Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 364,863 (bp)   Positions: 403
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.002
.002
.0
.005
.33
.004
--
.069
.156
.003
.051
.055
.085
.005
--
--
.4
.02
.05
.065
.002
.989
.022
.004
.0
.038
.001
.0
.0
.001
.002
.001
.0
.002
.004
.003
.005
.055
.0
.0
.002
.025
.005
.03
.061
.07
--
.007
.005
.001
.003
.003
.123
.405
.378
.372
.021
.024
.176
.043
.001
.138
.001
.0
.568
.029
.0
.038
.371
.003
.011
.008
.049
.026
--
.097
.163
.147
.002
--
--
.083
.673
.005
.456
--
.092
.003
.0
.994
.0
.036
.018
.063
--
.184
.021
.088
.115
.004
.107
.004
.005
--
.012
.006
.022
--
.42
--
.022
.356
.351
.071
.0
--
--
.053
.022
.085
.001
.0
.211
.001
.001
.0
.0
.001
.009
.0
.0
.0
.069
.051
.078
.116
.001
.009
.024
.006
.013
.015
.328
.163
.14
.045
.091
.284
.036
.019
.001
.002
.013
.222
.091
.469
.482
.417
.603
.078
.113
.022
.037
.033
.035
.012
.027
.435
.011
.001
.343
--
--
.0
--
--
.012
.013
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.215
.587
.023
--
--
--
.001
.145
.006
.002
.103
.009
.014
--
--
.084
.083
.024
.029
.248
.008
.39
.182
.031
.006
.006
.047
.139
.163
.047
--
.112
--
--
.156
.15
.01
.021
.017
.018
.029
.165
.011
.534
.004
.017
.019
.002
.49
.002
.008
.032
--
.003
.033
.091
.137
.095
.903
.168
.485
.003
--
--
.04
--
.0
.546
.004
.023
.02
.095
.128
.002
.062
.13
.035
.031
.001
.0
.002
.001
.002
.053
.01
.17
.013
.003
.037
.078
.085
.997
.986
.008
.472
.402
.014
--
--
.05
.112
.132
.044
.0
.017
--
.001
.013
--
--
.005
.108
.001
.005
.043
.007
.008
.001
.006
.001
.082
.113
.037
.002
.111
.114
.007
.023
.313
.014
.12
.17
.006
.009
.221
.155
.002
.0
--
.05
--
--
--
--
--
.015
.002
.024
.024
.099
.006
.002
.005
.408
.002
.018
.218
.019
.005
.041
--
.004
.133
.014
.887
.038
.004
.001
.001
.001
.005
.013
--
--
--
.005
.002
--
--
--
--
--
--
.002
.0
--
--
--
.001
--
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102546680
--
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
Tjp1
G
G
2
T
C
G
54
A
A
C
3
2
T
G
A
C
C
A
2
A
A
T
A
A
G
A
T
T
C
G
C
2
4
G
G
C
3
C
C
G
G
C
G
A
C
G
A
T
T
C
T
C
G
T
T
T
A
T
T
A
T
A
G
T
T
C
G
2
2
G
T
8
8
C
T
G
4
G
C
A
G
A
G
C
18
A
A
T
T
C
C
T
C
G
9
T
G
C
C
T
4
C
4
G
C
G
2
G
10
A
A
C
T
C
G
16
2
T
T
G
T
A
C
T
T
G
G
G
C
C
G
G
C
C
A
T
C
C
2
T
G
C
A
T
G
C
12
G
C
C
A
T
T
14
A
C
A
A
G
G
G
T
G
C
A
G
A
G
A
G
A
A
A
G
A
G
T
G
A
G
G
G
G
G
G
T
C
A
C
A
G
T
G
T
A
A
G
A
A
G
T
T
A
A
T
G
T
A
G
T
C
A
C
A
G
12
T
G
2
26
A
C
T
A
T
4
3
G
T
T
G
T
A
C
A
A
G
C
A
T
12
G
T
T
T
C
G
G
6
G
A
A
4
C
T
T
C
C
C
2
T
A
G
T
G
C
4
A
3
A
T
C
C
T
5
C
A
4
G
G
C
C
A
G
C
C
T
G
G
G
C
C
C
G
C
C
A
T
G
T
T
C
A
G
G
A
G
G
A
T
T
A
5
6
T
G
C
2
25
C
T
4
T
T
T
T
G
G
C
A
C
G
T
T
C
G
G
A
8
38
A
T
A
G
A
C
10
G
C
G
G
G
2
T
C
G
G
C
C
T
T
G
T
C
G
A
T
G
C
G
G
T
C
T
G
T
G
A
C
A
A
G
A
C
C
4
48
T
6
T
T
T
2
G
A
2
2
3
G
C
C
2
G
  127,245,313
  127,247,210
  127,248,799
  127,249,173
  127,249,638
  127,251,506
  127,251,752
  127,251,964
  127,252,011
  127,252,157
  127,252,424
  127,252,425
  127,252,439
  127,252,653
  127,252,671
  127,252,700
  127,254,031
  127,254,182
  127,256,224
  127,256,225
  127,260,255
  127,262,096
