Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 126,842 (bp)   Positions: 237
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.003
.0
.0
.785
.001
.054
--
.026
.093
.012
.074
.005
--
.927
.012
.007
.002
.657
.021
.228
.155
.861
.925
--
.258
.224
.096
.003
.001
.969
.996
.677
.02
.001
.0
.014
.004
.047
--
--
--
.016
.035
.007
.41
--
.003
.007
.04
.007
.186
.174
.147
.107
.004
.0
.004
.002
.05
.0
.0
.001
.006
.005
.083
.038
.006
.006
.146
.024
.963
.691
.067
.044
--
.157
.025
.022
.012
.015
.104
.153
.003
.016
.003
.308
--
--
.004
.457
.001
.139
.293
.076
.099
.025
.001
.332
.289
.036
.287
.569
.167
.382
.0
--
.039
.775
.12
.004
.096
.143
.047
--
.366
.225
.19
.0
.028
.964
.003
.002
.001
.984
.994
.722
.04
.124
.0
.001
.014
.0
.0
.003
--
--
.143
.923
.317
.564
.009
.009
.003
.002
.094
.038
.151
.002
.002
.0
.004
.041
.087
.044
.023
.012
.456
.004
.605
.021
.285
.002
.001
.004
.001
.518
.001
.009
.39
.101
.001
.0
.034
.023
.099
.004
--
--
.008
.004
.056
.053
.937
.855
.132
.106
.071
1.0
.001
.2
--
--
.067
.093
.008
.009
.005
.011
.15
.006
.09
.152
.039
.062
.015
.304
.002
.002
.436
.011
.212
.131
.001
.175
.019
.008
.019
.002
.368
.318
.979
.003
.004
.014
.003
.091
.004
.197
.0
.0
.003
.2
.054
.678
1.0
.999
.659
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
Tnrc6a
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
G
26
C
C
T
G
G
C
T
T
A
T
T
C
G
12
A
T
G
T
A
T
G
T
C
T
C
T
2
C
T
C
T
G
C
C
2
C
G
2
C
A
T
A
G
G
G
G
G
G
3
G
T
T
A
G
A
T
C
T
T
C
A
2
2
A
G
A
C
A
G
C
8
C
G
4
A
C
2
T
G
G
T
T
A
C
T
C
A
C
G
G
C
G
T
C
C
G
C
30
T
C
A
C
A
C
54
12
G
A
T
T
2
3
A
A
G
A
G
C
T
G
G
6
G
3
G
C
G
G
T
C
C
119
C
T
T
C
G
G
A
C
G
A
T
G
C
G
G
G
G
A
T
A
G
T
G
C
G
T
A
T
T
G
T
G
G
G
T
C
G
A
118
G
T
A
T
C
G
C
A
A
A
6
C
C
3
T
C
6
C
T
G
G
G
G
A
G
T
T
T
C
C
A
G
G
2
A
G
T
C
T
G
G
A
C
T
T
A
T
G
G
C
G
A
G
A
T
T
T
7
C
A
A
G
  200,080,497
  200,080,513
  200,080,642
  200,080,893
  200,082,377
  200,082,547
  200,082,606
  200,083,190
  200,083,260
  200,083,381
  200,083,448
  200,084,207
  200,085,396
  200,086,343
  200,086,599
  200,086,908
  200,087,253
  200,087,507
  200,090,253
  200,091,738
  200,092,750
  200,093,770
  200,093,807
  200,095,563
  200,095,986
  200,098,417
  200,099,071
  200,100,013
  200,100,324
  200,100,383
  200,100,455
  200,100,597
  200,100,634
  200,101,218
  200,101,267
  200,101,554
  200,101,728
  200,101,855
  200,101,892
  200,101,918
  200,102,274
  200,102,460
  200,102,466
  200,102,650
  200,102,853
  200,103,194
  200,103,224
  200,103,267
  200,103,356
  200,104,043
  200,104,426
  200,104,430
  200,104,437
  200,104,445
  200,104,800
  200,105,005
  200,105,233
  200,105,524
  200,105,670
  200,105,822
  200,105,945
  200,106,415
  200,106,630
  200,107,350
  200,107,402
  200,107,553
  200,107,571
  200,108,117
  200,109,901
  200,110,644
  200,110,727
