Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 300,610 (bp)   Positions: 487
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.451
.954
.983
.505
.326
.007
.063
.039
.095
.145
.012
1.0
.002
.128
--
--
--
--
--
.017
.004
.01
.002
.0
.215
.008
.005
.002
.0
.0
.001
.005
.056
.012
.0
.0
.024
.006
.0
.005
.001
.002
.001
.0
.004
.016
.018
.004
.002
.035
.025
.272
.541
.001
.023
.234
.114
.056
.018
.003
.001
.035
.282
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.977
.925
.979
--
.978
.992
.992
.997
.998
.99
1.0
.459
.106
.07
.27
--
.003
.001
.001
.0
.001
.12
.0
.582
.002
.001
.296
.026
.011
.135
.001
.033
.046
.001
.0
.001
--
.063
.103
.144
.152
.15
.131
.046
.039
.005
.007
.003
.117
.22
.398
.008
.022
.022
.001
.001
.17
.004
.003
.659
.002
.0
.109
.009
.001
.021
.001
.0
.001
.002
.975
.001
.002
.0
.001
.017
.028
.009
.004
.0
.001
.002
.002
.027
.0
.001
.001
.005
.001
.028
.028
.024
.483
.003
.0
.003
.073
.034
.002
.071
.014
.019
.805
.0
.107
.0
.0
.082
.381
.281
.005
.054
.008
.003
--
--
--
--
--
--
--
.03
.027
.009
.878
.407
.0
.002
.018
.004
.001
.011
.035
.01
.776
.016
.004
.007
.002
.002
.0
.001
.0
.0
.007
.022
.016
.0
.014
.0
.001
.02
.064
.008
.002
.017
.034
.0
.032
.003
.054
.001
.013
.006
.31
.013
.081
.147
.142
.121
.069
.002
.017
--
.003
.335
.049
.0
.0
.004
.001
.0
.001
.258
.001
.002
.003
.004
.002
.032
.013
.001
.046
.01
.003
.034
.001
.002
.0
.002
--
.001
.0
.006
.0
.001
.01
.294
.003
.0
.004
--
--
--
.023
.015
.0
.0
.0
.0
.002
.0
.997
.991
.062
.068
.015
.004
.006
.001
.011
.004
.017
--
--
--
.085
.002
.454
--
.0
.002
.002
.001
.002
.002
.005
.027
.011
.034
.001
.032
--
.042
.013
.165
.0
.344
.007
1.0
.964
.161
.0
.176
--
--
.012
.0
.005
.139
.0
.001
--
.222
--
--
--
--
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.016
.007
.016
.038
.003
.022
.0
.03
.052
.0
.007
--
--
--
--
--
.063
--
--
.0
.075
.588
.044
.023
.036
.062
.519
.001
.0
.073
.002
.001
.0
.001
.0
.092
.012
.0
.001
.001
.002
.0
.0
--
.023
.001
.063
.045
.015
.002
.402
.001
.002
.001
.0
.0
.004
.009
.649
.004
.002
.0
.015
.016
.001
.006
.001
.0
.004
.0
.001
.04
.0
.013
.009
.001
.135
.289
.249
.306
.152
.801
--
--
--
--
--
--
.508
.044
.0
.203
.04
.099
.082
.012
.115
.006
.005
.002
.002
.055
.001
.005
.234
.0
--
.024
.002
.012
.002
.958
.898
.003
.866
.754
.039
.98
.012
.012
--
.325
.11
.002
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
Trio
A
A
A
A
T
T
11
T
A
T
A
T
C
G
G
T
T
A
2
8
G
T
G
C
T
C
A
T
C
C
G
C
T
T
T
A
T
G
G
G
G
16
A
C
C
G
T
G
T
G
6
G
C
A
G
G
T
G
G
G
T
A
2
T
A
T
C
G
G
T
2
C
T
G
6
2
T
T
T
C
2
T
3
A
T
C
T
C
T
G
T
G
T
4
C
T
2
C
A
4
2
T
G
G
G
G
C
A
T
A
C
C
C
C
C
T
G
A
C
4
2
T
C
G
G
G
C
G
G
A
G
C
C
C
A
T
T
C
C
G
5
G
T
G
C
G
A
A
G
G
C
T
T
T
C
30
A
G
A
A
G
A
C
T
T
T
T
C
A
4
T
A
4
A
A
G
T
G
C
A
G
G
T
A
A
G
A
G
C
C
T
G
C
C
A
G
A
C
T
T
A
G
A
C
C
C
A
A
A
C
T
G
G
A
C
G
G
T
T
T
