Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 122,087 (bp)   Positions: 320
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.0
.011
.002
.006
.392
.009
.048
.006
.002
.006
.0
.0
.019
.024
.012
.011
.016
--
--
--
--
--
--
.003
.059
.01
.011
--
--
--
--
.046
.026
.08
.099
.001
.141
.044
.692
.754
.178
.014
.002
.055
.165
.063
.001
.032
.014
.001
.002
.138
.035
.003
.004
.012
.211
.02
.039
.001
.003
.001
.013
.0
.002
.013
.001
.009
.006
.039
.017
.111
.188
.049
.052
.068
.07
.023
.001
.0
.018
.11
.089
.057
.0
.565
.002
.0
.018
.015
.011
.018
.524
.222
.033
.022
.01
.052
.001
.001
.267
.003
.021
.009
.136
.022
.0
.0
.001
.154
.032
.002
.008
.12
.001
.0
.01
.013
.0
.001
.004
.013
.016
.009
.008
.003
--
.001
.0
.004
.009
.018
.004
.0
.083
.0
.032
.005
.0
1.0
.007
.001
.109
.053
.002
.002
.081
.016
.032
.012
.005
.017
.0
.054
.006
.001
.05
.007
.002
.026
--
--
.308
.025
.0
.001
.022
.074
.0
.007
.033
.015
.014
.0
.023
.001
.001
.001
.005
.359
.07
.001
.03
.188
.015
.014
.001
.001
.006
.005
.048
.204
.219
.281
.013
.0
.001
.0
.04
.256
.001
.147
.003
.0
.014
.464
.713
.006
.008
.054
.016
.0
.071
.003
.01
.018
.003
.0
.0
.0
.0
.006
.042
.245
.007
.005
.033
.005
.001
.325
--
--
--
.099
.001
.134
.012
.181
.032
.158
.079
.171
.001
.006
.003
.0
.037
.0
.001
.052
.053
.02
.001
.016
.0
.243
.004
.044
.052
.002
.001
.0
.009
.008
.006
.0
.011
.542
.584
--
--
--
--
--
--
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.08
.021
.019
.017
.051
.003
.004
.016
.038
.98
.042
.001
.058
.092
.001
.657
.488
.182
.0
.246
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
Ttll7
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
G
G
2
A
T
G
A
C
T
T
T
T
A
2
C
C
2
3
3
A
T
G
A
4
G
C
C
C
C
2
2
2
C
T
C
A
T
G
T
T
C
G
G
G
G
C
A
A
C
A
G
A
T
T
G
3
T
T
A
T
A
T
T
C
C
G
T
A
C
G
A
C
G
A
A
A
A
A
3
T
A
T
T
T
C
A
7
A
G
T
G
T
12
A
T
T
A
C
C
20
C
A
G
T
T
T
A
G
T
G
G
G
G
C
G
G
C
C
C
C
T
T
C
T
T
T
A
T
C
2
C
T
T
C
A
T
C
G
C
T
A
G
A
G
C
G
3
G
A
A
C
6
C
C
A
T
G
G
G
G
A
A
G
C
G
G
C
C
2
T
C
T
A
T
T
G
A
A
G
A
C
A
A
C
G
T
T
A
C
A
C
A
A
G
C
G
A
4
G
G
A
C
G
G
G
C
C
A
G
G
A
G
G
T
T
G
T
A
T
T
G
A
T
A
T
G
T
T
G
C
A
T
A
A
T
A
C
2
2
T
C
G
T
C
G
C
C
A
A
C
3
C
C
T
G
8
G
T
A
G
A
2
T
A
C
T
T
G
C
2
C
C
T
4
T
C
C
C
A
G
A
G
C
A
G
T
T
T
G
T
T
G
T
T
T
A
T
G
A
A
4
A
A
G
C
G
C
T
C
T
4
T
G
G
A
C
A
G
  271,260,054
  271,260,287
  271,260,330
  271,260,372
  271,260,623
  271,260,646
  271,260,753
  271,262,114
  271,262,349
  271,262,688
  271,263,634
  271,263,995
  271,264,272
  271,264,277
  271,265,707
  271,266,324
  271,266,347
  271,266,349
  271,266,461
  271,266,466
  271,266,468
  271,266,469
  271,266,478
  271,266,480
  271,266,787
  271,268,844
  271,268,872
  271,268,952
  271,269,044
  271,269,046
  271,269,084
  271,269,101
  271,271,138
  271,274,867
  271,275,381
  271,277,476
  271,278,576
  271,279,561
  271,279,732
  271,279,824
  271,279,881
  271,279,896
  271,280,392
  271,280,558
  271,281,477
  271,281,485
  271,282,701
  271,282,784
  271,283,137
  271,283,287
  271,283,289
  271,283,467
  271,283,698
  271,284,131
  271,284,751
  271,284,755
  271,284,990
  271,285,054
  271,285,617
  271,286,030
  271,286,611
  271,286,710
  271,286,762
  271,287,027
  271,287,040
  271,287,051
  271,287,254
  271,287,575
  271,287,709
  271,287,710
  271,288,368
  271,288,785
  271,288,794
  271,288,799
  271,288,818
  271,288,823
  271,288,923
  271,288,925
  271,288,945
  271,288,955
  271,288,960
  271,289,044
  271,289,060
  271,289,063
  271,289,179
  271,289,213
  271,289,414
  271,289,740
  271,289,939
  271,290,096
  271,290,256
  271,290,562
  271,290,826
  271,291,452
  271,291,978
  271,292,045
  271,292,258
  271,292,583
  271,292,647
  271,292,693
  271,292,823
  271,293,100
  271,293,218
  271,293,224
  271,293,332
