Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 99,416 (bp)   Positions: 308
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.004
.008
.001
.0
.1
.091
.016
.0
.042
.352
.267
.08
.017
.0
.003
.001
.0
.003
.125
.036
.101
--
--
--
--
--
--
.003
.002
.0
.0
.001
.0
.29
.159
.492
.558
.014
.033
.001
.304
.001
.194
.057
.002
.156
.112
.088
.1
.001
.006
.008
.019
--
.032
.001
.003
.161
.151
.086
.019
.113
.002
.378
.754
.006
.075
.008
.092
--
--
.009
.001
.014
.004
.004
.002
.003
.002
.131
.013
.0
.007
.389
.539
.254
--
--
.051
.0
.001
.88
.882
.005
.041
.016
.006
.001
.02
.001
.003
.007
.064
.008
.0
.001
.213
.002
.718
.349
.069
.003
.004
.007
.075
.085
.029
.027
.02
.018
.158
.202
.22
.068
.021
.481
.008
.077
.068
.136
.172
.423
.273
.062
.153
.036
.047
.011
.04
.002
.009
.38
.001
.03
.006
.07
.112
.005
.006
.048
.191
.9
.024
.046
.015
.179
.126
.032
.451
.001
--
--
.079
.068
.003
.955
.006
.026
.063
.08
.0
.305
.007
.001
.025
.002
.121
.292
.016
.244
.015
--
.015
.002
.012
.764
.01
.127
.131
.513
.018
.008
.008
--
--
.116
1.0
.055
--
.106
.082
.13
.246
.001
.002
1.0
.041
.121
.079
.001
.009
.001
.333
.119
.005
.048
.035
.014
.43
.013
.0
.0
.019
.107
.016
.0
.004
.023
.002
.0
.771
.002
.002
.001
.342
.002
.003
.003
.001
.003
.015
.021
.5
.157
.02
.007
.005
.018
.003
.0
1.0
.014
.004
.0
.263
.001
.0
.001
.073
.004
1.0
.005
.008
.0
.505
.002
.003
.062
.017
.022
.627
.111
.007
.0
.329
.543
.027
.0
.0
.022
.012
.048
.007
.058
.041
.003
.001
.219
.076
.025
.172
.306
.011
.003
.272
.957
.045
.001
.615
.084
.031
.076
.026
.002
.024
.068
.13
.002
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
Usp13
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
2
G
3
2
5
G
C
G
G
T
C
C
C
T
T
C
C
G
T
C
G
2
A
T
12
G
A
A
C
A
23
A
A
10
8
G
T
T
4
G
23
T
A
6
2
10
2
C
T
C
C
T
C
T
8
G
T
T
T
A
C
C
A
T
G
C
T
T
A
T
C
T
9
C
T
C
A
C
16
T
A
4
C
G
T
A
C
T
T
6
2
T
T
C
C
C
C
G
T
C
T
C
A
6
G
G
C
T
2
A
C
A
A
G
C
T
G
A
9
A
C
G
A
T
G
C
G
G
A
A
A
G
G
G
10
T
C
G
T
A
C
G
A
A
C
T
C
T
G
A
T
G
11
A
C
G
A
4
8
74
A
G
T
T
4
A
T
C
C
G
C
C
G
T
A
T
C
T
C
T
G
G
A
T
4
T
4
C
C
G
G
4
G
T
A
T
A
G
G
G
C
C
T
A
A
12
C
A
T
T
C
C
C
G
8
C
A
C
A
C
C
C
T
A
A
A
C
G
T
A
G
T
G
G
A
T
T
T
T
A
C
A
G
2
G
T
9
T
G
G
G
2
T
G
G
C
T
C
G
4
G
A
134
A
A
C
T
G
T
T
T
12
2
G
C
T
A
C
C
G
C
G
T
A
A
G
4
C
T
T
2
A
A
G
G
A
T
A
T
A
T
C
T
C
T
T
  138,848,545
  138,849,080
  138,849,376
  138,849,385
  138,849,425
  138,849,426
  138,849,441
  138,850,234
  138,850,667
  138,851,038
  138,851,412
  138,851,861
  138,851,921
  138,852,405
  138,852,418
  138,852,432
  138,852,527
  138,853,107
  138,853,382
  138,853,454
  138,853,719
  138,854,200
  138,854,456
  138,854,495
  138,854,595
  138,854,841
  138,854,879
  138,855,032
  138,855,509
  138,855,563
  138,855,753
  138,855,988
  138,857,217
  138,857,759
  138,857,825
  138,858,137
  138,858,139
  138,858,667
  138,858,940
  138,859,007
  138,859,134
  138,861,849
  138,862,463
  138,864,909
  138,865,661
  138,866,412
  138,866,426
  138,866,439
  138,866,774
  138,866,965
  138,867,804
  138,867,936
  138,868,523
  138,869,021
  138,870,094
  138,870,199
  138,870,494
  138,871,027
  138,871,030
  138,871,232
  138,871,470
  138,871,583
  138,871,617
  138,872,336
  138,872,557
  138,872,894
  138,875,076
  138,875,894
  138,876,163
  138,876,314
  138,876,492
  138,877,929
  138,877,999
  138,878,152
  138,878,679
  138,878,926
  138,879,187
  138,879,609
  138,879,653
  138,879,767
  138,879,811
  138,879,866
  138,882,329
  138,883,274
  138,884,392
  138,884,956
  138,885,086
  138,885,268
  138,886,194
  138,886,220
  138,886,856
  138,887,231
  138,887,235
  138,888,751
  138,889,380