A
T
A
C
C
T
G
A
T
C
A
T
T
2
13
A
T
C
C
G
T
G
C
T
A
C
4
A
G
T
A
G
C
T
T
A
A
C
G
T
T
A
T
C
A
A
G
A
A
9
T
2
C
T
T
C
T
T
C
2
T
G
C
C
A
C
G
C
G
C
T
A
G
G
G
T
3
G
C
T
C
T
G
T
C
A
A
A
A
C
T
T
C
A
G
T
G
C
G
T
G
T
C
C
C
A
G
C
G
A
C
A
A
C
A
T
G
G
G
A
G
8
A
2
4
C
G
G
G
A
C
2
C
C
G
C
C
C
C
G
G
C
T
C
G
G
T
A
A
C
A
T
C
A
A
A
A
A
C
C
G
C
A
T
A
G
T
A
G
C
16
G
5
4
C
3
T
2
A
A
T
C
C
C
T
5
G
A
G
C
C
T
A
G
C
G
A
T
G
C
A
T
A
A
C
T
C
A
C
T
G
G
G
C
C
G
C
T
7
A
T
A
T
G
T
T
T
20
4
4
A
T
G
A
G
G
A
T
2
2
G
A
T
C
C
G
2
C
A
G
A
A
12
G
G
T
4
4
T
2
T
4
A
3
2
2
G
  100,138,317
  100,138,893
  100,138,897
  100,139,280
  100,139,281
  100,139,797
  100,140,940
  100,141,056
  100,141,240
  100,141,261
  100,141,707
  100,142,160
  100,142,523
  100,143,641
  100,144,200
  100,144,238
  100,144,696
  100,144,702
  100,144,744
  100,144,849
  100,146,043
  100,146,406
  100,146,807
  100,146,872
  100,148,829
  100,148,929
  100,149,162
  100,150,131
  100,150,688
  100,151,388
  100,151,934
  100,154,653
  100,156,343
  100,157,212
  100,157,431
  100,158,227
  100,158,303
  100,159,452
  100,159,497
  100,159,505
  100,159,509
  100,159,534
  100,160,497
  100,162,804
  100,162,969
  100,163,035
  100,163,782
  100,164,578
  100,164,876
  100,164,913
  100,164,918
  100,165,314
  100,165,775
  100,166,804
  100,166,828
  100,167,909
  100,168,588
  100,168,888
  100,169,356
  100,170,204
  100,171,443
  100,172,165
  100,172,728
  100,172,835
  100,172,861
  100,172,978
  100,173,016
  100,173,259
  100,173,322
  100,173,334
  100,173,335
  100,173,348
  100,173,460
  100,173,591
  100,173,606
  100,173,668
  100,173,804
  100,173,824
  100,173,848
  100,173,862
  100,174,042
  100,174,068
  100,174,314
  100,174,554
  100,175,050
  100,175,145
  100,175,358
  100,175,496
  100,175,878
  100,176,043
  100,176,313
  100,177,033
  100,182,283
  100,182,583
  100,185,763
  100,185,984
  100,185,999
  100,186,134
  100,187,909
  100,188,264
  100,188,266
  100,190,450
  100,190,503
  100,191,697
  100,191,702
  100,195,504
  100,195,734
  100,197,080
  100,198,454
  100,198,909
  100,198,921
  100,198,935
  100,198,943
  100,198,951
  100,198,961
  100,198,979
  100,198,980
  100,200,665
  100,200,752
  100,201,208
  100,201,260
  100,201,292
  100,201,339
  100,201,663
  100,202,942
  100,202,944
  100,204,725
  100,206,027
  100,207,627
  100,208,348
  100,209,279
  100,210,458
  100,210,719
  100,210,913
  100,211,025
  100,211,282
  100,211,320
  100,211,328
  100,211,571
  100,211,593
  100,211,933
  100,212,044
  100,212,292
  100,212,513
  100,212,781
  100,212,999
  100,213,079
  100,213,275
  100,213,313
  100,213,388
  100,213,543
  100,213,731
  100,213,944
  100,214,035
  100,214,155
  100,214,194
  100,214,259
  100,214,642
  100,215,083
  100,215,208
  100,215,382
  100,215,566
  100,215,689
  100,215,729
