Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 231,293 (bp)   Positions: 578
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.001
.002
.034
.048
.025
.008
--
.002
.007
.024
.022
.078
.002
--
--
.126
.014
.011
.011
.011
.023
.011
.013
.019
.022
.007
.002
.079
.042
.094
.013
.005
.001
.023
.109
.245
.058
.055
.105
.025
.342
--
.01
.069
.003
.251
.353
.079
.0
.656
.017
.002
.0
.0
.332
.063
--
.011
.01
.007
.091
.021
--
--
.005
.002
.012
.011
.0
.0
.0
.078
.631
.022
.015
.002
.0
.044
.491
.007
.005
.022
.574
.562
.907
.002
.877
.783
.005
.002
.0
.0
.006
.013
.0
.031
.001
.002
.004
.066
.009
.003
.099
.068
.0
.0
.001
.0
.039
.061
.008
.0
.001
.003
.001
.163
.0
.001
.003
.062
.159
.031
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.183
--
--
--
.007
.034
.356
.003
.002
.013
.007
.017
.016
.417
.165
.043
.018
.133
.046
.08
.028
.049
.519
.325
.195
.093
.091
.094
.066
.146
.041
.038
.009
.399
.019
.52
.0
.002
.005
.006
.309
.111
.027
.022
.038
--
.986
.06
.035
.464
.265
.002
.001
.002
.003
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.019
.007
.099
.007
.093
.515
.384
.044
.027
.007
.002
.015
.009
.005
.009
.0
.042
.0
.008
.207
.013
.0
.003
.0
.004
.435
.762
.4
.004
.026
.005
.001
.488
.995
.727
.242
.187
.003
.001
.027
.006
.054
.005
.25
.195
.184
.275
.426
--
.296
.418
.016
.034
.125
.015
.02
.179
.021
.013
--
.026
.729
--
--
--
--
--
.022
.116
.035
.232
.192
.1
.011
.041
.0
.008
.065
.0
.262
--
--
.073
.013
.007
.001
.003
.001
.003
.007
.453
.6
.004
.001
.0
.005
.004
.004
.043
.003
.002
.0
.2
.101
.012
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.162
.173
--
.157
.009
.038
.13
.202
--
.02
--
.006
.003
.001
.015
.049
.008
.0
.0
.057
.001
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.398
.127
.293
.363
.033
.011
.01
.008
.002
.001
.944
.016
.0
.008
.037
.039
.023
.187
.151
.005
.001
.0
.368
.003
.001
.004
.01
.0
.003
.008
.024
.035
.0
.001
.0
.001
.001
.48
.094
.002
.035
.005
.029
.092
.311
.138
.001
.221
.0
.0
.001
.001
.005
.005
.02
.001
.002
.006
.0
.005
.268
.005
.002
.107
--
.005
.005
.006
.09
.004
.002
.0
.337
--
--
--
.375
.353
.0
.049
.034
--
--
--
--
--
.115
.001
.059
.116
.051
.006
.034
.006
.08
.003
.306
.0
.657
.0
.0
.0
.0
.003
.021
.064
.005
--
.003
.477
.983
.104
.002
.0
.001
.207
.028
.061
.001
.0
.004
.002
.122
.123
.001
.0
.015
.008
.168
.031
.028
.002
.003
.076
.031
.004
.005
.001
.176
.086
.0
.006
.43
.025
.001
.01
.002
.011
.191
.452
.029
.303
.094
.006
.031
.005
.033
.135
.152
.092
.003
.195
.027
.002
.0
.002
.001
.011
.001
.081
.0
.03
.03
.026
.094
.47
.013
.291
.01
.003
.005
.002
.005
.0
.0
.15
.447
.407
1.0
.094
.055
.048
.0
.098
.001
.002
