Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 364,863 (bp)   Positions: 130
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.0
.33
.001
.327
.001
.0
--
.069
.003
.012
.079
.008
.051
.055
.085
.005
--
--
.4
.02
.009
.065
.012
.921
.002
.989
.022
.004
.019
.0
.606
.008
.002
.001
.001
.027
.768
.706
.068
.116
.004
.005
.007
.001
.0
.055
.026
.0
.033
--
.066
.03
.858
.131
.007
.001
.123
.383
.021
.021
.009
.013
.024
.524
.043
.138
.0
.0
.009
.013
.001
.042
.003
.011
.001
.009
--
--
--
.002
--
--
.164
.092
.004
.0
.994
.015
.001
.001
.029
--
.351
.022
.075
--
.023
.15
.01
.021
.017
.018
.029
.006
.039
--
.54
.472
.013
--
.007
.001
.043
--
--
.005
.002
--
--
--
.201
--
--
.0
--
--
.001
--
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102546680
--
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
G
2
C
C
G
C
T
54
A
C
T
A
C
3
2
T
G
T
A
C
A
T
A
G
T
A
T
A
A
G
C
C
T
C
A
C
G
9
G
G
C
G
3
A
T
T
C
C
G
G
G
T
A
G
A
T
C
G
G
A
T
C
A
T
A
A
A
G
T
C
G
G
2
G
T
3
4
C
T
T
C
T
G
4
A
4
T
C
C
8
6
C
G
T
T
2
A
G
G
6
G
A
A
4
8
2
2
4
G
C
T
A
6
G
48
4
T
6
T
T
A
7
G
A
2
3
C
C
2
G
  127,247,460
  127,248,799
  127,249,638
  127,250,941
  127,251,323
  127,251,584
  127,251,591
  127,251,752
  127,251,964
  127,252,157
  127,252,179
  127,252,268
  127,252,404
  127,252,424
  127,252,425
  127,252,439
  127,252,653
  127,253,711
  127,253,799
  127,254,031
  127,254,182
  127,254,576
  127,256,225
  127,256,702
  127,259,223
  127,260,255
  127,262,096
  127,263,642
  127,263,692
  127,263,719
  127,264,086
  127,264,487
  127,266,787
  127,268,312
  127,268,313
  127,268,348
  127,268,752
  127,269,120
  127,269,129
  127,270,007
  127,271,526
  127,271,654
  127,272,520
  127,272,522
  127,273,118
  127,274,662
  127,274,730
  127,274,753
  127,275,282
  127,278,107
  127,278,180
  127,278,327
  127,278,786
  127,279,481
  127,280,520
  127,281,975
  127,282,776
  127,283,164
  127,283,202
  127,284,747
  127,286,621
  127,286,626
  127,286,628
  127,286,878
  127,287,212
  127,287,427
  127,288,148
  127,288,484
  127,288,819
  127,288,964
  127,289,521
  127,290,898
  127,291,490
  127,291,646
  127,292,547
  127,293,980
  127,294,421
  127,296,891
  127,297,114
  127,299,450
  127,300,132
  127,301,420
  127,301,477
  127,303,078
  127,304,591
  127,322,079
  127,322,325
  127,323,109
  127,327,870
  127,328,322
  127,328,324
  127,344,829
  127,358,262
  127,359,462
  127,377,852
  127,383,386
  127,387,304
  127,389,774
  127,423,528
  127,423,935
  127,423,953
  127,423,957
  127,423,960
  127,424,019
  127,434,238
  127,434,244
  127,441,796
  127,444,358
  127,453,556
  127,464,324
  127,464,327
  127,469,672
  127,472,323
  127,476,617
  127,504,346
  127,512,172
  127,513,249
  127,513,257
  127,523,625
  127,524,670
  127,526,683
  127,540,413
  127,550,235
  127,550,459
  127,554,244
  127,563,904
  127,573,774
  127,577,557
  127,587,913
  127,592,044
3
-
5
T
A
T
C
-
G
G
C
C
2
-
2/-
C
A
T/C
4
3
3
T/5
-
A
A
G
-
G
G
A
T
T
G
C/3
A/-
19
A
-
2
2
G
A
3/-
A/-
A
C
2
2
A
A
-
C
G
A
C
A
A
T
2
9
7
2
C
C
-
-
-
A
C
T
A
A
2/-
A
102
-
-
C/-
G
5
T
A
A
-
G
-
4
2
T
8/-
-
3
3
T/-
T/-
2/-
3
72
42
-
C
C
T
4/-
8/-
2/-
2/-
4/-
G/-
C/2
T/-
A/-
6/-
55
-
-
T/3
6/-
3
T/5
A/-
7/-
-
-
2/-
-
4
7
2/-
-