Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 127,554 (bp)   Positions: 263
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.005
.447
.242
.146
.013
.0
.001
.075
.042
.0
.617
.012
.861
.732
.0
.002
.361
.98
.96
.995
.029
.02
.463
.122
--
--
.202
.114
.0
.0
.003
.002
.095
.001
.0
.0
.0
.001
.05
.017
.0
--
--
.043
.003
.006
.008
.061
.062
.244
--
--
--
--
.986
.017
.086
.0
.006
.007
.012
.002
.163
--
--
.036
--
.124
.003
.022
.999
.047
.03
.021
.053
.251
.0
.199
.003
.002
--
--
--
--
.657
--
--
--
--
--
--
--
.001
.012
.004
.001
.0
.001
.359
.375
.291
.189
.044
.018
.032
.36
.009
.002
.843
.0
.616
.628
.007
.005
.873
.0
.001
.0
--
--
.054
.003
.012
.002
--
.511
.941
.004
.102
.004
.239
.005
.018
.029
.915
--
--
.001
.524
.001
.0
.417
.719
.03
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.004
.01
.042
.584
--
--
--
.004
.827
--
--
--
--
.365
--
--
--
.0
.005
.003
.002
--
--
.038
--
--
.084
.007
--
.419
.5
.243
.081
.054
--
--
--
.07
.049
.0
.074
.653
.677
--
.469
.209
.029
.359
.542
.608
.684
.646
.481
.382
.033
.008
.003
.002
.006
.012
.012
.002
.001
.002
.001
.002
.003
.044
.007
.001
.021
.083
.003
.055
--
--
.315
.001
.0
.027
.883
.091
--
--
.022
.002
.125
--
.006
.002
.246
.216
.031
.003
.015
--
--
.139
.563
.905
--
.17
--
--
.44
.027
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
Strbp
A
G
3
C
T
T
T
A
T
C
C
C
C
A
G
3
C
G
A
T
T
A
C
G
G
G
T
T
G
G
G
T
A
G
2
G
A
C
T
3
A
A
T
G
A
A
C
C
A
C
A
6
C
C
C
T
C
G
2
A
A
A
G
T
16
A
C
A
C
T
C
A
A
C
T
A
G
T
G
T
G
T
G
G
C
G
T
G
C
A
G
3
T
T
G
C
C
T
A
A
11
C
C
6
G
C
G
C
G
C
3
2
T
A
T
C
C
G
2
T
C
A
T
C
A
G
T
C
G
C
G
A
6
T
G
C
16
G
A
C
T
A
C
A
A
C
12
G
A
4
T
A
C
T
G
C
2
10
T
C
G
A
A
A
C
C
C
C
C
T
G
G
A
A
5
G
A
A
A
A
A
4
G
A
2
T
T
G
A
G
T
C
T
A
C
A
G
G
G
G
T
G
G
G
T
2
3
G
2
G
G
2
C
7
G
4
T
C
2
A
A
A
G
A
T
T
G
T
A
T
A
T
G
C
3
C
C
A
T
A
T
C
A
T
16
G
25
4
2
T
C
6
5
C
A
A
A
T
A
2
G
2
G
  27,059,012
  27,059,451
  27,059,807
  27,060,041
  27,060,417
  27,060,543
  27,061,926
  27,062,187
  27,062,189
  27,063,015
  27,063,241
  27,063,678
  27,064,443
  27,064,450
  27,064,652
  27,065,413
  27,066,764
  27,068,700
  27,069,431
  27,069,785
  27,072,862
  27,072,880
  27,073,020
  27,073,410
  27,073,956
  27,074,152
  27,074,456
  27,074,567
  27,074,886
  27,074,942
  27,074,949
  27,075,024
  27,075,036
  27,075,048
  27,075,050
  27,075,056
  27,075,057
  27,075,060
  27,076,274
  27,076,332
  27,076,561
  27,077,518
  27,077,559
  27,078,564
  27,078,689
  27,079,279
  27,079,284
  27,079,622
  27,079,623
  27,081,706
  27,082,111
  27,083,776
  27,085,212
  27,087,305
  27,088,125
  27,089,247
  27,089,274
  27,090,551
  27,091,887
  27,091,888
  27,092,186
  27,092,339
  27,092,414
  27,092,810
  27,093,036
  27,093,227
  27,093,824
  27,094,297
  27,094,381
  27,094,420
  27,095,513
  27,095,571
  27,095,892
  27,097,640
  27,097,901
  27,098,262
  27,098,610
  27,099,016
  27,099,362
  27,099,391
  27,101,226
  27,101,539
  27,101,642
  27,103,592
