Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 61,414 (bp)   Positions: 280
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
1.0
.0
.101
.001
.002
.192
.1
.312
.639
.008
.004
.046
.016
.801
.0
.003
.002
.184
--
--
--
--
.0
.049
.072
.07
.486
.023
--
.076
.703
.264
--
.029
.678
.223
.062
.036
--
--
--
--
--
--
.358
--
.073
.353
.468
.044
.438
.026
.139
--
--
--
--
--
--
--
.03
.034
.025
.034
.074
.057
.052
.717
--
--
--
--
.002
.079
.027
.001
.008
.065
.018
.378
.126
.018
--
--
--
--
.027
.01
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.043
.79
.983
.577
.01
.044
.028
.022
.317
.047
.003
.0
.473
.047
.04
.052
.025
.012
.006
.009
.001
.105
.102
.007
.006
.005
.004
.004
.004
.002
.056
.002
.006
.01
.037
.036
.031
.675
--
--
--
--
.3
.029
.036
.088
.245
.768
.259
.117
.045
.193
.175
.046
.056
.0
.015
.284
.114
.005
.429
.003
.001
.001
.001
.018
.16
.114
.025
.001
.432
.0
.064
.851
.001
.0
.0
1.0
.003
.004
.188
.075
.01
.003
.003
.012
.353
.901
.005
--
.004
.047
.016
.027
.122
.167
.012
.032
--
.002
.001
.465
.017
.051
.044
.01
.412
.766
.115
--
--
--
--
.024
.107
.033
.102
.153
.093
.581
.011
.0
.002
.002
.029
--
--
.001
.002
.002
.468
.087
.004
.002
.417
.363
.101
.158
.136
.997
.241
.239
.001
.003
.001
.008
--
.0
.061
.008
.08
--
--
.164
.076
.027
--
.772
.082
.009
.027
.0
.082
.246
.119
.107
--
.001
.006
.004
.0
.0
.0
.002
.0
.001
.0
.002
.258
.0
.0
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
Swap70
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
G
T
C
G
T
C
A
C
T
C
C
A
T
C
A
C
A
G
C
T
G
8
T
G
T
T
A
T
C
C
C
A
C
A
C
A
T
C
A
T
T
C
G
T
G
A
C
T
T
G
T
A
G
C
C
C
T
A
C
2
T
G
A
C
A
T
T
A
C
G
T
C
T
T
C
C
T
A
7
A
4
135
A
T
T
T
2
G
T
A
A
T
T
T
A
11
G
A
A
C
G
G
A
C
A
A
G
C
T
G
C
C
T
C
17
A
C
C
T
A
T
C
C
T
C
C
A
G
G
A
A
T
T
G
C
C
6
C
A
A
T
G
G
G
G
C
T
A
T
G
T
G
C
G
A
20
22
C
A
T
C
C
G
2
C
A
4
C
C
G
A
A
C
T
C
G
G
A
A
C
C
A
G
G
A
A
T
G
T
A
G
T
A
4
C
A
C
6
4
T
T
C
T
A
G
G
T
A
A
C
10
2
C
G
C
C
A
T
A
A
T
A
6
4
T
A
G
G
G
A
T
4
T
T
G
A
A
C
T
C
A
C
A
5
C
G
A
T
3
A
G
T
C
3
G
G
C
C
G
C
T
G
G
C
A
A
C
C
G
T
G
G
T
4
G
A
A
G
  181,861,440
  181,861,555
  181,861,607
  181,861,816
  181,861,849
  181,861,880
  181,862,256
  181,862,317
  181,862,490
  181,862,667
  181,862,725
  181,862,840
  181,862,888
  181,862,940
  181,863,016
  181,863,412
  181,863,413
  181,863,591
  181,863,626
  181,863,637
  181,863,670
  181,863,814
  181,863,837
  181,863,922
  181,863,948
  181,863,949
  181,864,087
  181,864,310
  181,864,558
  181,864,824
  181,865,043
  181,865,060
  181,865,343
  181,865,595
  181,865,635
  181,865,681
  181,865,691
  181,865,707
  181,865,910
  181,865,911
  181,865,912
  181,866,046
  181,866,140
  181,866,194
  181,866,440
  181,866,670
  181,866,802
  181,866,835
  181,866,852
  181,866,998
  181,867,039
  181,867,149
  181,867,215
  181,867,433
  181,867,442
  181,867,449
  181,867,452
  181,867,457
  181,867,541
  181,867,561
  181,867,934
  181,867,949
  181,867,952
  181,867,977
  181,868,003
  181,868,169
  181,868,178
  181,868,293
  181,868,489
  181,868,508
  181,868,539
  181,868,542
  181,868,698
  181,868,919
  181,869,037
  181,869,055
  181,869,195
  181,869,356
  181,869,746
  181,869,790
  181,869,824
  181,869,887
  181,870,006
  181,870,013
  181,870,212
  181,870,225
  181,870,308
