Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 109,085 (bp)   Positions: 457
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.001
.14
.002
.019
.011
.06
.0
.009
.033
.007
.031
--
.028
.017
--
--
.024
.032
.001
.002
.241
.008
.019
.002
.106
.0
.006
.042
.047
.007
.095
.576
.004
--
--
--
.002
.643
.102
.007
.06
.024
.121
.019
.0
.13
.016
.032
.04
.291
.069
.185
.48
.037
.032
.294
.289
.001
.0
.002
.017
.264
--
--
--
.005
.013
.0
.001
.165
.002
.099
.107
.099
.038
.001
.048
.006
.111
.091
.0
.003
.0
.003
.003
.0
.003
.029
.002
.011
.011
.003
.109
.107
.097
.094
.514
.074
.327
.135
.003
.018
.006
--
--
.022
.039
.024
.02
.004
.439
.156
.123
.019
.002
.007
.376
.38
.371
.0
.001
.0
.0
.001
.027
.087
.061
.233
.005
.094
--
--
.07
.058
.014
.167
.017
.182
.01
.09
.056
.211
.015
.054
.123
.006
.01
.012
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.378
.032
.0
.0
.005
.004
.772
.064
.007
.002
.001
.447
.004
.0
.0
.0
.0
.001
.178
.002
.009
.001
.03
.032
.08
.001
.001
.867
.005
.011
.01
.0
.001
.003
.012
.0
.0
.0
.0
.001
.006
.002
.006
.023
.004
.037
.065
.008
.003
.023
.002
.021
.005
.078
.016
.001
.07
.002
.462
.033
.0
.004
.001
.128
.009
.003
.09
.042
.003
.198
.063
.222
.091
.085
--
.02
.234
.011
.001
.14
.001
.792
.02
--
.0
.028
.015
.043
.027
.088
.029
.047
.024
.384
.396
.006
.04
.037
.026
.005
.058
.013
.167
.01
.093
.03
.003
.003
.001
.021
.06
.011
.451
.015
.032
.186
.157
.054
.011
.014
.016
.023
.08
.051
.007
.065
.034
.127
.02
.005
.01
.001
.008
.002
.002
.105
.028
.447
.008
.854
.602
.35
.38
--
--
--
--
.019
.217
.215
.092
.073
.003
.728
.93
.922
.031
--
--
.002
.128
.012
.051
.067
.034
.14
.126
.027
.029
.056
.031
.005
.0
.02
.077
.007
.023
.001
.001
.126
.002
.006
.005
.001
.001
.001
.001
.02
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.048
.031
.08
.059
.024
.023
--
.04
.096
.002
.005
.054
.019
.006
.009
.001
.001
.209
.025
.045
.005
.023
.026
.011
.081
.065
.126
.087
.03
.07
.354
.002
.59
.015
.011
.009
.998
.04
.065
.712
.019
.336
.0
.013
.001
.008
.0
.084
.003
.0
.125
.033
--
.001
.003
.006
.23
.099
.233
.316
.598
.017
.156
.0
.264
.002
.001
.014
.014
.0
.003
.0
.0
.001
.002
.006
.897
.37
.05
.227
.0
.026
.0
.008
.004
.036
.005
.003
.002
.002
.047
.002
.004
.038
.006
.029
.0
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
Tec
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
C
A
A
C
T
C
4
A
G
3
6
C
G
A
T
4
T
A
A
G
G
C
C
A
C
G
T
T
T
T
8
T
C
G
A
T
C
C
T
T
T
G
A
C
T
A
T
12
10
C
C
C
A
G
G
18
16
T
T
T
A
A
C
G
G
C
T
C
A
G
T
C
G
3
A
C
T
C
T
T
G
C
T
C
C
T
T
8
T
T
