Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 124,589 (bp)   Positions: 371
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.003
.0
.079
.0
.003
.0
.002
.123
.011
.009
--
.004
--
--
--
--
--
--
.134
.007
--
.992
--
.996
.001
.0
.828
.152
--
--
--
.002
.206
.189
.0
.225
.016
--
.02
.003
.072
.114
.001
.116
.005
.008
.074
.043
.442
.665
.015
.0
.07
.076
.883
.0
--
--
--
--
--
--
.193
.006
.102
.009
.373
.028
--
--
--
--
--
.138
1.0
.03
.008
--
.007
.118
.028
--
--
--
--
.758
.984
--
.024
.131
.079
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.964
.375
.001
.034
.006
.023
.071
.391
.003
.071
.011
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.049
.076
.228
.315
.11
.193
.018
.253
.011
.199
--
--
--
--
--
.025
.611
.581
.142
.997
.009
.003
.001
.105
.367
.003
.997
.0
.018
.208
.0
.066
.017
.042
.004
.001
.583
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.998
.007
.009
.003
.007
.0
.0
.003
.022
.0
.002
.0
.005
.027
.005
.007
.112
.003
.018
.109
.015
.174
.234
.127
.019
.02
.004
.064
.001
.001
.001
.003
.0
.001
.001
.002
.003
.177
.043
.01
.001
.001
--
--
--
--
.036
.031
.0
.002
.003
.002
.001
.002
.026
.402
.378
.055
.002
.993
.66
.121
.097
.001
.586
.064
.725
.961
.082
.0
.001
.006
.014
.02
.004
.011
.002
.003
.141
.0
.0
.191
.008
.038
.0
.019
.001
.021
--
--
--
--
--
.002
.002
.0
.002
.002
.003
.004
.001
.962
.002
.002
.0
.001
.004
.011
.102
.0
.777
.003
.007
.033
.007
.074
.904
.001
.05
.097
.006
.046
.032
.001
.002
.001
.011
.002
.0
.012
.027
.002
.008
.003
.004
.002
.008
.105
.309
.002
.02
.225
.39
.121
.066
.001
.015
.007
.518
.001
.002
.014
.001
.15
.015
.0
.014
.003
.004
.997
.0
.06
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.0
.007
.001
.001
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ptx3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
A
T
A
A
A
T
T
A
A
2
G
A
C
A
C
G
A
A
G
2
C
A
G
2
G
T
T
G
T
C
A
T
A
T
C
T
T
T
3
C
T
T
A
C
C
T
T
G
C
T
T
T
C
T
T
G
G
T
4
4
21
G
G
G
5
C
G
T
T
T
C
T
3
4
G
2
A
C
A
T
C
3
2
A
G
A
C
30
G
T
T
T
T
C
T
C
C
A
A
A
7
3
A
T
T
C
16
C
A
A
T
A
A
C
T
A
T
T
T
T
A
A
C
G
T
G
T
T
A
T
T
T
C
T
G
C
A
G
G
A
T
T
G
T
T
G
C
G
A
A
G
T
G
A
A
C
A
T
T
G
G
G
T
G
T
A
T
C
C
G
T
118
C
C
C
C
C
C
C
T
T
T
G
G
A
G
C
C
A
G
T
T
C
G
A
T
G
6
2
C
T
G
T
C
A
C
C
T
A
17
G
A
C
G
T
T
T
G
A
A
G
T
G
12
46
13
T
2
7
C
G
C
A
G
G
A
G
G
T
T
T
C
A
G
T
4
C
T
G
G
T
A
C
C
A
C
T
C
A
110
C
A
G
G
T
2
C
A
A
T
A
T
A
4
G
G
C
C
G
T
C
T
G
T
G
C
A
A
A
A
A
G
T
G
A
C
C
T
T
T
C
C
A
G
C
T
A
T
T
C
T
G
T
C
T
T
2
T
G
A
T
C
6
C
T
T
T
T
C
A
A
2
T
C
T
G
T
T
A
T
T
G
T
T
G
G
T
C
T
C
T
G
C
A
G
G
A
G
G
C
A
C
G
T
C
C
T
G
2
A
C
  177,232,356
  177,232,588
  177,232,751
  177,232,780
  177,232,789
  177,232,798
  177,232,989
  177,233,224
  177,234,208
  177,236,481
  177,237,152
  177,237,840
  177,239,031
  177,241,049
  177,241,052
  177,241,220
  177,241,223
  177,245,788
  177,246,542
