Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 140,056 (bp)   Positions: 416
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.024
.005
.003
.006
.001
.001
.075
.005
.0
.035
.058
.0
.011
.001
.0
.001
.006
.002
.003
.002
.14
.219
.09
1.0
.023
.068
.073
.036
.001
.002
.0
.326
.144
.0
.124
.0
.016
.026
.016
.004
.063
.427
.023
--
.121
.173
.206
.079
.126
.154
.777
.803
.811
.836
.688
.07
.0
.0
.038
.052
.002
.002
.02
.022
.248
.002
.004
.004
.009
.002
.172
.016
.064
.062
.011
.978
.0
.0
.011
.018
.001
.057
.07
.076
.004
.024
.186
.023
.011
.016
.022
.742
.0
.005
.063
.0
.001
.001
.02
.0
.003
.0
.0
.001
.002
.0
.003
.0
.0
.134
.107
.046
.029
.065
.001
.005
.005
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.0
.0
.125
--
.002
.001
.751
.05
.001
.002
.015
--
--
.092
.302
.315
.955
.745
.001
.001
.0
.028
.236
.494
.067
.071
.004
.003
.016
.001
.006
.156
.278
.006
.068
.061
.366
.013
.001
.031
.06
.468
.625
--
--
--
.011
.01
.022
.013
.002
.072
.004
.078
.004
.01
.021
.001
.0
.002
.0
.007
.0
.0
.0
.003
.392
.008
.004
.0
.004
.047
.015
.0
.022
.002
.0
.001
.0
.005
.009
.529
.0
.004
.012
.002
.136
.001
.006
.026
.02
.006
.008
.24
.003
.001
.001
.001
.0
.001
.003
.014
.111
.0
.316
.095
.022
.035
.001
.0
.003
.002
.0
.0
.001
.075
.01
.004
.005
.433
.082
.092
.005
.004
.003
.006
.009
.004
.005
.0
.025
.034
.175
.002
.004
.017
.009
.006
.002
.12
.255
.003
--
.001
.047
.142
--
--
.035
.001
.0
.02
.014
--
.365
.319
.005
.217
.002
.017
.044
.007
.026
.012
.001
.0
.043
.642
.018
.0
.017
.005
.002
.001
.0
.0
.006
.084
.003
.029
.004
.004
.013
.077
--
--
.006
.001
--
--
--
--
.001
.022
.024
.028
.295
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.0
.677
.691
.006
.003
.012
.006
--
--
--
.004
.132
.001
.0
.0
.009
.0
.0
.0
.001
.004
.025
.004
.0
.448
.342
.013
.0
.0
.085
.056
.139
.004
--
--
--
--
--
.006
.014
.053
--
--
--
--
.094
.089
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.076
.0
.152
.075
.054
.0
.002
.0
.0
.004
.008
.0
.0
.0
.0
.0
.443
.078
.014
.002
.002
.001
.002
.0
.01
.004
.002
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
Trpc7
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
LOC102555284
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
G
G
T
T
C
G
A
G
T
G
T
G
T
A
A
G
A
C
C
A
A
G
C
G
C
C
G
T
A
T
2
G
G
G
A
A
A
C
A
T
C
T
C
C
C
C
C
T
C
4
C
C
C
C
T
T
T
C
T
C
C
C
C
T
C
T
A
A
A
C
C
4
A
C
G
T
G
A
C
C
T
G
G
G
C
A
C
C
C
C
T
G
C
G
G
T
C
A
G
C
C
G
T
T
A
A
C
T
G
A
A
C
G
A
G
A
C
15
G
C
T
A
A
C
3
A
G
G
T
A
G
T
T
G
T
G
5
5
T
G
T
A
A
T
A
A
A
8
C
G
A
G
C
8
C
T
2
C
A
C
A
A
A
G
2
T
C
A
A
G
T
T
G
T
A
C
4
G
C
T
A
G
G
T
A
A
G
C
G
G
C
T
A
A
A
T
C
A
A
G
A
A
G
A
G
T
T
G
T
4
G
C
G
A
G
T
A
C
T
3
T
T
A
9
C
C
G
C
3
2
A
A
T
G
A
C
C
A
G
G
A
G
5
3
T
A
C
A
G
G
C
G
A
C
C
T
T
G
G
G
A
G
C
C
A
A
2
2
2
C
C
T
C
G
G
C
A
A
C
G
A
T
17
G
T
G
2
3
C
A
9
G
A
G
T
A
T
A
G
G
A
C
C
A
T
T
A
T
T
4
T
6
6
C
C
G
G
G
A
C
C
12
A
T
2
T
G
G
A
A
G
G
C
3
T
C
T
T
7
2
G
C
C
T
G
A
A
A
C
T
8
G
C
C
C
T
2
A
G
T
C
C
4
T
T
T
C
G
A
G
G
A
A
T
A
C
C
G
C
A
A
T
A
A
2
A
T
6
A
A
C
G
C
C
G
6
A
A
G
A
A
G
T
C
C
C
G
A
C
A
T
G
G
T
T
  10,318,204
  10,318,893
  10,319,417
  10,320,305
  10,320,915
  10,321,106