  100,216,233
  100,216,527
  100,216,539
  100,216,689
  100,216,802
  100,216,827
  100,216,836
  100,217,040
  100,217,090
  100,217,096
  100,217,507
  100,217,683
  100,217,747
  100,217,777
  100,217,812
  100,218,012
  100,218,480
  100,218,488
  100,218,824
  100,218,959
  100,219,167
  100,219,176
  100,219,259
  100,219,342
  100,219,376
  100,219,416
  100,219,552
  100,219,578
  100,219,665
  100,219,849
  100,219,953
  100,220,186
  100,221,252
  100,221,584
  100,222,257
  100,222,299
  100,223,365
  100,224,658
  100,224,664
  100,225,690
  100,226,458
  100,226,510
  100,227,125
  100,227,542
  100,227,770
  100,227,928
  100,227,974
  100,228,793
  100,229,632
  100,230,278
  100,230,383
  100,231,227
  100,232,600
  100,233,880
  100,234,731
  100,235,122
  100,235,984
  100,236,049
  100,236,344
  100,236,479
  100,236,529
  100,236,569
  100,237,265
  100,237,405
  100,237,599
  100,238,517
  100,239,075
  100,239,558
  100,240,373
  100,240,998
  100,241,147
  100,241,935
  100,242,014
  100,242,184
  100,242,412
  100,242,447
  100,242,449
  100,242,455
  100,242,465
  100,242,531
  100,244,036
  100,244,105
  100,244,142
  100,244,372
  100,244,532
  100,244,766
  100,244,887
  100,244,977
  100,245,176
  100,245,442
  100,245,444
  100,245,781
  100,246,745
  100,246,798
  100,247,074
  100,247,196
  100,247,458
  100,247,643
  100,247,694
  100,247,863
  100,248,175
  100,248,271
  100,248,598
  100,248,834
  100,249,593
  100,249,779
  100,250,018
  100,250,289
  100,250,395
  100,250,988
  100,251,157
  100,251,632
  100,251,969
  100,252,238
  100,252,578
  100,252,886
  100,253,338
  100,253,837
  100,254,100
  100,254,140
  100,254,308
  100,254,484
  100,254,654
  100,255,073
  100,256,028
  100,256,258
  100,256,404
  100,256,556
  100,256,566
  100,256,567
  100,256,604
  100,256,661
  100,259,524
  100,259,526
  100,260,796
  100,260,824
  100,260,973
  100,261,074
  100,262,078
  100,264,345
  100,264,351
  100,267,896
  100,267,905
  100,267,917
  100,270,298
  100,275,627
  100,276,807
  100,277,511
  100,278,578
  100,279,411
  100,281,839
  100,283,698
  100,284,276
  100,286,797
  100,290,989
  100,291,012
  100,291,082
  100,291,431
  100,292,399
  100,294,205
  100,296,236
  100,296,634
  100,303,332
  100,305,660
  100,308,313
  100,309,940
  100,309,958
  100,310,513
  100,311,403
  100,312,623
  100,315,475
  100,316,797
  100,317,422
  100,317,428
  100,317,544
  100,318,416
  100,318,748
  100,319,285
  100,319,622
  100,320,477
  100,322,808
  100,326,641
  100,331,013
  100,331,080
  100,331,083
  100,331,128
  100,331,460
  100,332,393
  100,332,402
  100,332,452
  100,332,465
  100,332,473
  100,332,481
  100,332,489
  100,332,491
  100,332,506
  100,332,511
  100,332,627
  100,333,059
  100,333,188
  100,334,404
  100,334,768
