Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 110,991 (bp)   Positions: 220
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.264
.05
--
--
--
.28
.046
.396
.191
.122
.171
.009
.959
.952
.742
.738
.986
.986
.996
.946
.964
.196
--
--
--
.002
.001
.005
.049
--
--
--
--
--
--
.014
.217
--
--
.48
.022
--
--
--
.0
.25
.005
--
.011
.358
.0
--
--
.026
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.896
.618
.86
--
.385
.212
.417
.932
.547
--
.522
.075
.0
.001
--
--
.002
.002
.581
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.979
--
--
.026
.011
.014
.067
--
--
--
--
--
.022
.003
.013
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.029
.281
.003
.077
.0
.015
.011
.01
.001
.011
.027
--
--
--
--
--
--
--
.042
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.003
.001
--
.001
.002
.15
.871
.254
.703
.175
.297
--
--
--
--
--
.008
.212
--
--
--
--
--
.005
.523
--
--
--
.292
--
--
--
.012
.016
--
--
--
--
--
.622
.724
--
--
--
.16
.01
.002
.001
.001
.5
.514
.084
.3
.017
.452
.0
.921
.961
.528
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Sycp1
Sycp1
Sycp1
Sycp1
Sycp1
Sycp1
Sycp1
Sycp1
Sycp1
Sycp1
Sycp1
Sycp1
Sycp1
Sycp1
Sycp1
Sycp1
Sycp1
Sycp1
C
A
C
4
2
13
T
C
C
A
A
G
2
4
T
G
T
G
A
G
A
C
T
2
A
C
G
A
C
G
T
C
T
2
C
C
2
T
T
C
4
T
A
C
A
A
G
T
C
A
C
C
T
A
G
C
C
T
T
G
G
3
G
T
C
G
T
T
C
T
T
G
A
2
A
A
6
A
C
C
G
10
G
A
A
G
T
T
A
A
T
T
A
G
A
T
T
T
T
A
T
T
A
A
G
G
C
6
C
A
A
T
G
T
A
C
A
C
A
T
A
G
G
C
T
4
T
A
T
C
3
2
A
49
T
C
G
A
G
C
G
T
A
C
T
G
G
T
C
T
T
T
A
T
2
A
C
G
A
A
A
C
A
A
A
C
C
T
A
C
T
G
G
2
T
4
G
A
2
T
G
A
A
G
A
G
C
T
G
A
4
A
C
A
A
A
T
C
A
C
T
C
C
A
G
A
A
A
G
A
4
3
C
G
C
T
G
2
8
C
  224,707,890
  224,707,980
  224,708,751
  224,708,767
  224,708,769
  224,709,007
  224,709,129
  224,709,335
  224,709,374
  224,709,735
  224,711,698
  224,711,903
  224,713,009
  224,713,012
  224,713,118
  224,713,119
  224,713,162
  224,713,163
  224,713,500
  224,714,289
  224,714,309
  224,714,692
  224,717,593
  224,718,177
  224,718,178
  224,720,008
  224,720,709
  224,721,540
  224,721,711
  224,722,472
  224,722,871
  224,723,009
  224,723,046
  224,723,379
  224,723,905
  224,723,988
  224,724,212
  224,724,368
  224,724,378
  224,724,880
  224,746,434
  224,746,961
  224,746,970
  224,747,109
  224,748,161
  224,748,693
  224,749,972
  224,750,678
  224,751,123
  224,751,326
  224,751,598
  224,752,084
  224,752,111
  224,752,175
  224,752,767
  224,752,830
  224,753,410
  224,753,416
  224,753,908
  224,754,054
  224,754,105
  224,754,175
  224,756,249
  224,756,791
  224,756,794
  224,756,830
  224,756,880
  224,757,550
  224,757,614
  224,757,843
  224,758,904
  224,758,942
  224,759,487
  224,759,923
  224,760,001
  224,760,213
  224,760,455
  224,760,661
  224,760,949
  224,761,041
  224,761,324
  224,761,938
  224,762,539
  224,763,150
  224,763,480
  224,763,920
  224,764,404
  224,764,405
  224,764,552
  224,764,554
  224,764,555
  224,764,558
  224,764,560
  224,764,659
  224,764,661
  224,764,686
  224,768,225
  224,768,333
  224,769,902
  224,770,543
  224,770,979
  224,771,274
  224,772,046
  224,773,309
  224,775,115
  224,775,220
  224,775,485
  224,775,646
  224,775,651
  224,776,707
  224,776,714
  224,776,723
  224,777,043
  224,777,046
  224,777,047
  224,777,072
  224,777,351
  224,777,968
  224,778,720
  224,778,768
  224,778,864
  224,778,956
  224,779,101
  224,794,540
  224,795,479
  224,796,605
  224,796,918
  224,797,964
  224,799,012
  224,799,073
  224,799,153
  224,799,154
  224,799,243
  224,799,392
  224,799,877
  224,800,182
  224,800,726
  224,800,864
  224,801,097
  224,801,335
  224,801,375
  224,802,161
  224,802,606
  224,809,051
  224,809,759
  224,810,044
  224,811,115
  224,812,007
  224,812,349
  224,813,328
  224,814,039
  224,814,041
  224,814,058
  224,814,222
  224,814,432
  224,814,493
  224,815,181
  224,815,395
  224,815,458
  224,815,459
  224,818,792
  224,819,114
  224,819,620
  224,820,732
  224,821,170
  224,821,176
  224,822,261
  224,822,544
  224,822,812
  224,827,911
  224,827,960
  224,827,985
  224,828,242
  224,828,257
  224,828,923
  224,829,197
  224,830,496
  224,831,698
  224,832,151
  224,832,935
  224,833,042
  224,834,068
  224,834,612
  224,834,699
  224,835,579
  224,836,877
  224,837,367
  224,837,372
  224,837,436
  224,837,597
  224,837,844
  224,837,930
  224,838,127
  224,838,560
  224,838,726
  224,839,228
  224,839,838
  224,840,619
  224,840,729
  224,842,016
  224,842,433
  224,843,484
  224,844,671
  224,844,734
  224,844,743
  224,845,255
  224,845,297
  224,845,338
  224,846,333
  224,846,527
  224,846,602
  224,846,603
  224,848,024
  224,848,633
  224,849,226
  224,851,318
  224,853,581
  224,855,683
  224,855,708
  224,855,768
A
-
A
4/-
2/-
-
A
T
T
G
-
A
-
-
C
A
C
A
-
2
G
T
C
-
A/-
4
A
-
-
A
T/2
C/-
T/C
2/-
T
T
-
-
-
G
-
T/3
T
-
C
G
T
C
A
G
T
9/7
T/3
2
A
T
T
G
A
A
5
-
T
18
11
2
C
2
T
C
G
A
7
-
A/-
-
-
G
A
T
2
10/-
C
G
G
-
C
C
7
3
A
C
C
-
T
C
3
C
G
G
G
C
-
G
A
A
3
-
6
G
T
2
C
C
T
G
-
T
A/2
A
C
G/A
A
T
-
-
2
C
C
G
-
2/-
G
-
A
A
A
G
2
G
2
G
G
2
C
A
2
C
T
A
C
C
G
C
-
G
G
A
T
C
2
2
2
5
G
?
T
C
G
G
G
A
G/11
2/-
2
-
A
G
-
C
A
5
G
5
C
2
26
4
A
-
-
C
T
3
G
G
T/2
T
-
C/A
10
3
10
G
A
4
-
-
T
C
4/-
3/-
T
5
T
3
A
-
-
3