  10,321,511
  10,322,593
  10,322,839
  10,322,973
  10,323,015
  10,323,127
  10,323,217
  10,323,241
  10,323,438
  10,323,565
  10,323,626
  10,323,629
  10,323,957
  10,324,097
  10,324,143
  10,324,147
  10,324,171
  10,324,858
  10,325,080
  10,325,176
  10,325,177
  10,325,248
  10,325,276
  10,325,462
  10,326,005
  10,327,229
  10,327,745
  10,330,862
  10,337,692
  10,338,077
  10,339,059
  10,339,222
  10,339,230
  10,341,765
  10,341,926
  10,342,271
  10,342,588
  10,342,600
  10,342,670
  10,342,674
  10,342,678
  10,342,707
  10,342,710
  10,342,711
  10,342,795
  10,342,814
  10,342,818
  10,342,822
  10,342,847
  10,343,644
  10,343,783
  10,343,854
  10,343,928
  10,343,967
  10,344,000
  10,344,004
  10,344,008
  10,344,009
  10,344,036
  10,344,067
  10,344,225
  10,344,248
  10,344,394
  10,344,645
  10,345,072
  10,345,206
  10,345,234
  10,345,422
  10,345,502
  10,345,790
  10,346,105
  10,346,130
  10,346,363
  10,346,438
  10,346,564
  10,346,600
  10,346,650
  10,346,659
  10,346,700
  10,346,814
  10,346,833
  10,346,897
  10,346,925
  10,346,935
  10,346,948
  10,347,018
  10,347,595
  10,347,746
  10,348,010
  10,348,558
  10,348,598
  10,348,759
  10,349,149
  10,349,381
  10,349,410
  10,349,576
  10,349,638
  10,349,647
  10,350,212
  10,350,228
  10,350,358
  10,350,366
  10,350,860
  10,351,014
  10,351,118
  10,351,120
  10,351,180
  10,351,189
  10,351,484
  10,351,552
  10,351,771
  10,351,788
  10,352,025
  10,352,117
  10,352,382
  10,352,535
  10,352,536
  10,352,539
  10,352,957
  10,353,151
  10,353,203
  10,353,757
  10,354,241
  10,354,441
  10,354,830
  10,355,164
  10,355,203
  10,355,385
  10,355,393
  10,355,399
  10,355,758
  10,356,984
  10,356,985
  10,357,040
  10,357,041
  10,357,158
  10,357,169
  10,358,100
  10,358,705
  10,359,248
  10,359,451
  10,359,613
  10,359,615
  10,360,101
  10,361,072
  10,361,327
  10,361,462
  10,361,689
  10,361,826
  10,361,834
  10,361,872
  10,362,570
  10,362,816
  10,363,006
  10,365,951
  10,366,130
  10,366,398
  10,366,416
  10,366,858
  10,366,863
  10,367,691
  10,368,497
  10,368,871
  10,369,436
  10,369,767
  10,370,424
  10,370,596
  10,370,909
  10,370,968
  10,371,239
  10,371,897
  10,372,036
  10,372,150
  10,372,290
  10,372,364
  10,372,709
  10,372,722
  10,372,927
  10,373,248
  10,373,263
  10,373,413
  10,373,563
  10,373,619
  10,373,873
  10,374,478
  10,374,525
  10,374,661
  10,374,687
  10,374,731
  10,374,916
  10,375,089
  10,375,198
  10,375,230
  10,375,326
  10,375,450
  10,375,740
  10,375,825
  10,375,988
  10,376,244
  10,376,519
  10,376,755
  10,376,885
  10,377,114
  10,377,201
  10,377,290
  10,377,293
  10,377,294
  10,377,515
  10,377,888
  10,378,123
  10,379,048
  10,379,175
  10,379,183
  10,379,733
  10,379,797
  10,379,900
  10,379,942
  10,380,317
  10,380,353
  10,380,677
  10,381,217
  10,381,254
  10,381,273
  10,382,001
  10,382,006
  10,382,403
  10,382,515
  10,383,002
  10,383,120
  10,383,384
  10,383,826
  10,383,946
  10,384,104
  10,384,210
  10,384,548
  10,384,698
  10,385,378
  10,385,422
  10,385,453
  10,385,600
  10,385,820
  10,385,852
