Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 240,762 (bp)   Positions: 506
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.036
.028
.111
.792
--
--
--
--
--
.028
.616
.642
.043
.014
.063
--
--
.0
.986
.99
.989
.997
.984
.941
.761
.99
.095
.041
.255
.193
.0
.021
.02
.028
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.027
.251
.046
.042
.003
.001
.006
.009
.28
.098
.577
.207
.006
.007
.009
.008
.001
--
--
--
--
--
--
--
.0
--
.019
.999
.727
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.052
.052
.008
--
--
--
--
--
--
--
.005
.006
.002
.132
.001
.0
.339
.137
--
--
--
.956
.033
.0
.005
.003
.005
.001
.0
.014
.472
.009
.066
.557
--
--
--
--
--
.361
--
.982
.897
.745
.265
.089
.26
.667
.928
.896
.35
.405
.552
.364
.028
.059
.015
.564
.803
.512
.418
.323
.167
.006
.045
.276
.217
.005
.0
.016
.832
.7
.735
.76
.577
.925
.992
.771
.01
.042
--
.007
.03
.204
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.014
.389
.322
--
.349
.593
.023
.211
.22
.219
.215
.001
.004
.004
.084
.121
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.019
.008
.016
.02
--
--
.003
.036
.004
.066
.241
.509
.853
.0
.066
--
.021
.12
--
.047
.036
.044
.003
.048
.231
--
--
--
--
--
.691
.889
.001
.009
.01
.026
.031
.005
.165
.185
.071
.017
.023
.059
.055
.012
.001
.017
.043
.005
.005
.0
.003
.006
.0
.291
.0
.015
.001
.033
.004
--
.676
--
.133
.29
.192
.116
.007
.017
.398
--
--
1.0
--
--
.004
.005
.002
.029
.082
.0
.009
.097
.098
.041
.129
.404
.272
.014
--
--
--
.019
.042
.514
--
--
--
.001
.001
.004
.018
.019
.002
.019
.058
.26
.11
.194
.981
.0
.203
.005
.002
.173
.091
.089
.098
.008
.004
.073
.063
.016
.001
.101
.052
.142
.065
.072
.015
.37
.346
.0
.003
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.354
.004
.011
.025
.022
.063
.07
.062
.001
.015
.012
.016
.049
.187
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.115
.001
.0
.014
.03
.015
.009
.21
.428
.079
.015
.085
.408
.082
--
--
.002
.016
.0
.005
.001
.14
.02
.883
.033
.002
.852
.044
.004
.286
.001
.001
.018
.045
.016
.062
.037
.087
.918
.01
.004
.386
.265
.559
.016
.164
.269
1.0
.115
.034
--
.059
.444
.065
.016
.02
--
--
.05
.004
.191
.585
.136
--
.654
.007
.47
.173
.01
--
.453
.004
.036
.31
.057
--
--
.011
.01
.053
.02
.021
.043
.164
.302
.033
.373
.058
.169
.0
.033
.406
--
.002
.001
.006
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
Tasp1
A
G
C
G
T
A
A
A
G
C
4
4
C
G
G
C
T
7
C
A
A
T
G
C
C
T
T
T
G
7
C
T
C
12
G
C
A
3
A
T
C
A
7
T
A
G
C
A
A
G
T
2
C
C
C
G
T
G
G
A
T
G
G
T
G
G
2
G
T
G
T
T
T
2
C
T
T
18
5
2
3
3
C
T
T
A
A
C
T
T
G
4
G
8
T
G
G
6
C
C
T
T
G
8
T
G
G
A
C
C
T
7
A
G
T
A
T
A
A
G
A
C
A
T
C
G
T
G
T
C
C
C
C
C
C
C
C
G
C
C
A
C
C
C
C
T
C
G
C
G
2
C
T
C
C
C
G
T
G
T
G
G
C
G
T
A
C
T
A
G
T
A
T
T
A
C
G
C
C
A
2
C
C
G
A
G
C
C
C
A
C
T
T
G
C
C
C
C
G
4
2
2
6
A
A
G
G
T
C
G
A
C
A
A
A
A
3
8
T
T
T
C
A
C
26
T
T
T
A
A
A
T
A
C
24
G
2
C
4
G
A
G
T
A
2
A
A
A
2
17
A
C
4
3
G
G
G
T
A
C
T
G
C
C
C
G
G
C
T
G
A
T
G
C
T
T
G
A
A
C
