Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 124,589 (bp)   Positions: 459
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.003
.0
.079
.0
.0
.002
.169
.128
.011
.0
.001
.009
--
--
.224
.004
.039
.004
.01
.005
.0
--
--
--
.364
.001
.011
.011
.03
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.001
.034
.002
.086
.1
.007
--
--
--
.055
.0
.007
.003
.013
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.066
.002
.001
.317
.023
--
--
--
.33
--
--
--
.004
.285
.853
.18
.005
.0
.0
.005
.081
.002
.008
.019
.016
.03
.03
.184
.005
.145
.002
.047
.002
.001
.006
.018
.045
.122
.996
.997
1.0
1.0
--
--
--
.087
.782
--
--
.005
.003
.0
.001
.001
.0
.002
.002
.007
.0
.042
.002
.0
.003
.088
.013
.087
.061
.718
.939
.013
.928
.875
.009
.087
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.015
.002
.189
.001
--
--
.801
.003
.002
.077
.175
.216
.225
.156
--
--
.002
.008
.003
.058
.079
.072
.001
.0
.116
.005
.017
.195
.098
.008
.442
.015
--
--
--
--
.001
.007
--
1.0
.159
.03
.008
.086
.018
--
--
--
--
--
--
.758
--
--
--
.131
.079
--
.0
.971
.741
.022
--
.049
.0
.009
.066
.042
.004
.001
.583
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.998
.007
.009
.003
.007
.0
.0
.003
.022
.0
.002
.0
.005
.027
.005
.007
.119
.015
.018
.109
.015
.174
.234
.611
.019
.01
.004
.001
.0
.064
.001
.006
.001
.001
.003
.0
.001
.001
.002
.003
.177
.043
.01
.001
.001
--
--
--
--
.395
.036
.031
.0
.002
.003
.002
.001
.002
.026
.402
.378
.055
.002
.022
.993
.66
.121
.097
.001
.586
.064
.725
.961
.082
.0
.021
.001
.006
.014
.02
.011
.004
.011
.002
.003
.141
.0
.0
.191
.008
.038
.001
.019
.001
.021
--
--
--
--
--
.002
.002
.0
.002
.002
.003
.004
.001
.962
.002
.002
.0
.001
.004
.011
.102
.0
.777
.003
.007
.033
.007
.074
.904
.001
.05
.097
.006
.08
.046
.032
.001
.001
.002
.001
.011
.002
.0
.012
.027
.002
.008
.003
.004
.002
.008
.105
.309
.002
.39
.393
.066
.001
.015
.007
.518
.001
.002
.0
.014
.001
.15
.273
.291
.015
.0
.003
.004
.997
.002
.002
.003
.06
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.034
.004
.0
.001
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ptx3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
Veph1
A
T
A
A
T
T
3
A
A
G
G
T
T
C
C
A
C
G
A
A
G
A
G
C
C
G
C
C
C
A
G
C
A
C
C
G
A
G
A
A
C
C
A
11
A
2
12
C
C
C
T
T
C
C
A
C
5
T
C
A
A
G
C
C
G
T
T
C
C
C
C
A
T
T
C
G
C
A
C
A
A
G
T
C
G
C
T
C
C
T
G
4
T
C
A
A
G
C
T
A
C
G
G
G
2
C
T
A
A
4
G
C
T
C
22
A
C
C
C
C
T
C
2
T
A
3
A
12
10
G
A
C
C
G
G
G
G
G
T
C
G
T
G
T
C
T
A
C
C
T
G
T
C
A
3
A
T
4
T
A
T
T
T
G
C
C
G
A
A
A
A
T
C
T
A
C
T
2
A
2
T
C
G
28
T
2
T
2
A
T
2
3
C
T
T
T
A
C
C
C
C
G
G
T
C
T
A
9
7
G
3
C
A
G
A
2
A
3
A
3
2
T
T
G
G
A
30
2
A
T
