Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 93,108 (bp)   Positions: 215
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
--
.047
.002
.37
.017
.018
.141
.139
.127
.0
.012
.596
.482
.619
--
--
.085
.003
.008
.132
.003
.012
.002
.192
.045
.001
.001
.051
.0
.015
.005
--
.003
.007
--
--
--
--
--
.002
.002
.019
.041
.027
.053
--
.006
.002
.008
.036
.057
--
--
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.038
.025
.014
.257
.01
.92
.213
.164
.46
.3
.004
.725
.063
.004
.996
.795
.804
.897
.894
.809
--
.048
.026
--
.002
.087
.0
.081
.025
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
.12
.009
.006
.0
.014
.004
.003
.003
.006
--
.218
.398
.001
.0
.059
.001
.004
.129
.001
.001
.014
.004
.106
.249
.028
.086
.117
.0
.0
.0
.108
.0
.001
.005
.046
.055
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.203
.144
.002
.008
.223
.054
.046
.016
.011
.0
.0
.074
.022
.001
.011
.989
.005
.005
.0
.0
--
.004
.025
.003
.999
.037
.049
.025
--
.424
.003
--
--
--
--
--
--
.204
.035
.008
.01
.007
.046
.002
.003
.005
.002
.024
.001
.024
.016
.095
.006
.377
.022
.026
.022
.0
.001
.194
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
Stk10
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
4
T
G
T
T
G
4
3
C
C
T
C
G
T
6
A
T
T
C
A
T
C
T
A
C
12
G
C
21
T
T
T
G
G
C
C
T
A
T
8
4
C
T
G
4
T
G
4
2
A
T
C
T
A
G
G
A
A
A
G
G
G
G
G
A
C
A
A
T
A
C
G
C
G
C
T
2
C
C
G
T
T
T
C
T
G
G
T
C
C
T
A
G
T
T
T
G
G
C
C
26
C
C
C
A
A
T
C
C
4
A
A
A
C
C
C
A
T
T
A
A
A
A
C
A
T
C
A
G
A
C
T
T
G
C
8
A
C
C
T
A
G
C
A
T
C
A
G
G
A
T
G
G
A
4
G
T
C
C
G
A
C
G
G
G
G
A
G
A
G
T
T
9
3
2
C
C
A
T
G
T
C
T
A
G
G
A
C
A
G
G
T
G
12
T
C
G
C
C
T
A
G
G
C
A
C
8
A
C
A
A
A
T
T
A
  17,318,050
  17,318,227
  17,318,393
  17,319,136
  17,319,511
  17,320,666
  17,321,045
  17,321,046
  17,321,050
  17,321,746
  17,321,944
  17,323,120
  17,326,003
  17,326,005
  17,326,805
  17,326,838
  17,328,376
  17,328,408
  17,328,591
  17,329,111
  17,329,881
  17,329,928
  17,330,428
  17,330,570
  17,330,942
  17,332,055
  17,333,388
  17,334,497
  17,334,994
  17,335,455
  17,335,806
  17,336,363
  17,337,185
  17,337,424
  17,337,861
  17,338,007
  17,338,151
  17,338,153
  17,338,368
  17,339,995
  17,339,999
  17,340,033
  17,340,058
  17,340,721
  17,343,952
  17,344,052
  17,344,066
  17,345,327
  17,345,329
  17,345,483
  17,347,073
  17,347,123
  17,347,135
  17,353,601
  17,353,626
  17,353,642
  17,353,643
  17,353,651
  17,353,665
  17,353,666
  17,353,699
  17,353,724
  17,353,749
  17,353,774
  17,354,693
  17,356,060
  17,357,889
  17,357,894
  17,358,223
  17,358,503
  17,358,909
  17,359,083
  17,359,149
  17,359,198
  17,360,653
  17,361,563
  17,361,944
  17,362,018
  17,362,932
  17,363,124
  17,364,099
  17,364,103
  17,364,143
  17,364,147
  17,364,151
  17,364,185
  17,364,270
  17,364,273
  17,364,948
  17,365,684
  17,365,740
  17,365,878
  17,366,095
  17,366,162
  17,366,361
  17,366,627
  17,366,705
  17,366,829
  17,366,838
  17,367,323
  17,367,326
  17,367,331
  17,367,347
  17,367,428
  17,367,460
  17,367,464
  17,367,498
  17,367,781
  17,367,888
  17,367,972
  17,368,176
  17,368,631
  17,368,899
  17,369,599
  17,369,773
  17,369,902
  17,370,016
  17,371,023
  17,371,412
  17,371,420
  17,371,662
  17,372,317
  17,372,878
  17,373,665
  17,374,707
  17,374,949
  17,375,031
  17,375,067
  17,375,302
  17,375,324
  17,375,443
  17,375,804
  17,376,089
  17,376,274
  17,376,481
  17,376,496
  17,376,639
  17,377,138
  17,377,489
  17,377,743
  17,377,748
  17,377,755
  17,377,768
  17,377,773
  17,377,778
  17,377,787
  17,378,118
  17,378,134
  17,378,164
  17,378,165
  17,378,224
  17,378,227
  17,378,279
  17,378,356
  17,378,527
  17,379,032
  17,379,350
  17,380,165
  17,380,619
  17,381,168
  17,381,273
  17,381,284
  17,381,301
  17,381,363
  17,381,401
  17,382,147
  17,382,687
  17,382,710
  17,382,720
  17,383,077
  17,385,123
  17,386,289
  17,386,291
  17,386,298
  17,386,299
  17,386,684
  17,386,695
  17,386,703
  17,386,719
  17,387,274
  17,389,681
  17,390,835
  17,391,243
  17,391,379
  17,391,690
  17,392,103
  17,395,173
  17,395,325
  17,395,366
  17,395,370
  17,395,409
  17,395,863
  17,396,152
  17,398,376
  17,399,411
  17,399,846
  17,400,245
  17,400,315
  17,400,945
  17,401,294
  17,401,301
  17,401,950
  17,401,974
  17,402,223
  17,402,417
  17,403,980
  17,404,412
  17,407,183
  17,407,598
  17,408,150
  17,408,152
  17,408,744
  17,409,077
  17,409,339
  17,409,640
-
G
A
C
-
A
-
-
-
T
4
T
6
T/2
-
A/T
A
C
5
G
C
T
G
G
A
-
C
2
-
C
T/3
T/A
A
A
T
T
C
C
C
8/-
-
C/G
6
A
-
2
2
4/-
2/-
A/-
2
T
2
A/G
G/A
G/C
A/C
A/G
2
2
G/A
G/A
G/A
G/A
C
-
A/-
A/G
G/C
G
C/G
2
G
A
T
C
-
T
T
A
T/C
T/C
T/C
C/T
T/C
A
C
2
T
T
A
G
A
3
-
T/-
G/C
4
4/5
C/-
-
C/-
C/2
T
G
2
C
T
T
-
C
G
5
G
G
3
G
C
C
G
T
G
G
T
C
C
G
G
2
A/-
T
C
C
A
A
-
G
T
T
2
A/G
-
C/T
G
C
-
3
A
3
A/-
-
A
C
-
-
-
C
T
T
T
A/-
3/4
-
A
T
T
T
G/-
-
A
-
2
-
-
-
2
3
2
2
A
C
T
C
4/AT
2
-/6
G
5
A/G
G/A
T
T/C
G/2
-
C
T
A
2
13
2
G
C
A
T
G
T
-
AC/3
T
T
A/T
G
C
C
-