Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 116,269 (bp)   Positions: 255
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.064
.191
.202
.016
.062
.001
.0
.0
.237
.004
.313
.377
.02
.998
.754
.096
.458
.0
--
--
--
--
.067
.001
.1
.0
.001
.001
.013
.062
--
.677
.001
.0
.0
.022
.071
.013
.119
.868
.29
.665
.004
.001
.001
.103
.002
.0
.035
.31
.103
.0
--
--
--
.013
.003
.0
.003
.002
.003
.493
.797
.001
.007
.011
.067
.003
.001
.002
.028
.025
.029
--
.435
.049
.002
.036
.006
.0
.013
.01
.167
.447
--
--
.81
.003
.001
.006
.384
.024
.002
.062
.114
.067
.001
.018
.0
.008
.001
.001
.001
.026
.865
.003
.018
.008
.048
.001
.0
.006
.006
.007
.049
.943
.002
.003
.027
.005
.013
.016
.096
.026
.005
.406
.69
.011
.011
.01
.005
.031
.017
.002
.009
.002
.0
.0
.357
.033
.031
.267
.007
.013
.119
.026
.034
.045
.012
--
--
--
--
--
--
--
.024
.004
.397
.074
.316
.002
.04
.016
.008
.009
.01
.008
.001
.001
.006
.006
.001
.0
.084
.006
.001
.109
.113
.0
.001
.0
--
--
--
.001
.004
.923
.001
.0
.124
.004
.005
.001
.0
.144
.012
.032
.018
.007
.01
.103
.002
.259
.008
.016
.102
.006
.02
.94
.104
--
--
.019
--
.001
.012
.011
.002
.177
.581
.016
.234
.22
.035
.03
.37
.001
.004
.022
.032
.005
.233
.236
--
--
.001
.0
1.0
.009
.005
.002
.035
.056
.0
.008
.002
.003
.378
.005
.099
.003
.0
.987
.239
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
Wwtr1
T
C
T
4
G
G
A
C
G
C
T
T
T
T
T
G
G
T
T
T
T
T
G
C
C
T
T
C
T
C
G
C
A
T
T
C
T
A
G
C
C
C
C
2
C
C
A
G
G
10
C
G
C
2
C
A
C
T
T
G
C
A
C
C
A
C
G
T
G
5
107
A
C
4
C
G
C
A
A
T
G
G
T
A
12
A
A
T
A
A
2
C
A
C
G
C
C
T
C
A
A
A
24
T
22
A
15
4
A
T
C
14
12
10
T
G
C
G
T
A
2
A
G
C
G
C
3
A
G
8
G
T
C
T
G
A
G
6
C
G
C
A
G
A
C
2
7
T
T
G
A
155
3
T
C
T
A
T
T
G
C
C
A
G
G
C
G
C
C
50
4
41
C
G
C
2
A
18
16
T
G
C
G
3
A
T
T
C
A
T
A
T
G
C
T
A
G
C
C
C
C
C
G
T
C
G
A
T
A
T
T
12
8
C
A
T
T
T
A
T
C
4
T
6
A
A
G
2
T
3
T
T
2
A
2
T
C
C
T
A
G
T
C
A
G
T
T
A
2
T
T
6
C
A
C
  166,986,247
  166,986,655
  166,986,656
  166,986,792
  166,987,135
  166,987,235
  166,988,633
  166,988,768
  166,988,847
  166,989,679
  166,989,897
  166,989,899
  166,990,304
  166,990,525
  166,991,951
  166,992,085
  166,993,157
  166,993,316
  166,993,988
  166,994,143
  166,994,412
  166,994,432
  166,994,757
  166,994,785
  166,994,804
  166,994,838
  166,994,968
  166,995,132
  166,995,986
  166,996,386
  166,997,179
  166,997,549
  166,997,693
  166,997,869
  166,998,901
  166,999,067
  166,999,264
  166,999,455
  166,999,468
  166,999,753
  166,999,887
  166,999,898
  166,999,971
  167,000,120
  167,000,122
  167,000,135
  167,000,500
  167,000,719
  167,000,984
  167,001,330
  167,001,348
  167,001,592
  167,002,356
  167,002,487
  167,002,519
  167,002,964
  167,003,113
  167,003,139
  167,003,412
  167,003,419
  167,003,467
  167,003,500
  167,003,588
  167,003,779
  167,003,796
  167,004,375
  167,004,568
  167,004,665
  167,005,403
  167,005,741
  167,005,747
  167,006,270
  167,006,646
  167,007,139
  167,007,277
  167,007,513
  167,007,542
  167,007,575
  167,007,616
  167,007,822
  167,007,874
