
.001
.055
.058
.004
.002
.008
.011
.0
.062
.019
.004
.017
.017
.026
.002
.002
.002
.0
.001
.012
.025
.34
.034
.006
.036
.002
.0
.147
.001
.0
.011
.016
.0
.017
.066
.186
.246
.0
.0
.0
.28
.0
.034
.091
.115
.047
.015
.001
.867
.997
.092
.0
.002
.572
.0
.015
1.0
1.0
.391
.0
.023
.592
1.0
.001
.007
.0
.97
.634
.918
.0
.162
.999
.002
--
--
.008
1.0
.988
1.0
.997
.038
.072
.001
.003
.0
.001
.0
.001
.008
.002
.002
.003
.004
1.0
.957
.064
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.017
.001
.002
.008
.251
.007
.415
.425
.063
.927
.002
.182
.004
.976
.991
.087
.997
--
.003
1.0
.961
--
--
--
.001
.491
.061
.311
.035
.039
.036
.005
.019
.0
.827
1.0
--
--
--
--
--
--
.002
--
.02
.207
.17
.002
.918
.001
.001
.006
.02
.017
.274
.002
.003
.023
.0
.0
.938
.003
--
.012
.0
.591
.004
.0
.991
.019
.0
.0
.001
.089
.064
.0
.06
.237
--
--
.015
.008
.0
.013
.043
.0
.0
.005
.001
.649
1.0
.999
.018
.996
.053
.0
.998
.813
.001
.078
.051
.077
.389
.004
.019
.002
.001
.003
--
--
.079
.0
.0
.016
.001
.004
--
.809
.032
.003
.984
.004
.08
.049
--
--
.043
--
--
.0
.293
.079
--
.004
.989
.997
.977
1.0
.982
.997
.126
1.0
.894
.448
.003
.002
.382
.999
.002
.0
.003
.005
.848
.003
.006
1.0
1.0
1.0
.853
.958
.014
.004
.003
.037
.04
.048
.001
.006
.915
.939
.199
.857
.068
.997
1.0
1.0
.326
.663
.253
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
Zfhx4
A
A
C
T
G
G
G
C
A
T
A
G
4
A
8
A
T
C
A
T
G
T
C
A
C
A
A
T
A
T
G
T
8
G
A
G
C
C
A
A
T
6
G
G
G
C
A
A
G
C
T
C
A
G
A
A
G
G
2
A
C
C
A
G
C
A
C
C
2
8
G
G
A
T
A
A
C
A
T
A
C
C
G
A
T
A
C
2
A
A
A
C
C
T
G
A
C
A
G
C
C
A
G
C
G
G
2
2
2
G
T
A
14
2
G
A
C
T
G
T
C
T
A
24
T
A
A
T
4
C
A
T
T
12
2
4
2
C
2
A
T
T
C
C
C
T
T
T
C
A
C
G
A
C
G
4
T
C
T
G
T
A
A
A
C
A
A
A
T
G
C
C
T
A
A
A
T
C
G
A
T
G
C
G
A
A
T
A
A
G
A
3
T
136
T
A
2
C
A
G
C
G
6
T
A
G
A
C
C
A
T
T
G
C
C
C
T
C
A
T
T
G
A
G
G
A
G
A
G
A
T
2
2
G
C
T
G
C
T
G
G
T
G
T
A
C
T
A
G
A
A
C
C
A
G
T
C
C
G
A
T
T
G
T
T
T
3
G
A
G
A
T
A
T
C
C
T
T
A
T
G
G
G
T
2
T
3
A
G
A
C
T
32
T
G
A
9
G
T
C
C
T
2
A
C
T
A
T
C
2
C
3
T
T
28
A
A
A
C
G
G
C
C
C
A
T
G
G
T
A
A
T
T
A
C
T
G
2
G
T
G
A
G
T
2
A
C
G
A
  118,158,329
  118,162,583
  118,163,776
  118,163,884
  118,164,045
  118,165,266
  118,165,270
  118,165,277
  118,165,347
  118,165,353
  118,165,624
  118,165,704
  118,166,719
  118,166,745
  118,166,778
  118,166,797
  118,169,017
  118,170,368
  118,173,997
  118,174,763
  118,175,532
  118,175,548
  118,175,653
  118,177,064
  118,177,279
  118,178,281
  118,179,081
  118,179,454
  118,179,704
  118,180,610
  118,180,669
  118,182,367
  118,182,376
  118,182,465
  118,183,222
  118,183,504
