Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 221,759 (bp)   Positions: 359
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.009
.028
.031
--
--
.01
.012
.011
.108
.002
.044
.008
.009
--
.007
.001
.001
.05
.024
.046
.014
.0
.0
.0
.009
.289
.005
.001
.045
.012
.006
.073
.017
.001
.122
.393
.428
.012
.02
.002
.004
.044
--
.014
.133
.001
.001
.012
.005
.004
.018
.463
--
--
.09
--
--
.049
.001
.0
.001
.002
.002
.003
.003
.0
.055
.019
.002
.009
.0
.028
.002
.002
.0
.004
--
--
--
--
--
--
--
.1
.005
.015
.173
.197
.001
.012
.013
.713
.004
.002
.008
.024
.001
.008
.0
.001
.035
.001
.017
.006
.086
.001
.001
.009
--
--
.01
--
.008
.727
.626
--
--
--
.915
.446
.01
.001
.075
.0
.012
.001
.001
.151
.001
.0
.002
.008
.002
.002
.024
.002
.616
.025
.001
--
--
.005
.066
.009
--
--
--
--
.212
.215
.013
.001
.069
.086
.101
.139
.002
.135
.458
.008
.009
.001
.299
.021
.019
.005
.862
.081
.004
.007
.009
--
.001
.017
.01
.001
.141
.001
.929
.966
.925
.01
.001
.022
.001
.001
.0
.002
.002
.002
.151
.027
.335
.0
.001
.001
.001
.001
.0
.791
.011
.007
.0
.024
.001
.004
.004
.001
.005
.0
.001
.001
.028
.001
.035
.074
.001
.0
.001
.355
.308
.212
.008
.005
.021
.017
.256
.022
.008
.098
.003
.008
.008
.085
.001
.002
.023
.096
.004
.007
.007
.005
.029
.009
.116
.013
.044
.072
.029
.0
.001
.038
.007
.011
.066
--
--
--
.191
.18
.08
--
.022
.058
.0
.001
.01
--
.002
--
.001
.01
.132
.011
.009
.008
.01
--
--
.004
.037
.0
--
--
--
--
--
.002
--
--
.996
.985
.968
.062
.454
--
--
.588
.002
.001
.0
.024
.024
.001
.205
.0
.001
.001
.404
.001
.05
.205
.292
.035
--
--
--
--
--
--
.022
.187
.157
.004
.001
.003
.013
.057
--
--
.002
.014
.068
.004
.012
.055
.992
.042
.025
.019
.03
.146
--
.599
.018
--
--
.038
.003
.005
.002
.88
.877
.036
.975
.966
.969
.997
.998
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
G
8
4
G
T
A
C
T
T
A
16
G
T
A
G
G
T
A
T
A
A
T
C
A
C
A
G
A
G
A
C
T
T
A
T
G
G
C
A
A
A
A
C
A
T
A
C
A
G
G
A
C
G
G
C
T
C
A
T
A
G
T
T
C
T
G
G
A
T
C
A
18
26
G
C
A
G
G
G
T
G
3
3
T
T
A
A
A
T
C
A
2
2
A
C
A
G
C
17
T
12
6
T
14
A
A
T
T
C
2
G
C
C
3
A
C
7
T
C
G
A
C
A
C
A
C
T
C
T
T
A
G
C
A
C
4
G
A
A
4
G
T
C
C
G
G
G
C
A
A
G
T
C
3
G
T
T
C
C
C
T
A
G
C
G
T
A
2
T
G
T
15
2
G
A
8
A
4
G
A
29
G
A
T
G
G
G
C
G
T
C
A
G
A
A
C
T
C
C
A
C
C
T
A
T
G
C
C
A
A
5
A
A
5
2
C
G
G
T
A
A
A
T
G
A
G
G
A
G
2
T
T
T
C
G
T
C
2
C
C
C
G
T
C
2
G
C
6
C
A
T
T
A
G
G
2
C
A
A
12
T
83
T
C
7
G
T
G
T
C
C
T
A
2
T
C
3
C
A
2
A
G
A
3
G
G
G
T
T
T
T
G
A
2
2
2
T
A
C
A
G
A
C
C
G
T
G
A
T
G
2
T
G
G
T
T
T
2
2
A
G
G
2
C
A
A
G
A
C
A
A
C
T
C
C
G
T
2
4
3
A
C
18
T
3
G
A
A
C
G
A
G
A
G
2
T
G
T
C
  14,576,387
  14,579,081
  14,579,085
  14,581,346
  14,583,208
  14,584,736
  14,584,785
  14,585,304
  14,585,371
  14,586,333
