Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 221,759 (bp)   Positions: 486
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.668
.871
.013
.009
.01
.002
--
.159
.028
.031
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.01
.012
.011
.002
.023
.406
.008
.009
--
--
.007
.001
.001
.05
.024
.046
.019
.014
.012
.0
.0
.0
.009
.289
.001
.045
.012
.006
.073
.017
.001
.122
.393
.428
.012
.02
.002
.004
.044
--
.09
.014
.133
.137
.001
.049
.007
.018
.463
--
--
--
.09
--
.035
.028
.035
.049
.001
.004
.0
.002
.002
.002
.003
.643
.019
.004
.008
.604
.0
.0
.0
.012
.077
.001
.0
.023
.035
.378
.004
.057
.021
.023
.0
.004
--
--
--
--
--
--
--
.031
.195
.02
.094
.1
.005
.015
.197
.001
.012
.013
.006
.713
.673
.002
.032
.001
.001
.006
.003
.001
.017
.086
.001
.001
.009
--
--
.903
--
.993
.727
.001
--
.013
--
--
.007
--
.001
.075
.045
.616
.025
.001
.158
--
--
.005
.009
--
.01
.008
.001
.002
.009
.001
.001
.287
.082
.009
.019
.018
.005
.009
.329
.864
.077
.004
.009
.016
.311
.312
.345
--
.0
.017
--
.013
.018
.141
.046
.002
.4
.966
.91
.004
.177
.058
.01
.007
.001
.022
.019
.002
.151
.027
.065
.013
.066
.335
.791
.011
.007
.0
.001
.04
.024
.008
.001
.005
.0
.001
.001
.028
.001
.035
.074
.001
.0
.001
.355
.308
.008
.005
.021
.017
.022
.008
.098
.003
.008
.085
.001
.0
.096
.007
.026
.001
.005
--
--
--
.029
.009
.009
--
.044
.228
.002
--
.0
.0
.169
.0
.001
.006
.038
.011
.043
--
--
--
.191
.207
.18
.08
.078
.011
--
.022
.058
.0
.001
.021
.002
.01
--
--
.002
--
.01
.015
.014
.011
.009
.006
.007
.007
--
--
.005
.001
.001
.015
--
.011
--
.089
.268
.969
.043
.007
.002
.003
.021
.078
.083
.163
.004
.021
.002
.001
.03
.03
.001
.0
.001
.006
.002
.007
.005
.026
.112
.106
.097
.012
.001
.001
.028
.017
.0
.014
.047
.292
--
--
--
--
.059
.009
.002
.021
.027
.012
.006
.002
--
--
.283
.001
.012
.001
.002
.018
.067
.001
--
.028
.074
.304
.548
.0
.025
--
--
.985
.968
.988
.992
.991
.981
.012
.017
.04
.001
.001
.001
.002
.014
.0
.0
.004
.003
.001
.009
.064
.0
.223
.398
.009
--
.008
.993
.469
.028
.061
.002
.0
.002
.01
.017
.094
--
--
.992
.002
.073
.12
.0
.005
.009
.588
.002
.004
.001
.0
.024
.024
.001
.205
.0
.001
.001
.404
.001
.05
.205
.292
.035
--
--
--
--
--
.022
.187
.157
.004
.001
.003
.013
.057
--
--
--
.002
.014
.004
.012
.055
.992
.042
.025
.019
.03
.146
--
.059
.599
.018
--
.038
.003
.005
.002
.88
.877
.036
.975
.969
.997
.998
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
Trerf1
T
G
A
G
T
T
T
A
8
4
A
C
A
A
G
C
A
C
G
G
A
C
T
A
8
G
G
T
T
A
G
G
T
A
T
A
4
2
C
T
C
A
C
A
A
G
A
C
T
T
A
T
G
G
C
A
A
A
A
C
C
A
T
C
C
G
A
A
C
G
G
G
C
C
T
C
C
A
C
G
A
7
T
T
C
C
A
2
C
T
T
G
C
A
G
G
A
T
T
A
20
2
C
T
T
A
G
G
G
T
G
A
2
C
G
G
G
T
T
A
A
T
C
A
G
2
A
A
2
G
T
6
4
6
T
A
A
T
T
G