.064
.005
.0
.052
.029
.03
.002
.08
.015
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
Tafa4
G
G
C
G
A
2
G
G
A
G
A
G
A
A
G
C
T
G
G
C
C
T
C
C
C
T
T
2
G
2
G
T
C
T
C
C
C
C
C
C
C
C
T
A
A
A
A
A
24
G
T
C
G
G
G
A
T
A
2
C
2
A
A
6
A
A
A
A
C
A
G
A
T
T
A
G
T
T
T
C
G
T
G
G
G
22
A
G
A
A
C
T
A
C
A
C
T
C
C
A
G
C
T
A
3
C
G
T
A
T
C
10
G
T
C
G
117
11
C
T
C
T
C
G
C
A
T
G
C
G
G
G
G
T
G
C
A
G
T
A
24
A
C
G
C
C
G
T
C
T
C
A
4
G
T
G
T
A
T
G
G
A
C
C
C
A
C
A
T
G
C
T
18
16
A
A
2
C
T
T
A
G
C
C
A
T
G
2
G
2
A
G
12
A
2
T
C
G
T
A
T
G
T
C
T
C
A
A
C
T
T
A
G
T
C
C
G
6
A
4
A
C
G
T
G
A
A
T
C
T
C
C
C
G
C
G
A
A
A
A
G
C
T
C
A
G
G
G
2
A
G
A
G
T
A
G
2
T
A
C
T
T
2
T
C
G
G
G
A
T
G
T
C
A
T
C
T
G
A
T
A
4
9
T
A
C
C
T
A
T
T
A
G
4
C
G
G
A
A
T
3
G
A
T
A
A
A
G
T
T
T
T
A
T
A
G
A
C
A
T
T
6
A
4
A
G
2
C
A
A
A
A
C
A
G
G
A
C
G
C
C
T
C
3
C
A
C
A
T
T
C
C
C
C
G
A
2
A
C
C
C
C
A
C
4
C
G
4
C
C
A
T
A
A
A
C
C
T
C
A
C
C
C
C
A
T
A
A
G
T
T
4
G
A
A
26
T
A
A
G
C
A
A
T
C
A
C
A
G
T
C
A
C
G
C
A
A
A
A
G
A
C
T
C
C
G
A
G
G
T
A
G
G
C
G
G
C
T
C
G
G
A
T
A
A
T
4
68
T
30
28
G
A
T
A
T
C
C
C
G
G
C
A
2
A
A
G
G
A
C
A
10
A
T
T
C
A
2
T
C
36
C
A
A
G
G
G
C
T
T
A
A
T
C
C
C
A
T
G
C
C
C
T
T
C
C
A
C
G
G
A
C
G
A
G
12
C
T
T
T
A
C
A
A
T
T
C
T
4
8
A
G
C
A
A
T
G
A
G
G
G
G
T
C
A
A
A
A
G
G
A
T
C
T
T
A
G
A
T
A
G
T
A
T
C
T
C
G
3
A
G
T
C
C
2
3
A
G
  193,702,655
  193,702,734
  193,703,156
  193,703,352
  193,703,359
  193,704,569
  193,704,601
  193,706,142
  193,706,283
  193,706,534
  193,706,849
  193,706,853
  193,707,085
  193,707,716
  193,708,739
  193,709,077
  193,709,572
  193,709,738
  193,709,754
  193,709,757
  193,709,759
  193,709,772
  193,709,775
  193,709,798
  193,709,799
  193,709,811
  193,709,820
  193,709,824
  193,709,849
  193,709,857
  193,709,866
  193,709,889
  193,709,899
  193,710,276
  193,710,967
  193,711,003
  193,711,056
  193,711,099
  193,711,100
  193,711,105
  193,711,143
  193,711,176
  193,712,001
  193,713,460
  193,713,785
  193,717,565
  193,719,050
  193,719,057
  193,719,318
  193,719,884
  193,720,109
  193,722,309
  193,722,374
  193,722,877
  193,723,890
  193,724,238
  193,724,800
  193,725,048
  193,725,398
  193,725,399
  193,725,534
  193,725,563
  193,725,736
  193,726,728
  193,726,764
  193,727,491
  193,727,708
  193,728,296
  193,730,235
  193,730,696
  193,730,911
  193,731,218
  193,732,216
  193,732,313
  193,732,427
  193,732,661
  193,732,716
  193,732,815
  193,732,860
  193,733,074
  193,733,201
  193,733,769
  193,733,783
  193,733,920
  193,734,012
  193,734,062
  193,734,217
  193,734,429
  193,734,439
  193,734,766
  193,734,768
  193,734,779
  193,734,826
  193,734,992
  193,735,084
  193,735,184
  193,735,189
  193,735,235