  14,586,550
  14,586,887
  14,587,112
  14,587,477
  14,588,990
  14,589,380
  14,589,449
  14,589,554
  14,590,028
  14,590,111
  14,590,409
  14,590,778
  14,590,915
  14,591,009
  14,591,308
  14,591,439
  14,591,834
  14,592,134
  14,592,299
  14,592,329
  14,592,386
  14,592,543
  14,592,585
  14,592,687
  14,592,857
  14,592,878
  14,592,879
  14,593,421
  14,593,450
  14,593,833
  14,595,342
  14,595,953
  14,596,134
  14,597,403
  14,597,492
  14,597,646
  14,597,709
  14,598,128
  14,598,166
  14,598,388
  14,598,635
  14,598,739
  14,598,940
  14,599,061
  14,599,109
  14,599,158
  14,599,252
  14,600,436
  14,600,459
  14,600,794
  14,601,043
  14,601,118
  14,601,220
  14,601,710
  14,601,728
  14,601,940
  14,602,132
  14,602,466
  14,602,536
  14,603,515
  14,604,564
  14,605,440
  14,605,549
  14,605,929
  14,606,132
  14,606,801
  14,606,894
  14,606,898
  14,606,901
  14,606,904
  14,606,911
  14,606,941
  14,606,966
  14,607,730
  14,607,843
  14,608,799
  14,608,907
  14,609,019
  14,609,082
  14,609,179
  14,609,180
  14,610,535
  14,610,682
  14,610,683
  14,610,779
  14,610,903
  14,612,097
  14,612,819
  14,613,491
  14,613,626
  14,614,028
  14,615,191
  14,615,440
  14,615,687
  14,615,749
  14,616,406
  14,616,417
  14,617,062
  14,617,233
  14,617,365
  14,618,500
  14,619,011
  14,619,387
  14,620,138
  14,621,083
  14,622,439
  14,625,313
  14,633,069
  14,633,916
  14,635,074
  14,635,115
  14,635,488
  14,635,561
  14,635,670
  14,636,795
  14,637,178
  14,637,189
  14,637,470
  14,638,054
  14,638,220
  14,638,224
  14,638,264
  14,638,301
  14,638,302
  14,638,350
  14,638,489
  14,639,353
  14,639,402
  14,639,811
  14,640,780
  14,640,796
  14,643,152
  14,644,977
  14,645,303
  14,645,659
  14,646,922
  14,646,930
  14,646,931
  14,647,155
  14,647,598
  14,650,253
  14,650,317
  14,650,769
  14,650,771
  14,650,777
  14,650,783
  14,651,979
  14,652,373
  14,652,747
  14,654,242
  14,655,692
  14,656,729
  14,656,769
  14,657,066
  14,658,379
  14,658,527
  14,659,463
  14,659,620
  14,659,657
  14,659,686
  14,659,696
  14,660,241
  14,660,309
  14,662,129
  14,662,924
  14,662,929
  14,663,890
  14,664,171
  14,664,875
  14,665,105
  14,665,241
  14,667,761
  14,669,056
  14,669,236
  14,669,682
  14,669,712
  14,669,717
  14,669,735
  14,669,742
  14,670,147
  14,670,363
  14,670,376
  14,670,799
  14,671,139
  14,671,149
  14,671,155
  14,671,182
  14,671,197
  14,671,200
  14,671,239
  14,671,324
  14,671,702
  14,671,716
  14,671,762
  14,671,802
  14,671,849
  14,671,851
  14,671,926
  14,671,930
  14,671,973
  14,671,994
  14,671,998
  14,672,118
  14,672,164
  14,672,171
  14,672,174
  14,672,197