  177,246,886
  177,246,967
  177,247,903
  177,253,763
  177,258,693
  177,262,497
  177,262,498
  177,262,584
  177,265,682
  177,266,496
  177,266,840
  177,267,578
  177,269,961
  177,270,873
  177,270,874
  177,272,639
  177,283,040
  177,283,145
  177,284,703
  177,288,147
  177,288,311
  177,290,502
  177,290,542
  177,290,802
  177,291,206
  177,291,218
  177,291,834
  177,291,988
  177,292,273
  177,292,485
  177,292,589
  177,292,656
  177,293,174
  177,293,278
  177,293,309
  177,293,440
  177,293,520
  177,294,457
  177,294,530
  177,294,625
  177,294,737
  177,294,906
  177,294,930
  177,295,394
  177,295,624
  177,296,609
  177,296,781
  177,298,253
  177,298,685
  177,298,842
  177,298,902
  177,299,074
  177,303,364
  177,305,404
  177,305,696
  177,306,438
  177,308,859
  177,309,944
  177,313,212
  177,322,320
  177,322,569
  177,324,728
  177,325,653
  177,325,654
  177,325,691
  177,326,522
  177,331,154
  177,332,271
  177,334,711
  177,335,894
  177,338,314
  177,346,798
  177,396,640
  177,396,798
  177,397,859
  177,398,370
  177,398,568
  177,398,654
  177,398,658
  177,398,674
  177,398,677
  177,398,680
  177,398,688
  177,398,692
  177,398,752
  177,399,683
  177,399,757
  177,400,097
  177,400,144
  177,400,232
  177,400,272
  177,400,294
  177,400,325
  177,400,625
  177,400,639
  177,400,863
  177,401,146
  177,401,413
  177,402,003
  177,402,621
  177,403,213
  177,403,708
  177,404,081
  177,404,251
  177,405,100
  177,405,173
  177,405,850
  177,407,227
  177,407,453
  177,407,538
  177,407,706
  177,407,792
  177,407,928
  177,408,183
  177,408,851
  177,408,886
  177,409,054
  177,409,347
  177,409,366
  177,409,528
  177,409,542
  177,409,617
  177,409,902
  177,409,950
  177,410,211
  177,410,303
  177,410,325
  177,410,327
  177,410,328
  177,410,729
  177,411,030
  177,411,068
  177,411,365
  177,427,769
  177,427,846
  177,427,893
  177,427,911
  177,427,950
  177,428,059
  177,428,224
  177,428,532
  177,428,732
  177,428,753
  177,429,020
  177,429,264
  177,429,384
  177,429,558
  177,429,579
  177,429,612
  177,430,168
  177,431,433
  177,431,952
  177,432,650
  177,432,997
  177,432,999
  177,433,001
  177,433,009
  177,433,021
  177,433,027
  177,433,029
  177,433,079
  177,433,268
  177,433,549
  177,433,803
  177,433,901
  177,433,931
  177,434,031
  177,434,197
  177,434,273
  177,434,454
  177,434,565
  177,434,612
  177,434,831
  177,434,914
  177,435,089
  177,435,092
  177,435,162
  177,435,593
  177,435,610
  177,435,631
  177,435,646
  177,435,659
  177,435,689
  177,435,751
  177,435,754
  177,435,811
  177,435,966
  177,435,968
  177,436,402
  177,436,726
  177,436,736
  177,437,622
  177,437,654
  177,437,738
  177,437,801
  177,437,940
  177,437,941
  177,438,096
  177,438,551
  177,438,577
  177,438,641
  177,438,823
  177,438,913
  177,439,083
