Variant Visualizer (Variants)

Submit Data | Help | Video Tutorials | News | Publications | Download | REST API | Citing RGD | Contact

Sequence Annotation

Assembly Rnor_5.0

Conservation

Genes ( + )

Genes ( - )

Genes ( - )

Rnor 5.0

LEW/NCrl (KNAW)

.977	.988	.051	.062	.002	.01	.357	.42	.45	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.017	.041	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.146	.115	.027	.004	.001	.003	.066	.062	.046	--	.046	.018	.011	.84	.006	.005	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.005	.027	.07	.188	.829	.904	.406	.587	.061	.037	.005	.189	.007	.759	.117	.009	.022	.111	.012	.02	.007	.038	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.03	.011	.819	.951	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.005	.015	--	.001	.007	.017	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.003	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.006	.002	.002	--	--	--	.01	.239	.02	.02	.01	.034	.003	.012	.006	.019	.009	.107	.003	.003	.054	.056	.016	.015	.042	.142	.001	.007	.001	.001	.037	.004	.014	.002	.001	.056	.008	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.004	.258	.022	.127	.138	--	--	.009	.056	.007	.008	.009	--	--	--	--	--	.015	.049	.046	.245	.237	.209	.009	.008	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.102	.034	.057	.018	.001	.004	--	--	--	--	--	.022	--	--	.003	.007	.005	.005	.007	.033	.032	.004	.005	.162	.036	.033	.058	.02	--	--	.053	.043	.005	--	--	.086	--	.007	.018	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.015	--	--	--	--	--	--	--	.111	.001	.004	.013	.003	--	--	--	--	.002	--	.235	.002	.426	.118	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.029	.032	.145	--	--	--	--	--	--	.786	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.135	.994	.94	.325	.002	.002	.26	--	.03	.002	.002	.002	.834	.968	.996	.591	.608	.427	.746	.268	.014	.007	.004	.077	.001	.015	.019	.004	.016	.001	.002	.288	.027	.002	.005	.003	.002	.008	.001	.004	.049
--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--
Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38										Vom2r38
--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--
G	G	A	A	T	3	G	T	T	G	G	C	A	2	T	C	G	G	C	A	G	T	C	T	A	A	G	A	T	C	T	C	G	C	A	C	C	T	C	G	G	T	G	G	A	A	T	G	A	C	G	T	C	T	G	G	G	A	A	C	4	T	G	A	A	G	A	T	C	A	A	T	C	G	G	G	G	G	A	C	G	C	5	T	G	2	A	A	A	C	T	T	T	A	A	A	T	G	G	A	G	C	C	C	T	T	A	A	G	G	A	G	C	A	G	T	A	T	T	C	A	A	T	A	C	A	A	T	G	A	T	G	T	C	T	2	A	G	A	G	C	A	A	A	C	A	T	A	C	T	A	A	A	A	T	G	A	A	C	13	A	G	G	A	T	T	G	C	G	G	A	C	G	T	A	A	T	A	C	G	A	G	A	G	A	T	A	G	A	10	C	G	G	T	C	C	A	T	T	22	C	C	G	T	T	A	T	A	G	A	C	A	3	C	C	T	G	T	A	A	A	T	C	T	A	A	G	A	C	2	T	T	A	G	G	A	2	C	C	T	A	4	14	2	G	G	A	G	A	C	C	G	A	C	T	C	C	G	4	G	2	C	C	C	3	36	A	T	2	G	G	9	8	7	C	G	T	C	G	3	18	T	T	C	G	A	A	C	C	C	A	C	A	G	C	T	T	2	T	T	A	C	3	4	3	8	7	6	C	6	G	C	A	8	4	C	12	10	G	4	4	64	C	3	C	A	T	4	3	T	2	T	A	A	A	4	T	A	A	C	2	T	C	C	A	C	A	18	G	10	T	C	A	6	4	G	30	20	6	C	T	T	G	A	T	9	C	A	T	A	3	G	4	6	A	6	2	4	G	A	A	A	C	A	A	A	C	G	T	4	T	G	G	G	A	G	A	3	A	T	A	4	G	A	T	A	G	A	C	2	T	G	T	T	C	A	C	A	G	A	C	G	A	C	G	5	4	3	6	T	G	T	A	T	T	A	T	T	A	T	T	G	A	T	C	A	C	A	A	C	T	T	T	G	A	G	C	A	A	A	16	T	G
