Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 113,160 (bp)   Positions: 290
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.009
.001
.003
.0
.001
.023
.012
.01
.007
.019
--
.011
.003
.017
.159
.012
.003
.096
--
--
.0
.0
.003
.0
.001
.0
.001
.0
.0
.038
.007
.007
.036
.004
.002
.0
.001
.404
.06
.002
.0
.138
.001
.001
.0
.004
.004
.002
.563
.01
.0
.001
.1
.096
.085
.023
.019
.03
.003
.002
.006
.006
.006
.002
.018
.188
.006
.151
.002
.013
.001
.007
.009
.019
.001
.0
.001
.017
.0
.197
.02
.049
.004
.041
.023
.464
.189
.0
.993
.116
.0
.0
.151
.001
.886
.0
.992
.029
.002
.006
.039
.0
.063
.076
.083
.775
.005
--
.001
--
--
--
--
.228
--
--
--
--
.0
.0
.006
.009
.0
.044
.0
.008
.681
.0
.166
.001
.008
.95
.996
.335
.299
.0
.0
.022
.026
.031
.061
.181
.002
.015
.004
.93
.013
.122
.002
.001
.101
.012
.262
.004
.028
.294
.032
.004
.237
--
.12
.037
.003
.112
.004
.002
.0
.002
.0
.001
.074
.196
.001
.001
.003
.001
.0
.001
.033
.036
.002
.008
.0
.002
.003
.002
.0
.004
.016
.009
.042
.001
.002
.009
.0
.0
.011
.326
.073
.075
.079
.081
.001
.0
.001
.001
.069
.07
.073
.168
.024
.0
.035
.014
.142
.033
.001
.0
.0
.002
.012
.001
.0
.018
.074
.084
.072
.021
--
.85
.853
.066
.0
.003
.025
.001
.0
.001
.0
.001
.006
.0
.004
.0
.001
.002
.03
.001
.034
.001
.001
.028
.002
--
.161
.049
.0
.671
.021
.012
.043
.017
.007
.132
.155
.36
.003
.0
.001
.149
.007
.002
.002
.005
.143
.0
.011
.009
.004
.0
.001
.006
.063
.038
.004
.04
.012
.0
.0
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
Stk32a
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
A
A
G
C
10
T
10
T
T
2
C
A
A
A
39
A
38
T
C
C
A
C
A
C
T
14
T
A
A
C
C
G
C
T
T
C
9
T
A
T
14
T
T
G
T
C
A
G
A
G
G
2
2
A
A
A
T
C
C
A
C
T
T
C
C
A
G
A
C
A
C
C
G
A
T
C
G
G
T
T
T
T
T
C
A
T
C
C
C
A
T
C
C
A
T
C
C
C
C
2
T
T
18
16
2
A
C
T
C
C
T
2
A
C
G
A
A
2
A
C
T
T
G
A
G
C
C
T
A
G
C
C
C
G
T
T
A
A
T
C
A
T
G
C
T
G
G
C
G
G
T
C
G
C
C
A
T
A
C
T
T
A
G
A
C
C
A
C
C
A
T
A
G
C
C
C
G
T
C
C
A
A
G
C
C
A
G
T
C
G
T
C
T
C
C
T
A
G
C
G
G
T
A
C
C
2
G
G
G
C
C
G
C
C
T
A
C
T
T
T
C
A
G
C
A
A
C
T
2
24
G
T
A
T
T
G
C
A
T
T
2
G
C
G
A
G
T
T
2
A
G
T
G
G
G
A
C
T
T
C
G
T
A
A
C
T
C
T
A
C
T
C
A
3
A
A
C
C
A
T
G
A
T
A
8
7
T
G
  37,253,353
  37,253,505
  37,253,981
  37,254,508
  37,254,878
  37,256,016
  37,257,245
  37,257,246
  37,257,248
  37,257,257
  37,257,260
  37,257,932
  37,258,360
  37,258,377
  37,258,608
  37,259,466
  37,259,639
  37,260,253
  37,260,352
  37,260,484
  37,261,351
  37,263,671
  37,264,301
  37,264,915
  37,265,363
  37,265,442
  37,265,693
  37,265,837
  37,265,893
  37,265,936
  37,266,077
  37,266,666
  37,266,869
  37,267,347
  37,268,096
  37,268,386
  37,268,932
  37,269,188
  37,269,549
  37,270,955
  37,272,247
  37,272,257
  37,272,358
  37,272,776
  37,272,922
  37,272,923
  37,273,163
  37,273,549
  37,273,756
  37,273,790
  37,273,916
  37,274,155
  37,274,595
  37,274,811
  37,274,814
  37,274,819
  37,274,912
  37,275,367
  37,275,410
  37,275,599
  37,275,609
  37,275,617
  37,275,627
  37,275,832
  37,276,508
  37,276,688
  37,276,727
  37,276,867
  37,277,782
  37,278,884
  37,279,201
  37,279,694
  37,280,164
  37,280,165
  37,280,706
  37,281,932
  37,282,010
  37,282,535
  37,283,174
  37,283,474
  37,283,934
  37,284,345
  37,284,617
  37,284,904
  37,284,915
  37,284,966