C
C
C
A
A
A
A
C
A
A
C
A
A
C
C
9
G
T
A
G
G
A
G
G
A
C
G
C
C
G
T
G
C
2
3
C
2
T
G
4
G
G
G
G
T
G
T
C
A
T
T
6
A
2
T
T
A
T
T
G
C
T
T
A
G
T
A
A
A
A
G
C
C
C
C
G
C
A
C
T
C
T
C
A
A
C
T
G
A
G
C
C
T
G
G
A
A
G
A
T
A
A
8
C
C
T
C
G
A
A
G
G
T
G
C
G
T
T
G
C
T
A
G
A
A
C
T
C
C
C
A
C
A
T
T
C
G
T
T
A
T
G
G
G
A
G
C
A
G
G
A
C
T
T
C
G
G
T
G
2
T
C
T
T
C
G
T
T
A
A
T
T
G
A
C
C
G
T
T
A
A
T
G
A
A
G
G
A
T
A
G
G
C
C
C
A
G
A
2
C
T
T
A
A
G
G
2
A
T
C
T
T
T
A
A
A
T
T
C
T
A
T
2
T
T
G
  139,348,586
  139,349,098
  139,349,418
  139,349,571
  139,349,986
  139,350,115
  139,350,282
  139,350,551
  139,350,637
  139,351,071
  139,351,328
  139,351,607
  139,353,051
  139,353,843
  139,354,176
  139,354,233
  139,354,343
  139,354,752
  139,356,143
  139,356,300
  139,356,372
  139,356,394
  139,356,418
  139,356,447
  139,356,527
  139,357,295
  139,357,488
  139,357,496
  139,358,267
  139,358,271
  139,358,816
  139,359,314
  139,359,315
  139,360,000
  139,360,047
  139,360,955
  139,360,959
  139,360,999
  139,361,528
  139,361,562
  139,361,563
  139,361,924
  139,361,967
  139,361,973
  139,362,585
  139,362,680
  139,363,380
  139,364,490
  139,365,017
  139,365,183
  139,365,447
  139,365,481
  139,365,925
  139,366,436
  139,367,058
  139,367,172
  139,369,352
  139,369,758
  139,370,041
  139,370,265
  139,370,369
  139,374,306
  139,374,338
  139,374,345
  139,374,357
  139,374,366
  139,374,408
  139,374,409
  139,374,631
  139,375,551
  139,376,334
  139,376,852
  139,377,378
  139,377,555
  139,377,556
  139,377,560
  139,377,564
  139,377,565
  139,377,567
  139,377,568
  139,377,580
  139,377,607
  139,377,953
  139,378,163
  139,378,167
  139,378,324
  139,378,902
  139,380,149
  139,380,550
  139,380,800
  139,382,158
  139,383,227
  139,385,413
  139,385,696
  139,385,820
  139,385,840
  139,387,074
  139,388,073
  139,388,154
  139,388,162
  139,388,218
  139,390,970
  139,392,439
  139,392,661
  139,392,700
  139,394,826
  139,394,830
  139,394,842
  139,397,695
  139,400,832
  139,401,643
  139,402,116
  139,402,122
  139,402,437
  139,402,865
  139,403,319
  139,403,563
  139,405,034
  139,405,992
  139,406,867
  139,406,939
  139,408,533
  139,408,907
  139,409,356
  139,409,383
  139,409,508
  139,409,857
  139,410,480
  139,416,782
  139,416,799
  139,416,805
  139,416,825
  139,416,841
  139,416,845
  139,416,865
  139,416,885
  139,416,905
  139,416,929
  139,416,931
  139,416,949
  139,416,966
  139,416,987
  139,416,997
  139,417,003
  139,417,029
  139,417,066
  139,417,083
  139,417,087
  139,417,107
  139,417,127
  139,417,262
  139,417,299
  139,417,308
  139,417,321
  139,417,343
  139,417,365
  139,417,387
  139,417,431
  139,417,434
  139,417,584
  139,417,630
  139,417,651
  139,417,698
  139,417,756
  139,417,959
  139,429,629
  139,431,051
  139,431,406
  139,432,148
  139,432,638
  139,432,867
  139,434,404
  139,434,431
  139,434,433
  139,434,965
  139,434,969
  139,434,978