  27,105,279
  27,107,437
  27,107,609
  27,108,498
  27,108,514
  27,108,515
  27,108,785
  27,109,589
  27,110,509
  27,110,644
  27,110,645
  27,110,647
  27,110,659
  27,110,664
  27,110,684
  27,110,685
  27,110,766
  27,110,788
  27,111,024
  27,111,233
  27,112,031
  27,112,099
  27,114,227
  27,115,785
  27,116,009
  27,117,077
  27,117,554
  27,117,555
  27,118,304
  27,118,404
  27,118,716
  27,118,870
  27,120,182
  27,120,297
  27,120,316
  27,120,882
  27,121,229
  27,121,303
  27,121,764
  27,121,932
  27,123,280
  27,123,776
  27,124,329
  27,124,520
  27,125,159
  27,125,603
  27,125,830
  27,126,531
  27,127,095
  27,128,570
  27,129,279
  27,129,643
  27,129,712
  27,131,303
  27,132,585
  27,133,800
  27,135,644
  27,136,136
  27,136,225
  27,136,381
  27,137,919
  27,138,378
  27,138,381
  27,138,571
  27,138,641
  27,138,863
  27,140,561
  27,140,680
  27,141,021
  27,141,986
  27,142,004
  27,142,023
  27,142,593
  27,142,741
  27,143,285
  27,143,352
  27,143,691
  27,145,284
  27,145,699
  27,145,702
  27,145,717
  27,145,718
  27,145,893
  27,146,349
  27,146,879
  27,146,887
  27,147,210
  27,147,550
  27,148,467
  27,148,469
  27,149,689
  27,153,627
  27,154,480
  27,155,861
  27,155,892
  27,156,252
  27,156,912
  27,157,356
  27,157,899
  27,158,412
  27,158,418
  27,158,422
  27,158,426
  27,158,629
  27,159,570
  27,160,566
  27,161,589
  27,162,197
  27,162,335
  27,162,459
  27,162,569
  27,162,583
  27,162,683
  27,162,767
  27,162,775
  27,162,782
  27,162,854
  27,162,860
  27,162,863
  27,162,868
  27,162,873
  27,162,878
  27,162,881
  27,162,891
  27,162,895
  27,162,900
  27,162,903
  27,162,908
  27,162,911
  27,162,917
  27,162,929
  27,162,941
  27,162,954
  27,162,966
  27,163,134
  27,163,135
  27,163,190
  27,163,193
  27,164,373
  27,164,628
  27,165,171
  27,165,981
  27,166,140
  27,167,419
  27,167,659
  27,168,823
  27,169,354
  27,170,098
  27,170,378
  27,170,547
  27,171,401
  27,171,779
  27,171,790
  27,171,902
  27,173,899
  27,174,983
  27,175,738
  27,176,734
  27,177,182
  27,177,377
  27,177,382
  27,177,846
  27,178,648
  27,178,687
  27,179,055
  27,179,056
  27,180,062
  27,180,919
  27,181,353
  27,181,386
  27,181,929
  27,182,915
  27,183,659
  27,183,963
  27,184,030
  27,185,737
  27,185,738
  27,185,741
  27,185,742
G
A
-
T
C
C
G
2
G
3
A
4
-
G
A
-
2
A
G
3/TA
C
T
3
A
C
A
2
2
-
A
-
2
2
T
-
2
T
-
T/3
-
G
2
C
A
G
T
2
C/2
A/-
T
G
6/-
T
T
T
C
T
2
2/-
A/-
G
G
A
T/118
-
G
5/6
4
T
11
C/3
T
-
G
2
-
T
C
C
C
-
C
A
A
4/3
A
A
G/2
C/15
A/-
A
3/-
A
G
C
A
G
G
T
T
-
2
3
-
C
T
A
A
25/27
A
3/-
-
C
T
G
3
3
4
2/-
C
3
G
G
A
G
A
C
T
2
2
A
C
-
T/13
C
9
-
T
T
T
A
-
G
A/-
G
A
-
A
G
-
9
G
2
2
2
2
-
-
-
T
G/2
G
2
2
A
3
T
3
A
2
A
3
T
C
5/-
A
G
G
-
G
T
-
A
G
-
G
3
A
-
T
C
3/CA
-
G
CT/3
T
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
3
-
-
-
-
-
2/-
-
10
55
A
-
23
A
2
C
T
A
-
C
A
3/CA
-
2
2
C
3
G
T/-
G
C
C
-
5
-
-
2/-
T/-
T
-
-
2
-
G
C
-
G
2/-
G/-
2/-
G/-