  37,285,481
  37,285,523
  37,286,389
  37,286,434
  37,287,808
  37,292,691
  37,293,014
  37,293,814
  37,293,931
  37,294,027
  37,294,175
  37,294,219
  37,294,733
  37,295,154
  37,296,476
  37,296,703
  37,297,354
  37,297,831
  37,298,876
  37,298,878
  37,299,137
  37,299,533
  37,299,638
  37,300,111
  37,301,290
  37,301,355
  37,301,544
  37,301,905
  37,302,098
  37,303,552
  37,303,753
  37,303,812
  37,304,527
  37,306,504
  37,307,788
  37,308,868
  37,309,162
  37,309,834
  37,310,186
  37,310,373
  37,311,652
  37,311,892
  37,312,232
  37,313,384
  37,313,438
  37,313,444
  37,315,460
  37,315,531
  37,315,592
  37,315,908
  37,317,467
  37,317,674
  37,317,909
  37,318,823
  37,319,118
  37,319,483
  37,319,652
  37,319,720
  37,319,727
  37,319,864
  37,320,222
  37,320,574
  37,320,587
  37,320,724
  37,321,140
  37,322,235
  37,322,489
  37,323,041
  37,323,156
  37,323,513
  37,323,805
  37,324,058
  37,324,953
  37,325,811
  37,325,948
  37,326,249
  37,327,651
  37,327,731
  37,328,094
  37,328,333
  37,328,765
  37,329,232
  37,329,264
  37,329,648
  37,329,753
  37,329,772
  37,330,178
  37,330,218
  37,330,221
  37,330,650
  37,330,781
  37,330,783
  37,332,394
  37,332,829
  37,332,832
  37,333,106
  37,333,298
  37,333,438
  37,333,820
  37,334,145
  37,334,566
  37,335,842
  37,336,170
  37,336,645
  37,336,650
  37,336,691
  37,337,150
  37,337,351
  37,337,448
  37,337,484
  37,337,490
  37,337,514
  37,337,528
  37,339,151
  37,339,152
  37,339,154
  37,339,163
  37,339,256
  37,339,419
  37,340,215
  37,340,767
  37,341,383
  37,341,384
  37,341,388
  37,341,734
  37,342,072
  37,342,171
  37,342,251
  37,342,820
  37,342,874
  37,343,484
  37,343,706
  37,343,817
  37,343,854
  37,345,150
  37,345,433
  37,345,632
  37,346,288
  37,346,609
  37,347,228
  37,347,723
  37,347,817
  37,347,918
  37,348,601
  37,348,817
  37,348,822
  37,349,628
  37,349,842
  37,350,213
  37,350,571
  37,350,645
  37,350,675
  37,350,797
  37,350,798
  37,350,862
  37,351,328
  37,351,531
  37,351,591
  37,351,868
  37,351,977
  37,352,347
  37,352,559
  37,352,747
  37,353,102
  37,353,168
  37,353,593
  37,353,620
  37,354,372
  37,354,610
  37,354,789
  37,354,809
  37,355,245
  37,355,295
  37,355,523
  37,355,826
  37,356,567
  37,356,860
  37,356,862
  37,357,178
  37,357,202
  37,357,499
  37,357,724
  37,358,903
  37,359,108
  37,359,254
  37,359,342
  37,359,903
  37,360,036
  37,360,077
  37,360,230
  37,360,543
  37,360,814
  37,361,406
  37,361,459
  37,361,595
  37,362,135
  37,362,377
  37,362,782
  37,363,053
  37,363,413
  37,365,103
  37,365,112
  37,365,317
  37,365,790
G
A
G
T
A
A
10/-
T/-
10/-
T/2
2
-
A
G
T
T
-
G
-
C
T
T
G
T
-
T
C
-
C
G
G
G
A
C
T
C
-
T
-
C
T
5
-
C
C
A
C
A
G
T
G
2
C
-
-
T
G
T
C
-
A
G
C/59
C
C
C/13
T
G
A
T
T
-
A
G
C
2
G
T
A
A
C
A
C
C
-
T
-
G
T
A
A
G
C
T
G
2
C
-
T
T
T
2/-
3
111
18/-
16/-
-
C
3
-
C/2
C/-
T/2
-
T
T
G/-
A/2
-
-
G
G
G
G
A
G
C
T
T
5
G
5
T
T
T
A
C
C
-
G
C
G
G
A
C
G
C
A
T
T
C
A
C
T
C
A
T
C
C
G
T
-
C
C
T
T
T
G
G
T
A
10
5
T
C
A
G
T
C
G
T
T
C
G
C
T
-
G
A
C
T
A
C
T
G
T
T
C
C
T
T
T
A
A
G
T
T
-
4
T
A
A
A
A
T
T
A
G
T
C
G
C
A
G
A
T
G
5
T
C
2/-
-
-
19
2
G
-
A
T
G
C
G
-
A
T
A
G
T
C
G
-
G
A
C
A
A
T
G
T
C
C
T
-
-
T
2
A
C
T
A
G
T
C
T
2
-
C
T
T
T
G
G
A
C
C
G
-
-
C
A