Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 300,610 (bp)   Positions: 389
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
1.0
.983
.505
.007
.063
.134
.145
.048
.001
.128
--
--
.003
.004
.013
.01
.0
.0
.005
.002
.0
.0
.009
.0
.001
.056
.012
.0
.002
.024
.006
.024
.0
.0
.022
.004
.001
.019
.521
.0
.234
.004
.114
.056
.015
.005
--
.001
.035
--
--
--
--
--
--
--
.668
.977
.979
.998
1.0
.106
.27
--
--
.003
.001
.053
.02
.0
1.0
.0
.006
.001
.115
.034
.0
.002
.009
.85
.271
.004
.0
.001
.0
.001
.005
.036
.481
.002
.0
.001
.0
.001
.007
.001
.002
.001
.001
.001
--
.001
.063
.103
.152
.039
.099
.038
.12
.083
.003
.696
.007
.001
.005
.007
.008
.001
.257
.383
.05
.008
.032
.693
.022
.022
.001
.001
.17
.004
.01
.0
.039
.001
.002
.001
.0
.002
.006
.024
.667
.0
.14
.381
.289
--
.878
.0
.002
.002
.001
.001
.001
.776
.802
.01
.002
.007
.025
.022
.016
.02
.064
.637
.008
.001
.008
.054
.002
.121
.015
--
.05
.001
.001
.258
.0
.276
.039
.002
.0
.001
.004
--
--
--
.991
.011
.068
.015
.085
.001
--
.046
.011
.034
.021
.008
.007
.032
.042
.001
.001
.004
.023
--
.165
.001
.007
.993
.008
.0
.012
.0
.005
.139
.0
.003
.253
.123
--
--
--
.02
.001
.012
.002
.0
--
--
.212
.588
.044
.068
.002
.073
.0
.0
.018
.006
.001
.0
.001
.001
.004
.0
.001
.045
.015
.006
.002
.007
.0
.01
.402
.077
.047
.001
.001
.0
.002
.003
.004
.065
.0
.0
.002
.004
.002
.649
.003
.0
.027
.015
.016
.001
.335
.124
.0
.0
.0
.013
.243
.001
.0
.135
.001
.001
.135
--
--
--
.026
.028
.455
.217
.0
.021
.0
.0
--
--
.137
.203
.054
.027
.064
.066
.04
.174
.099
.082
.0
.009
.006
.001
.021
.007
.006
.119
.002
.098
.006
.055
.002
.002
.005
.006
.001
.001
.234
.231
.0
--
--
.0
.002
.003
.005
.006
.014
.007
.002
.075
.003
.866
.982
--
--
--
.039
.032
.983
.985
.001
.002
.001
.066
.004
.023
.0
.0
--
--
--
--
.001
.004
.001
.0
.0
.003
--
--
.0
.041
.003
.057
--
.001
.0
.244
.121
.325
.002
.408
.086
.001
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
C
A
A
T
11
A
T
G
C
G
G
A
A
G
C
T
C
G
A
T
C
C
G
C
C
T
T
T
C
T
G
G
A
G
G
G
4
T
2
24
G
G
T
G
G
G
A
T
A
T
T
A
24
2
2
2
2
T
4
2
3
T
T
C
C
T
T
A
T
T
C
C
G
T
G
4
C
2
C
C
T
C
A
A
C
C
G
17
T
A
T
T
T
T
G
A
G
G
A
G
T
T
G
C
C
G
G
G
G
G
T
A
C
C
A
C
T
G
2
A
T
G
T
A
G
G
C
G
G
A
G
C
G
5
C
14
T
C
T
T
C
T
C
G
G
T
A
T
T
C
G
C
8
A
19
A
T
G
C
T
T
C
C
C
T
A
C
T
G
G
127
C
T
C
8
A
A
A
A
T
T
G
C
4
14
C
T
C
G
C
A
G
T
C
G
T
T
A
G
C
A
6
4
A
T
C
C
G
C
46
C
G
G
A
G
8
A
G
G
G
A
A
C
G
A
T
A
A
8
4
T
T
A
9
4
G
C
C
3
6
2
A
T
C
C
C
A
C
C
G
T
A
C
G
A
T
A
T
G
G
G
C
T
A
G
T
G
T
A
T
15
A
G
C
T
C
G
3
G
G
G
C
G
A
A
A
T
C
7
T
G
G
C
T
T
13
G
A
G
A
A
A
C
A
G
G
T
A
G
T
G
A
G
A
C
A
C
T
G
G
A
C
G
C
A
T
A
4
T
C
4
2
C
A
20
A
A
12
10
C
12
T
14
8
T
4
C
A
G
T
T
C
2
A
46
C
C
T
C
A
T
C
C
A
4
A
G
C
G
T
T
4
T
A
G
T
G
A
C
T
T
T
T
3
2
G
A
A
A
  100,137,463
  100,138,897
  100,139,280
  100,139,797
  100,140,940
  100,141,164
  100,141,261
  100,142,421
  100,143,431
  100,143,641
  100,144,200
  100,144,702
  100,144,856
  100,146,043
  100,146,096
  100,146,406
  100,146,872
  100,147,925
  100,149,162
  100,150,131