  193,735,320
  193,735,352
  193,735,431
  193,735,575
  193,735,583
  193,735,615
  193,735,835
  193,735,865
  193,735,982
  193,736,873
  193,736,931
  193,736,969
  193,737,043
  193,737,499
  193,737,724
  193,737,885
  193,738,081
  193,738,086
  193,738,142
  193,738,530
  193,738,583
  193,739,033
  193,739,244
  193,739,484
  193,739,696
  193,740,332
  193,741,751
  193,742,733
  193,742,832
  193,743,241
  193,743,483
  193,744,405
  193,745,693
  193,745,695
  193,745,700
  193,745,701
  193,745,755
  193,745,756
  193,746,010
  193,746,879
  193,747,021
  193,747,487
  193,747,560
  193,747,585
  193,748,172
  193,748,344
  193,748,628
  193,748,759
  193,748,769
  193,749,154
  193,750,394
  193,752,722
  193,752,770
  193,752,771
  193,753,452
  193,754,602
  193,754,688
  193,754,811
  193,755,100
  193,756,612
  193,756,922
  193,757,744
  193,757,804
  193,758,413
  193,758,905
  193,758,988
  193,759,330
  193,759,494
  193,759,868
  193,760,402
  193,760,650
  193,761,693
  193,761,710
  193,761,733
  193,761,764
  193,761,766
  193,761,850
  193,761,895
  193,762,534
  193,763,731
  193,763,746
  193,763,807
  193,763,843
  193,763,908
  193,765,029
  193,765,230
  193,765,474
  193,765,575
  193,765,830
  193,766,355
  193,766,452
  193,766,611
  193,769,923
  193,770,605
  193,773,717
  193,773,838
  193,773,862
  193,773,865
  193,773,940
  193,774,452
  193,779,971
  193,780,287
  193,780,506
  193,780,916
  193,780,951
  193,781,284
  193,781,375
  193,781,389
  193,781,502
  193,781,712
  193,781,935
  193,782,075
  193,782,096
  193,782,163
  193,782,198
  193,782,206
  193,782,322
  193,782,339
  193,782,427
  193,782,590
  193,782,748
  193,792,145
  193,792,255
  193,792,545
  193,792,648
  193,792,969
  193,792,984
  193,793,034
  193,793,044
  193,793,060
  193,793,064
  193,793,236
  193,793,287
  193,793,581
  193,793,699
  193,793,717
  193,793,877
  193,793,983
  193,793,989
  193,793,991
  193,794,059
  193,794,195
  193,794,256
  193,794,270
  193,794,309
  193,794,356
  193,794,400
  193,794,557
  193,794,885
  193,795,077
  193,795,227
  193,795,245
  193,795,251
  193,795,319
  193,795,865
  193,795,994
  193,796,080
  193,796,111
  193,796,138
  193,796,211
  193,796,439
  193,796,534
  193,796,543
  193,796,584
  193,796,672
  193,796,687
  193,796,718
  193,796,736
  193,796,854
  193,796,911
  193,797,369
  193,797,900
  193,798,044
  193,798,188
  193,799,436
  193,800,188
  193,800,797
  193,800,814
  193,801,332
  193,802,605
  193,802,607
  193,802,759
  193,803,939
  193,804,473
  193,805,082
  193,805,708
  193,805,891
  193,806,055
  193,806,277
