Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 71,680 (bp)   Positions: 308
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.065
.0
.041
.257
.003
.007
.997
.002
.001
.317
.007
.438
.005
.02
.022
.022
.991
.999
.998
1.0
1.0
.997
.027
.0
.19
.001
.007
.033
.314
.813
.0
.062
.002
.002
.0
.274
.003
--
--
--
.195
.271
.017
.049
.007
.011
.007
.017
.98
.007
.012
.001
.007
--
--
.001
.114
.003
.016
.02
.004
.019
.001
.002
.622
.007
.006
.042
.001
.222
.064
.053
.195
.921
.275
.508
.004
.064
.0
.005
.007
.007
.006
.0
.001
.135
.003
.005
.001
.001
.002
.0
.01
.014
.001
.061
.001
.09
.065
.301
.613
.606
.387
.35
.264
.206
.169
.024
.406
.045
.019
.012
.101
.211
.009
.13
.013
.003
.011
.496
.697
.533
.006
.002
.232
.84
.675
.0
.019
.006
.481
.745
.018
.007
.003
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.003
.017
.003
.0
.332
.197
.956
.535
.094
.01
.234
.007
--
--
--
.051
.016
.105
.415
.034
.048
.003
.0
.17
.026
.004
.012
.015
.61
.002
.0
.0
.229
.009
.005
.001
.001
.45
.011
.006
.026
.109
.119
.02
.708
.084
.003
.021
.001
.047
.06
.02
.999
.62
.943
.714
.084
.131
.047
.01
.009
.001
.002
.0
.909
.04
.042
.046
.026
.013
.007
.076
.186
.005
.002
.0
.068
.005
.001
.0
.018
.019
.015
.027
.003
.015
.95
.026
1.0
.001
.33
.064
.192
.0
.0
.0
.264
.002
.023
.036
.568
.051
--
--
.0
.008
.016
.122
--
--
--
--
--
.012
.758
.476
.001
.001
--
--
--
.082
.014
.001
.062
.023
.063
.563
--
--
--
--
.002
.053
.003
.0
.001
--
.102
--
--
.017
.053
.112
.134
.057
.006
.031
.038
.01
.001
.003
.092
.114
.011
.001
.041
.458
.409
.248
.092
.103
.999
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
Trip11
A
T
G
G
G
9
A
6
A
G
T
T
5
T
A
T
G
C
G
G
C
T
T
T
C
T
T
4
G
G
C
A
G
T
A
G
A
G
C
C
T
T
A
T
G
A
C
T
C
G
T
A
4
T
T
C
A
G
T
A
G
G
C
C
A
T
G
G
G
T
G
G
A
G
T
A
A
G
T
T
G
T
A
G
A
T
T
A
T
C
A
C
A
G
A
C
G
T
C
G
A
G
G
2
T
A
A
G
T
11
C
G
A
G
2
G
T
A
10
G
C
A
C
C
C
2
G
C
C
A
G
T
C
A
T
C
T
T
T
T
T
T
C
T
A
G
A
T
C
G
G
T
C
C
C
2
G
T
G
T
T
C
C
G
A
A
G
C
G
C
T
C
G
A
T
G
G
T
T
A
A
C
G
A
G
G
T
A
C
T
G
T
T
A
A
A
A
A
C
G
T
24
3
2
C
T
A
T
C
G
4
A
T
A
T
G
C
G
T
G
A
A
T
G
C
T
A
T
G
A
A
3
T
T
G
T
T
C
A
G
T
T
C
T
T
C
G
22
4
C
G
C
A
T
A
A
T
G
T
2
T
G
4
G
C
T
C
G
A
A
C
G
C
G
G
T
C
T
T
T
G
G
A
G
C
C
A
A
4
C
C
G
G
T
G
G
C
4
2
T
T
A
G
G
T
A
T
A
  134,953,251
  134,953,688
  134,953,749
  134,954,192
  134,954,462
  134,954,724
  134,955,234
  134,956,006
  134,956,027
  134,956,436
  134,957,212
  134,957,325
  134,957,375
  134,957,730
  134,957,731
  134,957,734
  134,957,808
  134,957,835
  134,958,058
  134,958,144
  134,958,148
  134,958,269
  134,958,662
  134,959,621
  134,959,710
  134,960,671
  134,960,732
  134,960,800
  134,960,880
  134,961,193
  134,961,207
  134,961,238
  134,961,258
  134,961,326
  134,962,277
  134,962,322
  134,962,506
  134,962,633
  134,966,561
  134,966,563
  134,966,742
  134,966,981
  134,967,362
  134,967,410
  134,967,485
  134,967,622
  134,967,682
  134,967,701
  134,967,925
  134,968,163
  134,968,208
  134,968,302
  134,968,402
  134,968,611
  134,968,632
  134,968,868
  134,968,968
  134,969,050
  134,969,513
  134,969,553
  134,969,581
  134,969,755
  134,969,815
  134,969,817
  134,969,951
  134,970,058
  134,970,105
  134,970,709
  134,971,442
  134,972,306
  134,972,876
  134,973,178
  134,973,222
  134,973,278
  134,973,309
  134,973,912
  134,974,931
  134,975,020
  134,975,104
  134,975,153
  134,975,692
  134,975,697
  134,975,706
  134,975,797
  134,975,864
  134,976,076
  134,976,443
  134,976,678
  134,976,701
  134,976,702
  134,976,786
  134,977,100
  134,977,295
  134,977,393
  134,977,454
  134,977,474
  134,977,534
  134,977,860