  100,150,688
  100,151,388
  100,154,254
  100,154,873
  100,155,515
  100,156,343
  100,157,212
  100,157,431
  100,158,251
  100,158,303
  100,159,452
  100,160,195
  100,163,081
  100,163,115
  100,163,736
  100,164,578
  100,164,877
  100,164,920
  100,165,542
  100,166,802
  100,167,909
  100,168,534
  100,168,588
  100,168,888
  100,168,983
  100,170,151
  100,170,882
  100,171,443
  100,172,165
  100,172,789
  100,172,835
  100,172,861
  100,172,955
  100,173,335
  100,173,385
  100,173,409
  100,173,437
  100,173,460
  100,173,606
  100,174,042
  100,174,314
  100,175,050
  100,175,358
  100,175,496
  100,175,550
  100,175,878
  100,176,313
  100,176,416
  100,176,586
  100,176,905
  100,178,186
  100,178,608
  100,181,474
  100,182,283
  100,182,498
  100,182,593
  100,185,763
  100,185,999
  100,186,932
  100,187,246
  100,187,908
  100,187,967
  100,188,271
  100,188,283
  100,188,505
  100,188,645
  100,189,387
  100,191,673
  100,192,470
  100,192,742
  100,192,956
  100,193,389
  100,193,673
  100,194,946
  100,196,866
  100,197,080
  100,197,103
  100,197,808
  100,197,832
  100,197,935
  100,198,454
  100,198,719
  100,198,912
  100,198,921
  100,198,943
  100,198,980
  100,199,028
  100,199,342
  100,199,440
  100,199,463
  100,199,851
  100,200,256
  100,200,546
  100,200,577
  100,200,665
  100,200,752
  100,201,190
  100,201,207
  100,201,314
  100,201,335
  100,201,600
  100,201,663
  100,202,538
  100,202,596
  100,202,942
  100,202,944
  100,204,725
  100,206,027
  100,207,627
  100,208,348
  100,209,552
  100,210,913
  100,211,100
  100,211,933
  100,212,781
  100,213,263
  100,213,731
  100,214,155
  100,215,207
  100,215,729
  100,216,263
  100,216,539
  100,218,002
  100,218,480
  100,218,490
  100,219,552
  100,221,252
  100,222,257
  100,222,299
  100,224,640
  100,224,663
  100,226,690
  100,226,785
  100,227,125
  100,227,129
  100,227,501
  100,227,974
  100,232,600
  100,233,725
  100,233,880
  100,236,373
  100,236,479
  100,236,529
  100,236,538
  100,236,569
  100,237,639
  100,239,327
  100,240,373
  100,241,709
  100,242,455
  100,243,798
  100,244,076
  100,244,359
  100,245,176
  100,245,435
  100,245,781
  100,245,933
  100,246,378
  100,247,776
  100,249,511
  100,250,018
  100,251,143
  100,254,100
  100,254,140
  100,254,347
  100,254,484
  100,256,661
  100,258,728
  100,259,526
  100,260,796
  100,270,298
  100,272,272
  100,277,511
  100,290,964
  100,291,082
  100,291,431
  100,293,985
  100,294,197
  100,294,198
  100,294,205
  100,296,634
  100,298,491
  100,298,493
  100,302,052
  100,303,317
  100,304,032
  100,305,660
  100,308,454
  100,309,958
  100,311,358
  100,313,134
  100,315,474
  100,317,544
  100,318,416
  100,318,748
  100,319,285
  100,319,622
  100,320,478
  100,320,646
  100,326,462
  100,331,128
  100,331,151
  100,332,627
  100,333,058
  100,334,246
  100,338,306
  100,339,092
  100,339,365
  100,344,535
  100,344,642
  100,345,953
  100,349,509
  100,349,714
  100,353,129
  100,353,529