  118,184,304
  118,184,901
  118,185,201
  118,185,783
  118,186,162
  118,186,439
  118,186,587
  118,187,447
  118,187,624
  118,188,275
  118,188,421
  118,188,818
  118,190,042
  118,191,007
  118,192,306
  118,193,406
  118,193,408
  118,193,443
  118,193,593
  118,194,207
  118,194,218
  118,194,528
  118,196,150
  118,197,257
  118,198,800
  118,199,265
  118,199,518
  118,200,604
  118,200,917
  118,201,123
  118,201,329
  118,201,871
  118,202,092
  118,202,134
  118,202,305
  118,202,898
  118,203,439
  118,203,696
  118,203,871
  118,204,110
  118,204,121
  118,204,156
  118,204,418
  118,204,757
  118,204,824
  118,205,090
  118,205,291
  118,205,553
  118,205,886
  118,205,894
  118,206,018
  118,206,122
  118,206,156
  118,207,610
  118,208,002
  118,208,363
  118,208,848
  118,208,866
  118,208,968
  118,209,304
  118,209,918
  118,210,036
  118,210,125
  118,210,237
  118,210,409
  118,210,563
  118,210,566
  118,210,846
  118,211,375
  118,211,719
  118,211,730
  118,211,749
  118,211,771
  118,211,835
  118,211,890
  118,212,018
  118,212,340
  118,212,580
  118,213,115
  118,213,272
  118,213,502
  118,213,583
  118,213,886
  118,214,304
  118,214,355
  118,215,107
  118,215,662
  118,215,854
  118,215,941
  118,215,991
  118,216,422
  118,216,548
  118,216,596
  118,216,743
  118,216,815
  118,217,856
  118,218,770
  118,219,491
  118,220,513
  118,221,956
  118,222,047
  118,222,052
  118,222,085
  118,222,984
  118,223,636
  118,224,716
  118,225,389
  118,226,161
  118,226,567
  118,227,236
  118,227,398
  118,227,759
  118,228,178
  118,228,394
  118,228,404
  118,228,743
  118,228,825
  118,228,871
  118,229,117
  118,229,235
  118,229,703
  118,230,239
  118,230,376
  118,230,450
  118,230,850
  118,230,851
  118,230,871
  118,231,087
  118,231,089
  118,231,163
  118,231,237
  118,231,349
  118,231,427
  118,231,763
  118,232,475
  118,232,789
  118,232,839
  118,232,872
  118,233,040
  118,233,169
  118,233,273
  118,234,050
  118,234,202
  118,234,266
  118,235,097
  118,235,643
  118,238,528
  118,238,869
  118,238,891
  118,238,980
  118,239,722
  118,241,395
  118,242,401
  118,243,129
  118,245,273
  118,251,434
  118,251,972
  118,252,825
  118,254,063
  118,255,277
  118,255,337
  118,255,700
  118,256,299
  118,256,812
  118,257,284
  118,257,306
  118,257,708
  118,258,266
  118,259,625
  118,259,633
  118,260,351
  118,260,394
  118,260,430
  118,260,452
  118,260,582
  118,260,832
  118,261,125
  118,262,271
  118,262,417
  118,262,435
  118,262,436
  118,263,973
  118,264,567