  127,263,642
  127,263,692
  127,263,985
  127,265,297
  127,266,247
  127,266,951
  127,267,021
  127,267,287
  127,268,312
  127,268,884
  127,269,708
  127,270,772
  127,271,654
  127,272,192
  127,272,520
  127,274,730
  127,275,109
  127,275,282
  127,276,674
  127,277,357
  127,277,540
  127,278,786
  127,278,792
  127,279,935
  127,281,566
  127,281,975
  127,282,411
  127,282,776
  127,282,985
  127,282,986
  127,283,164
  127,283,192
  127,283,203
  127,283,204
  127,284,747
  127,286,878
  127,287,211
  127,287,427
  127,287,826
  127,288,148
  127,288,327
  127,288,819
  127,289,741
  127,289,932
  127,290,103
  127,290,970
  127,291,201
  127,291,646
  127,292,547
  127,294,417
  127,296,203
  127,296,454
  127,299,450
  127,299,924
  127,299,925
  127,300,023
  127,300,132
  127,300,854
  127,301,477
  127,301,606
  127,302,514
  127,302,809
  127,303,064
  127,303,925
  127,304,591
  127,305,282
  127,322,325
  127,323,109
  127,328,321
  127,348,926
  127,349,067
  127,349,119
  127,349,217
  127,349,441
  127,349,727
  127,350,252
  127,350,257
  127,350,485
  127,350,832
  127,351,985
  127,352,121
  127,353,502
  127,353,809
  127,355,054
  127,355,364
  127,355,406
  127,358,056
  127,358,279
  127,358,740
  127,359,461
  127,359,462
  127,362,791
  127,367,193
  127,372,575
  127,372,770
  127,377,120
  127,377,852
  127,381,640
  127,381,827
  127,382,095
  127,382,143
  127,382,183
  127,382,198
  127,382,206
  127,382,230
  127,382,281
  127,382,394
  127,382,421
  127,382,575
  127,382,626
  127,382,712
  127,382,726
  127,382,738
  127,382,753
  127,382,781
  127,382,788
  127,382,796
  127,382,836
  127,382,842
  127,382,843
  127,382,965
  127,383,050
  127,383,057
  127,383,073
  127,383,099
  127,383,197
  127,383,246
  127,383,256
  127,383,317
  127,383,321
  127,383,327
  127,383,374
  127,383,521
  127,383,800
  127,383,806
  127,383,813
  127,383,829
  127,383,927
  127,383,954
  127,384,056
  127,384,194
  127,384,225
  127,384,226
  127,384,237
  127,384,247
  127,384,312
  127,384,382
  127,384,392
  127,384,765
  127,385,020
  127,385,026
  127,385,195
  127,385,401
  127,385,424
  127,385,568
  127,385,571
  127,385,579
  127,385,671
  127,385,750
  127,385,765
  127,385,867
  127,385,868
  127,385,881
  127,386,187
  127,386,220
  127,386,264
  127,386,398
  127,386,400
  127,386,407
  127,386,427
  127,386,431
  127,386,456
  127,386,457
  127,386,499
  127,386,576
  127,386,703
  127,386,919
  127,386,947
  127,387,056
  127,387,074
  127,387,096
  127,387,156
  127,387,205
  127,387,305
  127,387,497
  127,387,499
  127,387,501
  127,387,521
  127,387,595
  127,387,946
  127,388,227
  127,388,736
  127,389,774
  127,403,376
  127,403,528
  127,403,529
  127,404,437
  127,404,482
  127,405,191
  127,405,266
  127,405,402
  127,405,838
  127,405,862
  127,406,438
  127,406,461
  127,406,756
  127,407,252
  127,407,435
  127,407,728
  127,408,163
  127,408,180
  127,408,909
  127,409,024
  127,409,119
  127,412,146
  127,412,767
  127,413,752
  127,415,735
  127,417,901
  127,418,498
  127,419,434
  127,420,467