T
C
A
G
4
2
A
G
G
C
C
T
T
A
A
C
C
2
A
A
C
G
T
T
G
C
C
T
G
G
T
C
A
C
G
A
A
A
A
A
T
G
9
T
T
C
A
A
T
A
T
A
A
T
C
C
8
A
A
C
A
A
A
8
T
A
T
A
C
G
T
G
T
C
G
C
G
C
G
G
G
C
C
T
G
A
T
T
C
T
A
C
A
C
G
T
A
T
A
T
A
A
C
C
T
G
A
C
T
T
T
A
G
C
A
C
A
A
C
7
C
T
G
C
A
A
C
A
C
C
C
A
C
T
C
G
C
A
G
A
G
A
T
C
T
8
C
T
C
C
G
C
G
T
5
4
T
A
T
C
4
3
T
C
C
T
A
G
A
C
G
C
G
A
G
C
A
A
C
A
T
A
G
C
A
A
C
T
C
A
T
T
G
A
C
C
C
T
C
A
C
14
A
A
C
A
4
4
A
G
T
2
15
C
C
G
G
G
G
G
C
T
A
T
C
5
T
T
G
T
T
A
C
G
A
A
C
C
C
A
T
G
G
A
C
C
23
A
T
G
G
A
G
T
2
4
C
C
C
A
4
C
16
8
10
A
G
A
G
T
T
A
C
A
T
A
G
G
A
C
A
C
G
C
T
G
C
G
G
T
C
C
A
A
G
G
C
C
T
G
C
3
C
G
T
C
A
G
2
T
T
C
G
A
T
T
C
A
G
A
C
C
5
C
G
T
2
C
C
G
C
C
G
A
A
C
C
G
T
T
G
C
C
T
G
T
C
G
T
A
20
T
G
G
C
G
T
G
G
C
T
7
A
A
C
A
  37,729,480
  37,730,388
  37,730,807
  37,730,891
  37,731,001
  37,731,723
  37,732,356
  37,732,376
  37,732,583
  37,733,824
  37,735,267
  37,735,293
  37,735,379
  37,736,090
  37,736,827
  37,739,464
  37,739,499
  37,739,728
  37,739,960
  37,740,453
  37,740,526
  37,740,717
  37,741,147
  37,742,088
  37,742,664
  37,742,977
  37,743,428
  37,744,294
  37,744,542
  37,744,976
  37,745,071
  37,746,133
  37,746,272
  37,746,756
  37,747,459
  37,747,470
  37,747,471
  37,747,604
  37,747,759
  37,747,900
  37,748,364
  37,748,486
  37,748,562
  37,748,580
  37,748,728
  37,748,949
  37,748,996
  37,749,212
  37,749,386
  37,749,388
  37,749,529
  37,749,610
  37,749,915
  37,750,264
  37,750,332
  37,750,545
  37,751,414
  37,751,416
  37,751,505
  37,751,542
  37,751,704
  37,751,939
  37,752,211
  37,752,319
  37,752,340
  37,752,498
  37,752,578
  37,752,750
  37,753,336
  37,753,343
  37,753,461
  37,754,299
  37,754,443
  37,754,601
  37,754,603
  37,755,087
  37,755,856
  37,756,069
  37,756,300
  37,756,359
  37,757,149
  37,757,384
  37,757,417
  37,757,507
  37,757,850
  37,757,851
  37,758,215
  37,758,743
  37,758,755
  37,758,962
  37,758,975
  37,758,976
  37,758,985
  37,759,159
  37,759,179
  37,759,183
  37,759,184
  37,759,774
  37,760,193
  37,760,315
  37,760,565
  37,761,165
  37,761,437
  37,761,442
  37,762,182
  37,762,188
  37,763,233
  37,763,240
  37,763,251
  37,763,434
  37,763,502
  37,763,597
  37,763,649
  37,763,732
  37,764,222
  37,764,247
  37,764,296
  37,764,323
  37,764,324
  37,764,325
  37,764,438
  37,764,440
  37,764,474
  37,764,476
  37,764,843
  37,765,658
  37,765,905
  37,766,054
  37,766,394
  37,766,542
  37,766,672
  37,766,805
  37,766,819
  37,766,933
  37,767,026
  37,767,112
  37,767,173
  37,767,239
  37,767,597
