Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 168,948 (bp)   Positions: 308
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.012
.019
.01
.015
.061
.89
.006
.112
.989
.104
.011
.001
.0
.0
.0
.0
.351
.0
.339
.305
.17
.014
.379
.003
.0
--
--
.007
.004
.019
--
--
--
.0
.008
.002
.012
.835
.002
.017
.0
.013
.377
.028
.002
.011
.001
.0
.017
.0
.001
.032
.196
.179
.096
.013
--
--
.0
.089
.032
.046
.005
.102
.003
.563
.026
.159
--
--
.328
.02
.003
.0
.003
.05
.001
.042
.001
.006
.0
.008
--
.001
.099
.336
.185
.009
.399
.049
.0
.0
--
.017
.012
.003
.006
.005
.0
.004
.869
.768
.998
.739
.264
.013
.001
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.007
.044
.001
.001
.007
.088
.042
.064
.01
.059
.394
.015
.147
.313
.009
.008
.006
.002
.002
.008
.076
.014
.219
.002
.008
.001
.054
.04
.009
.005
.091
.081
.176
.01
.011
.02
.089
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.097
.001
--
--
.421
.027
.08
.022
.11
.002
.073
.015
.125
.243
.675
.58
.017
.038
.0
.002
.001
.001
.002
.023
.082
.0
.796
.753
.014
.012
.023
.008
.058
.218
.148
.031
.0
.0
.005
.028
.416
.059
.017
.009
.04
.036
.005
.008
.013
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.278
.363
.006
.137
.008
.003
.004
.003
.05
.062
.374
.004
.035
.136
.323
.313
.092
.055
.001
.007
.013
.08
.003
.258
.0
.001
.001
.026
.024
.016
.116
.001
.002
.0
.032
.005
.0
.001
.037
.008
.015
.006
.048
.009
.02
.407
.849
.003
.1
.002
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
C
C
A
C
C
C
A
G
T
T
A
G
G
T
G
C
A
G
C
G
G
C
T
G
T
A
G
G
T
A
A
T
A
C
C
A
T
C
T
G
G
T
G
T
A
A
G
A
A
A
G
T
C
T
G
2
A
A
G
T
T
A
T
A
T
C
G
C
T
A
G
A
C
T
A
G
G
G
8
A
G
C
T
G
C
C
4
C
A
T
2
C
T
G
C
T
2
A
T
T
T
C
C
C
G
C
T
C
G
C
G
G
C
A
C
C
G
G
C
G
C
C
C
C
C
C
T
C
C
G
C
A
G
2
G
G
A
C
A
G
C
A
A
A
A
2
3
A
C
A
A
G
G
C
C
T
G
G
G
C
T
G
G
A
A
A
C
T
T
G
2
6
C
A
C
C
G
2
4
4
4
4
2
2
C
8
A
A
T
G
C
A
G
A
G
13
A
G
G
G
C
T
A
T
A
T
T
T
T
A
G
C
G
A
T
2
G
C
C
C
T
A
A
A
A
G
A
T
T
G
C
G
A
T
G
C
C
C
3
A
A
A
G
T
A
C
A
G
A
C
C
A
C
A
G
A
4
A
A
T
A
G
T
T
C
G
4
C
G
T
A
A
A
A
G
A
C
G
C
T
C
A
G
G
A
T
C
G
C
A
C
C
C
G
A
G
G
A
A
G
A
G
A
C
T
T
  177,991,531
  177,991,535
  177,991,581
  177,991,672
  177,991,718
  177,991,807
  177,991,968
  177,992,003
  177,992,111
  177,992,185
  177,992,194
  177,992,258
  177,992,304
  177,992,433
  177,992,463
  177,992,476
  177,992,613
  177,992,640
  177,993,042
  177,993,169
  177,993,359
  177,993,560
  177,993,811
  177,994,249
  177,994,469
  177,994,531
  177,994,566
  177,994,609
  177,994,638
  177,994,710
  177,995,555
  177,995,638
  177,995,641
  177,996,894
  177,997,350
  177,997,386
  177,997,897
  177,998,284
  177,998,840
  177,999,279
  178,000,188
  178,000,617
  178,001,701
  178,002,100
  178,002,149
  178,002,421
  178,002,445
  178,002,453
  178,002,868
  178,003,491
  178,003,772
  178,004,604
  178,004,620
  178,004,744
  178,004,828
  178,004,884
  178,004,968
  178,005,032
  178,005,471
  178,005,840
  178,006,088
  178,006,537
  178,007,444
  178,007,600
  178,007,858
  178,008,084
  178,008,439
  178,009,221
  178,009,967
  178,010,133
  178,010,866
  178,011,004
  178,011,339
  178,012,434
  178,013,008
  178,013,891
  178,014,193
  178,015,105
  178,015,710
  178,015,998
  178,019,547
  178,022,104
  178,024,080
  178,025,920
  178,028,470
  178,030,998
  178,031,242
  178,032,245
  178,034,490
  178,035,043
  178,036,227
  178,036,616
  178,039,553
  178,040,810
  178,040,837
  178,041,104
  178,041,506
  178,041,538
  178,041,541
  178,041,550
  178,041,945
  178,041,958
  178,042,043
  178,042,631
  178,042,746
  178,043,363