  127,421,354
  127,421,484
  127,421,742
  127,423,528
  127,423,935
  127,423,953
  127,423,957
  127,423,960
  127,424,019
  127,424,423
  127,424,488
  127,424,659
  127,425,551
  127,426,391
  127,427,345
  127,427,650
  127,431,212
  127,431,227
  127,431,321
  127,431,740
  127,432,104
  127,432,364
  127,432,904
  127,433,696
  127,433,698
  127,434,954
  127,436,512
  127,437,305
  127,437,380
  127,437,829
  127,439,497
  127,439,501
  127,440,549
  127,441,794
  127,444,062
  127,444,355
  127,444,691
  127,445,144
  127,445,425
  127,446,182
  127,446,403
  127,446,783
  127,449,010
  127,449,366
  127,450,202
  127,450,484
  127,450,540
  127,450,954
  127,451,045
  127,451,239
  127,451,376
  127,451,549
  127,451,749
  127,451,922
  127,451,959
  127,451,972
  127,452,344
  127,452,623
  127,452,642
  127,452,812
  127,452,850
  127,453,081
  127,453,556
  127,453,773
  127,458,228
  127,458,669
  127,458,797
  127,459,799
  127,459,824
  127,459,852
  127,460,029
  127,460,171
  127,461,935
  127,462,281
  127,463,735
  127,464,324
  127,464,327
  127,467,453
  127,469,671
  127,469,785
  127,472,316
  127,476,386
  127,476,617
  127,478,828
  127,482,334
  127,482,365
  127,482,378
  127,482,643
  127,482,707
  127,482,802
  127,482,895
  127,483,050
  127,483,131
  127,483,132
  127,483,190
  127,483,253
  127,483,508
  127,483,565
  127,483,733
  127,483,739
  127,483,773
  127,483,868
  127,484,082
  127,484,446
  127,484,461
  127,485,708
  127,486,169
  127,486,536
  127,486,872
  127,486,974
  127,487,004
  127,487,013
  127,487,074
  127,487,989
  127,488,099
  127,488,145
  127,489,198
  127,489,422
  127,489,524
  127,489,687
  127,489,841
  127,489,863
  127,489,982
  127,490,013
  127,490,340
  127,490,360
  127,490,735
  127,490,759
  127,491,050
  127,491,474
  127,491,802
  127,492,732
  127,493,111
  127,493,157
  127,493,442
  127,494,459
  127,494,460
  127,494,515
  127,494,567
  127,495,512
  127,500,038
  127,500,039
  127,504,346
  127,513,249
  127,513,257
  127,523,625
  127,524,670
  127,536,231
  127,549,134
  127,550,235
  127,550,459
  127,554,123
  127,554,244
  127,563,904
  127,570,559
  127,577,262
  127,577,557
  127,587,913
  127,592,044
C
C
-
A
2
2
-
G
-
G
3/-
2/-
C
A
T
T
3
3
-
A/-
G
-
G
G
C
-
C
C
G
T
3
-
-
3
A
T
-
2
T
A
A
A
A
G
A
A
-
A
G
A
A
A
-
3
-
G
9
C
T/2
-
C
-
T
C
C
T
A
-
-
A
102
-
-
A
3
G/5
-
A
T
G
A
G
A
T
-
G
G
C
13
2
9
C
3
A
-
C
A
5
T
C
-
3
-
-
T
A
-
7
-
A/2
G
4/CT
T/-
T
A
-
-
2
-
C
C
G
T
G
C
7
A
C
T
G
C
A
T
T
C
A
A
G
-
C
A
T
G
2
3
3
-
A
T
A
C
C
-
-
G
G
-
T
-
A
T
2
C
G
G
A
-
A
G
22
G
G
G
C
G
A
G
C
G
C
A
2
8
6
T
A
T
G
A
-
C
G
A
G
G
G
T
T
2
T
G
4
G
C
C
3
C
C
C
4
T
G
G
G
72
-
C
A
2/-
26/-
A/-
T
C
T
C
-
-
A
C
G
A
G
G
G
A/3
G
A
A
T
-
-
A
-
C
C
T
C
42
-
C
C
T
-
T
C
TC/3
A
T
G
-
C
G
3/5
3
G/2
T
-
-
-
C
3/TA
T
T
G
-
12
G
-
A
11
T
T
G
A
T
T
9
A
A
A
A
T
T
A
T
T
-
C
-
C
C
T
G
8
C
G
-
C
C
A
2
G
-
6/-
-
6
T
2/-
-
C/2
T/-
-
T/2
G
3
C
55
G/2
T
-
2
A
C
C
T
T
2
T
-
-
AT/3
A
T
A
8
A
-
A
T
A
2
A
-
C
3
3
T
A
T
C
C
C
C
A
A
C
G
T
T
T
T
A
-
3
A
C
A
C
T
G
G
T
G
-
C/3
4/-
-
T/3
6/-
3
5
T/-
2/-
-
-
2/-
2/-
-
GA/6
5/CT
7
2/-
-