99,993,180	99,993,181	99,994,571	99,998,119	99,998,227	99,998,394	99,999,209	99,999,711	99,999,712	100,001,438	100,001,798	100,002,068	100,002,084	100,002,175	100,002,178	100,003,028	100,003,673	100,005,115	100,005,567	100,006,176	100,006,268	100,008,291	100,008,601	100,012,188	100,013,290	100,013,345	100,014,845	100,015,605	100,015,619	100,016,395	100,016,526	100,017,060	100,017,292	100,018,243	100,018,440	100,018,553	100,020,174	100,020,838	100,021,089	100,021,278	100,021,307	100,022,124	100,022,163	100,022,348	100,022,585	100,022,875	100,023,045	100,023,203	100,026,490	100,026,521	100,026,552	100,027,396	100,027,878	100,027,959	100,028,337	100,028,340	100,028,436	100,029,168	100,029,172	100,029,923	100,030,512	100,033,034	100,034,174	100,034,179	100,034,268	100,034,499	100,034,810	100,047,112	100,047,250	100,049,199	100,049,664	100,049,929	100,050,685	100,053,855	100,053,856	100,053,903	100,053,906	100,054,250	100,055,413	100,055,936	100,056,766	100,056,949	100,061,635	100,062,744	100,062,916	100,062,976	100,063,625	100,064,492	100,065,985	100,066,035	100,066,671	100,066,790	100,066,899	100,066,901	100,066,954	100,068,108	100,068,119	100,068,127	100,068,161	100,068,391	100,068,401	100,068,438	100,068,695	100,068,784	100,069,071	100,069,602	100,069,706	100,070,192	100,070,286	100,070,351	100,070,478	100,070,658	100,070,732	100,070,750	100,070,810	100,071,054	100,071,074	100,071,080	100,071,227	100,071,659	100,071,803	100,071,823	100,071,937	100,072,380	100,072,434	100,072,570	100,072,802	100,072,821	100,073,158	100,073,302	100,073,396	100,073,506	100,073,601	100,073,649	100,085,827	100,085,846	100,085,913	100,085,936	100,086,209	100,086,210	100,086,212	100,086,414	100,086,606	100,086,631	100,086,681	100,086,701	100,086,741	100,086,871	100,087,048	100,087,057	100,087,427	100,087,482	100,087,638	100,087,810	100,088,033	100,088,052	100,088,080	100,088,415	100,088,564	100,088,568	100,089,140	100,089,470	100,089,663	100,090,274	100,090,383	100,090,412	100,090,603	100,090,837	100,090,853	100,090,961	100,091,085	100,091,101	100,091,216	100,091,476	100,091,698	100,091,754	100,091,883	100,092,067	100,092,341	100,092,886	100,092,915	100,092,936	100,093,146	100,093,399	100,093,436	100,093,636	100,093,687	100,093,702	100,093,868	100,094,011	100,094,250	100,094,253	100,094,303	100,094,319	100,094,418	100,094,442	100,094,501	100,094,758	100,094,762	100,094,828	100,095,120	100,095,320	100,095,379	100,095,769	100,096,263	100,096,726	100,096,747	100,096,975	100,097,026	100,097,092	100,097,142	100,097,239	100,097,328	100,097,455	100,097,459	100,097,473	100,099,933	100,101,328	100,101,639	100,101,640	100,101,664	100,101,775	100,102,119	100,102,132	100,102,232	100,102,238	100,102,589	100,102,727	100,102,922	100,103,325	100,103,498	100,103,531	100,104,094	100,104,095	100,104,448	100,104,723	100,104,850	100,104,912	100,104,927	100,105,055	100,105,102	100,105,110	100,105,239	100,105,285	100,105,341	100,105,518	100,105,883	100,106,079	100,106,091	100,106,257	100,106,266	100,106,271	100,106,272	100,106,279	100,106,366	100,106,494	100,106,580	100,109,321	100,112,382	100,114,583	100,119,666	100,119,974	100,121,305	100,121,522	100,121,732	100,122,537	100,123,090	100,124,210	100,124,213	100,125,592	100,126,936	100,127,155	100,127,156	100,127,157	100,127,750	100,127,757	100,129,102	100,129,106	100,129,112	100,131,727	100,131,731	100,131,900	100,132,211	100,132,215	100,132,221	100,135,713	100,137,194	100,137,425	100,137,530	100,137,537	100,138,298	100,138,342	