T
4
C
C
3
3
T
C
A
7
G
6
C
A
22
G
A
A
C
4
2
T
C
G
A
C
T
T
T
G
A
3
G
A
G
C
T
T
A
A
A
A
T
G
C
A
2
G
C
G
C
C
C
A
G
T
A
A
A
G
C
T
C
T
A
T
G
T
C
A
G
A
A
G
A
C
C
T
G
T
A
G
C
A
A
5
A
A
5
2
C
G
G
T
A
A
T
G
A
G
A
G
2
T
T
C
G
G
2
C
G
G
G
5
A
A
T
C
A
C
C
10
C
C
A
C
C
10
4
G
T
G
C
2
4
A
A
14
12
T
4
A
83
T
C
7
G
G
A
T
G
G
T
C
T
4
3
2
G
G
A
T
G
A
10
C
9
C
8
C
T
4
12
A
C
C
A
A
8
C
4
2
G
A
C
G
G
C
C
T
G
C
A
T
G
6
2
C
C
G
A
9
A
A
G
A
G
2
3
G
G
G
C
T
T
G
G
G
G
C
T
T
C
A
T
C
A
A
C
G
2
C
G
T
T
C
G
A
A
G
A
8
T
G
G
C
C
T
G
G
C
C
G
A
4
G
A
4
G
T
G
8
A
A
A
G
G
A
A
104
C
G
C
4
8
T
2
T
T
A
T
A
A
T
G
A
C
5
A
G
A
C
C
G
T
G
A
T
G
2
T
G
G
T
T
T
2
A
G
G
2
C
A
A
G
A
C
C
A
A
C
C
C
G
T
2
4
3
A
C
18
12
T
3
G
A
C
G
A
G
A
G
2
G
T
C
  14,575,302
  14,575,600
  14,575,924
  14,576,387
  14,576,436
  14,577,947
  14,578,748
  14,578,953
  14,579,081
  14,579,085
  14,579,534
  14,579,737
  14,579,747
  14,579,857
  14,580,164
  14,580,201
  14,581,355
  14,581,379
  14,583,207
  14,584,011
  14,584,736
  14,584,785
  14,585,304
  14,586,333
  14,586,558
  14,586,802
  14,586,887
  14,587,112
  14,587,458
  14,587,477
  14,588,990
  14,589,380
  14,589,449
  14,589,554
  14,590,028
  14,590,111
  14,590,408
  14,590,409
  14,590,639
  14,590,778
  14,590,915
  14,591,009
  14,591,308
  14,591,439
  14,592,134
  14,592,299
  14,592,329
  14,592,386
  14,592,543
  14,592,585
  14,592,687
  14,592,857
  14,592,878
  14,592,879
  14,593,421
  14,593,450
  14,593,833
  14,595,342
  14,595,953
  14,596,134
  14,596,656
  14,597,403
  14,597,492
  14,597,503
  14,597,692
  14,597,958
  14,598,588
  14,598,635
  14,598,739
  14,598,814
  14,598,940
  14,599,061
  14,599,109
  14,599,296
  14,599,939
  14,600,427
  14,600,429
  14,600,436
  14,600,662
  14,600,790
  14,600,794
  14,601,079
  14,601,118
  14,601,220
  14,601,859
  14,602,177
  14,602,466
  14,602,537
  14,603,165
  14,603,234
  14,603,357
  14,603,590
  14,603,641
  14,603,804
  14,603,917
  14,604,098
  14,604,564
  14,604,720
  14,604,796
  14,605,199
  14,605,412
  14,605,545
  14,606,191
  14,606,192
  14,606,261
  14,606,801
  14,606,894
  14,606,898
  14,606,901
  14,606,904
  14,606,911
  14,606,948
  14,606,964
  14,607,175
  14,607,227
  14,607,440
  14,607,728
  14,607,730
  14,607,843
  14,608,799
  14,609,019
  14,609,082
  14,609,179
  14,609,180
  14,609,554
  14,610,535
  14,610,581
  14,610,683
  14,610,904
  14,612,097
  14,613,626
  14,614,034
  14,614,036
  14,615,191
  14,615,440
  14,615,749
  14,616,406
  14,616,417
  14,617,062
  14,617,256
  14,617,358
  14,618,833
  14,619,011
  14,619,852
  14,620,138
  14,621,300
  14,621,903
  14,623,482
  14,624,824
  14,625,313
  14,629,613
  14,633,104
  14,635,488
