Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 60,115 (bp)   Positions: 446
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.08
.553
.001
.001
.001
.016
.0
.01
.027
.007
.062
.1
.004
--
.077
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
--
--
.003
.029
.006
.155
.004
.0
.468
.078
.015
.056
.013
.047
.0
.008
.853
.001
.042
.002
.506
.029
.451
.248
.023
.055
.164
.001
.005
.025
.048
.001
.067
.045
.002
.08
.026
--
--
--
--
--
--
.061
.029
.206
.085
.003
.002
.004
.004
.002
.003
.0
.001
.016
.01
.237
.016
.022
.058
.164
.099
.157
.263
.199
.02
.031
.029
.236
.002
.218
.516
.025
.033
.79
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.011
.021
.004
.0
.009
.017
.088
.002
.066
.395
.001
.005
.023
.008
.029
.028
.001
.006
.059
--
--
--
.268
.003
.089
.09
.072
.085
--
--
--
.013
.006
.004
.0
.005
.398
.145
.122
.664
.064
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.144
.212
.025
.011
.09
.024
.017
.11
.02
.353
.082
.172
.025
.044
.039
.001
.005
.007
.009
.102
--
--
--
--
--
.258
.206
.472
.471
--
--
.003
.002
.184
.484
.06
.078
.168
.305
.02
.018
.066
.002
.005
.397
.404
.115
.021
.071
.178
.246
.12
.173
.286
.466
.505
.561
.236
.068
.003
.002
.597
.0
.01
.222
.443
.028
.019
.002
.009
.001
.002
.002
.003
.01
.002
.0
.034
.269
.265
.26
.01
.124
.51
.643
.018
.0
.493
.019
.039
.42
.386
.003
.026
.017
.016
.001
.041
.079
.01
.005
.0
.0
.052
.953
.004
.021
.865
.003
.031
.053
.148
.015
.034
.001
.002
.034
.04
.123
.005
.003
.007
.005
.049
.235
.637
.736
.011
--
--
.096
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.018
.067
.078
.01
.001
.016
.137
.0
.006
.0
.049
.0
.038
.021
.113
.222
.265
.077
--
--
--
.006
.06
.056
.045
.025
.017
--
--
--
--
--
.292
.001
.05
.005
.227
.3
.309
.26
.01
.589
.011
.025
.009
.002
.001
.027
.003
.166
.15
--
.372
.433
.523
.02
.04
.277
.216
.027
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.035
.184
.053
.001
.031
.0
.006
.007
.002
.063
.009
.012
.03
.0
.046
.007
.024
.021
.008
.013
.013
.001
.002
.001
.394
.0
.012
.005
.003
.009
.015
.747
.696
--
--
--
--
--
--
--
--
.742
.936
.01
.013
.011
.036
.008
.002
.001
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
Tmod3
T
C
G
T
6
G
T
A
C
T
C
G
A
C
C
A
T
T
5
C
C
T
G
10
G
A
C
A
T
C
T
A
A
A
T
A
T
C
G
G
G
T
A
C
2
T
G
G
G
4
A
G
G
G
A
A
T
3
A
G
G
G
C
G
T
T
C
A
T
A
C
C
C
G
T
5
G
G
C
C
C
C
T
T
G
A
T
G
C
A
A
T
T
G
G
C
C
C
C
C
A
T
A
C
A
T
A
C
C
C
G
C
T
A
C
T
G
G
G
T
T
T
G
C
A
G
G
A
G
G
T
T
5
A
G
A
T
T
C
A
G
T
C
C
A
G
C
T
G
C
A
T
T
T
G
C
G
T
A
C
C
C
A
A
T
A
A
C
2
2
A
G
G
T
A
16
C
C
16
T
C
C
C
C
G
G
A
T
C
T
T
G
T
A
A
G
C
C
T
66
G
T
A
G
T
T
2
A
C
C
C
A
T
A
C
G
C
C
G
T
C
G
T
C
A
3
G
T
C
C
G
19
C
G
G
G
T
C
T
T
T
C
C
T
C
3
G
C
A
T
C
C
A
8
T
A
11
G
C
T
G
C
C
23
C
G
G
T
G
A
G
G
T
T
T
C
T
8
T
C
T
C
C
A
C
T
C
T
T
C
A
G
108
A
G
G
T
A
T
T
2
A
G
A
A
A
T
T
C
A
A
A
T
A
T
G
G
C
T
A
C
C
C
C
G
C
A
C
C
A
C
G
G
T
A
A
A
G
3
C
A
T
A
T
A
G
C
C
C
G
C
A
T
A
A
T
G
G
G
A
G
A
G
G
46
G
A
A
C
G
C
T
T
C
T
T
G
G
G
G
T
A
G
G
A
G
C
T
C
C
A
C
G
A
A
A
A
T
G
T
G
C
C
C
T
T
C
A
C
T
G
C
C
C
C
A
G
A
T
C
A
A
G
G
G
4
A
9
A
C
C
C
G
A
A
T
G
T
T
A
C
G
T
G
T
C
  82,035,657
  82,035,837
  82,035,953
  82,036,730
  82,036,924
  82,037,477
  82,038,322
  82,039,524
  82,039,740
  82,039,802
  82,039,834
  82,040,324
  82,040,376
  82,041,920
  82,042,298