  193,807,444
  193,807,518
  193,807,859
  193,808,013
  193,808,071
  193,808,338
  193,808,557
  193,808,756
  193,809,620
  193,810,349
  193,810,598
  193,810,672
  193,810,925
  193,811,716
  193,811,739
  193,812,074
  193,812,130
  193,812,208
  193,812,406
  193,812,992
  193,813,024
  193,813,133
  193,813,711
  193,813,760
  193,813,787
  193,814,045
  193,814,072
  193,814,426
  193,814,552
  193,814,783
  193,816,323
  193,816,603
  193,816,661
  193,816,840
  193,817,509
  193,818,006
  193,818,012
  193,818,092
  193,818,128
  193,818,597
  193,818,640
  193,818,813
  193,818,945
  193,819,030
  193,819,099
  193,819,410
  193,819,571
  193,819,694
  193,820,053
  193,820,629
  193,820,900
  193,821,255
  193,821,957
  193,821,973
  193,822,158
  193,822,329
  193,822,648
  193,822,884
  193,822,909
  193,822,933
  193,823,675
  193,823,710
  193,823,767
  193,824,029
  193,824,206
  193,824,355
  193,824,586
  193,825,775
  193,825,779
  193,825,906
  193,826,034
  193,826,352
  193,827,839
  193,828,787
  193,830,196
  193,830,324
  193,833,832
  193,835,470
  193,835,969
  193,836,418
  193,836,504
  193,836,507
  193,836,516
  193,836,693
  193,836,753
  193,837,181
  193,837,508
  193,837,643
  193,837,765
  193,837,784
  193,837,927
  193,838,086
  193,838,340
  193,838,649
  193,838,653
  193,838,670
  193,838,860
  193,839,016
  193,839,065
  193,839,161
  193,839,532
  193,839,649
  193,840,210
  193,840,237
  193,840,256
  193,840,296
  193,840,823
  193,840,939
  193,841,448
  193,841,792
  193,842,107
  193,842,210
  193,842,275
  193,842,996
  193,843,420
  193,843,436
  193,843,497
  193,843,550
  193,843,761
  193,843,909
  193,844,468
  193,844,600
  193,844,935
  193,845,178
  193,845,241
  193,845,298
  193,845,370
  193,845,436
  193,845,550
  193,845,633
  193,845,768
  193,845,907
  193,845,929
  193,846,255
  193,846,681
  193,846,682
  193,846,868
  193,847,304
  193,847,331
  193,847,336
  193,847,640
  193,847,778
  193,847,815
  193,848,072
  193,848,138
  193,848,324
  193,849,443
  193,850,637
  193,850,675
  193,851,862
  193,852,042
  193,853,057
  193,853,714
  193,871,122
  193,873,853
  193,874,140
  193,875,172
  193,876,099
  193,877,117
  193,878,877
  193,882,713
  193,882,722
  193,886,614
  193,886,616
  193,889,004
  193,889,318
  193,889,756
  193,891,302
  193,892,990
  193,892,994
  193,892,998
  193,893,002
  193,897,811
  193,899,075
  193,902,708
  193,902,857
  193,904,941
  193,905,131
  193,905,212
  193,905,313
  193,905,337
  193,905,354
  193,905,388
  193,905,524
  193,905,649
  193,906,241
  193,906,449
  193,906,509
  193,906,897