T
A
11
G
C
A
C
T
C
A
T
T
C
C
G
T
118
C
C
C
C
C
C
C
T
T
T
G
G
A
G
C
C
A
G
T
T
C
G
A
T
G
8
C
C
T
G
T
C
C
C
C
T
C
T
A
17
C
G
A
C
G
T
T
T
G
A
A
G
T
G
12
46
13
T
4
2
7
C
G
C
A
G
G
A
G
G
T
T
G
T
C
A
G
T
4
C
T
G
G
T
A
A
C
C
A
G
C
T
C
A
110
C
A
G
G
T
G
C
A
A
T
A
T
A
4
G
G
C
C
G
T
C
T
G
T
G
C
A
A
A
A
A
G
T
G
A
C
C
T
T
T
C
C
T
A
G
C
8
T
A
T
T
C
T
G
T
C
T
T
2
T
G
A
T
C
C
T
T
T
C
A
A
2
G
T
C
T
2
4
G
T
A
T
T
T
T
G
T
T
G
G
T
C
T
T
G
C
A
G
G
A
G
41
G
C
A
C
6
4
G
T
C
A
12
C
T
A
C
  177,232,356
  177,232,588
  177,232,751
  177,232,780
  177,232,798
  177,232,989
  177,233,231
  177,233,234
  177,234,208
  177,234,317
  177,236,104
  177,236,480
  177,236,979
  177,237,241
  177,237,701
  177,237,840
  177,237,995
  177,238,038
  177,238,166
  177,238,243
  177,238,347
  177,239,030
  177,239,083
  177,239,375
  177,239,530
  177,239,696
  177,239,758
  177,239,895
  177,240,014
  177,240,401
  177,240,492
  177,240,782
  177,241,049
  177,241,052
  177,241,067
  177,241,220
  177,241,223
  177,243,197
  177,245,788
  177,245,862
  177,246,009
  177,246,258
  177,246,318
  177,246,411
  177,246,826
  177,246,886
  177,246,919
  177,246,967
  177,247,028
  177,247,157
  177,247,232
  177,247,707
  177,247,790
  177,247,822
  177,248,533
  177,248,573
  177,248,578
  177,248,587
  177,248,593
  177,248,596
  177,248,628
  177,248,813
  177,248,836
  177,248,844
  177,249,017
  177,249,030
  177,249,119
  177,249,134
  177,249,142
  177,249,143
  177,249,157
  177,249,341
  177,249,344
  177,249,347
  177,249,351
  177,249,352
  177,249,597
  177,250,077
  177,250,082
  177,250,085
  177,250,091
  177,250,120
  177,250,303
  177,250,321
  177,250,512
  177,251,034
  177,251,959
  177,252,146
  177,252,356
  177,252,592
  177,253,019
  177,253,092
  177,253,582
  177,253,775
  177,253,987
  177,254,045
  177,254,537
  177,254,678
  177,255,120
  177,255,177
  177,255,271
  177,255,549
  177,255,552
  177,255,650
  177,255,756
  177,255,807
  177,256,131
  177,256,515
  177,256,516
  177,256,525
  177,256,798
  177,256,908
  177,256,935
  177,257,095
  177,257,312
  177,257,895
  177,257,949
  177,257,951
  177,258,121
  177,258,201
  177,258,283
  177,258,566
  177,258,693
  177,258,694
  177,258,773
  177,258,811
  177,260,024
  177,260,245
  177,260,247
  177,260,332
  177,260,446
  177,260,697
  177,261,400
  177,261,449
  177,261,514
  177,261,625
  177,261,633
  177,261,637
  177,262,498
  177,262,635
  177,262,735
  177,262,826
  177,263,180
  177,263,232
  177,263,249
  177,263,744
  177,264,343
  177,264,555
  177,264,600
  177,265,198
  177,265,280
  177,265,366
  177,265,367
  177,265,379