  100,337,740
  100,338,307
  100,339,365
  100,341,434
  100,341,657
  100,341,827
  100,343,479
  100,344,530
  100,344,563
  100,344,661
  100,344,665
  100,344,669
  100,345,734
  100,345,996
  100,346,023
  100,347,278
  100,348,954
  100,349,509
  100,349,714
  100,349,745
  100,349,797
  100,350,940
  100,353,168
  100,353,285
  100,353,517
  100,354,375
  100,354,400
  100,354,401
  100,355,832
  100,356,644
  100,356,987
  100,359,025
  100,360,056
  100,360,298
  100,360,542
  100,361,113
  100,361,463
  100,361,778
  100,363,205
  100,363,486
  100,363,875
  100,363,972
  100,365,114
  100,365,300
  100,365,328
  100,365,441
  100,366,511
  100,366,966
  100,368,979
  100,369,137
  100,370,795
  100,371,753
  100,371,758
  100,373,576
  100,373,844
  100,374,104
  100,374,211
  100,376,101
  100,376,255
  100,376,256
  100,376,339
  100,377,032
  100,377,567
  100,377,764
  100,378,649
  100,378,766
  100,379,350
  100,379,500
  100,379,978
  100,380,646
  100,381,473
  100,381,906
  100,382,667
  100,382,733
  100,382,736
  100,382,790
  100,382,793
  100,382,996
  100,383,582
  100,383,583
  100,383,618
  100,383,679
  100,383,681
  100,383,695
  100,384,381
  100,385,294
  100,387,384
  100,389,113
  100,390,159
  100,390,404
  100,390,407
  100,391,938
  100,396,107
  100,398,122
  100,398,123
  100,399,539
  100,400,476
  100,403,298
  100,403,311
  100,403,329
  100,404,555
  100,404,786
  100,406,695
  100,406,726
  100,407,568
  100,409,209
  100,410,275
  100,410,328
  100,410,334
  100,412,608
  100,412,892
  100,412,949
  100,414,536
  100,417,286
  100,417,828
  100,421,282
  100,424,189
  100,432,227
  100,432,228
  100,432,469
  100,436,780
A/-
3
-
G
C
G
-
G
C
C
G
C
T
T
3
A
T/A
C/7
-
-
A
C
A
T
C
T
G
C
G
T
A
T
G
C
C
G
3
5
G/A
G/A
G/A
-
T
T
T
A
-
A
5
G/A
-
A
T
G
G/A
A
C
A
A
A
C
G
2/-
5
5
3
C/T
A
G/C
T/3
2/-
C/5
3
C
-
-
T/C
T/A
T/3
C/G
-
T/A
-
G
2
T
4
2
C
A
C
T
C
4/-
-
-
-
A
-
4/-
-
4
C
2
G/A
A
T
4/5
A
7
C/9
T
T
C/T
C/T
4
G/4
2
T
4/-
-
C
C/A
2
A
A
T
5
C
G
A
T
T
A
G
2
C
A
T
A
-
A
A
A
3
A
G
A/G
A
C
T
C
C
A
C/5
-
3
A
G
-
A
G
T
19
A
G
C
T
-
4/-
C
T
-
A/G
T
A
C
C
T
G
A
A
C
C
G
A
T
A
T
T
11
G/A
T
T
G
A
3/AT
T
C
C
2
G/A
-
T
T
T
-
G
G
T
C
A
4
G
T
T
2
G
C
G
2
C
T
CA/3
2
C
A
G
A
G
G
C
C
-
-
G
A
T
A
5
C
G/C
C/T
C
G
T
-
T
A
-
G
A
T
2
-
G
G
G
A
C
C
G
G
A
-
G
A
G
G
-
C
-
C/G
C
C
A
C
C
T
-
C
A
5
C/G
T
7/5
C
T
A
T
C
G
C
T
A
C
-
-
2
C
T
G
T
C
C/T
A/G
A/C
A/C
13
G
G
A
T
C
A
C
A
G
A/3
C
A
A
G
-
A
G
A
T
A
-
-
G
G
T
-
T/G
A
A
A
G
5
-
5
-
-
A
G/A
G/A
G/A
G
A
2/-
7
C/G
G/A
G
C/G
G
C/G
A
A
G
-
10
A
A
C
-
G
A
T
C
T
A/T
-/4
A/T
A/T
T
A
T
A
T
G
7
G
A
C
T
4
T
-
A
5/-
4/-
G
3/-
3
2/-
C
G
C
T
T
T
2
-
A
T
A
G
T
2
G
A
T
T
G
-
T
A
G
G
G
T
A
A
T
G
-
G
A
C
A
T
T
A
T
C
-
A/G
G
A/G
T/G
T
T/2
6/G
5/C
-
-
-
G
C
T
G
2
C
C
T/C
-
2/-
G/-
G
C
T
3
G/A
2/-
C/-
T
A
G
3/5
-
G/C
C
C
4/-
-
13
-
G/3
-
G
3/-
-
-
-