  14,635,561
  14,638,651
  14,639,353
  14,639,402
  14,639,811
  14,639,946
  14,640,780
  14,640,782
  14,643,152
  14,645,303
  14,645,659
  14,648,889
  14,650,311
  14,650,317
  14,651,979
  14,655,692
  14,656,009
  14,656,729
  14,656,764
  14,656,972
  14,658,193
  14,658,379
  14,658,490
  14,658,527
  14,658,542
  14,659,120
  14,659,457
  14,659,619
  14,659,658
  14,659,696
  14,659,787
  14,659,854
  14,659,855
  14,659,999
  14,660,297
  14,661,355
  14,662,129
  14,663,091
  14,663,402
  14,663,632
  14,663,890
  14,664,132
  14,664,434
  14,664,712
  14,665,105
  14,665,240
  14,665,434
  14,665,682
  14,665,762
  14,667,760
  14,668,569
  14,669,056
  14,669,236
  14,669,864
  14,670,147
  14,670,363
  14,670,376
  14,670,518
  14,670,578
  14,670,663
  14,670,799
  14,671,239
  14,671,324
  14,671,702
  14,671,716
  14,671,718
  14,671,757
  14,671,762
  14,671,839
  14,671,926
  14,671,930
  14,671,973
  14,671,994
  14,671,998
  14,672,118
  14,672,164
  14,672,171
  14,672,174
  14,672,197
  14,672,202
  14,672,210
  14,672,391
  14,672,491
  14,672,572
  14,672,635
  14,672,665
  14,672,816
  14,673,065
  14,673,076
  14,673,113
  14,673,147
  14,673,291
  14,673,300
  14,673,323
  14,673,927
  14,673,961
  14,674,284
  14,674,305
  14,674,461
  14,674,692
  14,674,755
  14,674,892
  14,674,895
  14,674,935
  14,675,026
  14,675,055
  14,677,802
  14,678,725
  14,679,751
  14,681,356
  14,682,114
  14,683,039
  14,683,424
  14,684,368
  14,686,064
  14,686,070
  14,686,937
  14,687,072
  14,691,104
  14,692,181
  14,692,952
  14,692,969
  14,693,643
  14,694,195
  14,694,858
  14,694,860
  14,696,073
  14,696,074
  14,696,636
  14,700,548
  14,701,330
  14,701,690
  14,702,175
  14,702,541
  14,702,547
  14,702,553
  14,702,655
  14,702,864
  14,702,941
  14,703,953
  14,704,168
  14,705,395
  14,706,660
  14,706,661
  14,706,662
  14,706,853
  14,706,889
  14,706,940
  14,707,448
  14,708,144
  14,708,207
  14,708,815
  14,709,926
  14,709,928
  14,711,622
  14,713,221
  14,714,745
  14,715,501
  14,716,754
  14,721,209
  14,723,487
  14,723,598
  14,724,053
  14,724,058
  14,724,060
  14,724,080
  14,724,778
  14,725,841
  14,725,843
  14,726,105
  14,726,301
  14,726,401
  14,726,555
  14,726,818
  14,727,211
  14,727,966
  14,728,015
  14,728,292
  14,728,805
  14,728,809
  14,729,096
  14,729,163
  14,729,298
  14,729,330
  14,729,336
  14,729,340
  14,729,758
  14,729,804
  14,730,352
  14,730,603
  14,730,700
  14,730,857
  14,731,750
  14,731,769
  14,731,955
  14,732,197
  14,732,205
  14,732,210
  14,732,211
  14,732,657
  14,732,996
  14,733,224
  14,733,966
  14,734,183
  14,734,184
  14,735,433
  14,736,908
  14,737,118