  193,907,073
  193,907,128
  193,907,423
  193,907,584
  193,907,869
  193,908,031
  193,908,227
  193,908,567
  193,908,770
  193,908,774
  193,908,917
  193,908,923
  193,908,983
  193,909,520
  193,909,581
  193,909,715
  193,909,765
  193,909,775
  193,909,820
  193,909,924
  193,909,925
  193,909,994
  193,910,029
  193,910,550
  193,910,551
  193,910,590
  193,910,708
  193,910,709
  193,910,904
  193,910,905
  193,910,930
  193,911,017
  193,911,351
  193,911,471
  193,911,742
  193,912,197
  193,912,448
  193,912,930
  193,915,347
  193,916,253
  193,916,439
  193,916,534
  193,916,991
  193,917,226
  193,917,235
  193,918,970
  193,919,045
  193,919,100
  193,919,130
  193,919,160
  193,919,330
  193,919,364
  193,919,580
  193,919,625
  193,919,678
  193,919,884
  193,919,915
  193,919,940
  193,920,093
  193,920,146
  193,920,295
  193,920,422
  193,920,547
  193,920,549
  193,920,554
  193,921,134
  193,921,151
  193,921,177
  193,921,362
  193,921,364
  193,921,366
  193,921,606
  193,921,644
  193,922,068
  193,922,165
  193,922,516
  193,922,567
  193,922,780
  193,922,886
  193,922,925
  193,923,962
  193,923,990
  193,924,264
  193,924,275
  193,924,278
  193,924,356
  193,924,441
  193,924,446
  193,924,547
  193,925,053
  193,925,234
  193,925,268
  193,925,896
  193,926,499
  193,927,412
  193,928,786
  193,929,466
  193,929,571
  193,929,572
  193,929,827
  193,929,842
  193,932,714
A
A
T
A
G
-
2
2
T
A
C
A
G
G
A
T
C
-
-
A
A
-
-
-
T
-
-
-
-
-
-
-
-
C
T
-
-
-
T
-
-
T
-
G
2
C
2
4
24/-
T
C
2
A
C
A
G
G
G
-
C/-
-
G
-
6/-
G
G
T
T
T
G
A
-
C
G
T
A
C
C
G
T
A
A
A
9/7
A
22/-
G
A
G
-
3
C
G
3
G
T
C
T
T
-
4
T
C
G
-
G
A
-
G
C
T
-
T
C
T
C
-
-
T
C
T
C
2
A/T
2
2
G
T
T
A
A
A
A
C
A
G
G
C
-
G
-
G
G
A
T
T
A
G
T
C
T
G
-
A
C
-
C
C
C
A
T
C
-
T
T
-
A
G
T/2
A
T
2
18/-
16/-
G
T
-
A
2
C
G
A
T
T
G
C
C
2/-
T
-
T
A
12/-
A/5
2/-
T/3
C/-
-
C
G
A
A
G
T
C
A
G
G
G
C
C
G
T
G
A
G
A
-
4
-
G
T
A
C
A
G
-
C
T
C
A
T
A
C
A
A
6
C
T
C
T
T
A
T
G
T
A
A
-
G
5
G
A
C
T
A
-
G
T
T
C
C
-
5
T
A
5
T
T
C
T
G
2
T
A
A
G
2
2
C
-
-
-
C
-
A
23
C
G
-
C
T
3
-
T
A
A
G
T
C
3/-
A
C
C
G
G
C
A
C
C
G
C
G
5
C
A
G
A
C
C
C
-
-
-
8
3
-
10
-
T
-
-
T
G
A
2
G
T
5
T
A
2
T
-
2
T
T
80
3
3
T
T
G
G
C
-
-
G
T
T
A
G
C
T
-
A
T
-
5
T
G
C
G
-
G
T
2
C
A
C
A
T
T
2
T
C
G
T
A
T/3
C
-
C
C
G
-
TA/3
G
G
A
2
G
G
C
T
C
5
G
A
A
2
T
G
A
-
T
G
T
G
A
G
T
G
T
T
C
-
A
A
G
G
A
A
T
A
A
T
T/3
G
T
A
2
T/2
G
G
2
-
68/-
T/-
30/-
-
A
T
G
G
A
A
A
T
A
A
T
G
-
G
G
-
A
G
2
G
-
T
C
A
T
T
-
C
G
-
A
G
G
A
C
A
T
A
G
G
G
C
T
A
2
G
C
A
2
32
17
2
A
T
T
-
A
A
G/31
2
T
4
C
A
-
T
C
C
C
5
T
C
G
C
2
T
C
-
-
G
A
T
G
G
G
A
G
A
A
A
A
C
T
G
G
G
T
A
T
G
C
T
C
C
G
A
T
C
T
2
C
G
-
G
C
T
T
-
G
2
-
T
C/3
2/-
-
C
T