  177,265,457
  177,265,460
  177,265,595
  177,265,671
  177,266,021
  177,266,096
  177,266,125
  177,266,496
  177,266,632
  177,266,706
  177,266,773
  177,267,153
  177,267,327
  177,267,343
  177,267,578
  177,267,633
  177,267,866
  177,268,214
  177,268,272
  177,269,961
  177,270,157
  177,270,556
  177,270,874
  177,273,998
  177,274,279
  177,275,695
  177,276,194
  177,277,137
  177,278,533
  177,280,003
  177,280,881
  177,281,141
  177,283,040
  177,283,118
  177,284,164
  177,284,703
  177,288,136
  177,288,145
  177,288,311
  177,288,641
  177,289,979
  177,290,502
  177,290,802
  177,290,873
  177,291,206
  177,291,218
  177,291,240
  177,291,301
  177,291,587
  177,291,834
  177,292,485
  177,292,656
  177,294,732
  177,294,918
  177,294,920
  177,294,930
  177,299,598
  177,303,050
  177,304,085
  177,306,438
  177,307,764
  177,308,859
  177,309,944
  177,311,971
  177,324,841
  177,325,653
  177,325,654
  177,325,844
  177,326,523
  177,326,823
  177,327,734
  177,331,154
  177,334,711
  177,334,841
  177,334,859
  177,338,314
  177,346,798
  177,347,501
  177,389,984
  177,390,482
  177,400,110
  177,401,273
  177,407,843
  177,408,851
  177,411,184
  177,427,846
  177,429,384
  177,429,579
  177,429,612
  177,430,168
  177,431,433
  177,431,952
  177,432,650
  177,432,997
  177,432,999
  177,433,001
  177,433,009
  177,433,021
  177,433,027
  177,433,029
  177,433,079
  177,433,268
  177,433,549
  177,433,803
  177,433,901
  177,433,931
  177,434,031
  177,434,197
  177,434,273
  177,434,454
  177,434,565
  177,434,612
  177,434,831
  177,434,914
  177,435,089
  177,435,092
  177,435,162
  177,435,593
  177,435,608
  177,435,644
  177,435,646
  177,435,659
  177,435,689
  177,435,751
  177,435,754
  177,435,851
  177,435,966
  177,436,179
  177,436,402
  177,436,626
  177,436,639
  177,436,726
  177,436,736
  177,437,121
  177,437,622
  177,437,654
  177,437,738
  177,437,801
  177,437,940
  177,437,941
  177,438,096
  177,438,551
  177,438,577
  177,438,641
  177,438,823
  177,438,913
  177,439,083
  177,439,189
  177,439,232
  177,439,279
  177,439,303
  177,439,385
  177,439,630
  177,439,636
  177,439,764
  177,439,852
  177,439,863
  177,439,884
  177,440,045
  177,440,082
  177,440,290
  177,440,636
  177,440,643
  177,440,979
  177,442,200
  177,442,203
  177,442,333
  177,442,357
  177,442,688
  177,443,078
  177,443,099
  177,443,288
  177,443,310
  177,443,397
  177,443,443
  177,443,568
  177,443,678
  177,444,028
  177,445,234
  177,445,654
  177,445,934
  177,446,576
  177,446,921
  177,447,410
  177,447,560
  177,448,513
  177,449,130
  177,449,206