  100,354,375
  100,354,695
  100,355,832
  100,356,653
  100,356,991
  100,360,234
  100,360,298
  100,360,542
  100,361,113
  100,362,547
  100,362,700
  100,363,972
  100,365,300
  100,365,328
  100,365,372
  100,365,441
  100,365,569
  100,365,915
  100,366,184
  100,366,511
  100,367,302
  100,368,803
  100,368,922
  100,369,137
  100,369,479
  100,369,512
  100,369,711
  100,370,072
  100,370,236
  100,371,076
  100,371,753
  100,374,099
  100,374,104
  100,374,211
  100,375,169
  100,375,583
  100,376,101
  100,376,229
  100,376,255
  100,376,256
  100,376,339
  100,377,143
  100,377,292
  100,378,182
  100,378,446
  100,378,766
  100,379,060
  100,379,160
  100,379,997
  100,380,055
  100,380,627
  100,381,906
  100,382,033
  100,382,667
  100,383,582
  100,383,698
  100,383,714
  100,383,919
  100,384,597
  100,384,710
  100,386,537
  100,387,384
  100,387,598
  100,387,649
  100,387,899
  100,388,738
  100,388,742
  100,389,026
  100,389,113
  100,389,283
  100,389,526
  100,389,728
  100,390,054
  100,390,159
  100,390,373
  100,390,404
  100,390,407
  100,391,006
  100,392,702
  100,392,958
  100,393,921
  100,395,238
  100,395,317
  100,395,764
  100,396,034
  100,396,540
  100,396,676
  100,398,122
  100,399,488
  100,399,539
  100,400,476
  100,400,502
  100,402,011
  100,403,098
  100,403,311
  100,404,555
  100,404,557
  100,404,786
  100,406,695
  100,407,029
  100,407,240
  100,407,568
  100,407,627
  100,407,629
  100,408,375
  100,409,210
  100,409,447
  100,410,302
  100,410,353
  100,412,608
  100,412,892
  100,413,429
  100,414,050
  100,414,160
  100,414,182
  100,414,536
  100,414,632
  100,417,288
  100,417,289
  100,417,799
  100,417,865
  100,417,872
  100,418,284
  100,419,541
  100,420,330
  100,420,494
  100,420,678
  100,420,963
  100,421,033
  100,421,064
  100,421,098
  100,421,181
  100,422,292
  100,422,858
  100,422,869
  100,423,656
  100,423,675
  100,424,133
  100,424,189
  100,427,086
  100,427,525
  100,427,746
  100,428,895
  100,429,003
  100,429,131
  100,430,809
  100,431,521
  100,431,567
  100,432,227
  100,432,469
  100,434,879
  100,434,923
  100,435,448
  100,437,219
2
-
G
G
-
T
C
A
T
T
3
7
7
A
T
C
T
A
G
C
G
T
A
T
T
G
C
C
3
3
5
A
G
A
A
A
-
C
-
-
A
A
C
A
T
A
13
C
G
3
5
5
-
-
-
2/-
-
5/3
-
-
-
3/TG
4
2
T
C
C
?
C
C
G
A
2
C
A
4/-
-
--/-
T
T
2
2
C
C
A
T
A
-
C
G
G
C
C
C
A
4
A
A
G
A
A
C
A
9
T
4
A
A
T
T
C
C
T
T
2
T
C
7/13
-
11
C
3
A
G
A
A
T
5
C
G
-
A
A
-
3
14/-
C
5
2
19
T
C
T
A
A
11/9
3/AT
C
C
C/7
2
T
-
-
-
G
C
2
G
G
2
2
3/CA
A
C
G
T
C
A
C
-
13
-
T
8/-
G
G
5
G
-
C
C
C/5
4/-
-
5
C
T
-
2
9
T
A
7/5
A
A
2
G
A
-
G
6/-
4/-
G
G
T
T
A
-
-
T
4
A
G
5
-
5
-
A
T
A/G
A/-
G
3/GT
C
2
-
G
-
-
5
?
G
-
-
A
T
G
-
-
-
G
C
T
T
A
T
G
T
A
2
2
2
T
G
A
G
-
T
A
A
T
G
G
-
-
A
G
G
T/A
-
T
A
A
A
T
A
-
A
A
C
T
C
C
G
G
C
A
-
2
C
C
T
C
2
-
T
G
A
G
-
G
T
G
A
A
C
T
4
4
C
C
A
T
T
G
3
3
A
A
G
T
-
T
G
C
G
4/-
-
9
4/-
2/-
-
T
-
G
G
12/-
10/-
T
-
C
14/-
8/-
C
4/-
T
G
C
A
17
T
-
A/-
-
-
T
C
4
C
A
T
T
5
-
G
A
T
A
C
T/3
4/-
G
G
A
C
A
G
3
G
C
3/TG
9
-
-
A
T
C
T