  10,385,858
  10,385,862
  10,386,101
  10,388,134
  10,388,664
  10,388,861
  10,390,487
  10,390,513
  10,391,184
  10,391,988
  10,392,566
  10,392,569
  10,392,572
  10,392,924
  10,395,618
  10,396,110
  10,396,393
  10,401,800
  10,402,196
  10,402,348
  10,402,352
  10,402,755
  10,403,624
  10,405,603
  10,406,718
  10,407,974
  10,407,993
  10,408,060
  10,408,158
  10,408,294
  10,408,301
  10,408,349
  10,408,510
  10,408,837
  10,409,284
  10,409,536
  10,409,586
  10,409,814
  10,409,922
  10,410,056
  10,410,245
  10,410,315
  10,410,371
  10,410,458
  10,410,504
  10,411,405
  10,412,656
  10,412,930
  10,413,112
  10,413,246
  10,413,255
  10,413,381
  10,413,599
  10,413,698
  10,414,042
  10,414,581
  10,414,697
  10,414,942
  10,414,966
  10,416,039
  10,416,059
  10,416,283
  10,416,287
  10,416,423
  10,416,495
  10,416,537
  10,416,548
  10,416,854
  10,417,199
  10,417,246
  10,417,674
  10,417,738
  10,420,768
  10,421,001
  10,421,560
  10,421,568
  10,421,897
  10,421,900
  10,421,909
  10,422,901
  10,423,554
  10,423,572
  10,423,906
  10,424,222
  10,424,307
  10,425,558
  10,425,560
  10,426,350
  10,426,356
  10,426,372
  10,426,703
  10,426,841
  10,426,846
  10,426,847
  10,426,977
  10,427,495
  10,427,565
  10,427,764
  10,427,903
  10,428,521
  10,428,631
  10,428,719
  10,428,851
  10,429,084
  10,429,177
  10,429,540
  10,429,611
  10,430,001
  10,430,103
  10,430,107
  10,430,155
  10,430,648
  10,430,691
  10,431,265
  10,431,271
  10,431,298
  10,431,644
  10,431,715
  10,431,733
  10,431,756
  10,431,768
  10,431,778
  10,431,830
  10,431,939
  10,432,078
  10,432,125
  10,432,135
  10,432,241
  10,432,276
  10,432,470
  10,432,527
  10,432,704
  10,432,822
  10,432,865
  10,433,031
  10,433,040
  10,433,050
  10,433,057
  10,433,086
  10,433,136
  10,433,313
  10,433,786
  10,434,525
  10,435,342
  10,436,067
  10,436,070
  10,436,223
  10,436,669
  10,436,747
  10,436,938
  10,437,365
  10,437,653
  10,437,980
  10,438,457
  10,438,458
  10,438,738
  10,438,830
  10,450,194
  10,450,230
  10,450,271
  10,451,797
  10,452,266
  10,452,534
  10,452,574
  10,453,110
  10,454,959
  10,456,087
  10,456,399
4
A
A
G
C
T
A
G
A
G
A
C
T
C
G
G
-
-
G
T
A/T
A/T
4
T
A
T
T
A
C
G
C
-
A
T
A
G
-
2
2
G
C
T
C
T
C/T
C/G
C/T
C/T
T/2
G/CT
4/-
C/T
C/G
T
C/T
T/C
-
-
-
T/-
C/T
C/G
C/T
C/T
G
C/T
T/2
G
G
G
2
T
-
G
T
A
C
A
G
G
T
-
A
A
A
T
10
T
T
T
A
G
T
T
A
A
C
T
T
A
T
T
A
C
C
G
3/5
T
C
A
2
2
7
A
G
A
G
T
-
C
T
C
C
T
A
-
5
A
A
C
G
A
C
3
-
T/G
A
-
-
3
2
C
G
G
C
T
G
A/G
-
A
C
C
A
T
8/-
-
C
-
T
T
T
G
G
G
G/A
-
C
T
A/C
2
A
C
2
A
C
G
T
-
T
T
C
G
A
A
C
G
G
A
T
A
A
T
C
G
G
C
C
3
13
G
A
G
2
A
-
G/T
C
C
A
-
4/-
11
C/T
5
G
A
C
G
A
2
-
C
C
T
-
T
T
A
T
-
-
G
G
C
A
G
T
T
G
A
A
G
A
-
-
2
2
T
A/2
G/C
A
3
C
-
T
A
C
T/A
4
G/A
G/A
G
A
T
T
G
A/2
2/-
2/-
2/-
-
T
2
3
G/A
A
5
G
3/4
T
A
G
A
-
A
C
A
-
-
C/2
G
-
A
C
A
C
G
G
G
T
A
3
T
T
G
-
2
C
3
C
-
5
6/-
-
C/3
T
A
C
C
T
T
T
12/-
T
T/-
2/-
T/A
A
A
G
A/C
C
A
4
-
C
A
G
C
-
-
G/4
T
A
G
A
T
G
G
T
C
-
A
A
T
G
3
2/-
2
A
C
T
T
-
C
C
C
C/4
-
2
A
-
G
G
C
3
2
T
A
T
G
G
T/C
A/G
A/G
2/-
G
A
-
G
C
C/T
A
G
T
A
-
G
G
A
G
C
T
C
G
-
A
A
T
T
2
C
A
A
A
9