  177,449,406
  177,449,508
  177,450,410
  177,450,887
  177,451,165
  177,451,688
  177,451,704
  177,453,231
  177,453,268
  177,454,221
  177,454,655
  177,454,809
  177,454,813
  177,455,155
  177,456,657
  177,456,930
  177,456,946
  177,457,358
  177,457,359
  177,458,552
  177,461,122
  177,461,808
  177,462,786
  177,463,167
  177,463,168
  177,463,633
  177,463,642
  177,463,889
  177,464,124
  177,464,243
  177,465,116
  177,465,605
  177,465,793
  177,465,926
  177,466,653
  177,466,762
  177,467,506
  177,467,698
  177,467,798
  177,468,804
  177,469,204
  177,469,423
  177,469,573
  177,469,771
  177,470,012
  177,470,093
  177,470,142
  177,470,313
  177,470,988
  177,471,717
  177,471,829
  177,471,922
  177,472,344
  177,472,756
  177,472,883
  177,472,912
  177,473,107
  177,473,909
  177,474,198
  177,474,929
  177,475,041
  177,476,856
  177,477,019
  177,477,410
  177,477,495
  177,480,033
  177,480,407
  177,480,744
  177,480,864
  177,481,132
  177,481,180
  177,481,190
  177,481,203
  177,481,325
  177,481,388
  177,482,291
  177,482,343
  177,482,346
  177,482,737
  177,482,741
  177,483,214
  177,484,212
  177,484,435
  177,497,690
  177,497,787
  177,497,964
  177,498,953
  177,499,104
  177,499,224
  177,499,767
  177,500,316
  177,500,384
  177,500,427
  177,500,823
  177,500,824
  177,500,854
  177,501,058
  177,501,232
  177,501,392
  177,501,506
  177,502,963
  177,503,129
  177,503,311
  177,503,357
  177,503,362
  177,503,364
  177,503,419
  177,503,421
  177,504,102
  177,504,158
  177,504,413
  177,505,993
  177,506,135
  177,507,413
  177,508,213
  177,509,659
  177,510,487
G
C
G
G
C
C
-
3
G
C
A
7
G
T
T
G
G
A
G
C
A
G
A
T
T
A
G
T
T
16
A
A
G
T
A
A
G
G/2
-
T
T
T
G
-
-
-
12/-
3
19/23
T
G
C
T
T
T
T
-
A
G
T
G
A
A
G
A
C
A
G
2
T
G
G
C
C
T
T
A
-
A
5
C
C
C
G
A
T
C
T
T
C
10
-
C
2
2
T
A
G
C
G
2
A
A
2
-
T
G
-
T
-
A
T
G
T
22/-
T
G
T
T
T
-
T
2/-
T/-
2
-
G
12/-
10/-
10
T
43
C/2
A
A
A
A
C
-
T
C
C
C
C
5
G
G
T
T
C
A
C
T
T
-
2
C
-
C
G
G
-
C
A
T
5
T
T
G
G
T
C
T
-
11
T
-
2/-
G
-
T/9
9/5
A
28/-
G
2/-
C
-
C
C
2/-
3/-
2
11
2
G
C
T
T
A
T
A
A
G
T
C
5
9/-
7/-
T
-
A
9
A
9
2/-
C
3/-
G
3/-
-
2
T/-
A
G/2
2
-
-
21
C
-
-
-
A
3
G
T
C
-
C
C
C
G
G
A
C
-
T
T
T
T
G
T
T
2
2
C
A
A
-
A
T
A
G
A
C
C
T
T
T
-
A
-
T
T
-
A
C
T
T
A
G
C
A
C
G
-
T
A
C
T
A
G
C
G
C
G
-
A
C
A
-
-
-
C
-
-
-
A
A
T
2
C
C
T
A
A
C
G
16
C
T
G
T
C
-
T
G
A
C
-
5
3
T
A
T
A
7
A
T
G
-
T
G
A
A
5/7
-
G
G
G
-
22
G
2
-
25
C
3/CA
2
A
C
A
-
-
C
A
T
C
T
G
G
-
A
-
A
-
T
T
C
G
G
T
A
33/29
G
A
T
-
A
C
C
C
T
G
A
G
5
C
C
-
-
A
G
A
T
A
C
C
C
T
G
C
-
A
C
T
C
-
-
A
C
T
C
C
T/3
4
A
-
C
A
2
19
T
C
A
A
5
T
A
T
G
A
-
C
2
2
10
6/-
-
A
C
A
9
12/-
T
C
-
A