  37,767,796
  37,767,868
  37,768,066
  37,768,155
  37,768,381
  37,768,636
  37,768,654
  37,768,820
  37,768,826
  37,768,858
  37,768,994
  37,769,039
  37,769,044
  37,769,046
  37,769,048
  37,769,083
  37,769,338
  37,769,407
  37,769,497
  37,769,762
  37,769,784
  37,769,845
  37,769,888
  37,770,060
  37,770,066
  37,770,702
  37,770,829
  37,770,837
  37,770,839
  37,770,841
  37,771,014
  37,771,132
  37,771,163
  37,771,192
  37,771,733
  37,771,784
  37,771,880
  37,772,004
  37,772,285
  37,772,385
  37,772,415
  37,772,689
  37,772,699
  37,772,706
  37,772,739
  37,772,817
  37,772,894
  37,773,177
  37,773,403
  37,773,405
  37,773,470
  37,773,474
  37,773,490
  37,773,493
  37,773,694
  37,773,748
  37,773,889
  37,773,893
  37,773,913
  37,773,942
  37,774,115
  37,774,156
  37,774,621
  37,774,655
  37,774,729
  37,774,773
  37,774,835
  37,775,080
  37,775,434
  37,775,634
  37,776,170
  37,776,314
  37,776,401
  37,776,476
  37,776,641
  37,776,677
  37,776,738
  37,776,831
  37,776,967
  37,777,138
  37,777,155
  37,777,165
  37,777,348
  37,777,409
  37,777,423
  37,777,689
  37,777,693
  37,777,736
  37,777,777
  37,777,869
  37,777,918
  37,777,998
  37,778,006
  37,778,050
  37,778,056
  37,778,069
  37,778,143
  37,778,148
  37,780,656
  37,780,988
  37,781,164
  37,783,111
  37,783,576
  37,785,545
  37,786,319
  37,787,072
  37,787,581
  37,787,865
  37,788,581
  37,788,718
  37,788,933
  37,789,140
  37,789,497
  37,789,498
  37,789,808
  37,789,839
  37,789,842
  37,790,313
  37,790,366
  37,790,395
  37,790,675
  37,790,774
  37,790,828
  37,790,894
  37,791,386
  37,791,527
  37,791,529
  37,791,534
  37,791,644
  37,791,661
  37,791,805
  37,792,211
  37,792,389
  37,792,437
  37,792,483
  37,792,486
  37,792,528
  37,792,547
  37,792,550
  37,792,552
  37,792,672
  37,792,682
  37,792,685
  37,792,857
  37,792,884
  37,793,240
  37,793,376
  37,793,440
  37,794,239
  37,794,827
  37,798,248
  37,798,310
  37,798,696
  37,798,698
  37,798,857
  37,799,474
  37,799,537
  37,799,723
  37,799,852
  37,800,061
  37,800,127
  37,800,221
  37,800,448
  37,800,472
  37,800,483
  37,800,524
  37,800,587
  37,800,666
  37,800,667
  37,800,747
  37,800,794
  37,800,863
  37,800,916
  37,800,935
  37,800,950
  37,801,173
  37,801,249
  37,801,317
  37,801,322
  37,801,459
  37,801,496
  37,801,508
  37,801,647
  37,801,717
  37,801,745
  37,801,752
  37,801,980
  37,801,984
  37,802,188
  37,802,252
  37,802,424
  37,802,444
  37,802,499
  37,802,637
  37,803,384
  37,803,408