  138,890,203
  138,890,222
  138,890,224
  138,890,239
  138,890,268
  138,890,370
  138,890,797
  138,890,889
  138,891,150
  138,891,167
  138,891,387
  138,891,708
  138,892,064
  138,892,409
  138,892,423
  138,892,479
  138,892,527
  138,892,555
  138,892,626
  138,893,188
  138,893,265
  138,893,312
  138,893,315
  138,893,636
  138,893,638
  138,893,728
  138,893,760
  138,893,764
  138,893,914
  138,893,958
  138,894,108
  138,894,172
  138,894,198
  138,894,284
  138,894,340
  138,894,529
  138,894,602
  138,894,795
  138,894,811
  138,895,042
  138,895,074
  138,895,083
  138,895,353
  138,895,652
  138,895,680
  138,895,725
  138,896,880
  138,897,174
  138,897,529
  138,897,961
  138,898,051
  138,898,209
  138,899,499
  138,899,685
  138,899,744
  138,899,799
  138,899,928
  138,899,973
  138,900,029
  138,900,166
  138,900,272
  138,900,286
  138,900,436
  138,900,545
  138,900,615
  138,900,643
  138,900,686
  138,901,315
  138,901,369
  138,901,523
  138,902,137
  138,904,197
  138,904,622
  138,904,781
  138,904,789
  138,906,740
  138,907,343
  138,907,603
  138,908,463
  138,908,599
  138,908,981
  138,909,272
  138,909,838
  138,910,754
  138,910,816
  138,911,391
  138,914,053
  138,914,303
  138,915,606
  138,915,653
  138,916,218
  138,916,961
  138,917,105
  138,917,155
  138,917,206
  138,917,591
  138,917,661
  138,917,877
  138,918,215
  138,918,259
  138,918,345
  138,919,084
  138,919,574
  138,920,383
  138,921,362
  138,921,474
  138,922,513
  138,922,515
  138,923,315
  138,923,680
  138,924,005
  138,924,526
  138,925,421
  138,926,531
  138,926,765
  138,927,104
  138,927,839
  138,928,405
  138,928,699
  138,929,333
  138,929,801
  138,930,082
  138,930,424
  138,930,827
  138,931,059
  138,931,066
  138,931,070
  138,931,374
  138,931,465
  138,931,852
  138,931,982
  138,932,021
  138,932,743
  138,932,824
  138,933,253
  138,933,302
  138,933,711
  138,934,786
  138,934,819
  138,935,031
  138,935,285
  138,935,507
  138,935,554
  138,935,694
  138,935,737
  138,936,074
  138,936,390
  138,936,576
  138,936,655
  138,936,880
  138,937,297
  138,937,442
  138,937,552
  138,937,556
  138,937,724
  138,937,779
  138,938,089
  138,938,136
  138,938,297
  138,938,633
  138,938,954
  138,939,365
  138,939,763
  138,940,318
  138,940,630
  138,940,967
  138,941,308
  138,941,437
  138,941,553
  138,941,765
  138,941,958
  138,942,583
  138,943,111
  138,943,127
  138,943,132
  138,943,266
  138,943,298
  138,943,303
  138,943,318
  138,943,374
  138,943,448
  138,943,561
  138,943,704
  138,943,718
  138,943,747
  138,943,859
  138,943,981
  138,944,585
  138,944,753
  138,945,054
  138,945,150
  138,945,173
  138,945,453
  138,945,486
  138,946,234
  138,947,125
  138,947,170
  138,947,513
  138,962,096
  138,962,330
  138,962,983
  138,963,170
  138,963,265
  138,963,437
  138,964,235
  138,964,287
  138,964,314
  138,964,363
  138,964,561
  138,964,641
  138,964,809
  138,965,023
  138,965,071
C
T
-
T
3/-
-
-
-
T
T
G/-
C
T
T
T
C
C
T
T
A
C
T
9/7
-
C
A
-
A
G
G
T
T
-
T
C
10/-
8/-
T
A
C
-
A
-
14
G
-
-
-
-
G
C
T
2
T/76
G
C
-
A
C
A
C
G
T
25
C
C
A
T
C
2
G
A
T
C
-
-
-
T
9/5
G
-
5
G
-
T
3/5
29
15
T
-
C
6/-
2/-
9
C
A
T
T
8
C
G
T
C
T
G
-
C
A
T
C
-
T
A
T
T
10
T
C
T
G
-
T
T
A
2
C
A
T
T
T
G
G
G
A
C
A
-
C
T
A
C
7
T
4
32
G
T
C
T
C
A
9
A
T
-
G
T
3
G
-
-
-
T
A
C
C
-
-
4
16
T
A
T
T
A
6
T
A
3
G
T
G
C
C
C
C
-
C
-
?
G
A
A
-
T
11
G
C
-
A
A
A
A
T
2
G
G
-
T
G
C
3
T
T
T
T
-
T
3
T
C
T
T
2
2
7
T
4
T
A
C
G
A
G
2
-
G
C
C
C
A
G
T
G
C
-
A
-
-
C
A
A
T
-
C
A
A
G
A
T
A
4/-
T
G
-
T
G
2
2
A
-
-
-/TC
-
-
T
-
C
G
T
9
A
A
A
C
G
G
A
-
A
20
C
-
C
G
?
C
C
C
G
C
-
C
T
C
T
G
C