100,138,388	100,140,894	100,140,899	100,141,274	100,147,752	100,148,749	100,149,314	100,149,456	100,149,952	100,150,070	100,152,222	100,152,649	100,152,650	100,152,665	100,152,666	100,152,667	100,153,953	100,156,192	100,156,362	100,156,810	100,156,828	100,157,393	100,157,397	100,157,436	100,159,516	100,159,517	100,159,922	100,159,965	100,161,085	100,161,331	100,161,577	100,161,676	100,161,683	100,164,202	100,169,418	100,170,607	100,170,608	100,170,841	100,173,748	100,174,007	100,175,571	100,177,503	100,177,816	100,177,824	100,177,914	100,177,931	100,177,962	100,178,008	100,178,033	100,178,034	100,178,075	100,178,103	100,178,127	100,178,232	100,178,234	100,178,586	100,178,884	100,179,203	100,179,497	100,180,358	100,180,421	100,180,443	100,180,445	100,181,402	100,181,551	100,181,677	100,181,938	100,182,117	100,182,192	100,182,213	100,182,372	100,183,420	100,183,435	100,183,618	100,183,640	100,184,062	100,184,313	100,184,597	100,184,748	100,185,204	100,185,215	100,186,343	100,186,476	100,187,186	100,187,212	100,187,248	100,187,257	100,187,273	100,187,285	100,187,291	100,187,423	100,187,560	100,187,759	100,187,776	100,188,124	100,188,127	100,188,133	100,188,635	100,188,735	100,188,747	100,189,177	100,189,543	100,189,643	100,190,452	100,190,485	100,190,733	100,190,736	100,191,680	100,191,863	100,195,478	100,195,516	100,195,532	100,197,377	100,197,978	100,198,146	100,198,283	100,198,625	100,198,731	100,198,735	100,199,071	100,199,520	100,199,528	100,199,534	100,199,551	100,199,554	100,199,685	100,200,077	100,200,979	100,203,116	100,203,137	100,203,421	100,203,663	100,203,826	100,204,387	100,204,422	100,204,423	100,204,498	100,204,547	100,204,840	100,205,636	100,205,918	100,205,921	100,206,656	100,207,088	100,207,885	100,208,135	100,208,140	100,208,160	100,208,199	100,208,303	100,208,314	100,208,316	100,208,445	100,208,460	100,208,478	100,208,571	100,208,573	100,208,630	100,208,725	100,208,848	100,208,906	100,209,090	100,209,218	100,209,397	100,209,600	100,210,069	100,210,070	100,211,132	100,212,061	100,213,320	100,217,356
T	T	T	A/2	T/-	3/-	C	G	A	G/-	G/-	C/-	A/-	2/-	T/3	G	A	C	T	G	T	C	2	C	G	2	A	-	C	A	-	A	T	9	A/2	11	C/2	C	T	A	A	2	T	C	-	5	C	C	C	C/T	G/T	A	T	C	A	C	2	G	3	T	-	4	2	-	?	T	T	C	2	T	G	C	A	-	A	-	-	A	C	T	T	T	5/-	2	2	-	-	9	29	G	-	A	G	-	G	T	C	C	A	G	C	T	T	A	C	C	G	G	5	A	T	C	A	G	C	C	16	C	T/45	G	G	G	C	C	T	2	21	C	A	G	C	T	C	T	A	-	-	T	G	A	A	T	3	-	A	T	A	G	T	A	C	T	G	T	C	A	T	3	C/-	13/-	G	T	T	G	C	C	A	T	C	A	G	A	A	G	G	G	A	G	G	A	G	A	2	T	C	C	-	C	G	-	G	A	A	C	T	A	G	19	C	-	11	T	T	C	C	C	G	G	T	T	A	G	-	-	T	C	24	A	G	G	G	C	A	C	T	G	C	G	2	-	C	C	G	A	T	G	-	A	T	C	T	-	-	-	A	C	C	T	3	-	T	A	G	A	C	C/T	G/A	G/-	4/-	G/13	2/-	C/4	CG/CT	2	3/-	36/-	-	T/3	2/-	G/-	?	9/-	8/-	7/-	C/4	G/-	T/12	C/2	17/5	3/-	18/-	T/16	T/12	C/2	G/17	A/4	2	16	C/5	C/2	9	C/-	2	-	2	-	T/2	2/-	T/2	2	2	C/2	3/-	4/-	3/-	8/-	7/-	6/-	2	-	6/5	C/5	-	8/-	4/-	5/7	12/-	10/-	G/2	4/-	-	64/-	C/-	3/-	C/6	A/2	T/-	4/-	3/-	TG/TA	-	-	A/2	-	A/2	-	T/2	A/G	A/G	C/G	2/-	T/-	C/3	C/2	A/-	C/2	A/2	18/11	G/2	10/-	T/5	C/G	A/G	6/-	4/-	A	30/-	20/-	6/-	C/2	T/108	C	C	A/-	G	9/-	C/2	A/4	T/-	A/2	3/-	G/2	4/-	6/-	A/-	6/-	2/-	4/-	G/A	A/3	A/G	G	C/5	A/2	A/2	A/2	C/4	G/2	T/2	-	T/-	G/2	G/12	G/-	A/2	G/-	A/-	3/-	A/3	G	C	-	A	G	G	G	A	G	A	2/-	T/4	A	2	2	-	C	-	-	A	G	G	A	2	2	A	5/-	4/-	-	-	G	A	A	A/2	T/33	G	G	G	G	G	G	A	A	G	C	T	19	T	2	C	T	-	G	C	2	G	3	2	G	G	G	-	G	2