  134,977,873
  134,978,018
  134,978,098
  134,978,320
  134,978,728
  134,978,733
  134,978,745
  134,978,836
  134,978,861
  134,978,877
  134,979,149
  134,979,222
  134,979,252
  134,979,492
  134,979,802
  134,979,953
  134,980,210
  134,980,282
  134,980,467
  134,980,524
  134,980,719
  134,980,929
  134,981,067
  134,981,074
  134,981,203
  134,981,673
  134,982,098
  134,982,124
  134,982,128
  134,982,296
  134,982,364
  134,982,766
  134,982,898
  134,983,167
  134,983,348
  134,983,369
  134,983,744
  134,983,854
  134,984,246
  134,984,314
  134,984,366
  134,984,434
  134,984,526
  134,985,074
  134,985,113
  134,985,186
  134,986,743
  134,986,784
  134,986,985
  134,987,083
  134,987,113
  134,987,263
  134,987,485
  134,987,660
  134,987,787
  134,987,899
  134,988,525
  134,988,568
  134,988,723
  134,988,787
  134,988,801
  134,989,115
  134,989,377
  134,989,461
  134,989,882
  134,990,054
  134,990,128
  134,990,144
  134,990,689
  134,990,966
  134,991,652
  134,991,775
  134,991,804
  134,991,879
  134,991,972
  134,991,997
  134,992,087
  134,992,876
  134,992,879
  134,992,940
  134,993,103
  134,993,363
  134,993,370
  134,993,381
  134,993,401
  134,993,774
  134,993,832
  134,994,250
  134,994,484
  134,994,544
  134,994,594
  134,994,931
  134,995,021
  134,995,090
  134,995,160
  134,995,735
  134,995,873
  134,996,131
  134,996,495
  134,997,846
  134,998,893
  134,998,973
  134,999,365
  135,001,498
  135,001,601
  135,001,603
  135,002,132
  135,002,195
  135,002,254
  135,002,627
  135,002,943
  135,003,217
  135,003,409
  135,003,440
  135,003,513
  135,003,518
  135,003,522
  135,003,524
  135,003,534
  135,003,548
  135,003,969
  135,003,995
  135,004,455
  135,004,795
  135,004,895
  135,005,008
  135,005,225
  135,006,041
  135,006,042
  135,006,043
  135,006,063
  135,006,936
  135,007,400
  135,007,684
  135,007,804
  135,008,293
  135,008,518
  135,008,528
  135,008,878
  135,009,050
  135,009,268
  135,009,477
  135,009,495
  135,009,705
  135,009,773
  135,010,224
  135,010,260
  135,010,383
  135,010,488
  135,010,813
  135,010,825
  135,011,230
  135,011,344
  135,011,540
  135,011,621
  135,011,893
  135,012,286
  135,012,320
  135,012,348
  135,012,514
  135,012,893
  135,013,088
  135,013,373
  135,013,846
  135,014,069
  135,014,239
  135,014,298
  135,014,308
  135,014,801
  135,014,990
  135,015,444
  135,015,917
  135,016,507
  135,016,595
  135,016,925
  135,017,269
  135,017,271
  135,017,506
  135,017,508
  135,018,417
  135,018,747
  135,018,937
  135,019,049
  135,019,358
  135,019,895
  135,020,134
  135,020,214
  135,020,226
  135,020,435
  135,020,439
  135,020,451
  135,020,459
  135,020,994
  135,021,045
  135,021,556
  135,021,901
  135,022,704
  135,022,746
  135,022,954
  135,023,276
  135,023,278
  135,023,333
  135,023,434
  135,023,701
  135,023,708
  135,023,712
  135,023,721
  135,023,737
  135,023,740
  135,024,130
G
C
A
A
A
-
C
-
G
2
G
A
-
2
2
TA/-
A
T
A
A
T
T/2
C
2
-
2
C
-
A
A
T
G
C
A
G
A
13
A
A
A
C
G
C
3
A
G
T
C
A
-
C
G
4/-
T/C
T/C
-
G
A
G
G
A
2
C/G
C/G
T
C
T
A
A
C
A
T
G
A
C
G
T
2
A
C
A
C
G
A
C
A
C
T
A
A
C
T
C
A
G
2
A
C
T
-
G
A
2
-
-
G
G
A
C
-
A
A
G
A
-
2
G
T
-
A
T
C
T
2
T
-
2
T
G
G
A
2
T
G
A
T
C
A
C
C
2
C
A
T/A
G
A
G
-
G
A
A
A
T
G
T
-
C
C
C
C
C
2
T
C
T
G
T
-
A
T
C
7
T
G
C
A
T
C
A
-
G
A
A
3
A
A
C
G
T
2
A
G
A
G
G
G
C
G
T
A
A
24/-
-
2/-
T
C
G
C
T
A
-
C
C
G
T/A
G/A
T
G/A
C
13
-
T
4
2
T
C
5
G/TC
A
T
T
-
C
C
A
C
C
T
C
A
C
-
A
G
C
T
A
-
-
T
A
T
G
A
T
-
C
A
5
-
T/G
A
-
A
A
C
T
A
G
G
T
A
-
A
T
-
2
A
G
C
A
T
G
-
7
C/T
A/5
A/C
4/-
C/A
3
A
A
C
A
A
T
4/-
2/-
-
7
G
T
2
A
G
C
C