  178,043,371
  178,043,426
  178,044,063
  178,044,076
  178,044,081
  178,044,338
  178,044,474
  178,044,857
  178,045,036
  178,045,092
  178,045,104
  178,045,127
  178,045,157
  178,046,092
  178,046,353
  178,046,489
  178,046,542
  178,046,762
  178,046,794
  178,046,855
  178,047,129
  178,047,342
  178,048,021
  178,048,196
  178,048,350
  178,048,371
  178,054,607
  178,054,812
  178,055,202
  178,055,929
  178,055,934
  178,055,940
  178,056,030
  178,056,481
  178,057,037
  178,057,074
  178,057,202
  178,057,497
  178,057,618
  178,057,753
  178,058,078
  178,058,345
  178,058,347
  178,058,349
  178,058,416
  178,058,536
  178,058,658
  178,058,663
  178,059,294
  178,059,609
  178,059,713
  178,059,891
  178,059,968
  178,060,059
  178,060,331
  178,060,398
  178,060,489
  178,060,506
  178,060,745
  178,060,772
  178,060,797
  178,060,798
  178,060,800
  178,060,807
  178,061,001
  178,061,063
  178,061,179
  178,061,242
  178,061,257
  178,061,264
  178,061,463
  178,061,469
  178,061,483
  178,061,605
  178,061,655
  178,061,667
  178,061,674
  178,061,682
  178,061,715
  178,061,733
  178,061,779
  178,061,782
  178,061,798
  178,061,806
  178,061,809
  178,061,892
  178,062,042
  178,062,241
  178,062,247
  178,062,707
  178,063,127
  178,064,268
  178,064,291
  178,064,675
  178,064,723
  178,065,589
  178,065,917
  178,066,313
  178,066,455
  178,066,827
  178,066,867
  178,068,142
  178,068,167
  178,068,368
  178,068,461
  178,068,575
  178,068,668
  178,068,715
  178,069,233
  178,069,849
  178,070,712
  178,071,439
  178,071,441
  178,071,512
  178,071,514
  178,071,940
  178,072,166
  178,072,356
  178,072,651
  178,072,888
  178,073,057
  178,073,396
  178,073,503
  178,073,604
  178,073,724
  178,073,838
  178,073,845
  178,074,006
  178,074,040
  178,074,073
  178,074,110
  178,074,351
  178,074,885
  178,075,072
  178,075,362
  178,075,419
  178,075,441
  178,075,473
  178,075,576
  178,075,600
  178,075,610
  178,075,617
  178,075,631
  178,075,666
  178,075,741
  178,075,749
  178,076,101
  178,076,298
  178,076,373
  178,076,375
  178,076,496
  178,076,505
  178,076,836
  178,077,025
  178,077,096
  178,077,222
  178,077,579
  178,077,818
  178,077,983
  178,077,985
  178,078,415
  178,078,436
  178,078,686
  178,078,945
  178,078,974
  178,079,018
  178,079,666
  178,079,952
  178,080,216
  178,080,826
  178,082,075
  178,082,233
  178,084,957
  178,085,096
  178,085,307
  178,085,960
  178,086,290
  178,086,432
  178,086,433
  178,086,879
  178,087,240
  178,087,507
  178,087,722
  178,088,040
  178,088,049
  178,088,151
  178,088,587
  178,090,450
  178,090,559
  178,090,776
  178,091,051
  178,091,521
  178,091,799
  178,092,229
  178,092,255
  178,092,564
  178,092,805
  178,092,855
  178,092,884
  178,094,178
  178,094,223
  178,094,642
T
C
T
3
C
T
T
A
4
A
G
C
G
A
2
A
C
T
G
A
A
A
2
T
C
A
C
T
A
A
C
2
2
C
-
T
T
G
3
C/2
C
5
A
G
2
C
G
C
A
G
8
11
G/T
C
T
3
A
-
G
G
5
C
C
G
T/A
-
C
T
T
A
C
G
C
G
T
G
G
T
A
A
-
-
-
T
2
G/A
A
C/T
-
T
G
G
-
A
C
C
C/A
T/A
2/-
A/T
C
C
G
T
G
C/-
T
-
C
C/T
G/A
5
A
C
C/T
A/G
C/T
C/T
G/A
A
C/T
A
C/T
C/G
C/T
A
T
T
C
C/T
C/T
G/A
G
G
A
-
A
A
G
T
G
A
G
G
T
C
C
-
-
3
13
C
G
A
A
T
T
C
C
C
T
T
C
A
A
G
2
A/G
G/5
G
5
3
2/-
6/-
C/T
A/G
C/T
C/T
G/C
-
4/-
4/-
4/-
4/-
2/-
2/-
C/3
8/-
A/G
A/G
T/C
T
T
A/G
G/2
G
G/A
-
G
C
4
C
A
C
G
C
G
A
2
C
C
G
A
T
A
G
C
2/-
G/A
C/T
C/T
T
G
G
G
6
C
A
G
A
A
A
A
T
G
G
C
A
T
T
-
G
G
G
G/A
C
A/G
C/T
A/G
G/T
A/G
C/T
3
C
T
T
G/A
A/T
-
G
G
A
G
A
C
C
G
A
-
T
A
C
G
G
2
G
A
2
A
A
T
C
T
T
T
T
-
C
T
A
T
G
T
A
T
A
G
A
A
G
T
A
T
A
G
T
T/C
C