  177,439,189
  177,439,232
  177,439,279
  177,439,303
  177,439,630
  177,439,636
  177,439,764
  177,439,852
  177,439,863
  177,439,884
  177,440,045
  177,440,082
  177,440,290
  177,440,636
  177,440,643
  177,440,979
  177,442,200
  177,442,333
  177,442,357
  177,442,688
  177,443,078
  177,443,099
  177,443,288
  177,443,310
  177,443,397
  177,443,443
  177,443,568
  177,443,678
  177,445,234
  177,445,654
  177,445,934
  177,446,576
  177,447,410
  177,447,560
  177,448,513
  177,449,130
  177,449,206
  177,449,406
  177,449,508
  177,450,410
  177,450,887
  177,451,165
  177,451,687
  177,451,704
  177,453,231
  177,453,268
  177,454,221
  177,454,655
  177,454,809
  177,454,813
  177,455,155
  177,456,657
  177,456,930
  177,456,946
  177,457,358
  177,457,359
  177,458,552
  177,461,122
  177,461,808
  177,462,786
  177,463,167
  177,463,168
  177,463,633
  177,463,642
  177,463,889
  177,464,124
  177,464,243
  177,465,116
  177,465,605
  177,465,793
  177,465,926
  177,466,653
  177,466,762
  177,467,506
  177,467,698
  177,467,798
  177,468,804
  177,469,204
  177,469,423
  177,469,771
  177,470,012
  177,470,093
  177,470,313
  177,470,988
  177,471,717
  177,471,829
  177,471,922
  177,472,344
  177,472,756
  177,472,883
  177,472,912
  177,473,107
  177,473,909
  177,474,198
  177,474,929
  177,475,041
  177,476,856
  177,477,019
  177,477,307
  177,477,397
  177,477,410
  177,477,818
  177,480,033
  177,480,407
  177,480,744
  177,480,864
  177,481,132
  177,481,180
  177,481,190
  177,481,325
  177,481,388
  177,482,291
  177,482,737
  177,482,741
  177,482,816
  177,483,214
  177,484,212
  177,484,435
  177,498,426
  177,498,953
  177,499,104
  177,499,224
  177,499,767
  177,500,316
  177,500,384
  177,500,427
  177,500,451
  177,500,823
  177,500,824
  177,500,854
  177,501,058
  177,501,232
  177,501,392
  177,501,506
  177,502,963
  177,503,311
  177,503,357
  177,503,362
  177,503,364
  177,504,102
  177,504,158
  177,504,413
  177,507,413
  177,508,213
  177,508,324
  177,509,658
  177,509,659
  177,510,487
G
C
G
G
T
C
C
-
G
-
T
G
T
A/G
C/T
A
T
A/-
A
2/-
C/3
C
T
-
G/2
T/-
A
2
-
T
G
T/-
A/2
T/-
T
C
C
C
-
2
G
C
C
T
A
G
C
A
T
G
C
C
T
C
C
T
A
C
-
-
-
T
T
C
-
T
A
C
C
C
T
C
-
-
A
2/-
C
A
G
C
T
3/-
-
T
2
2
T
30/-
A
C
-
C
-
T
C
T
T
C
G
T
-
-
G
-
A
A
-
G
G
G
C
G
G
A
C
T
C
C
C
C
C
C
T
A
C
A
A
C
C
C
A
C
T
C
T
A
G
A
A
G
G
C
T
C
C
3
2
5
G
T
A
A
A
C
-
3
2
10
C
A
A
T
C
T
C
G
C
G
G
A
C
-
T
T
T
T
G
T
T
2
2
C
A
A
-
A
T
A
G
A
C
C
T
T
T
-
A
-
-
T
-
A
C
T
T
A
A
C
G
-
A
C
T
A
G
C
G
C
G
-
A
C
A
-
-
-
C
-
-
A
A
T
2
C
C
T
A
A
C
G
C
T
G
T
C
-
T
G
A
C
-
3
T
A
T
7
A
T
G
-
T
G
A
A
7/5
-
G
G
G
-
22
G
2
-
25
C
CA/3
2
A
C
A
-
-
C
A
T
C
T
G
G
-
A
-
A
-
T
T
C
G
G
T
A
G
A
T
A
C
C
C
T
G
A
G
5
C
C
-
-
A
G
A
T
-
T
C
C
C
C
T
G
C
-
C
T
C
A
C
-
T
C
C
A
-
C
A
2
13
T
C
T
A
A
5
T
A
T
G
A
C
2
2
10
A
C
A
T
C
A
2/-
-
A