  271,293,400
  271,293,672
  271,293,919
  271,293,934
  271,293,986
  271,295,583
  271,295,734
  271,296,685
  271,297,073
  271,297,877
  271,298,338
  271,298,840
  271,299,455
  271,299,460
  271,299,739
  271,299,955
  271,300,485
  271,300,526
  271,300,528
  271,300,530
  271,300,812
  271,300,819
  271,300,829
  271,301,118
  271,301,362
  271,301,413
  271,310,993
  271,311,495
  271,314,564
  271,315,031
  271,315,556
  271,316,249
  271,316,265
  271,316,448
  271,316,554
  271,316,638
  271,316,876
  271,316,905
  271,317,001
  271,317,202
  271,317,234
  271,317,260
  271,317,347
  271,317,714
  271,317,812
  271,317,906
  271,318,014
  271,318,462
  271,318,517
  271,319,211
  271,319,325
  271,319,410
  271,319,551
  271,320,002
  271,320,009
  271,320,080
  271,320,312
  271,320,323
  271,320,450
  271,321,108
  271,321,395
  271,321,682
  271,322,376
  271,322,380
  271,322,516
  271,323,658
  271,323,947
  271,324,011
  271,324,013
  271,324,880
  271,325,171
  271,325,430
  271,325,542
  271,325,667
  271,326,736
  271,326,797
  271,327,309
  271,327,689
  271,328,027
  271,328,310
  271,328,453
  271,328,565
  271,328,728
  271,329,673
  271,329,752
  271,330,084
  271,330,539
  271,330,696
  271,330,697
  271,331,796
  271,332,812
  271,333,428
  271,333,602
  271,333,626
  271,333,749
  271,333,760
  271,334,065
  271,335,411
  271,335,689
  271,335,787
  271,337,662
  271,338,675
  271,338,836
  271,339,383
  271,339,638
  271,339,857
  271,339,882
  271,339,967
  271,340,374
  271,340,750
  271,340,772
  271,340,810
  271,340,920
  271,341,014
  271,341,093
  271,341,321
  271,341,322
  271,341,523
  271,341,776
  271,341,901
  271,342,024
  271,342,323
  271,342,412
  271,342,608
  271,342,713
  271,343,601
  271,343,713
  271,343,720
  271,343,743
  271,345,279
  271,345,430
  271,346,642
  271,347,222
  271,347,331
  271,347,363
  271,347,375
  271,348,288
  271,349,059
  271,349,684
  271,349,714
  271,349,757
  271,350,247
  271,350,341
  271,350,665
  271,350,701
  271,350,781
  271,351,840
  271,352,410
  271,352,423
  271,352,439
  271,352,916
  271,353,145
  271,353,283
  271,354,019
  271,354,143
  271,354,336
  271,354,744
  271,355,584
  271,356,775
  271,356,776
  271,357,007
  271,357,626
  271,357,884
  271,357,970
  271,357,971
  271,358,820
  271,358,944
  271,358,949
  271,358,963
  271,358,979
  271,359,020
  271,359,243
  271,360,081
  271,362,127
  271,362,239
  271,362,499
  271,362,500
  271,362,515
  271,362,529
  271,362,572
  271,363,000
  271,363,021
  271,363,055
  271,363,085
  271,363,092
  271,363,095
  271,363,096
  271,364,736
  271,365,341
  271,365,366
  271,365,592
  271,365,842
  271,366,094
  271,366,364
  271,367,244
  271,369,440
  271,369,989
  271,370,209
  271,370,954
  271,371,221
  271,371,283
  271,371,318
  271,372,653
  271,374,197
  271,375,771
  271,376,161
  271,376,247
  271,376,438
  271,377,033
  271,377,086
  271,377,842
  271,377,974
  271,378,640
  271,379,357
  271,381,555
-
5
C
A
-
G
C
T
T
G
C
C
C
C
G
-
C/G
C/G
2/-
3/-
3/4
A/-
T/C
G/C
-
-
G/C
C/3
C/G
C/G
C/G
-
-
-
T
C
T
G
C
2
C
C
T
A
A
C
A
T
2
G
A
T
2
T
C
A
A
-
C
-
G
5
G
A
C
T
T
A
T/3
C
T
A
G
A
-
T
A/-
A/-
A/-
A/-
-
G
G
C
C
C
A
G
-
C
A
C
A
C
-
G
C
C
G
T
A
-
T
G
A
C
A
C
G
A
C
A
C
-
4
T
C
A
T
T
T
T
A
C
T
C
G
G
T
C
A
-
T
C
A
T
C
C
G
A
T
2
G
A
G
A
T
-
-
A
G
G
T
-
T
T
G
C
A
A
A
2
3
G
T
T
A
A
5
T
-
C
C/T
T/3
T
C
C
A
T
T
-
T
T
-
C
T
A
C
C
G
T
3
T
G
2
A
G
G/A
A/G
-
G/A
T
G
T
A
-
A
C/T
T
A/7
T
A
G
2
A
A
C
A
C
G
C
C
A
C
A
G
C
A
C
G
T
2
A/C
C
2
G
C
G
C/3
2/-
-
2
A/4
T
C
A
T
T
T
G
G
T
-
T
T
C
A
-
A
A
G
A
G
2/-
T/-
G
T
C
C
A
C/G
2/-
G
3
C/G
4/-
2
-
T
C/G
A/C
G/T
A/G
C
C/T
A/G
G/T
T/C
T/G
T/2
G/T
T/G
T/G
A
A
T/C
T/C
G
C
A
G
G
-
G
G
T
C/G
A
T
C
T
C
-
-
A
T
G
T
-
C