  139,434,994
  139,435,035
  139,435,154
  139,435,157
  139,436,124
  139,436,135
  139,436,137
  139,436,149
  139,436,155
  139,436,156
  139,436,163
  139,436,164
  139,436,578
  139,436,704
  139,436,809
  139,437,000
  139,437,679
  139,437,715
  139,440,568
  139,442,190
  139,443,244
  139,443,918
  139,444,109
  139,444,123
  139,444,127
  139,444,133
  139,444,339
  139,444,852
  139,446,081
  139,446,859
  139,447,046
  139,448,170
  139,448,438
  139,448,911
  139,449,071
  139,449,658
  139,449,687
  139,449,691
  139,449,695
  139,449,921
  139,450,103
  139,450,127
  139,450,135
  139,450,139
  139,450,403
  139,450,460
  139,451,636
  139,451,801
  139,452,842
  139,453,809
  139,454,821
  139,455,549
  139,455,553
  139,456,455
  139,456,642
  139,457,414
  139,459,421
  139,460,413
  139,463,436
  139,463,802
  139,463,803
  139,463,868
  139,466,583
  139,466,626
  139,467,319
  139,467,562
  139,467,566
  139,467,868
  139,467,908
  139,467,914
  139,469,067
  139,469,091
  139,469,764
  139,469,780
  139,469,847
  139,469,860
  139,469,861
  139,469,949
  139,469,980
  139,469,982
  139,470,407
  139,471,353
  139,471,936
  139,473,446
  139,475,650
  139,476,293
  139,477,602
  139,480,699
  139,481,201
  139,481,391
  139,482,044
  139,482,322
  139,482,615
  139,482,633
  139,482,749
  139,483,274
  139,483,664
  139,485,367
  139,485,549
  139,487,200
  139,487,243
  139,488,661
  139,488,971
  139,489,961
  139,491,499
  139,492,165
  139,492,192
  139,492,206
  139,492,234
  139,492,249
  139,492,293
  139,492,799
  139,492,817
  139,494,326
  139,495,907
  139,496,536
  139,497,319
  139,498,330
  139,498,414
  139,500,441
  139,500,845
  139,501,512
  139,501,651
  139,501,673
  139,501,680
  139,501,714
  139,501,792
  139,502,247
  139,502,261
  139,502,616
  139,503,235
  139,503,533
  139,503,768
  139,504,461
  139,504,547
  139,504,662
  139,505,402
  139,505,418
  139,505,421
  139,505,473
  139,505,492
  139,505,501
  139,505,508
  139,505,521
  139,505,533
  139,505,539
  139,505,545
  139,505,994
  139,506,580
  139,507,024
  139,507,460
  139,507,514
  139,508,371
  139,508,558
  139,508,973
  139,509,133
  139,509,238
  139,509,239
  139,509,242
  139,509,533
  139,509,953
  139,511,037
  139,511,052
  139,511,118
  139,511,199
  139,511,314
  139,511,600
  139,512,580
  139,512,586
  139,513,016
  139,513,497
  139,514,003
  139,514,138
  139,514,301
  139,514,837
  139,514,846
  139,515,607
  139,515,908
  139,516,178
  139,516,222
  139,516,515
  139,516,653
  139,516,756
  139,517,079
  139,517,117
  139,518,299
  139,518,351
  139,518,684
  139,518,768
  139,518,973
  139,519,477
  139,519,827
  139,519,973
  139,520,096
  139,520,107
  139,520,111
  139,520,112
  139,520,115
  139,521,404
  139,521,530
  139,522,633
  139,523,614
  139,523,687
  139,523,750
  139,524,361
  139,524,450
  139,524,971
  139,524,990