  167,007,876
  167,008,629
  167,008,743
  167,008,793
  167,008,852
  167,009,409
  167,009,803
  167,009,964
  167,010,260
  167,010,403
  167,010,498
  167,010,537
  167,010,654
  167,010,773
  167,010,947
  167,011,155
  167,011,413
  167,011,693
  167,012,277
  167,012,300
  167,012,460
  167,012,738
  167,012,887
  167,013,802
  167,014,092
  167,014,096
  167,014,154
  167,014,801
  167,015,699
  167,016,768
  167,016,776
  167,016,778
  167,016,780
  167,016,915
  167,017,174
  167,017,481
  167,018,312
  167,018,445
  167,018,821
  167,018,922
  167,018,954
  167,019,267
  167,019,421
  167,019,837
  167,020,442
  167,020,458
  167,020,632
  167,020,737
  167,021,046
  167,021,509
  167,021,516
  167,021,709
  167,021,922
  167,021,950
  167,022,000
  167,022,016
  167,022,053
  167,022,221
  167,022,319
  167,022,332
  167,023,303
  167,023,479
  167,023,920
  167,024,648
  167,024,690
  167,024,988
  167,025,227
  167,025,975
  167,026,506
  167,026,533
  167,026,755
  167,027,115
  167,027,164
  167,027,205
  167,027,444
  167,027,681
  167,027,818
  167,027,852
  167,028,131
  167,028,315
  167,028,496
  167,028,503
  167,029,067
  167,029,111
  167,029,168
  167,029,263
  167,029,286
  167,030,251
  167,030,868
  167,031,078
  167,031,087
  167,031,282
  167,031,798
  167,033,129
  167,033,545
  167,033,667
  167,034,458
  167,034,460
  167,034,553
  167,034,691
  167,035,720
  167,036,433
  167,036,539
  167,036,665
  167,037,141
  167,037,395
  167,038,048
  167,038,173
  167,038,183
  167,038,359
  167,038,819
  167,039,376
  167,040,074
  167,040,161
  167,040,403
  167,041,074
  167,041,085
  167,041,103
  167,041,113
  167,041,118
  167,041,133
  167,041,150
  167,041,183
  167,041,303
  167,041,480
  167,041,642
  167,042,520
  167,047,170
  167,047,457
  167,047,522
  167,047,671
  167,047,827
  167,051,869
  167,053,967
  167,055,038
  167,055,342
  167,055,343
  167,055,368
  167,055,545
  167,056,396
  167,057,660
  167,057,935
  167,059,401
  167,060,424
  167,060,493
  167,061,012
  167,061,658
  167,063,160
  167,063,272
  167,065,713
  167,067,825
  167,069,295
  167,069,296
  167,069,577
  167,069,578
  167,070,228
  167,070,627
  167,071,000
  167,071,671
  167,071,691
  167,072,198
  167,072,254
  167,072,812
  167,072,846
  167,072,914
  167,072,916
  167,074,223
  167,076,648
  167,083,008
  167,088,035
  167,089,270
  167,089,322
  167,096,809
  167,100,309
C
2
T/-
-
A
A
C
T
A
T
2
C
-
C
C
3
2
C
G
C
C
4/5
A
2
2
3
A
T
G
T
A
A
C
A
C
A
C
C
T
8
T
2
T
-
6
T
G
2
A
-
C/-
-
T
2/-
-
G
5
A
C
?
C/17
3
T
2
9/7
T
T
2
C
-
-
-
T
-
T
A
T
G
-
G
G/-
G/C
C
7
-
2
C
C
G
G
-
T
T
A
T
G
T
C
T
G
T
C
-
C
-
-
-
-
G
G
T
14/-
12/-
10/-
C
T
G
2
C
G
-
3
A
T
T
-
-
G
A
-
5
G
T
A
2
G
T
-
T
G/2
T
G
A
G
T
-
-
C
6
6
-
-
-
2
T
G
T
T/2
C
T
T
3
11
T
A
T
A
G
G
-
-
41/-
T
A
C/5
-
G
18/-
16/-
C
C
C/2
T
-
A/16
C
C
G
C
C
G
C
A
T
G
24
C
T
T
T
T
T
T
A
T
C
G
C
7
A
C
-
-
T
T
C
C
C
2
C
10
-
-
-
7/5
2
A
2/-
17
-
-
C
2/-
A/-
2/-
T/-
C/2
G
C
T
A
C
T
G
A
C
2
G
2/-
5
T/2
6/-
T
T
C/2