  37,803,418
  37,803,469
  37,803,488
  37,803,612
  37,803,640
  37,803,642
  37,803,671
  37,803,677
  37,803,714
  37,803,739
  37,803,907
  37,803,934
  37,803,960
  37,803,980
  37,803,990
  37,804,001
  37,804,048
  37,804,064
  37,804,103
  37,804,170
  37,804,299
  37,804,328
  37,804,433
  37,804,469
  37,804,498
  37,804,929
  37,805,114
  37,805,153
  37,805,165
  37,805,263
  37,805,361
  37,805,501
  37,805,567
  37,805,597
  37,805,752
  37,806,023
  37,806,080
  37,806,098
  37,806,249
  37,806,303
  37,806,404
  37,806,405
  37,806,632
  37,806,673
  37,806,681
  37,806,721
  37,807,090
  37,807,103
  37,807,174
  37,807,356
  37,807,369
  37,807,412
  37,807,425
  37,807,439
  37,807,447
  37,807,478
  37,807,767
  37,807,954
  37,808,037
  37,808,103
  37,808,299
  37,808,650
  37,809,428
  37,809,796
  37,809,927
  37,810,214
  37,810,246
  37,810,530
  37,810,807
  37,811,295
  37,811,392
  37,811,455
  37,811,567
  37,811,817
  37,811,970
  37,813,362
  37,813,476
  37,813,559
  37,814,209
  37,814,322
  37,814,418
  37,816,824
  37,816,873
  37,817,058
  37,817,226
  37,817,770
  37,818,591
  37,819,752
  37,819,891
  37,820,453
  37,820,513
  37,820,832
  37,821,029
  37,821,457
  37,821,811
  37,821,818
  37,822,975
  37,824,588
  37,826,307
  37,826,456
  37,827,839
  37,828,456
  37,829,247
  37,829,335
  37,829,758
  37,829,978
  37,830,240
  37,830,479
  37,831,428
  37,831,720
  37,831,877
  37,831,932
  37,832,011
  37,832,102
  37,832,103
  37,832,491
  37,832,811
  37,834,580
  37,835,896
  37,836,866
  37,836,991
  37,837,738
G
T
T
G
2
C
3
-
G
A
-
-
2
T
A/4
C
-
C
G
8
A
A
A
T
G
T
A
G
2
C
C
-
A
T
A
A/2
T/-
-
T
C
C
2
A
G
T
G
G
C
12/-
-
T
T
T
2
A
13
18/-
16/-
C
G
C
G
G
T
-
A
5
C
T
2
A
C
T
G/-
3/-
5
T
3
G
C
C
A
G
C
T
T
C
-
-
-
-
G
A
C
G/C
4/-
2/-
G
2
T
G
T
C
G
-
-
A
T
2/-
T
G
T
T
C
C
A
T
-
A
7
3
4
G
G
T
-
G
G
G
C
G
C
2
-
C
C
G
G
G
C
G
-
T
G
A
G
T
-
G
G
3
G
G
G
-
T/3
G
C
2
-
A
C
A
G
T
A
G
2
3
T
A
T
G
T
C
T
C
C
C
T
C
G
T
C
T
A
C
G
C
G
2
G
G
T
G
A
A
G
T
G
C
G
G
C
T
G
T
-
G
T
-
T
C
A
G
G
C
G
-
A
6
A
C
T
C
5
A
G
G
A
C
T
G
C
T
6
-
T
5
7
T
-
T
A
C
-
-
G
C
G
G
-
3/-
C
T
T
C
G
-
T
T
A
A
C
-
3
G
G
G
T
G
C
G
4
A
G
T
10
G
T
G
C
A
A
G
5/3
A
A
C
T
T
A
-
T
C
4
G
-
-
12
T
G
-
-
T
T
A
T
A
A
A
T
C
T
A
A
-
C
G
T
A
C
G
T
C
2
G
T
T
T
G
-
A
A
T
T
T
-
G
7
4
A
T
C
C
-
-
T
T
5
17
-
T
-
8/10
-
5
A
5
T
C
C
G
A
G
C
G
A
A
G
T
T
T
T
A
C
T
T
A
A
C
T
A
C
G
A
A
T
T
A
A
T
-
G
4
G
T
G
A
-
C
2
T
C
G
2
3
T
G
A
-
T
T
-
4
A
C
2/-
A
A
A
T
T
A
G
C
T
A
C
C
5
A
T
T
G
A
C
T
A
C
G
-
C
A
T
T
T
C
-
T
T
C
7/-
G
G
T
G