  14,737,119
  14,737,643
  14,738,136
  14,738,766
  14,739,839
  14,739,902
  14,740,386
  14,741,747
  14,741,860
  14,742,030
  14,742,669
  14,742,715
  14,743,442
  14,743,580
  14,743,662
  14,743,925
  14,744,253
  14,744,325
  14,744,494
  14,744,507
  14,744,510
  14,744,557
  14,744,669
  14,744,670
  14,744,997
  14,745,086
  14,745,253
  14,745,831
  14,745,834
  14,745,846
  14,746,043
  14,746,065
  14,746,082
  14,746,094
  14,746,360
  14,746,546
  14,747,213
  14,747,239
  14,749,860
  14,750,759
  14,751,100
  14,751,458
  14,751,898
  14,752,899
  14,754,210
  14,755,072
  14,755,292
  14,755,723
  14,755,750
  14,756,312
  14,756,660
  14,757,151
  14,757,248
  14,757,900
  14,759,397
  14,759,767
  14,759,994
  14,760,242
  14,760,671
  14,761,853
  14,762,347
  14,762,448
  14,763,263
  14,763,419
  14,765,305
  14,765,536
  14,766,074
  14,766,918
  14,767,120
  14,767,252
  14,767,862
  14,769,389
  14,771,833
  14,772,182
  14,772,735
  14,772,769
  14,773,433
  14,774,235
  14,774,552
  14,774,701
  14,774,780
  14,776,491
  14,776,982
  14,777,085
  14,777,191
  14,777,218
  14,777,397
  14,777,962
  14,778,164
  14,778,408
  14,779,119
  14,779,132
  14,779,368
  14,779,377
  14,780,156
  14,780,347
  14,782,087
  14,782,088
  14,782,862
  14,783,008
  14,783,844
  14,783,965
  14,784,429
  14,785,121
  14,785,589
  14,786,145
  14,786,146
  14,787,657
  14,788,926
  14,789,283
  14,790,210
  14,790,469
  14,790,942
  14,791,139
  14,791,717
  14,791,762
  14,792,626
  14,793,159
  14,793,835
  14,794,833
  14,795,558
  14,795,713
  14,795,790
  14,796,193
  14,796,216
C
A
G
7
3
C
T/-
G
8/-
-
G
T
5
G
A
G
C
2
-
A
G
2
C
G
-
A
A
C
A
6
A
A
9
G
C
G
4/-
2/-
12
C
T
G
T
11
A/2
A
G
T
A
9
G
C
GT/4
T
A
G
T
3
?
T
5
G
C
T
G
A
-
C
T
A
A
2
T
T
C
T
T
2
T
A
G
-
C
C
T
T
-
-
T
4
C
2
T
T
T
C
G
C
C
G
-
-
T
C
C
C
11
6
2
8
3
4
2/-
A
T
T
T
-
C
G
C
C
T
G
A
-
G
-
-
C
C
6/-
4/-
-
3/4
G
G
2
4
-
9
4/-
2
T
-
-
C
T
-
7/-
A
6/-
T
G
-
9
-
2
T
4/-
2/-
C
-
18
T
T
C
C
13
C
7
-
A
G
A
G
G
C
G
34
7
-
2
C
-
T
-
-
T
2
3
T
T
2
3/5
C
G
G
30
A
T
C
T
C
G
C
-
C
2
-
A
G
G
A
C
G
G
C
A
G
G
A
G
T
G
-
3
G
-
-
-
C
A
C
T
-
C
C
G
38
G
A
-
C
C
T
A
A
-
G
T
A
T
-
A/2
A/2
C
G
-
3
?
-
T
9
G
G
T
10/-
-
A
C
T
T
-
4/-
A/-
15
-
12/-
5/3
4/-
A/13
-
C
T
-
A
T
T
G
-
T
3
15
C
4/-
3/-
2/-
A
A
C
A
T
9
10/-
-
-
2
-
T
2
-
-
9
A
7
T
T
-
T
4/-
2/-
C
C
A
A
A
T
G
C
A
T
G
C
A
-
-
T
T
C
G
-
T
T
A
4
A
-
-
4
3
20
T
C
20
2
A
A
A
T
3
3
T
C
C
T
G
G
A
A
-
G
7/10
-
C
T
A
C
C
C
G
-
-
2
4
T
T
C
C
A
T
A
-
G
-
C
2
-
9
15
C
-
G
G
G
T
C
2
T
-
T
A
T
-
-
G
2/-
2
3
G
3/5
G
C
G
A
2
21
-
G
C
3
2
2
A
C
A
G
G
A
-
C
A
2
G
-
-
2/-
T
A
25
-
T
G
G
A
G
2
C/2
A/-
G
A
3
A
A
2
2/-
4/-
3/-
T
T
-
-
C
-
2
G
T
G/2
2
-
-
A
-
C
2
-