  14,672,202
  14,672,210
  14,672,391
  14,672,491
  14,672,499
  14,672,572
  14,672,635
  14,672,665
  14,672,816
  14,672,995
  14,673,065
  14,673,076
  14,673,113
  14,673,147
  14,673,187
  14,673,291
  14,673,300
  14,673,323
  14,673,337
  14,673,685
  14,673,961
  14,674,007
  14,674,284
  14,674,687
  14,674,692
  14,674,935
  14,675,026
  14,677,791
  14,678,388
  14,678,725
  14,679,709
  14,680,045
  14,683,039
  14,686,063
  14,687,072
  14,687,959
  14,691,104
  14,691,541
  14,692,971
  14,693,642
  14,693,643
  14,694,195
  14,694,860
  14,696,073
  14,700,548
  14,701,330
  14,701,690
  14,702,175
  14,702,541
  14,702,655
  14,702,941
  14,703,953
  14,704,168
  14,704,962
  14,705,395
  14,705,542
  14,706,662
  14,706,663
  14,709,932
  14,709,934
  14,710,023
  14,713,220
  14,721,219
  14,725,840
  14,728,827
  14,732,192
  14,732,197
  14,732,205
  14,732,210
  14,732,211
  14,733,224
  14,737,118
  14,737,119
  14,744,485
  14,744,494
  14,744,507
  14,749,861
  14,751,106
  14,759,767
  14,759,994
  14,765,305
  14,765,536
  14,766,918
  14,767,120
  14,767,252
  14,767,862
  14,769,389
  14,771,833
  14,772,182
  14,772,735
  14,772,769
  14,773,433
  14,774,235
  14,774,552
  14,774,701
  14,774,780
  14,776,491
  14,776,982
  14,777,085
  14,777,191
  14,777,218
  14,777,226
  14,777,397
  14,777,962
  14,778,164
  14,778,408
  14,779,119
  14,779,132
  14,779,368
  14,779,377
  14,780,156
  14,780,347
  14,782,088
  14,782,862
  14,783,008
  14,783,399
  14,783,844
  14,783,965
  14,784,429
  14,785,121
  14,785,589
  14,786,145
  14,786,146
  14,787,657
  14,788,926
  14,789,283
  14,790,469
  14,790,942
  14,791,139
  14,791,140
  14,791,717
  14,791,762
  14,792,626
  14,793,159
  14,793,835
  14,794,833
  14,795,558
  14,795,713
  14,795,714
  14,795,790
  14,796,193
  14,796,216
7
8/-
-
2
T/-
G
2
C
-
G
-
A
C
6
A
A
9
G
C
G
13
C
T
G
T
11
A
2
A
G
T
A
9
G
C
G/2
T
A
G
T
3
19
T
G
C
G
T
C
A
A
C
T
A
2
T
C
-
3
9
G
A
C
C
T
C
A
A
-
2
T
G
-
-
A
T
C
11
6
2
8
3
-
-
-
C
G
G
C
C
T
G
-
2/-
-
T
2
C
T
17/-
C
-
-
4/3
-
G
G
2
4
C/2
-
C
CG/3
T
-
5
C/2
7/-
T/3
T
A
C
T
G
T
G
T
G
-
C
C
T
A
T
G
T
4/-
5
-
2
-
A
C
T
-
18
A
2
4
A/2
C
A
C
C/-
3/-
G/5
T/-
C
5
2
A
9
10
A
G
A
G
-
-
2
G/2
T/2
-
-
2
A/9
-
2
-
A
G
-
A
G
C
-
A
C
T
A
C
2
-
A
G
G
-
C
A
A
C
G
G
C
G
-
A
G
G
T
G
-
3
G
-
-
-
C
A
C
T
-
G
C
C
G
38
A
G
A
-
C
C
C
T
A
G
T
-
T
G
T
T
C
G
2/-
A
5/3
-
T
G
7/9
C
T
T
A
-
C/2
A/-
7
-
3/5
-
C
T
-
A
G
T
3
C/3
T
C
G
2/-
T/-
C/-
3/-
C/-
3
2/-
A/3
G/9
3
-
4
3
20
20
3
3
G
C
G
2/-
2/-
2/-
2
2
21
G
C
3
2
C/2
A
C
A
G
G
A
-
C
A
2
G
-
-
2/-
2/-
T
A
25
-
T
G
G
A
G
2
A/-
G
A
T/9
C/3
A
A
2
-
4/-
3/-
T
T
-
C
-
G/2
A/-
G
T
2
2
-
-
A
-
T/-
C
2
-