  200,110,754
  200,112,528
  200,112,589
  200,112,866
  200,112,945
  200,112,981
  200,113,082
  200,113,149
  200,113,284
  200,113,409
  200,113,548
  200,114,373
  200,114,635
  200,114,641
  200,115,816
  200,116,274
  200,116,509
  200,116,913
  200,117,092
  200,117,375
  200,117,643
  200,117,681
  200,118,076
  200,118,704
  200,118,757
  200,119,523
  200,119,892
  200,120,281
  200,120,859
  200,120,947
  200,121,000
  200,121,206
  200,121,575
  200,123,881
  200,124,513
  200,124,560
  200,124,693
  200,124,755
  200,124,916
  200,125,553
  200,125,610
  200,126,130
  200,126,279
  200,127,316
  200,127,351
  200,127,356
  200,128,866
  200,132,202
  200,134,879
  200,136,206
  200,136,208
  200,136,711
  200,136,990
  200,137,254
  200,137,815
  200,138,189
  200,138,457
  200,139,129
  200,140,941
  200,143,566
  200,143,878
  200,144,067
  200,144,852
  200,145,788
  200,145,820
  200,146,072
  200,146,548
  200,147,773
  200,148,396
  200,148,552
  200,148,554
  200,148,843
  200,149,159
  200,149,317
  200,149,505
  200,150,051
  200,150,662
  200,152,133
  200,152,325
  200,152,638
  200,153,171
  200,153,217
  200,153,486
  200,153,601
  200,153,602
  200,154,458
  200,154,755
  200,158,668
  200,159,044
  200,159,602
  200,160,357
  200,161,297
  200,162,518
  200,162,956
  200,163,584
  200,163,621
  200,164,125
  200,165,254
  200,166,266
  200,166,662
  200,167,848
  200,168,098
  200,168,174
  200,169,348
  200,170,090
  200,170,951
  200,170,996
  200,172,155
  200,172,230
  200,172,969
  200,173,097
  200,173,837
  200,173,855
  200,173,874
  200,173,876
  200,173,890
  200,174,033
  200,174,374
  200,174,885
  200,175,123
  200,175,155
  200,175,191
  200,176,383
  200,177,006
  200,177,017
  200,177,113
  200,177,832
  200,177,924
  200,178,015
  200,178,343
  200,178,688
  200,178,815
  200,179,172
  200,180,713
  200,183,931
  200,183,940
  200,183,953
  200,184,598
  200,187,738
  200,188,495
  200,188,569
  200,189,644
  200,189,700
  200,190,338
  200,190,374
  200,190,867
  200,191,556
  200,191,845
  200,191,853
  200,192,066
  200,193,145
  200,193,644
  200,195,576
  200,195,894
  200,197,508
  200,197,591
  200,197,606
  200,198,072
  200,200,538
  200,200,604
  200,201,742
  200,202,251
  200,203,883
  200,204,317
  200,204,681
  200,204,942
G
C
C
-
-
-
-
A
A
T
G
C
-
C
C
T
T
-
G
10
T
-
-
2
A
C
3
C
T
C
-
G
C
A
G
A
T
T
-
T
A
-
T
-
A
G
T
A
A
-
A
4
-
A
A
C
G
T
G
C
17
C
G
T
2
-
-
G
A
T
C/2
A/T
10
T
-
T
C
-
G
T
-
C
8
2
G
G
C
T
G
-
G
-
A
T
2
2
C
6
T
-
2
-
-
T
C
7
G
T
-
12/-
C
G
9
TA/3
-
-
3
G
A
2
C
A
-
-
-
-
T
-
A
7
A
A
C
T
3
-
T
C
C
T
3
T
G
T
A
T
C
5
T
T
A
A
?
G
A
T
A
C
A
T
A
C
G
C
-
A
-
A
T
-
C
T
A
-
-
T
-
G
38
T
T
A
C
C
G
-
7
T
-
C
2
-
G
C
A
A
-
T
G
A
C
2
G
2
A
C
T
T
-
3
A
A
7
-
A
C
C
2
C
T/C
G
A
A
A
A
C
A/12
T
C
C
G
C
-
T
G
-
G/2