  181,870,310
  181,870,313
  181,870,315
  181,870,317
  181,870,318
  181,870,321
  181,870,322
  181,870,323
  181,870,325
  181,870,327
  181,870,329
  181,870,569
  181,870,631
  181,871,107
  181,871,217
  181,871,359
  181,871,416
  181,871,689
  181,871,870
  181,871,876
  181,871,951
  181,872,107
  181,872,295
  181,872,301
  181,872,605
  181,872,698
  181,872,930
  181,872,934
  181,872,980
  181,873,028
  181,873,153
  181,873,572
  181,873,699
  181,874,169
  181,874,171
  181,874,410
  181,874,491
  181,874,558
  181,874,601
  181,874,602
  181,874,682
  181,874,683
  181,874,753
  181,874,763
  181,874,804
  181,874,940
  181,875,206
  181,875,208
  181,875,233
  181,875,315
  181,875,560
  181,875,565
  181,875,633
  181,875,637
  181,875,784
  181,875,819
  181,875,887
  181,875,899
  181,875,942
  181,875,980
  181,876,013
  181,876,023
  181,876,043
  181,876,096
  181,876,305
  181,876,407
  181,876,793
  181,877,050
  181,877,078
  181,877,129
  181,877,555
  181,877,615
  181,878,438
  181,878,779
  181,878,795
  181,878,849
  181,878,896
  181,879,696
  181,879,873
  181,880,661
  181,880,722
  181,880,750
  181,881,251
  181,881,284
  181,881,703
  181,882,076
  181,882,973
  181,882,989
  181,883,362
  181,883,489
  181,883,676
  181,883,677
  181,884,367
  181,884,384
  181,884,410
  181,884,412
  181,884,413
  181,884,434
  181,884,534
  181,885,368
  181,885,523
  181,885,681
  181,886,572
  181,886,710
  181,887,226
  181,887,295
  181,887,454
  181,887,621
  181,887,690
  181,887,754
  181,888,240
  181,888,430
  181,888,618
  181,888,652
  181,888,904
  181,889,270
  181,889,299
  181,889,305
  181,889,448
  181,889,476
  181,890,213
  181,891,106
  181,891,132
  181,891,138
  181,891,204
  181,891,904
  181,892,075
  181,892,543
  181,892,731
  181,892,812
  181,892,848
  181,892,900
  181,893,434
  181,894,390
  181,894,551
  181,894,735
  181,895,347
  181,895,532
  181,895,534
  181,896,198
  181,896,371
  181,896,372
  181,896,935
  181,896,995
  181,897,792
  181,898,568
  181,898,923
  181,898,926
  181,899,286
  181,899,435
  181,899,594
  181,899,921
  181,900,873
  181,900,874
  181,901,250
  181,901,534
  181,901,981
  181,902,670
  181,903,372
  181,903,926
  181,904,050
  181,904,286
  181,904,361
  181,906,541
  181,906,543
  181,906,833
  181,906,851
  181,906,862
  181,907,429
  181,907,592
  181,907,779
  181,908,802
  181,909,522
  181,912,529
  181,914,416
  181,914,556
  181,915,000
  181,915,468
  181,916,381
  181,917,353
  181,918,337
  181,918,341
  181,918,343
  181,918,352
  181,918,353
  181,918,355
  181,920,426
  181,921,141
  181,921,623
  181,921,655
  181,921,762
  181,922,149
  181,922,175
T
C
A
C
G
A
2
T
G
T
C
2
T
G
-
T
G
T
2
A
T
A
2
-
4
5
C
G
G
C
5
A
T
G
T
T
T
G
G
T
G
C
A
T
A
C
A
G
2
C
C
T
G
C
T
T
T
A
C
G
T
-
A
A
G
T
C
C
C
C
T
G/2
2
A
C
A
G
T
5
G
-
G
-
-
T
C
C
G
-
2
C
6
C
4
4
A
3
-
A
G
G
-
C
C
G
T
G
G
A
A
C
A
A
T
C
-
-
G
T
-
C
G
A
T
T
C
4
T
G
A
A
G
G
C
C
41
4
G
-
A
C
2
C
A
A
A
8
G
C
-
A
A
C
T
T
A
C
20/-
22/-
T
G
T/-
3
G
C
-
A
C
-
2
T
C
G
G
T
-
T
T
C
-
G
12
T
G
C
T
G
T
A
T
2
G
-
113
-
-
G
G
2
-
-
C
14
G
A
G
A
4/5
G
3
11
A
-
2/-
4
A
5
T
-
C
G
G
-
G
6/-
-
C
C
A
A
C
G
C
-
T/3
-
A
7
G
C/-
T/-
T
C
T
G
5/-
3
C
G
17
-
A/-
A
C
T
-
A
A
G
11
A
T
C
A
A
A
G
T
G
G
A
A
A
A
-
-
A
T
G
A