  82,043,086
  82,043,213
  82,043,641
  82,043,659
  82,043,727
  82,043,829
  82,043,931
  82,043,967
  82,044,120
  82,044,145
  82,044,469
  82,044,644
  82,044,892
  82,045,199
  82,045,298
  82,045,745
  82,045,896
  82,046,533
  82,046,720
  82,046,909
  82,047,451
  82,047,853
  82,048,559
  82,048,790
  82,049,015
  82,049,863
  82,051,401
  82,051,648
  82,052,487
  82,052,584
  82,052,792
  82,053,293
  82,053,340
  82,053,434
  82,054,664
  82,055,051
  82,055,372
  82,056,161
  82,057,520
  82,057,646
  82,057,670
  82,058,363
  82,058,497
  82,058,555
  82,058,733
  82,058,947
  82,058,989
  82,059,159
  82,059,260
  82,059,341
  82,059,647
  82,059,808
  82,059,864
  82,059,884
  82,060,256
  82,060,522
  82,060,785
  82,060,790
  82,060,825
  82,061,036
  82,061,116
  82,061,168
  82,061,209
  82,061,246
  82,061,352
  82,061,376
  82,061,620
  82,061,631
  82,061,645
  82,061,710
  82,061,712
  82,061,738
  82,061,743
  82,061,986
  82,062,037
  82,062,132
  82,062,134
  82,062,209
  82,062,283
  82,062,538
  82,062,792
  82,062,859
  82,063,072
  82,063,102
  82,063,161
  82,063,804
  82,063,946
  82,064,027
  82,064,105
  82,064,343
  82,064,925
  82,064,975
  82,065,165
  82,065,346
  82,065,356
  82,065,431
  82,065,454
  82,065,475
  82,065,501
  82,065,741
  82,065,771
  82,065,826
  82,066,048
  82,066,278
  82,066,289
  82,066,349
  82,066,432
  82,066,466
  82,066,494
  82,066,691
  82,066,999
  82,067,004
  82,067,020
  82,067,302
  82,067,455
  82,067,512
  82,067,796
  82,068,072
  82,068,111
  82,068,266
  82,068,291
  82,068,356
  82,068,364
  82,068,394
  82,068,529
  82,068,636
  82,068,661
  82,068,693
  82,068,857
  82,068,988
  82,069,255
  82,069,266
  82,069,293
  82,069,514
  82,069,545
  82,069,698
  82,069,704
  82,069,717
  82,069,726
  82,069,820
  82,069,827
  82,069,832
  82,070,032
  82,070,051
  82,070,214
  82,070,281
  82,070,298
  82,070,372
  82,070,387
  82,070,467
  82,070,558
  82,070,580
  82,070,639
  82,070,653
  82,070,656
  82,070,749
  82,070,753
  82,070,754
  82,070,840
  82,070,895
  82,071,065
  82,071,301
  82,071,493
  82,071,527
  82,071,595
  82,071,605
  82,071,693
  82,071,796
  82,071,843
  82,071,971
  82,072,047
  82,072,078
  82,072,156
  82,072,181
  82,072,183
  82,072,271
  82,072,329
  82,072,476
  82,072,544
  82,072,576
  82,072,769
  82,072,898
  82,073,048
  82,073,278
  82,073,316
  82,073,466
  82,073,554
  82,073,629
  82,073,646
  82,073,650
  82,073,667
  82,073,721
  82,073,748
  82,073,827
  82,073,829
  82,073,938
  82,073,939
  82,074,075
  82,074,087
  82,074,221
  82,074,279
  82,074,332
  82,074,369
  82,074,565
  82,074,623
  82,074,734
  82,074,784
  82,074,832
  82,074,936
  82,074,944
  82,074,968
  82,074,972
  82,074,991
  82,074,997
  82,075,042
  82,075,294
  82,075,387
  82,075,611
  82,076,139
  82,076,195
  82,076,540
  82,076,576
  82,076,748
  82,076,878
  82,076,974
  82,076,987
  82,077,085
  82,077,151
  82,077,176
  82,077,353
  82,077,491
  82,077,502
  82,077,511
  82,077,628
  82,077,896
  82,077,898
  82,077,903
  82,077,938
  82,077,963
  82,078,163
  82,078,236
  82,078,248
  82,078,390
  82,078,416
  82,078,517
  82,078,528
  82,079,238
  82,079,240
  82,079,242
  82,079,342
  82,079,595