  139,525,020
  139,525,449
  139,525,508
  139,525,831
  139,525,879
  139,526,639
  139,526,777
  139,527,545
  139,527,565
  139,527,865
  139,528,204
  139,528,218
  139,528,310
  139,528,406
  139,528,728
  139,528,801
  139,530,015
  139,530,208
  139,530,226
  139,530,360
  139,531,539
  139,531,810
  139,532,180
  139,533,148
  139,534,593
  139,535,808
  139,536,455
  139,536,946
  139,536,949
  139,536,960
  139,536,963
  139,536,979
  139,537,368
  139,537,587
  139,537,618
  139,537,767
  139,538,511
  139,538,832
  139,539,832
  139,540,606
  139,541,084
  139,541,165
  139,541,221
  139,541,242
  139,541,326
  139,543,190
  139,543,292
  139,543,575
  139,544,020
  139,544,463
  139,544,839
  139,545,306
  139,545,378
  139,545,693
  139,546,809
  139,547,556
  139,547,944
  139,549,386
  139,549,397
  139,549,502
  139,549,874
  139,550,153
  139,551,923
  139,552,348
  139,552,697
  139,555,067
  139,555,197
  139,555,218
  139,555,532
  139,555,601
  139,555,717
  139,556,873
  139,557,291
  139,557,547
  139,557,605
  139,559,358
  139,559,815
  139,560,410
  139,560,675
  139,562,586
  139,563,486
  139,564,370
  139,564,515
  139,564,980
  139,565,111
  139,566,155
  139,567,146
  139,567,404
  139,567,736
  139,568,450
  139,568,564
  139,568,620
  139,570,147
  139,570,832
  139,571,246
  139,571,489
  139,572,343
  139,573,098
  139,573,163
  139,573,932
  139,574,634
  139,576,079
  139,576,080
  139,576,384
  139,576,432
  139,577,317
  139,578,402
  139,578,695
  139,579,172
  139,579,513
  139,579,963
  139,580,150
  139,581,490
  139,582,881
  139,583,248
  139,584,073
  139,585,921
  139,586,829
  139,586,849
  139,587,488
  139,587,931
G
A
T
A
C
A/2
G
A/G
2
A
-
-
T
A
A
G
-
-
C/T
A/G
A/G
T/G
G/A
C/G
C/T
T/C
T/A
G
G/3
-
T
A
G
-
A
T
C
-
G
2
A
C
-
-
2
3
T
G
-
3
C
-
A
T
T
2
C
A
2
G
A
G/T
C
T/A
G/A
G/T
2/-
G/-
G
T
C
C
3
-
2
-
-
-
-
-
-
-
T
-
-
A/G
G
T
C
2
A
-
A
-
3
11
A
-
C/G
3
3
C
A
-
T/C
A
G/A
A/G
T
2
C
-
-
A
A
G
C
G
G
A
-
T
C
-
-
T
-
A
T/3
C/A
C/G
C/G
C/T
C/G
C/G
C/G
C/G
G/C
C/T
C/G
A/T
C/G
G
C/A
C/G
T/A
C/T
G/C
C/G
G/C
2/-
C/G
T/A
C/G
C/G
C/G
2
T/A
G/C
T/C
2
2
C/G
G/C
A
G
T
-
C
T
A
A/C
T/A
T/C
A/2
C/T
G/T
G
C/T
A/3
2/-
T
A
C
C
A
T
G
T
G
T
T/2
C
A
T
T
T
5
A
-
2/-
2/-
6/-
G
G
T
A
C
A
C
-
T
13
G
A/G
A/G
3/-
-
T/C
T/C
T/C
T
G
3
-
-
C
C
G
2
-
4
12
T
-
A
2/-
5
-
A
G
T
C
G
2/-
6
5
A/G
-
-
A/3
T
4/-
3/-
3
G/C
G/C
C
2
3
C
A
2
G
T
A
3
T
A
5
G
2
A
2
G
C
G/A
-
-
T
T
A
G
C
A/C
C
G
T
T
-
T
G
G
9
T
-
C
A
C
C
A
16
A
3
C
2
A
T
A
T
A
A
5
-
-
C/2
2/-
T/4
G/3
4/-
G/C
C
C
C
C
T
C
T
T
G
2
-
T
-
3
4
G
A
3
5
T
A
A
G
2
-
C
C
-
G
A
A
A
2
T
A
A
T
T
C
A
A
T
G
G
A
G
T
C
G/A
C/T
C/A
T/C
G/A
G/A
A/T
A/G
G/A
G
C
G
C
-
T
C/T
-
T
A
C
4
C
-
G
A
G
A
A
T/C
G/C
G
C
G
A
-
A/C
C/G
C
T
T
3
G
T
G
-
C
A
T
C
C
T
C
A
A
8
G
A
T
G
A
A
T
T
C
A
2
A
A
C
T
-
A
A
C
A
G
A
A
C
G
T
C
G
T
G
T
2
A
A
A
C
G
C
A
C
T
-
-/4
A/T
C
T
A
2
T
T
T
G
A
3
-
T
G
4
C
G
A
A
2/-
A/-
C
A
C
C
2
5
G
G
2
C
A
C
A/2
T/2
-
2
C
C