  118,265,460
  118,266,039
  118,266,094
  118,266,687
  118,267,101
  118,267,231
  118,268,214
  118,268,492
  118,268,808
  118,269,179
  118,269,358
  118,269,496
  118,270,265
  118,272,531
  118,273,779
  118,273,804
  118,275,115
  118,275,453
  118,275,968
  118,276,992
  118,277,220
  118,277,896
  118,278,119
  118,278,312
  118,279,530
  118,279,764
  118,279,990
  118,280,241
  118,280,689
  118,281,053
  118,281,870
  118,282,532
  118,283,057
  118,283,214
  118,283,917
  118,283,937
  118,284,352
  118,284,381
  118,284,826
  118,285,286
  118,286,219
  118,288,162
  118,288,173
  118,288,433
  118,289,838
  118,290,166
  118,292,281
  118,293,415
  118,293,535
  118,294,101
  118,294,740
  118,294,995
  118,295,368
  118,296,133
  118,296,416
  118,296,553
  118,296,557
  118,296,559
  118,296,563
  118,297,856
  118,297,922
  118,297,931
  118,298,074
  118,298,441
  118,298,909
  118,299,072
  118,299,999
  118,300,593
  118,301,026
  118,304,087
  118,304,419
  118,304,582
  118,304,811
  118,304,827
  118,305,550
  118,305,685
  118,305,687
  118,306,087
  118,306,484
  118,306,516
  118,307,460
  118,308,467
  118,308,780
  118,309,641
  118,309,942
  118,312,484
  118,314,245
  118,314,663
  118,315,629
  118,315,682
  118,317,624
  118,317,957
  118,319,444
  118,321,316
  118,321,317
  118,321,549
  118,322,448
  118,322,586
  118,322,798
  118,323,306
  118,323,476
  118,323,547
  118,323,941
  118,324,252
  118,324,268
  118,324,269
  118,324,556
  118,324,962
  118,326,981
  118,328,321
  118,330,141
  118,331,149
  118,332,225
  118,332,543
  118,332,749
  118,333,114
  118,333,165
  118,333,631
  118,333,843
  118,335,432
  118,336,327
  118,336,853
  118,338,492
  118,340,413
  118,340,787
  118,340,822
  118,340,823
  118,340,910
  118,340,988
  118,344,556
2
C
A
A
A
G/A
G/A
C/2
T
C
G
C
-
G
-
G
3
G
G
C
A
G
G
15/13
T
C
G
-
T
A
A
G
-
A
G
A
2
A
C
G
G
-
C
T
2
T
G
3
A
3
2
-
T
2
C
T
A
A
-
G
T
T
C
A
5
T
T
A
-
-
2
A
G
C
C
-
A
G
C
G
G
A
T
G
C
T
G
-
G
-
-
T
T
C
T
-
T
T
A
T
T
G
7
T
A
A
2/-
2/-
2/-
A
A
G
-
-
T
T
G
3
A
A
2
C
G
-
C
2
G
-
-
T
G
A
C
12/-
-
-
-
T
-
G
-
G
T
T
T
G
C
G
T
T
T
A
G
T
T
-
G
T
C
A
C
G
2
6
12
G
T
-
C
T
T
T
5
G
G
2
A
T
A
5
C
-
A
A
G
G
2
G
G
A
-
-
T/-
-
C
-
-
T
G
A
T
T
-
C
G
A
T
T
T
T
C
A
A
T
T
T
C
3
G
C
2
A
G
C
A
C
A
G
A
G
C
-
-
3
A
2
A
4
C
T
A
C
A
C
T
T
7
G
3
-
G
A
T
G
A
C
G
T
-
-
-
G
T
C
A
C
-
T
G
A
C
A
T
4
T
T
C
C
T
23
C
T
C
3
-
A
-
T
3/4
-
T
C
-
5
12
17
-
C
C
T
3
A
-
G
T
C
C
-
4/5
-
A
-
A
A
-
-
6
G
3
A
T
T
A
-
G
C
A
A
C
G
19
C
C
-
2
C
7
-
A
C
2
G
5
5/TA
2/-
-
-
-
2