  82,079,684
  82,079,693
  82,079,885
  82,079,915
  82,079,933
  82,079,976
  82,080,074
  82,080,099
  82,080,106
  82,080,139
  82,080,147
  82,080,168
  82,080,190
  82,080,396
  82,080,405
  82,080,439
  82,080,449
  82,080,450
  82,080,519
  82,080,545
  82,080,641
  82,080,663
  82,080,869
  82,080,880
  82,080,973
  82,081,055
  82,081,283
  82,081,426
  82,081,438
  82,081,710
  82,081,721
  82,082,010
  82,082,097
  82,082,132
  82,082,358
  82,082,482
  82,082,659
  82,082,685
  82,082,761
  82,083,058
  82,083,185
  82,083,211
  82,083,381
  82,083,390
  82,083,453
  82,083,549
  82,083,561
  82,083,581
  82,083,764
  82,083,786
  82,083,798
  82,083,803
  82,083,879
  82,083,883
  82,083,890
  82,083,902
  82,083,906
  82,083,917
  82,084,045
  82,084,239
  82,084,306
  82,084,398
  82,084,721
  82,084,959
  82,085,381
  82,085,404
  82,085,507
  82,085,525
  82,085,584
  82,085,607
  82,085,624
  82,085,629
  82,085,654
  82,085,678
  82,085,858
  82,086,196
  82,086,246
  82,086,270
  82,086,350
  82,086,384
  82,086,407
  82,086,420
  82,086,463
  82,086,506
  82,086,511
  82,086,557
  82,086,609
  82,086,612
  82,086,695
  82,086,726
  82,086,873
  82,087,105
  82,087,177
  82,087,311
  82,087,465
  82,087,476
  82,087,486
  82,087,737
  82,087,860
  82,088,112
  82,088,137
  82,088,348
  82,088,366
  82,088,409
  82,088,461
  82,088,472
  82,088,501
  82,088,568
  82,088,765
  82,088,861
  82,088,967
  82,088,994
  82,089,074
  82,089,359
  82,089,519
  82,089,568
  82,089,576
  82,089,697
  82,089,777
  82,089,785
  82,089,892
  82,090,028
  82,090,072
  82,090,073
  82,090,132
  82,090,169
  82,090,360
  82,090,567
  82,090,718
  82,091,140
  82,091,202
  82,091,549
  82,091,614
  82,091,618
  82,091,623
  82,091,634
  82,091,819
  82,092,022
  82,092,108
  82,092,109
  82,092,121
  82,092,139
  82,092,142
  82,092,179
  82,092,334
  82,092,387
  82,092,406
  82,092,673
  82,092,674
  82,092,762
  82,092,995
  82,093,047
  82,093,073
  82,093,102
  82,093,341
  82,093,497
  82,093,499
  82,093,513
  82,093,830
  82,093,949
  82,093,954
  82,093,964
  82,093,988
  82,094,006
  82,094,015
  82,094,023
  82,094,026
  82,094,037
  82,094,048
  82,094,288
  82,094,292
  82,094,361
  82,094,370
  82,094,373
  82,094,844
  82,094,909
  82,094,913
  82,094,975
  82,095,194
  82,095,236
C
T
A
C
-
T
C
2
T
C
T
2
19
5
5/9
2
C
C
-
T
T
2
T
-
C
G
15
6
A
T
C
C
G
G
C
G
A
2
T
A
C
C
G
2
-
A
T
A
A
-
-
A
A
A
T
-
-
-
G
A
A
4
G
A
C
C
T
3
C
G
T
T
T
C
C
-
A
T
T
A
G
T
2
C
C
G
C
2
G
T
T
C
C
C
T
5
T
T
T
T
2
C
C
A
-
C
G
A
T
T
-
T
C
11
2
C
-
A
A
A
C
C
A
T
2
C
A
G
C
C
A
C
-
G
A
G
C
C
G
G
T
-
A
2
G
A
T
A
A
G
G
C
C
19
A
G
A
C
C
G
T
G
G
G
C
-
T
T
-
2/-
G
C
A
C
G
-
T
T
-
C
T
T
30
-
A
A
G
C
T
C
C
A
C
C
G
A
T
T
A
-
A
C
G
A
C
G
-
5
T
T
T
T
C
8
T
A
T
10
A
C
A
2
C
10
G
-
-
C
T
A
C
-
2
A
A
T
11
A
C
-
A
T
T
C
T
-
A
2
T
C
G
T
T
-
G
T
-
C
T
C
A
C/-
-/25
23/-
T
A
A
A
A
C
A
-
C
C
A
G
C
-
A
T
A
T
A
C
T
C
A
C
C
3
C
A
-
-
A
5
2
G
C
C
-
-
A
C
20
T
5
C
T
T
4
8
2
T
2
A
A
T
G
G
T
5
-
T
A
A
G
T
3
C
T
A
A
C
G
C
2
T
-
T
G
C
G
C
C
A
T
T
A
T
A
T
C
G
G
9/6
-
C
T
C
-
G
T
A
-
A
2
2
G
A
T
-
C
2
3
C
T
A
A
A
C
G
A
C
G
A
A
17
4
11
G
T
C
T
2
G
G
C
A
C
A
G
T
A
C
C
15
C
T
C
A
A
G
T
G
2
T
G
C
T
G
3
A
T
A
-
C
-
C
A
C/13
C/-
A
A/2
A/2
C
A
G
C
G
-
C
C
C
C
G